CuGenDBv2

Gene ID	PI0018233
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	PR domain zinc finger protein 8, putative isoform 1
Genome location	chr08:14008420..14011270
RNA-Seq Expression	PI0018233
Synteny	PI0018233
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR038971 - Cyclin-dependent protein kinase inhibitor SMR11/SMR16

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0055894.1 PR domain zinc finger protein 8, putative isoform 1 [Cucumis melo var. makuwa]

3.4e-118

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XP_008463308.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501496 [Cucumis melo]

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XP_022156261.1 uncharacterized protein LOC111023190 [Momordica charantia]

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XP_038883894.1 unknown protein 1 [Benincasa hispida]

3.7e-104

87.23

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KYB8 Uncharacterized protein

1.9e-119

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A0A1S3CIW8 uncharacterized protein LOC103501496

1.6e-118

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A0A5A7UL34 PR domain zinc finger protein 8, putative isoform 1

1.6e-118

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A0A6J1DUE1 uncharacterized protein LOC111023190

4.2e-90

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        S +C TPP  ++SG+AQTCP AP+KP  K R+ D+GLCRKLEF
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A0A6J1GG30 uncharacterized protein LOC111453838

3.1e-85

73.95

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        TPP SF++G+AQTCPAAPVKPSRK RNLD+GLCRKLEF
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P85192 Unknown protein 1

5.1e-08

39.81

Show/hide

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        G+S++  +LV    E   E    +  L+E VYE++LE I+  QAE  LA++  S S      TPP++  + G+ +TCP AP+K    R  R +DM LCRK
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Query:  LEF
        L+F
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Q9SKN7 Cyclin-dependent protein kinase inhibitor SMR11

1.6e-06

33.12

Show/hide

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        E P E+ ++      P+TP   V D  P   + + L+   I  +   G V   P   Q   S+S    V       +SD E++E++Y+NLL VI+S Q  
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Query:  SSLAQLSSSQSDSPDCNTPPTSF----MSGVAQTCPAAPVKPSRKLRNLDMGLCRKL
         S+A +         C TPP S      + V+ TCP AP+K ++  RN+D GL RKL
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G28330.1 unknown protein

