; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0018113 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0018113
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr11:26295903..26296307
RNA-Seq ExpressionPI0018113
SyntenyPI0018113
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ADN34145.1 hypothetical protein [Cucumis melo subsp. melo]8.7e-4274.6Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY
        MDLGFT VTRSR+R S IWI SPTESSTP RP VNL+ PSGGV QMRP ASPSSN ESSTPPTTYSQAVTL+KRF+ RP+IK+Y +K IV+YDPII  EY
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY

Query:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEK
        QSLTL+E VSKIFP+ FNFL +  +K
Subjt:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEK

KAA0026217.1 hypothetical protein E6C27_scaffold19G001920 [Cucumis melo var. makuwa]6.4e-3769.29Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY
        MDLGFT VTRSR+R S I I  PTESSTP RP  NL+ P G V QM+P ASPSSN +SSTPPTTYSQAVT +KRF+ RPKIK Y +K IV+YDP I LEY
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY

Query:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEKL
        QSLTL+E VSKIFPE FNFL +   K+
Subjt:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEKL

KAA0043136.1 putative Retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]8.1e-4073.02Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY
        MDLGFTTVTR  +RS  IWI SPTESSTP RP  NL+ PS GV QMRP ASPSSN ESSTPPTTYSQAVT +KRF+ RP+IK+Y +K IV+YDPII LEY
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY

Query:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEK
        QSLT +ETVSKIFPE FNFL +   K
Subjt:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEK

KAA0066421.1 hypothetical protein E6C27_scaffold21G005030 [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-3767.16Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY
        MDLGFTTVTRSR+RSS I IES TESSTP RP  NL+ P GG  QMRP ASPSSN ESSTPPTTYSQ VT +KRF+ RP+IK+Y +K IV+YD II  EY
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY

Query:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEKLENSTSLF
        QS+TL++TVSKIF + FN L +   K  N  SLF
Subjt:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEKLENSTSLF

TYK23025.1 hypothetical protein E5676_scaffold386G001370 [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-3470.54Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESST-PPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLE
        +DLGFT VTRSR+R   IWI S TESSTP RP  NL+ PSG V QMR  ASPSSNMESST PPTTYSQAVT +KRF+ RP+ KTY KK I +Y P I LE
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESST-PPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLE

Query:  YQSLTLDE-TVSKIFPEGFNFL-QKTSEK
        YQ+LTL+E TVSKIFP+GFNFL +KTS K
Subjt:  YQSLTLDE-TVSKIFPEGFNFL-QKTSEK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SRB3 Uncharacterized protein6.5e-3570.54Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESST-PPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLE
        +DLGFT VTRSR+R   IWI S TESSTP RP  NL+ PSG V QMR  ASPSSNMESST PPTTYSQAVT +KRF+ RP+ KTY KK I +Y P I LE
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESST-PPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLE

Query:  YQSLTLDE-TVSKIFPEGFNFL-QKTSEK
        YQ+LTL+E TVSKIFP+GFNFL +KTS K
Subjt:  YQSLTLDE-TVSKIFPEGFNFL-QKTSEK

A0A5A7TM80 Putative Retrotransposon protein3.9e-4073.02Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY
        MDLGFTTVTR  +RS  IWI SPTESSTP RP  NL+ PS GV QMRP ASPSSN ESSTPPTTYSQAVT +KRF+ RP+IK+Y +K IV+YDPII LEY
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY

Query:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEK
        QSLT +ETVSKIFPE FNFL +   K
Subjt:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEK

A0A5D3BM67 Uncharacterized protein6.3e-3867.16Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY
        MDLGFTTVTRSR+RSS I IES TESSTP RP  NL+ P GG  QMRP ASPSSN ESSTPPTTYSQ VT +KRF+ RP+IK+Y +K IV+YD II  EY
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY

Query:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEKLENSTSLF
        QS+TL++TVSKIF + FN L +   K  N  SLF
Subjt:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEKLENSTSLF

A0A5D3E4J4 Uncharacterized protein3.1e-3769.29Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY
        MDLGFT VTRSR+R S I I  PTESSTP RP  NL+ P G V QM+P ASPSSN +SSTPPTTYSQAVT +KRF+ RPKIK Y +K IV+YDP I LEY
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY

Query:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEKL
        QSLTL+E VSKIFPE FNFL +   K+
Subjt:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEKL

E5GCE6 Uncharacterized protein4.2e-4274.6Show/hide
Query:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY
        MDLGFT VTRSR+R S IWI SPTESSTP RP VNL+ PSGGV QMRP ASPSSN ESSTPPTTYSQAVTL+KRF+ RP+IK+Y +K IV+YDPII  EY
Subjt:  MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEY

Query:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEK
        QSLTL+E VSKIFP+ FNFL +  +K
Subjt:  QSLTLDETVSKIFPEGFNFLQKTSEK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTTGGGGTTTACTACGGTAACCCGATCTAGAGCAAGATCATCCGACATATGGATTGAATCCCCTACGGAGTCTTCTACTCCATCTAGGCCTTTGGTCAATCTTGT
CTACCCTTCTGGCGGAGTCACTCAAATGAGACCTCATGCCTCTCCTTCATCAAATATGGAGTCATCTACTCCTCCTACAACGTATTCTCAGGCTGTCACTCTAGAAAAAC
GATTCATACTAAGGCCCAAGATCAAAACATATTCTAAAAAACAAATTGTAATCTATGATCCTATCATAGTGCTAGAATATCAAAGTCTCACTCTAGATGAGACAGTTTCA
AAAATCTTCCCTGAAGGCTTTAATTTCCTTCAGAAGACCTCAGAAAAACTAGAAAATTCTACGAGTTTATTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTTGGGGTTTACTACGGTAACCCGATCTAGAGCAAGATCATCCGACATATGGATTGAATCCCCTACGGAGTCTTCTACTCCATCTAGGCCTTTGGTCAATCTTGT
CTACCCTTCTGGCGGAGTCACTCAAATGAGACCTCATGCCTCTCCTTCATCAAATATGGAGTCATCTACTCCTCCTACAACGTATTCTCAGGCTGTCACTCTAGAAAAAC
GATTCATACTAAGGCCCAAGATCAAAACATATTCTAAAAAACAAATTGTAATCTATGATCCTATCATAGTGCTAGAATATCAAAGTCTCACTCTAGATGAGACAGTTTCA
AAAATCTTCCCTGAAGGCTTTAATTTCCTTCAGAAGACCTCAGAAAAACTAGAAAATTCTACGAGTTTATTCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLGFTTVTRSRARSSDIWIESPTESSTPSRPLVNLVYPSGGVTQMRPHASPSSNMESSTPPTTYSQAVTLEKRFILRPKIKTYSKKQIVIYDPIIVLEYQSLTLDETVS
KIFPEGFNFLQKTSEKLENSTSLF