; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0019320 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0019320
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionATP citrate synthase
Genome locationchr02:243626..249643
RNA-Seq ExpressionPI0019320
SyntenyPI0019320
Gene Ontology termsGO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
GO:0003878 - ATP citrate synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR013650 - ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type
IPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like
IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050962.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]6.4e-24098.11Show/hide
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A0A6J1HYY6 ATP citrate synthase2.2e-23897.4Show/hide
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O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 34.3e-22390Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDFTELTN + WLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVK RLG +VEM GCKA
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFNVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG F VFQDLDFSF+EMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATF+GIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIM
        V+GPEATMTGICK+AI+CIM
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Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 37.9e-22590.07Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLL+EHLKRLA IDL I SAQV +STDFTEL N +PWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQV +FVK+RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKT+FLPTEK  T +ACAPLIATLPLE+R KIGDFI GV++VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNI+FPLPFGRVL+P+ESF+H LDEKTS+SLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFSGIIRALREKESKLKAARM+IYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICKQAI+CIM+ A
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 22.0e-22891.96Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDFTEL N +PWLS+ KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK+RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Q53JY8 ATP-citrate synthase subunit alpha chain protein 13.2e-21086.56Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDFTEL N +PWLS+ KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK+RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTIFL TEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF VFQDLDFSFLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFK-KWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELG
        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFK  + KWGNIEFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGG                 EL 
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Query:  NYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPL
        NYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+
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Query:  EVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        EV+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Q9SGY2 ATP-citrate synthase alpha chain protein 11.2e-20480.85Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   +PWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK+RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFNVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATF+GIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09430.1 ATP-citrate lyase A-33.1e-22490Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDFTELTN + WLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVK RLG +VEM GCKA
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFNVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG F VFQDLDFSF+EMN
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        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATF+GIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIM
        V+GPEATMTGICK+AI+CIM
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIM

AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-18.4e-20680.85Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   +PWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK+RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFNVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATF+GIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA

AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-18.4e-20680.85Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   +PWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK+RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFNVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATF+GIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA

AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-18.4e-20680.85Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   +PWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK+RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATF+GIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-27.1e-20580.14Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+NQ TD  EL   +PWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A VA FVK+RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFNVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVS+RLGC+ISFSECGGI+IEENWDKVKTI +PT    T E CAPL+ATLPLEI+G++ DFI  +F +F+DLDF+FLEMN
Subjt:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFNVFQDLDFSFLEMN

Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+G+PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFP+PFGRV++ TESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATF+GIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMR+LG+E+GVP+E
Subjt:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFSGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE

Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTAGGAAGAAGATCAGAGAGTATGACTCTAAGAGGCTTCTCAAGGAGCATCTTAAACGCCTCGCTAATATCGACCTCCAGATCTGCTCTGCTCAGGTAAATCAATC
GACCGACTTCACTGAGCTGACAAACAACAAACCATGGTTGTCATCCACCAAGTTGGTGGTGAAACCAGACATGTTATTTGGGAAACGTGGAAAGAGTGGCTTGGTAGCTT
TAAATTTGGATCTAGCTCAAGTTGCCGAGTTTGTAAAGCAACGCCTTGGAGTACAGGTTGAGATGGGTGGTTGCAAGGCTCCAATTACGACATTCATTGTGGAGCCATTT
GTTCCCCATGATCAAGAGTACTACCTATCTATTGTCTCTGAAAGGCTTGGCTGCACAATAAGTTTTTCAGAATGTGGGGGAATCGAAATTGAAGAGAACTGGGATAAAGT
CAAGACGATTTTCCTTCCAACTGAAAAACCTTTTACACTTGAGGCATGTGCTCCGTTAATAGCTACACTTCCTCTGGAGATTCGAGGAAAGATTGGTGACTTCATAATGG
GCGTATTCAATGTATTTCAAGATCTGGACTTCAGTTTCCTGGAGATGAATCCATTCACCCTGGTGAACGGGGAGCCATATCCACTGGATATGAGGGGGGAATTGGATGAC
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