1.2e-07

33.12

Show/hide

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        E P E+ ++      P+TP   V D  P   + + L+   I  +   G V   P   Q   S+S    V       +SD E++E++Y+NLL VI+S Q  
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Query:  SSLAQLSSSQSDSPDCNTPPTSF----MSGVAQTCPAAPVKPSRKLRNLDMGLCRKL
         S+A +         C TPP S      + V+ TCP AP+K ++  RN+D GL RKL
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGATTTTGCTCGACGTACTGATGAATCTAAAGAATCAGAAAATTCGTCTACTAAATGTTGTAGTAAAGTGGAAACTCAGCTGGAGATTGTTGAACTAAGAGTTCCTAT
TGAGCCTTCAACGCCCGATGCTGATAGAGAGAGTGGTGATTTTCCTTCTGATTCTAAATCCCCAATCACTCAGGTTGTGAGTAGCAAACCTCTTTTATTAACTTGTTTAG
ATTCTTTAGGTGAAAGAATTGAAGCCCCTTTTGAGAGTTCTGACTCTTTTGATCCTCTTTGTAGCCCCCGTACTCCTAAAGATGGTGTTTTTGATCCCTTTTCCCCTGCC
CCTGCTCATTTGGCTTTAGCTCCTATCTCTAGAAAGTATTTTAGTGGCTCTGTTGGATTTGTTCCTCGCCGTCTTCAATTTGGTTCTTCTTCTTCTTCATTGCAATTAGT
GGAAGCTGAAGAAGAACAATCCATTTCTGATAGTGAGCTGTTGGAGGCAGTTTATGAGAATCTCTTGGAAGTTATTGTTTCCCATCAAGCTGAGTCTTCTCTTGCTCAGC
TCTCAAGCTCTCAAAGTGATTCTCCTGATTGTAATACACCTCCTACTTCTTTTATGAGTGGGGTTGCTCAAACTTGTCCTGCTGCGCCTGTTAAGCCCTCGAGAAAGTTG
CGAAATCTTGACATGGGTTTGTGCAGAAAGCTTGAGTTCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAAAACTCCATTTTTGATCCCACTTCCAATCTCAATCTCTCTCTACACTGATTTTCTTTCTTGGTTTTCGAGCCTTATTCTCTTAACTTTAAGCTTTTCACTTCCCCTTT
CCGTCGCCGTCGTCCTCTTCAACCTTCGTTCAATCCCATTACTCAGCCGCCAGGTAGTTTTCTCCCTCTTCCCTTCACTTTCCAAACGCTTTTTTGCCCTCTTTTTCCCT
TCCCTGCATCTGGGTTTCTGTTGTTTTTCCCTTTTGATGTTGTTACAACGCGAAATCTTCAGTTACCCATATGTTTGTTTTCCCTTTCGTTGTGTGCTTTGATCAGATTC
CTTGTTTTTTTTCCCCCTGTTTCGTTAGGGTTTTGTAGTTTTTGATTTGATTTCTTCGTCATTCAGGGTTTTGATTTGCGCCCATTTGATTTAACGAAGATGGATTTTGC
TCGACGTACTGATGAATCTAAAGAATCAGAAAATTCGTCTACTAAATGTTGTAGTAAAGTGGAAACTCAGCTGGAGATTGTTGAACTAAGAGTTCCTATTGAGCCTTCAA
CGCCCGATGCTGATAGAGAGAGTGGTGATTTTCCTTCTGATTCTAAATCCCCAATCACTCAGGTTGTGAGTAGCAAACCTCTTTTATTAACTTGTTTAGATTCTTTAGGT
GAAAGAATTGAAGCCCCTTTTGAGAGTTCTGACTCTTTTGATCCTCTTTGTAGCCCCCGTACTCCTAAAGATGGTGTTTTTGATCCCTTTTCCCCTGCCCCTGCTCATTT
GGCTTTAGCTCCTATCTCTAGAAAGTATTTTAGTGGCTCTGTTGGATTTGTTCCTCGCCGTCTTCAATTTGGTTCTTCTTCTTCTTCATTGCAATTAGTGGAAGCTGAAG
AAGAACAATCCATTTCTGATAGTGAGCTGTTGGAGGCAGTTTATGAGAATCTCTTGGAAGTTATTGTTTCCCATCAAGCTGAGTCTTCTCTTGCTCAGCTCTCAAGCTCT
CAAAGTGATTCTCCTGATTGTAATACACCTCCTACTTCTTTTATGAGTGGGGTTGCTCAAACTTGTCCTGCTGCGCCTGTTAAGCCCTCGAGAAAGTTGCGAAATCTTGA
CATGGGTTTGTGCAGAAAGCTTGAGTTCTGAATGTTGGCGCCTTTCTAATTAGCTTCAGATCATTGCATAGAAGAATGTAGGTAAAGCTGACTCTGGAGAATGAATTACT
TACTTGCTAATTTGAACATCTGACGTTTTTGTACTGATTATATGACTAGCAAAATCTCTGCTGAAGCAGGCTGATTATTGTAAATTTTGGAAGTCTTCTTTTGAAAAAGC
TTGTTGGGTTGGATCATGGATGTTTGTCTTGTGATCTCATCTCCTCAGTTTGGTTAAGAGTAGGATTGTTGAAAATGATATTGACCAATAAACCAATCCTCTTTGTTACT
ATGATCAGCACGTTGTTAATATGATGTCATTTTTATTCCTTTAGCGGGTATTACTTTATTTCCTAGGCAGAGATGCACTTGTAGAAATGCTAAATGAAGAATTATTTGTT
ACTGGTATCATTTGCCAAAAGAACTTGTAGACTCTTACTTTTTTTCTGTCAGGATTGTACCATTTCTAGCTCACCTTCTATATTGAATGTTAAGTTCTCATTTCATTAAT
AACTAATCTTTTTGGATCTTCTGGTGATTTCACAACCAAGGACCTTACAAGTTCGAACTCTCCAGTTTTTCATATTATTTTGAATCTAGTTAGCTATTTTAACTAATTTT
GAACTATTGAGGATACAAAACGTATGAAGTGGGTCGTATTACTAATTTGCGTTTTTATTCATTAAGTTTATTGGAATGTCTTGAAATATCTTATCTAGCGCTCCGAATGA
ACAAGCATGAAGTCTTGTTATTTACATTATTTACGATTTGGCTCTAAGATTTAGAAGAGTGCGCTATATAAACTCTCGAATTCCATTAGTGCCTCTGAATTAATCTATTG
TTTTTTTCTCTAATAATAAATTGTTGCCCGTGGGCGTAGCAAATATACTATTAGTGAACCACGTAAATGTCTTTTCAATTCCACAACAAAGCTCATGTTGATTTGAACAT
GTCTAAATGATCTGGGGTTCGAAAATGATTGATGATTGAACTCCCAGGTGATTGTGGAATAGAATACTAGAACTTAATTGTTCATGCAGATCCTTCAGAAAATGTACTGA
TGTAGGGTCCAAAATGATGATTCCATGAAATGAGAAATGTTAGCAAAGAAGTTAGAAGAAAGAACTAAGAAAGAGGAAAATGGTGGCAGTCAGATTCAGGTTCTCTTGGT
GGCTTAGGCATGGGTGTTGCTCCTGCTCTCTTCTTTTTGGCAGGCAGAAAGTGGCAACTTTCAACAATGGGTATAGTACAAGTCTTAAAAGTACACTAACTTTTGAGATT
TGATGGAATCCTAACTTACTTTTTATTAGGTCCTACTTTTTGATCTAGTTGTTAGTTGGATAAGCTCAGTTTCACTTTTAATTTCCATTAAATTAAATACTGACTTCAAA
TAAACTACTTGAGCTTTGTCTAGTGGTCTTTAGAGCATGTGAAAATGTAGGGCGTGGTGGGAATGGATTTAAATCTCATGGTGATCATCGAATTTGGATCATACAAGTTT
TATGATCGTAATGTAATATATATATCATTGAGTGCTGAAATTGACTTGAACACCTTAAAAGGACCCACAAGACTAGTATCTGAAAATGTATAGAGAAGATTTGTAGCCTG
ATTATGTGGGATTTTG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MDFARRTDESKESENSSTKCCSKVETQLEIVELRVPIEPSTPDADRESGDFPSDSKSPITQVVSSKPLLLTCLDSLGERIEAPFESSDSFDPLCSPRTPKDGVFDPFSPA
PAHLALAPISRKYFSGSVGFVPRRLQFGSSSSSLQLVEAEEEQSISDSELLEAVYENLLEVIVSHQAESSLAQLSSSQSDSPDCNTPPTSFMSGVAQTCPAAPVKPSRKL
RNLDMGLCRKLEF

PI0018233 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome