; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0018526 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0018526
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein XRI1
Genome locationchr09:6122207..6124404
RNA-Seq ExpressionPI0018526
SyntenyPI0018526
Gene Ontology termsGO:0007140 - male meiotic nuclear division (biological process)
GO:0007143 - female meiotic nuclear division (biological process)
InterPro domainsIPR039933 - Protein XRI1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0067591.1 protein XRI1 [Cucumis melo var. makuwa]6.4e-11687.5Show/hide
Query:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIST-----------DEGISSSPKSRL
        GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDAL+EYTSKRRRL  DQHHFFQFEFPQSSY  WN+QIDDMNNDNYYYY  NYDAIST           DEGISSSPKSRL
Subjt:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIST-----------DEGISSSPKSRL

Query:  SNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDM
        SNEETS E +MKTQD ETYSTPNYYYE HHHHHPNSSSSSSSK HKF    EAD KSIFSMSTNLPISTGD E ETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGD+
Subjt:  SNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDM

Query:  TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
Subjt:  TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

XP_004151416.1 uncharacterized protein LOC101215634 [Cucumis sativus]3.0e-12989.32Show/hide
Query:  STGSELHSLSFLNSSPLGFAIMEGGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL---DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIS
        S+GSELHSL FLNSSPLGFAIMEG AAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL   DQHHFF F+FPQ+SYD WNNQIDD+NND  YYYY NY AIS
Subjt:  STGSELHSLSFLNSSPLGFAIMEGGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL---DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIS

Query:  TDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYE----HHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRK
        TDEGISSSPKSRLSNEETS EDMMKTQD ETYSTPNYYYE    HHHHHHPNSSSSSSSK HKF    EAD KSIFSMSTNLPISTGD E E KKAKKRK
Subjt:  TDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYE----HHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRK

Query:  VVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        VVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
Subjt:  VVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

XP_008466833.2 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103504140 [Cucumis melo]8.1e-10384.13Show/hide
Query:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMK
        GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDAL+EYTSKRRRL  DQHHFF       +         M     YYYY NYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETS E +MK
Subjt:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMK

Query:  TQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMP
        TQD ETYSTPNYYYE HHHHHPNSSSSSSSK HKF    EAD KSIFSMSTNLPISTGD E ETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGD+TLNDINQKILMP
Subjt:  TQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMP

Query:  PTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        PTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
Subjt:  PTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

XP_022146436.1 uncharacterized protein LOC111015652 [Momordica charantia]1.5e-8064.48Show/hide
Query:  SELHSLSFLNSSPLGFAIMEGG----AAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL---DQHH----FFQFEFPQ---SSY-----DWNNQIDDMNNDN
        S+LHSL    SSPL FA+M+      A  +DPCFSP +STGYLEDALVE+TSKRRRL   D  H      QF+FPQ   SSY     D +N  D  +  N
Subjt:  SELHSLSFLNSSPLGFAIMEGG----AAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL---DQHH----FFQFEFPQ---SSY-----DWNNQIDDMNNDN

Query:  YYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTE-DMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSES
          Y +NNYDA+S DE IS+SPKSR+S E   T+   MKT + E +STPN  Y ++ + HPNSSSSSS   H+F AE  AD ++I S+S  LP+S+G   S
Subjt:  YYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTE-DMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSES

Query:  ETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        ETK  KKRKVVYPFALVKPGGVEGD+TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALT+IHTQGRRG+ITIIRTKG
Subjt:  ETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

XP_038874964.1 uncharacterized protein LOC120067481 [Benincasa hispida]3.5e-10678.17Show/hide
Query:  MSSTGSELHSLSFLNSSPLGFAIMEGGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRLDQHHFFQFEFPQS------SYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNY
        MSS G EL SLS  NSSPLGFA+M+G AAVI+P FSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRLD HH FQFEFPQS       YDWNNQIDDMNN+N YYYY+NY
Subjt:  MSSTGSELHSLSFLNSSPLGFAIMEGGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRLDQHHFFQFEFPQS------SYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNY

Query:  DAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSS-SSKLHKFEAEAE--ADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAK
        DA+ST+EGISSS KSR+S EETS  DMMKTQ+ +TYSTPNYYYE   H+ PNSSSSS SSKLHK EAEAE  AD +SIFS+S NLPISTG          
Subjt:  DAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSS-SSKLHKFEAEAE--ADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAK

Query:  KRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
             +PFALVKPGG+EGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
Subjt:  KRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMV0 Uncharacterized protein1.4e-12989.32Show/hide
Query:  STGSELHSLSFLNSSPLGFAIMEGGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL---DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIS
        S+GSELHSL FLNSSPLGFAIMEG AAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL   DQHHFF F+FPQ+SYD WNNQIDD+NND  YYYY NY AIS
Subjt:  STGSELHSLSFLNSSPLGFAIMEGGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL---DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIS

Query:  TDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYE----HHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRK
        TDEGISSSPKSRLSNEETS EDMMKTQD ETYSTPNYYYE    HHHHHHPNSSSSSSSK HKF    EAD KSIFSMSTNLPISTGD E E KKAKKRK
Subjt:  TDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYE----HHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRK

Query:  VVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        VVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
Subjt:  VVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

A0A1S3CSB7 LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC1035041403.9e-10384.13Show/hide
Query:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMK
        GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDAL+EYTSKRRRL  DQHHFF       +         M     YYYY NYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETS E +MK
Subjt:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMK

Query:  TQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMP
        TQD ETYSTPNYYYE HHHHHPNSSSSSSSK HKF    EAD KSIFSMSTNLPISTGD E ETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGD+TLNDINQKILMP
Subjt:  TQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMP

Query:  PTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        PTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
Subjt:  PTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

A0A5A7VPU6 Protein XRI13.1e-11687.5Show/hide
Query:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIST-----------DEGISSSPKSRL
        GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDAL+EYTSKRRRL  DQHHFFQFEFPQSSY  WN+QIDDMNNDNYYYY  NYDAIST           DEGISSSPKSRL
Subjt:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIST-----------DEGISSSPKSRL

Query:  SNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDM
        SNEETS E +MKTQD ETYSTPNYYYE HHHHHPNSSSSSSSK HKF    EAD KSIFSMSTNLPISTGD E ETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGD+
Subjt:  SNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDM

Query:  TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
Subjt:  TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

A0A5D3BG61 Protein XRI19.4e-8167.42Show/hide
Query:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIST-----------DEGISSSPKSRL
        GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDAL+EYTSKRRRL  DQHHFFQFEFPQSSY  WN+QIDDMNNDNYYYY  NYDAIST           DEGISSSPKSRL
Subjt:  GGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL--DQHHFFQFEFPQSSYD-WNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAIST-----------DEGISSSPKSRL

Query:  SNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDM
        SNEETS                                                                D E ETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGD+
Subjt:  SNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDM

Query:  TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
Subjt:  TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

A0A6J1CZC7 uncharacterized protein LOC1110156527.2e-8164.48Show/hide
Query:  SELHSLSFLNSSPLGFAIMEGG----AAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL---DQHH----FFQFEFPQ---SSY-----DWNNQIDDMNNDN
        S+LHSL    SSPL FA+M+      A  +DPCFSP +STGYLEDALVE+TSKRRRL   D  H      QF+FPQ   SSY     D +N  D  +  N
Subjt:  SELHSLSFLNSSPLGFAIMEGG----AAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRL---DQHH----FFQFEFPQ---SSY-----DWNNQIDDMNNDN

Query:  YYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTE-DMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSES
          Y +NNYDA+S DE IS+SPKSR+S E   T+   MKT + E +STPN  Y ++ + HPNSSSSSS   H+F AE  AD ++I S+S  LP+S+G   S
Subjt:  YYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTE-DMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSES

Query:  ETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        ETK  KKRKVVYPFALVKPGGVEGD+TLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALT+IHTQGRRG+ITIIRTKG
Subjt:  ETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NLW5 Protein XRI14.8e-1340.17Show/hide
Query:  EAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTK
        E E     + +   S N+      S S         ++YPFA +KP GV G MTL DINQKI  PP +P  H        P V       SGK VV  TK
Subjt:  EAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTK

Query:  IHTQGRRGTITIIRTKG
        I T+G +G+ITI+RT+G
Subjt:  IHTQGRRGTITIIRTKG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14630.1 unknown protein1.3e-3442.26Show/hide
Query:  ISTGYLEDALVEYT--SKRRRLDQHHFFQFEFPQSSYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYY
        +STGYLEDAL+E++  SKRRRL         F  +    +N +D  ++ N++    NY   S          S+ ++E  ++   + +++  + S+ N +
Subjt:  ISTGYLEDALVEYT--SKRRRLDQHHFFQFEFPQSSYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYY

Query:  YEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFA
                    SSS+SK + ++                               +K++VVYPF +VKPGG E D+TLNDIN++ILMP  RPVRHPVGDFA
Subjt:  YEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFA

Query:  CRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        CRPCVSADGPGLSGKAVVA TKI T G RGTITIIRTKG
Subjt:  CRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

AT2G01990.1 unknown protein2.8e-3243.8Show/hide
Query:  ISTGYLEDALVE--YTSKRRRLDQHHFFQFEFPQSSYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYY
        +STGYLEDAL+E    SKRRRL       FE P  S++     DD  ND  +  + +Y  +++      +P    + E  S     +   +  Y +P+  
Subjt:  ISTGYLEDALVE--YTSKRRRLDQHHFFQFEFPQSSYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSRLSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYY

Query:  YEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKR---KVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVG
                   +S S  K++  E                    T  S S      KR   K+VYPF LVKPGG E D+TLNDIN++ILM P+RP+RHPVG
Subjt:  YEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKR---KVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVG

Query:  DFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG
        DFA RPCVS  GPGLSGKAVVALTKI TQG RGTITIIRTKG
Subjt:  DFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG

AT5G48720.1 x-ray induced transcript 13.4e-1440.17Show/hide
Query:  EAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTK
        E E     + +   S N+      S S         ++YPFA +KP GV G MTL DINQKI  PP +P  H        P V       SGK VV  TK
Subjt:  EAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTK

Query:  IHTQGRRGTITIIRTKG
        I T+G +G+ITI+RT+G
Subjt:  IHTQGRRGTITIIRTKG

AT5G48720.2 x-ray induced transcript 13.4e-1440.17Show/hide
Query:  EAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTK
        E E     + +   S N+      S S         ++YPFA +KP GV G MTL DINQKI  PP +P  H        P V       SGK VV  TK
Subjt:  EAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKILMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTK

Query:  IHTQGRRGTITIIRTKG
        I T+G +G+ITI+RT+G
Subjt:  IHTQGRRGTITIIRTKG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTAGTACTGGTAGTGAACTTCATTCTCTATCTTTTCTCAATTCCTCACCCTTGGGTTTTGCAATTATGGAGGGCGGCGCCGCCGTCATTGATCCATGTTTCTCACC
AGCGATTTCCACCGGTTATTTGGAAGATGCGTTGGTTGAATACACTTCAAAACGACGGCGTTTGGATCAACACCATTTTTTTCAATTTGAATTCCCACAAAGCTCTTACG
ATTGGAACAACCAAATTGATGATATGAATAATGATAATTATTATTATTATTATAATAATTATGACGCCATTTCTACAGATGAGGGAATAAGCAGTTCGCCGAAAAGCAGA
TTGAGTAATGAGGAAACGAGTACGGAGGATATGATGAAAACGCAAGATGCGGAGACGTACTCGACTCCAAATTATTATTATGAACATCACCATCATCATCATCCAAATTC
TTCTTCTTCATCTTCTTCTAAATTACACAAATTTGAGGCTGAGGCTGAGGCTGATCACAAATCCATTTTCTCCATGTCCACCAACCTCCCTATTTCAACAGGTGATAGTG
AAAGTGAAACAAAGAAGGCAAAGAAGAGGAAGGTGGTGTATCCATTTGCATTAGTGAAGCCAGGAGGTGTAGAAGGTGATATGACCTTAAACGATATAAACCAAAAGATT
TTAATGCCTCCAACCCGCCCGGTTCGACACCCGGTCGGGGATTTCGCATGTCGACCATGTGTGTCTGCTGATGGACCGGGCCTATCGGGCAAAGCCGTGGTCGCTTTGAC
CAAAATTCATACTCAAGGAAGGAGAGGCACCATCACCATTATTAGAACCAAGGGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTTTTGAAAAAACAAAAATTTATATAAACCCATTTTTGAAAACGGTGGAGATTCAGTTTTTCAAAATTATCAAAATGAGTAGTACTGGTAGTGAACTTCATTCTCTAT
CTTTTCTCAATTCCTCACCCTTGGGTTTTGCAATTATGGAGGGCGGCGCCGCCGTCATTGATCCATGTTTCTCACCAGCGATTTCCACCGGTTATTTGGAAGATGCGTTG
GTTGAATACACTTCAAAACGACGGCGTTTGGATCAACACCATTTTTTTCAATTTGAATTCCCACAAAGCTCTTACGATTGGAACAACCAAATTGATGATATGAATAATGA
TAATTATTATTATTATTATAATAATTATGACGCCATTTCTACAGATGAGGGAATAAGCAGTTCGCCGAAAAGCAGATTGAGTAATGAGGAAACGAGTACGGAGGATATGA
TGAAAACGCAAGATGCGGAGACGTACTCGACTCCAAATTATTATTATGAACATCACCATCATCATCATCCAAATTCTTCTTCTTCATCTTCTTCTAAATTACACAAATTT
GAGGCTGAGGCTGAGGCTGATCACAAATCCATTTTCTCCATGTCCACCAACCTCCCTATTTCAACAGGTGATAGTGAAAGTGAAACAAAGAAGGCAAAGAAGAGGAAGGT
GGTGTATCCATTTGCATTAGTGAAGCCAGGAGGTGTAGAAGGTGATATGACCTTAAACGATATAAACCAAAAGATTTTAATGCCTCCAACCCGCCCGGTTCGACACCCGG
TCGGGGATTTCGCATGTCGACCATGTGTGTCTGCTGATGGACCGGGCCTATCGGGCAAAGCCGTGGTCGCTTTGACCAAAATTCATACTCAAGGAAGGAGAGGCACCATC
ACCATTATTAGAACCAAGGGTTAATAGTAATAAAGAACCAAATGTTAACCCTAAATATGTATTACTATTTCAAATTAGTCTTATAGGTTATTCCCAACTTTATCGATTGG
CTTTGGCCTCTTTGAATTGTACAGAGGGGGAGAGTGAGGAAAAAATTGAATGTAATATAATTAGTAATGAGAGATGAAGGGGAAAGAAGAGGTCAATGACTTTGTACTTG
TATCATAATTTTCCATTAAAGATAGCCTAAGTAATTAAAGTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSTGSELHSLSFLNSSPLGFAIMEGGAAVIDPCFSPAISTGYLEDALVEYTSKRRRLDQHHFFQFEFPQSSYDWNNQIDDMNNDNYYYYYNNYDAISTDEGISSSPKSR
LSNEETSTEDMMKTQDAETYSTPNYYYEHHHHHHPNSSSSSSSKLHKFEAEAEADHKSIFSMSTNLPISTGDSESETKKAKKRKVVYPFALVKPGGVEGDMTLNDINQKI
LMPPTRPVRHPVGDFACRPCVSADGPGLSGKAVVALTKIHTQGRRGTITIIRTKG