; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0018236 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0018236
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationchr05:3283270..3287493
RNA-Seq ExpressionPI0018236
SyntenyPI0018236
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR017907 - Zinc finger, RING-type, conserved site
IPR018957 - Zinc finger, C3HC4 RING-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047955.1 RING zinc finger protein-like protein [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-13881.85Show/hide
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XP_004139186.2 uncharacterized protein LOC101211581 [Cucumis sativus]4.8e-15194.27Show/hide
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XP_008454833.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495144 [Cucumis melo]5.8e-14993.86Show/hide
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XP_022150768.1 uncharacterized protein LOC111018833 [Momordica charantia]1.8e-13484.23Show/hide
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        MSE +MELQSTA  EM+T++S+ D TNPCPICLG I + SYL+KCFH FCYNCIVQWTKVVSGKRSC LS IKCPLCKTESSSIIHGLDGH FQRHYV+ 
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XP_038889020.1 uncharacterized protein LOC120078783 isoform X1 [Benincasa hispida]9.7e-13685.56Show/hide
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        MSE++MELQSTA +E  TS+S SD TNPCPICLG I Q SYL+KCFH FCYNCI+QWTKVVSGK SC LSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH  QRHYV+ 
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        R +LDAAKPFLSARADRF+LELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWN+PVVP +AI+EDL LKPVTPYLYIF+YDPDD
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLN5 RING-type domain-containing protein2.3e-15194.27Show/hide
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        MS KSMELQSTASMEM+T TSTSDYTNPCPICLGPINQSSYL+KCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH FQRHYV+P
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A0A1S3BZL4 uncharacterized protein LOC1034951442.8e-14993.86Show/hide
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A0A5A7U2Q2 RING zinc finger protein-like protein1.0e-13881.85Show/hide
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        MSEKSMELQS ASME+KTSTSTSDYT+PCPICLGPINQSSYL+                        F+              NFCYNCIVQWTKVVSGK
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Query:  RSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGHYFQRHYVDPDFQDSFILSKAHKYRLQCYYTEPG-FLDDIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEE
        RSC LSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH+FQRHYV+PDFQDSFILSKAHKYRLQCYYTEPG FL+DIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEE
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Query:  DVDIIMHHFLGLINSFFRRNEPKYQTETPELKRKRFSRTILDAAKPFLSARADRFMLELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWNKPVVPSVAIEEDLELKP
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        VTPYLYIFD DPDD
Subjt:  VTPYLYIFDYDPDD

A0A5D3D454 RING zinc finger protein-like protein2.8e-14993.86Show/hide
Query:  MSEKSMELQSTASMEMKTSTSTSDYTNPCPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGHYFQRHYVDP
        MSEKSMELQS ASME+KTSTSTSDYT+PCPICLGPINQSSYL+KCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSC LSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGH+FQRHYV+P
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A0A6J1DAB4 uncharacterized protein LOC1110188338.8e-13584.23Show/hide
Query:  MSEKSMELQSTASMEMKTSTSTSDYTNPCPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGHYFQRHYVDP
        MSE +MELQSTA  EM+T++S+ D TNPCPICLG I + SYL+KCFH FCYNCIVQWTKVVSGKRSC LS IKCPLCKTESSSIIHGLDGH FQRHYV+ 
Subjt:  MSEKSMELQSTASMEMKTSTSTSDYTNPCPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGHYFQRHYVDP

Query:  DFQDSFILSKAHKYRLQCYYTEPGFLDDIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHFLGLINSFFRRNEPKYQTETPELKRKRFS
        DFQDSFILSKAHKYRLQCYYTEPGFL+DIF+VQRYWKL+KYLQANQWLEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHH LGLIN FF RNE KYQTE+PE+K+++FS
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Query:  RTILDAAKPFLSARADRFMLELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWNKPVVPSVAIEEDLELKPVTPYLYIFDYDPDDGD
          + DAAKPFLSARADRF+ ELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGW++PVVPSVAI+EDL LKPVTPYLYIFDYDPDDG+
Subjt:  RTILDAAKPFLSARADRFMLELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWNKPVVPSVAIEEDLELKPVTPYLYIFDYDPDDGD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q09268 Uncharacterized RING finger protein C32D5.109.1e-0439.29Show/hide
Query:  CPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSI
        C +C   I  ++ L  C H FCY+CIV W    SG          CP+CKT  S I
Subjt:  CPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSI

