; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0018108 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0018108
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionleucine-rich repeat extensin-like protein 6
Genome locationchr06:5277075..5277607
RNA-Seq ExpressionPI0018108
SyntenyPI0018108
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049526.1 Nutrient reservoir [Cucumis melo var. makuwa]6.0e-6683.62Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
        ME PISLQILISLT LLLL     SSLPVFHPR+SAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT

Query:  YSSPPP-------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        YSSPPP                   P PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLL LF
Subjt:  YSSPPP-------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

KGN57146.1 hypothetical protein Csa_010613 [Cucumis sativus]5.1e-6582.49Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
        METPI LQ LISLTALLLLFP+G SSLPVFHPR+SAGAKYQIECTMCSACDNPC QYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPP+SGTYDYYS PPPPAQP+YT
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT

Query:  YSSPPP-------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        YSSPPP                   P PPPPNPIVPYFPF+YHTPPPGSSAAV RLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
Subjt:  YSSPPP-------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

XP_022955565.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita moschata]3.3e-5676.27Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
        MET ISL+  ISLTA+LL FPAGFSSLP    RT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPP+SGTY YYSPPPPP+QPTYT
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT

Query:  YSSPPPPP-------------------PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        YSSPPPPP                   PPPPNPIVPYFPFY+HTPPPGS+AA GRLTNS  CSVLTV LF FLLALF
Subjt:  YSSPPPPP-------------------PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

XP_023526139.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-5575.71Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
        MET ISL++ ISLTA+LL FPAGFSSLP    RT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPP+SGTY YYSPPPPP+QPTYT
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT

Query:  YSSPPPPP-------------------PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        YSS PPPP                   PPPPNPIVPYFPFY+HTPPPGS+AA GRLTNS  CSVLTV LF FLLALF
Subjt:  YSSPPPPP-------------------PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

XP_038906774.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Benincasa hispida]3.6e-5577.27Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
        MET ISL+  ISLTA+LLLFPAGFSSLPV   R SAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPP    PPPPVNCPPPPSPP+SGTY YYS PPPP QPTYT
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT

Query:  YSSPPP------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        YSSPPP                  P PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVG LTNSL  SVLTVALFSFLL LF
Subjt:  YSSPPP------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAN7 Nutrient reservoir2.4e-6582.49Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
        METPI LQ LISLTALLLLFP+G SSLPVFHPR+SAGAKYQIECTMCSACDNPC QYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPP+SGTYDYYS PPPPAQP+YT
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT

Query:  YSSPPP-------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        YSSPPP                   P PPPPNPIVPYFPF+YHTPPPGSSAAV RLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
Subjt:  YSSPPP-------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

A0A5A7U5R9 Nutrient reservoir2.9e-6683.62Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
        ME PISLQILISLT LLLL     SSLPVFHPR+SAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT

Query:  YSSPPP-------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        YSSPPP                   P PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLL LF
Subjt:  YSSPPP-------------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

A0A6J1C7N8 leucine-rich repeat extensin-like protein 36.1e-4869.66Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQP
        ME    L+ L+ L A+LL+FPA   SLP    RTSAGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPP+SGTY YYS PPPPAQP
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQP

Query:  TYTYSSPPP-----------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        TYTYSSPPP                 P PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAA   LT +  CSV T  LF+ LLALF
Subjt:  TYTYSSPPP-----------------PPPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

A0A6J1GVF6 leucine-rich repeat extensin-like protein 61.6e-5676.27Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
        MET ISL+  ISLTA+LL FPAGFSSLP    RT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPP+SGTY YYSPPPPP+QPTYT
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT

Query:  YSSPPPPP-------------------PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        YSSPPPPP                   PPPPNPIVPYFPFY+HTPPPGS+AA GRLTNS  CSVLTV LF FLLALF
Subjt:  YSSPPPPP-------------------PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

A0A6J1IXZ9 leucine-rich repeat extensin-like protein 65.1e-5575.14Show/hide
Query:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT
        MET ISL+  ISLTA+LL F AGFSSLP    RT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP ++CPPPPSPP+SGTY YYSPPPPP+QPTYT
Subjt:  METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYT

Query:  YSSPPPPP-------------------PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        YSSPPPPP                   PPPPNPIVPYFPFY+HTPPPGS+AA GRLTNS  CSVLTV LF FLLALF
Subjt:  YSSPPPPP-------------------PPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 34.2e-0657.5Show/hide
Query:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPP--PPAQPTYTYSSPPPPPPPPPNPIV--PYFPFYYHTPPPGSSA
        Y  PPPPPP PPPPV  PPPP PP       YSPPP  PP  P   YS PPPPPPPPP P+   P  P Y   PPP S A
Subjt:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPP--PPAQPTYTYSSPPPPPPPPPNPIV--PYFPFYYHTPPPGSSA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G06750.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein7.6e-1149.6Show/hide
Query:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYTYSSP----------PPP------PPPPPNPIVPYFPFYYHT
        + CTMCS+CDNPC    +P P   SPPP    PPP S    G+Y YYSPPPP +     Y  P          PPP       PPPPNPIVPYFPFYYHT
Subjt:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYTYSSP----------PPP------PPPPPNPIVPYFPFYYHT

