; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0018217 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0018217
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionlight-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic
Genome locationchr03:8605784..8608850
RNA-Seq ExpressionPI0018217
SyntenyPI0018217
Gene Ontology termsGO:0006850 - mitochondrial pyruvate transmembrane transport (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0031305 - integral component of mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0050833 - pyruvate transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140959.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucumis sativus]5.9e-7690.05Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS
        MSGACSFPF +IKIPSTSSSPAAT+AAAS SAS SSSASSS    SSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPS TPPLKPTPP QS
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS

Query:  PPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        PPS     DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  PPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

XP_008441491.1 PREDICTED: proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 [Cucumis melo]2.2e-8695.81Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS
        MSGACS PFANIKIPSTSSSPAATA+AASPSASASSSASSSSSLHSSLRF SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPSPTPPLKP+PPSQS
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS

Query:  PPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        PPSPV+KQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  PPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

XP_022939849.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita moschata]5.0e-7588.66Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPT-PPSQ
        MSGACS PFA IKIP+TSSSP    A ASPSASA+SSASSSS+ HSS+RFSS+KPF+FTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPT PPSQ
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPT-PPSQ

Query:  SPPSP--VVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        +PPSP    K DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
Subjt:  SPPSP--VVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

XP_023551626.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.2e-7589.18Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPT-PPSQ
        MSGACS PFA IKIP+TSSSP    A ASPSASA+SSASSSS+ HSS+RFSSSKPF+FTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPT PPSQ
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPT-PPSQ

Query:  SPPSP--VVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        +PPSP    K DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
Subjt:  SPPSP--VVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

XP_038884716.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Benincasa hispida]9.1e-7790.72Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS
        MSGACS PFA IKIP  SSSP   AAA SPSASASSSASSSS  H+SLRFSSSKPF+FTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSP SPTPPLKPTPP QS
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS

Query:  PP---SPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        PP   SPVVKQDNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
Subjt:  PP---SPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBA0 Uncharacterized protein2.9e-7690.05Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS
        MSGACSFPF +IKIPSTSSSPAAT+AAAS SAS SSSASSS    SSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPS TPPLKPTPP QS
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS

Query:  PPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        PPS     DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  PPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

A0A1S3B3J8 proline-rich receptor-like protein kinase PERK141.0e-8695.81Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS
        MSGACS PFANIKIPSTSSSPAATA+AASPSASASSSASSSSSLHSSLRF SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPSPTPPLKP+PPSQS
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS

Query:  PPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        PPSPV+KQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  PPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

A0A6J1FIC8 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic2.4e-7588.66Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPT-PPSQ
        MSGACS PFA IKIP+TSSSP    A ASPSASA+SSASSSS+ HSS+RFSS+KPF+FTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPT PPSQ
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPT-PPSQ

Query:  SPPSP--VVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        +PPSP    K DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
Subjt:  SPPSP--VVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

A0A6J1JS47 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic8.3e-6881.31Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS
        MSGACSFPFA IKIP+ SSS    +AA SPSASA SS SSSS+ HSS+RFSSSKPF+FTIRSSQT+GP+RRPAAPSLREPSPPSPP   PPLKPTP S +
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQS

Query:  PP-------SPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
         P       + V KQDN ITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDL+
Subjt:  PP-------SPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

A0A6J1K1U3 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic2.0e-7488.14Show/hide
Query:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPP-SQ
        MSGACS PFA IKIP+ SSSP    A ASPSASA+SSASSSS+ HSS+RFSSSKPF+FTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPP SQ
Subjt:  MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPP-SQ

Query:  SPPSP--VVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        +PPSP    K DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDE DQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
Subjt:  SPPSP--VVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FEC1 Light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic6.2e-4470.19Show/hide
Query:  SSASSSSSLHSSLRFS-SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAA-PSLREPS---PPSPPSPTPPLKPTPPSQSPPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQ
        SS+SSSS+  SS RFS ++KP +F IR SQTEGPLRRP+A P+LREP    PPS PS +PP  P+PP Q   +  V   +V T+EFQR KAKELQEYFKQ
Subjt:  SSASSSSSLHSSLRFS-SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAA-PSLREPS---PPSPPSPTPPLKPTPPSQSPPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQ

Query:  KKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        KKL+ A QGPFFGF  KNEISNGRWAMFGFAVG+LTEYATGS+ VDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  KKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G34000.1 one-helix protein 24.4e-4570.19Show/hide
Query:  SSASSSSSLHSSLRFS-SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAA-PSLREPS---PPSPPSPTPPLKPTPPSQSPPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQ
        SS+SSSS+  SS RFS ++KP +F IR SQTEGPLRRP+A P+LREP    PPS PS +PP  P+PP Q   +  V   +V T+EFQR KAKELQEYFKQ
Subjt:  SSASSSSSLHSSLRFS-SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAA-PSLREPS---PPSPPSPTPPLKPTPPSQSPPSPVVKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQ

Query:  KKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE
        KKL+ A QGPFFGF  KNEISNGRWAMFGFAVG+LTEYATGS+ VDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  KKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGGGGCTTGTTCATTCCCCTTCGCCAATATCAAAATCCCCTCCACTTCCTCCTCACCGGCCGCCACCGCCGCTGCCGCTTCTCCCTCCGCCTCCGCCTCCTCTTC
CGCTTCTTCTTCATCCTCCCTTCACTCTTCTCTCCGATTCTCCTCCTCCAAGCCTTTCCTCTTCACCATTCGAAGCTCTCAGACCGAAGGCCCTCTTCGGAGACCCGCAG
CTCCTTCTCTCAGAGAGCCTTCGCCGCCGTCTCCCCCTTCGCCGACGCCTCCTCTCAAGCCTACTCCTCCGTCGCAATCGCCTCCGTCACCGGTTGTGAAACAGGATAAT
GTGATCACATTGGAGTTTCAGAGGCTGAAGGCTAAGGAGCTTCAGGAGTATTTTAAGCAGAAGAAGCTTGATGAAGCTGATCAGGGACCATTCTTTGGCTTCATCGGGAA
GAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCTGTTGGATTACTGACCGAGTATGCAACTGGTTCAAACTTTGTTGATCAAGTAAAGATCCTTCTCTCAA
ATTTTGGGATAGTAGATCTCGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAATACATCTGGTTAGATCTTGATTCATTTACTTTTAATAAATGTTAAGTTTAGCGTTTGACAAGTTAAATTAAAATTATAAAATGAAGAAAATGATATTTTATCAAAA
AAGAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGAGTTATATAAGAGTTTGAAAGGCCATAATTTTTCTTAGTTCATTCTGAAAATTCATCAAATGGCTTGTATTTTTCTGAAACTTGGC
GACATCATATCCACACCAAACATATCCCCTCAAATCCTAATCCATTTCTCTTAACCAAATCTATTTTTCATTTTATTTTTTTATTTTTGACTTCACTTCCCTATTCCTTC
GATTCTTCCATTTCACTTCCACTCACAATTTTCTGAAATGTCAGGGGCTTGTTCATTCCCCTTCGCCAATATCAAAATCCCCTCCACTTCCTCCTCACCGGCCGCCACCG
CCGCTGCCGCTTCTCCCTCCGCCTCCGCCTCCTCTTCCGCTTCTTCTTCATCCTCCCTTCACTCTTCTCTCCGATTCTCCTCCTCCAAGCCTTTCCTCTTCACCATTCGA
AGCTCTCAGACCGAAGGCCCTCTTCGGAGACCCGCAGCTCCTTCTCTCAGAGAGCCTTCGCCGCCGTCTCCCCCTTCGCCGACGCCTCCTCTCAAGCCTACTCCTCCGTC
GCAATCGCCTCCGTCACCGGTTGTGAAACAGGATAATGTGATCACATTGGAGTTTCAGAGGCTGAAGGCTAAGGAGCTTCAGGAGTATTTTAAGCAGAAGAAGCTTGATG
AAGCTGATCAGGGACCATTCTTTGGCTTCATCGGGAAGAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTTGCTGTTGGATTACTGACCGAGTATGCAACTGGT
TCAAACTTTGTTGATCAAGTAAAGATCCTTCTCTCAAATTTTGGGATAGTAGATCTCGAATGACACGACGTACAAGGTCGATGTTGCTATATTTTTCCACTTTCTGTAAT
TTATGTATCTACATCATGTAATTCATCTTATAGTCTTCATGAGAGTTTTGTTGTCTGTTACACTTAATTGCCATTCAAGTGTGTGTTCTCCTTGCAATACTTACTGTTTT
TCTGTTATATATAAATCTTCCCTTTTTTTATGAGTCTTTGTAATTCTAATTCACTGGGAGCATATTACCTATTCAAACCTTGCTAAAATTCTGTACCTTCATTCATTGGA
GGTTCCATTTACATAATAAAAACCTTGAAACTATGATTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGACSFPFANIKIPSTSSSPAATAAAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFSSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPAAPSLREPSPPSPPSPTPPLKPTPPSQSPPSPVVKQDN
VITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIVDLE