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| Q15287 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 4.0e-19 | 43.02 | Show/hide |
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+R RRS SGS SS+RSRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S SS S SP P R+ + RRSR+ P KR ++ SP
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+ +HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
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| Q3KPW1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1-B | 3.0e-19 | 43.41 | Show/hide |
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++ RRS SGS SSSRSR S S S SSS S S S+S S S + SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RRSR+ KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPPRKPSPVR
Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R +P+R
Subjt: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
Query: DGPKPENVGPDAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
P + P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
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|
| Q4R5N1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 4.0e-19 | 43.02 | Show/hide |
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+R RRS SGS SS+RSRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S SS S SP P R+ + RRSR+ P KR ++ SP
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Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRT-VNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+ +HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
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Query: DGPKPENVGPDAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
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| Q9SEE9 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 2.9e-110 | 67.44 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S+SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
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Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
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Query: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
+ PKRD PK +N DAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG S
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
Query: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRR
P RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++PR+
Subjt: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRR
Query: V--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
+ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: V--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G16610.1 arginine/serine-rich 45 | 2.0e-111 | 67.44 | Show/hide |
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MAKPSRGRRSP S+SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
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Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
+ PKRD PK +N DAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG S
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
Query: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRR
P RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++PR+
Subjt: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRR
Query: V--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
+ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: V--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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| AT1G16610.2 arginine/serine-rich 45 | 1.9e-109 | 66.82 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S+SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSPL
+ PKRD PK +N DAEKD R+ PR + SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG SP
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSPL
Query: ARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRRV-
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR G AGRRGRSSSYS+SPSPR++PR++
Subjt: ARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPGAAGRRGRSSSYSASPSPRKVPRRV-
Query: -SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: -SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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| AT1G16610.3 arginine/serine-rich 45 | 3.2e-109 | 65.68 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S+SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRSRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
+ PKRD PK +N DAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG S
Subjt: ATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
Query: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPGAAGRRGRSSSYSA
P RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+ G G AGRRGRSSSYS+
Subjt: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPGAAGRRGRSSSYSA
Query: SPSPRKVPRRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
SPSPR++PR++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: SPSPRKVPRRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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