Query:  PPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVAL
        PP G S +  RL NSL  ++  V L
Subjt:  PPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVAL

AT3G22800.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein8.2e-0547.87Show/hide
Query:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYS-PPPPPAQPTYTYSSPPPP--PPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP
        + Y I+C       +P      PPPPPP PPPP   PPPP PP    Y Y S PPPPP+ P Y Y  PPPP   PPPP+P     P+ Y  PPP
Subjt:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYS-PPPPPAQPTYTYSSPPPP--PPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein3.0e-0757.5Show/hide
Query:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPP--PPAQPTYTYSSPPPPPPPPPNPIV--PYFPFYYHTPPPGSSA
        Y  PPPPPP PPPPV  PPPP PP       YSPPP  PP  P   YS PPPPPPPPP P+   P  P Y   PPP S A
Subjt:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPP--PPAQPTYTYSSPPPPPPPPPNPIV--PYFPFYYHTPPPGSSA

AT4G16140.1 proline-rich family protein8.2e-1345.93Show/hide
Query:  ECTMCSACDNPCGQYLSPPPPP--PSPPPP----VNCPPPPSPPTSGTYDYYSPP-------PPPAQPTYTYSSPPP------PPPPPPNPIVPYFPFYY
        +CTMC++CDNPC    SPPPPP  PSPPPP      CPPPPS    G Y YY P        PPP+  +  Y  PPP      P  PPPNPIVPYFPFYY
Subjt:  ECTMCSACDNPCGQYLSPPPPP--PSPPPP----VNCPPPPSPPTSGTYDYYSPP-------PPPAQPTYTYSSPPP------PPPPPPNPIVPYFPFYY

Query:  HTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF
        + PPP S  +           V  + +FS     F
Subjt:  HTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF

AT5G49280.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein1.3e-1551.82Show/hide
Query:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPP----VNCPPPPSPPTS-GTYDYYSPPPPPA------QPTY-----TYSSPPP-----PPPPPPNPIVPYFP
        + CTMCS+CDNPC    S  PPPPSPPPP      CPPPPSPP+S G   YY PPP  +       P Y      Y  PPP     P PPPPNPIVPYFP
Subjt:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPP----VNCPPPPSPPTS-GTYDYYSPPPPPA------QPTY-----TYSSPPP-----PPPPPPNPIVPYFP

Query:  FYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLAL
        FYYHTPPPGS +   R  +S     +  ALF+  L L
Subjt:  FYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACTCCTATTTCTCTCCAAATTCTCATCTCTCTCACGGCGCTTCTCCTCCTTTTTCCCGCCGGATTTTCCTCTCTTCCGGTCTTCCACCCCCGGACCTCCGCCGG
CGCCAAGTACCAAATTGAATGCACAATGTGCTCTGCTTGTGACAATCCCTGCGGTCAGTATCTCTCTCCGCCACCTCCTCCACCTTCTCCTCCTCCGCCCGTCAATTGTC
CCCCGCCCCCTTCTCCTCCTACCTCCGGCACCTACGACTATTACTCTCCCCCGCCGCCGCCAGCTCAACCCACTTACACATACTCCTCCCCACCGCCGCCGCCTCCCCCG
CCGCCGAATCCCATTGTCCCATATTTCCCATTCTATTACCACACTCCACCGCCGGGCTCTTCCGCCGCCGTCGGCCGTTTGACGAATTCCTTGCCTTGCTCTGTTCTTAC
CGTTGCTCTGTTTTCCTTTTTACTTGCTTTGTTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACTCCTATTTCTCTCCAAATTCTCATCTCTCTCACGGCGCTTCTCCTCCTTTTTCCCGCCGGATTTTCCTCTCTTCCGGTCTTCCACCCCCGGACCTCCGCCGG
CGCCAAGTACCAAATTGAATGCACAATGTGCTCTGCTTGTGACAATCCCTGCGGTCAGTATCTCTCTCCGCCACCTCCTCCACCTTCTCCTCCTCCGCCCGTCAATTGTC
CCCCGCCCCCTTCTCCTCCTACCTCCGGCACCTACGACTATTACTCTCCCCCGCCGCCGCCAGCTCAACCCACTTACACATACTCCTCCCCACCGCCGCCGCCTCCCCCG
CCGCCGAATCCCATTGTCCCATATTTCCCATTCTATTACCACACTCCACCGCCGGGCTCTTCCGCCGCCGTCGGCCGTTTGACGAATTCCTTGCCTTGCTCTGTTCTTAC
CGTTGCTCTGTTTTCCTTTTTACTTGCTTTGTTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METPISLQILISLTALLLLFPAGFSSLPVFHPRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPTSGTYDYYSPPPPPAQPTYTYSSPPPPPPP
PPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAVGRLTNSLPCSVLTVALFSFLLALF