Q80Z37 E3 ubiquitin-protein ligase Topors4.2e-0928.57Show/hide
Query:  SMELQSTASMEM-------KTSTSTSDYTNP--------CPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLD
        S E+ ++A+ E        K  TS    T P        CPICL   +  SYL++C H FC+ C+ +W+K          +  +CPLCK    SI H + 
Subjt:  SMELQSTASMEM-------KTSTSTSDYTNP--------CPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLD

Query:  GH-YFQRHYVDPDFQDSFILSKAHKYRLQCYYT
            F+ + + P +  SF   +  ++R +   T
Subjt:  GH-YFQRHYVDPDFQDSFILSKAHKYRLQCYYT

Q9E1W2 E3 ubiquitin-protein ligase IE611.3e-0535.63Show/hide
Query:  TSTSTS-DYTNPCPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGL--DGHYFQRHYVDPD
        TSTS S   T  C IC+  I+       C H+FC+ CI  WT           +S +CPLC+T  SSI+H +  D +Y +   +  D
Subjt:  TSTSTS-DYTNPCPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGL--DGHYFQRHYVDPD

Q9NS56 E3 ubiquitin-protein ligase Topors9.4e-0929.69Show/hide
Query:  SMELQSTASMEM-------KTSTSTSDYTNP--------CPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLD
        S E+ ++A+ E        K  TS    T P        CPICL   +  SYL++C H FC+ C+ +W+K          +  +CPLCK    SI H + 
Subjt:  SMELQSTASMEM-------KTSTSTSDYTNP--------CPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLD

Query:  GH-YFQRHYVDPDFQDSFIL-SKAHKYR
            F+ + + P +  SF+   +  +YR
Subjt:  GH-YFQRHYVDPDFQDSFIL-SKAHKYR

Q9V8P9 E3 ubiquitin-protein ligase Topors3.7e-0531.67Show/hide
Query:  CPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGL
        C ICL    +  + + C H FC+ C+ +W+K+            +CPLCK    +IIH +
Subjt:  CPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39100.1 RING/U-box superfamily protein6.3e-0823.68Show/hide
Query:  CPICLGPINQ---SSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSS--IIHGLDGHYFQR--------------HYVDPDFQDSFI--
        CPICL  + +   ++ +  C H +C  CI +W+   S KR+       CPLC T   S  I+       + +              H  +P  +   I  
Subjt:  CPICLGPINQ---SSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSS--IIHGLDGHYFQR--------------HYVDPDFQDSFI--

Query:  --------LSKAHKYRLQCYYTEPGFLDD--IFDVQRYWKLQKY-----------------LQANQW--------LEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHF
                 S++     +  +  PG + D  IF  +  W+   Y                 L  N +        +E W++RELQA++ + D  +I+H  
Subjt:  --------LSKAHKYRLQCYYTEPGFLDD--IFDVQRYWKLQKY-----------------LQANQW--------LEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHF

Query:  LGLINSFFRRNEPKYQTETPELKRKRFSRTILDAAKPFLSARADRFMLELELFLASGLNIEAYDSV
          L      R   +   +T  L     S     + + FLS + D F  EL  F  S L +E YD+V
Subjt:  LGLINSFFRRNEPKYQTETPELKRKRFSRTILDAAKPFLSARADRFMLELELFLASGLNIEAYDSV

AT3G05250.1 RING/U-box superfamily protein3.6e-8054.75Show/hide
Query:  SDYTNPCPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGHYFQRHYVDPDFQDSFILSKAHKYRLQCYYTE
        SD+ +PCPICLG   + SYL+ CFH FC+NCI QW KVVS K S   SS+ CPLCKTE+ SIIH  DG  F+RHY+DP+  D F+L+K  +YRLQCYYTE
Subjt:  SDYTNPCPICLGPINQSSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSIIHGLDGHYFQRHYVDPDFQDSFILSKAHKYRLQCYYTE

Query:  PGFLDDIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHFLGLINSFFRRNEPKYQTETPELK---RKRFSRTILDAAKPFLSARADRFM
         GFL D+FDV R+WKLQK+LQ N+ LE WL+RELQAL+QEEDVDI++HH +G++ SF +R + + + ET   +   +++F   + +AA+PF+ AR DRF+
Subjt:  PGFLDDIFDVQRYWKLQKYLQANQWLEVWLKRELQALIQEEDVDIIMHHFLGLINSFFRRNEPKYQTETPELK---RKRFSRTILDAAKPFLSARADRFM

Query:  LELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWNKPVVPSVAIEEDLELKP------VTPYLYIFDYDPD
         ELELFLA+GLN+EAYD++Y Q L  N       A EE  E++       VTPYL+IF+ D D
Subjt:  LELELFLASGLNIEAYDSVYLQRLGWNKPVVPSVAIEEDLELKP------VTPYLYIFDYDPD

AT3G05670.1 RING/U-box protein5.5e-0436.07Show/hide
Query:  NPCPICLGPINQ---SSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSI
        N C ICL   +       L+ C H FC+ CI++W+KV S          +CPLCK    +I
Subjt:  NPCPICLGPINQ---SSYLEKCFHNFCYNCIVQWTKVVSGKRSCTLSSIKCPLCKTESSSI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGAAAAGTCCATGGAATTGCAGAGCACTGCGTCGATGGAGATGAAGACAAGCACTTCCACTTCGGACTATACGAACCCTTGCCCGATCTGCCTTGGACCCATAAA
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GTCCTTTATGCAAGACAGAAAGTTCTTCTATAATACATGGATTAGATGGACATTATTTCCAAAGACATTATGTTGATCCGGATTTCCAGGATAGCTTTATCTTATCAAAA
GCTCATAAGTATAGATTACAGTGCTATTATACTGAACCAGGTTTCTTGGATGACATATTTGATGTGCAGAGGTATTGGAAGTTACAGAAGTATCTCCAGGCAAACCAGTG
GCTTGAAGTTTGGTTGAAAAGGGAACTTCAAGCTTTGATTCAGGAAGAAGATGTTGACATAATTATGCACCACTTTCTTGGTTTAATTAATTCATTTTTTCGTAGAAATG
AACCTAAGTATCAAACAGAAACTCCTGAACTGAAGAGGAAAAGGTTTAGCCGAACGATCCTTGATGCAGCAAAGCCATTCCTTTCAGCAAGAGCTGATCGATTCATGCTC
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AGATCTTGAACTCAAACCTGTAACTCCATACTTGTATATCTTTGACTATGACCCTGATGATGGTGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCATGGAATTGCAGAGCACTGCGTCGATGGAGATGAAGACAAGCACTTCCACTTCGGACTATACGAACCCTTGCCCGATCTGCCTTGGACCCATAAATCAATCTTCCTAT
CTTGAAAAGTGCTTTCATAACTTTTGTTACAATTGCATTGTACAATGGACCAAAGTGGTTTCTGGGAAGCGCTCCTGCACACTTTCCTCCATTAAATGTCCTTTATGCAA
GACAGAAAGTTCTTCTATAATACATGGATTAGATGGACATTATTTCCAAAGACATTATGTTGATCCGGATTTCCAGGATAGCTTTATCTTATCAAAAGCTCATAAGTATA
GATTACAGTGCTATTATACTGAACCAGGTTTCTTGGATGACATATTTGATGTGCAGAGGTATTGGAAGTTACAGAAGTATCTCCAGGCAAACCAGTGGCTTGAAGTTTGG
TTGAAAAGGGAACTTCAAGCTTTGATTCAGGAAGAAGATGTTGACATAATTATGCACCACTTTCTTGGTTTAATTAATTCATTTTTTCGTAGAAATGAACCTAAGTATCA
AACAGAAACTCCTGAACTGAAGAGGAAAAGGTTTAGCCGAACGATCCTTGATGCAGCAAAGCCATTCCTTTCAGCAAGAGCTGATCGATTCATGCTCGAGTTGGAGCTAT
TTCTTGCTTCAGGTTTGAACATTGAAGCCTATGATTCAGTTTACTTGCAACGGTTGGGTTGGAACAAGCCTGTAGTGCCGAGCGTGGCTATTGAAGAAGATCTTGAACTC
AAACCTGTAACTCCATACTTGTATATCTTTGACTATGACCCTGATGATGGTGATTAAACAAGTTCTTAAAACTTTTAATTGTTTTTGTGAAAGTAAGTCTTGTGTTATCT
CCCCACCTTCCAGTATGGATTTAATGAAAAGTTGGAATCTGTCAAGCTGTCTGCTTTAACTTTTTGTTGTTGAATTTGAATTTTGATAATCTTGTAACTACATATTAATA
TTTTTCTTATTGAGATTGGCTGCTTACTAGACCCATCAACACAGACAGAGAATGGTCGGTTCGGGTTTGGTTTTGGCCAAAATCGATTCTAAGGGAATTGTATAGAAGAG
AAATTAAATAGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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