; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0019400 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0019400
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-2A
Genome locationchr11:4263364..4265912
RNA-Seq ExpressionPI0019400
SyntenyPI0019400
Gene Ontology termsGO:0030100 - regulation of endocytosis (biological process)
GO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
PWA58297.1 ras-related protein RABB1b [Artemisia annua]2.3e-6356.76Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T+N + IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L  WL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVG---LRG
        D R+ ++PN++IM++GNK D   RR V+KEEGE FA++NGLLFLE SA+T+Q+++E         FLK    I+ KI+ GV D+SN  +GIKVG    +G
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVG---LRG

Query:  SIESSSMEIKSGGFTLKSTCCS
        +        +SGG      CCS
Subjt:  SIESSSMEIKSGGFTLKSTCCS

XP_008458689.1 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: ras-related protein Rab-2A-like, partial [Cucumis melo]1.5e-8674.67Show/hide
Query:  AVYDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSW
        A+YDYLFKYILIGNTGVGKS LMSQFL KKF+PVHEVTVGAEFG RTLTL+DKIIKLHIWDTAGQE +KSIT+SYYRGAIGALLVYDVTRR+TF NLKSW
Subjt:  AVYDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSW

Query:  LDDIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVT--KEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLR
        LDD+REL+HP+ISIMV+ NKVD++ RREVT  KEEG+HFAEQNGL FLETSAKT+QN+ E         F  I NNI+ KIELGV+DLSN  +GIKVGLR
Subjt:  LDDIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVT--KEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLR

Query:  GSIESSSMEIKSGGFTLKSTCCSIQ
          +E SSM  +S GFT    CC+IQ
Subjt:  GSIESSSMEIKSGGFTLKSTCCSIQ

XP_016561646.1 PREDICTED: ras-related protein RABB1b [Capsicum annuum]2.3e-6356.62Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T++ + IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ ++PN++IM++GNK D   RR V+KEEGE FA++NGLLFLE SA+T QN++E         F++    I+ KI+ GV D+SN  +GIKVG  G I+
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS
         ++   + G    +  CCS
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS

XP_024179601.1 ras-related protein RABB1b [Rosa chinensis]1.8e-6356.62Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T+  + IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ ++PN++IM++GNK D   RR V+KEEGE FA++NGLLFLE SA+T QN++E         F+K    I+  I+ GV D+SN  +GIKVG      
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS
          S   + G    +S CCS
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS

XP_028126365.1 ras-related protein RABB1b [Camellia sinensis]6.1e-6458.26Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T++ + IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ ++PN+SIM++GNK D   RR V+KEEGE FA++NGLLFLE SA+T QN++E         F+K    I+ KI+ GV D+SN  +GIKVG  G  +
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC
         SS +   G  T +  CC
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C8F9 LOW QUALITY PROTEIN: ras-related protein Rab-2A-like7.2e-8774.67Show/hide
Query:  AVYDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSW
        A+YDYLFKYILIGNTGVGKS LMSQFL KKF+PVHEVTVGAEFG RTLTL+DKIIKLHIWDTAGQE +KSIT+SYYRGAIGALLVYDVTRR+TF NLKSW
Subjt:  AVYDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSW

Query:  LDDIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVT--KEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLR
        LDD+REL+HP+ISIMV+ NKVD++ RREVT  KEEG+HFAEQNGL FLETSAKT+QN+ E         F  I NNI+ KIELGV+DLSN  +GIKVGLR
Subjt:  LDDIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVT--KEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLR

Query:  GSIESSSMEIKSGGFTLKSTCCSIQ
          +E SSM  +S GFT    CC+IQ
Subjt:  GSIESSSMEIKSGGFTLKSTCCSIQ

A0A1U8FR11 GTP-binding protein YPTC41.1e-6356.62Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T++ + IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ ++PN++IM++GNK D   RR V+KEEGE FA++NGLLFLE SA+T QN++E         F++    I+ KI+ GV D+SN  +GIKVG  G I+
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS
         ++   + G    +  CCS
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS

A0A2G3ACN4 ras-related protein RABB1b1.1e-6356.62Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T++ + IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ ++PN++IM++GNK D   RR V+KEEGE FA++NGLLFLE SA+T QN++E         F++    I+ KI+ GV D+SN  +GIKVG  G I+
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS
         ++   + G    +  CCS
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS

A0A2P6S5V8 Putative small monomeric GTPase8.6e-6456.62Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T+  + IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ ++PN++IM++GNK D   RR V+KEEGE FA++NGLLFLE SA+T QN++E         F+K    I+  I+ GV D+SN  +GIKVG      
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS
          S   + G    +S CCS
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCCS

A0A2U1MAN3 Ras-related protein RABB1b1.1e-6356.76Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T+N + IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L  WL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVG---LRG
        D R+ ++PN++IM++GNK D   RR V+KEEGE FA++NGLLFLE SA+T+Q+++E         FLK    I+ KI+ GV D+SN  +GIKVG    +G
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVG---LRG

Query:  SIESSSMEIKSGGFTLKSTCCS
        +        +SGG      CCS
Subjt:  SIESSSMEIKSGGFTLKSTCCS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P53994 Ras-related protein Rab-2A3.7e-6454.13Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        Y YLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T++ K IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRR+TF++L +WL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ S+ N+ IM++GNK D + RREV KEEGE FA ++GL+F+ETSAKT  N++E         F+     I  KI+ GV D++N   GIK+G + +  
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC
        ++S     GG      CC
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC

P61105 Ras-related protein Rab-2A1.1e-6353.67Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        Y YLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T++ K IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRR+TF++L +WL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ S+ N+ IM++GNK D + RREV KEEGE FA ++GL+F+ETSAKT  N++E         F+     I  KI+ GV D++N   GIK+G + +  
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC
        +++     GG      CC
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC

Q05975 Ras-related protein Rab-25.7e-6554.59Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        Y YLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T++ K IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRR+TF++L +WL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ S+ N+ IM++GNK D + RREV KEEGE FA ++GL+F+ETSAKT  N++E         F+     I  KI+ GV D++N   GIK+G + S  
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC
        S S+ +   G      CC
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC

Q39570 GTP-binding protein YPTC42.2e-6455.25Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        Y YLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR + ++ K IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGL-RGSI
        D R+ ++PN++IM++GNK D   RR VT EEGE FA+++GL+FLETSA+T  N++E         F+     I  KI+ GV D+SN   GIKVG   G+ 
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGL-RGSI

Query:  ESSSMEIKSGGFTLKSTCC
           +++   GG    S+CC
Subjt:  ESSSMEIKSGGFTLKSTCC

Q90965 Ras-related protein Rab-2A3.7e-6453.67Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        Y YLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T++ K IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRR+TF++L +WL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        D R+ S+ N+ IM++GNK D + RREV KEEGE FA ++GL+F+ETSAKT  N++E         F+     I  KI+ GV D++N   GIK+G + +  
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC
        ++++    GG      CC
Subjt:  SSSMEIKSGGFTLKSTCC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16920.1 RAB GTPase homolog A1B2.0e-4443.28Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFK +LIG++GVGKS L+S+F   +F    + T+G EF  RTL ++ K++K  IWDTAGQE Y++IT +YYRGA+GALLVYDVTRR TF+N+  WL 
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        +++  + PNI +M++GNK D      V  E+G+ +AEQ  L F+ETSA    N+++       T   +I +    ++E G    +++P G K+ ++  + 
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  S
        +
Subjt:  S

AT1G73640.1 RAB GTPase homolog A6A1.3e-4352.26Show/hide
Query:  DYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLDD
        DYLFK +LIG++ VGKS L+S+F   +F+   + T+G EF  R + + DKIIK  IWDTAGQE +++IT SYYRGA+GALL+YD+TRR TFDN+K WL +
Subjt:  DYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLDD

Query:  IRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDE
        +R+ ++P   ++++GNK D    REV ++EG+  AE  GL FLETSA    N++E
Subjt:  IRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDE

AT4G17160.1 RAB GTPase homolog B1A3.5e-5750.24Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        Y Y FKYI+IG+TGVGKSCL+ +F  K+FQ VH++T+G EFGA+T+T+++K IKL IWDTAGQE ++S+T+SYYRG  G LLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE
        + R+ +  N++ M++GNK D + +R V+ EEGE FA ++GL+F+E SAKT  N++E         F++    I  +I+ GV+D +N P GI  G  G  +
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIE

Query:  SSSMEIKSG
        +SS + + G
Subjt:  SSSMEIKSG

AT4G17170.1 RAB GTPase homolog B1C5.0e-6458.88Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        Y YLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T+++K IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRG
        D R+ ++ N++IM++GNK D   RR V+ EEGE FA+++GL+F+E SAKT QN++E         F+K    I  KI+ GV D+SN   GIKVG  G
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRG

AT4G35860.1 GTP-binding 21.3e-6455.4Show/hide
Query:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD
        YDYLFKYI+IG+TGVGKSCL+ QF  K+FQPVH++T+G EFGAR +T++ + IKL IWDTAGQE ++SIT+SYYRGA GALLVYD+TRRETF++L SWL+
Subjt:  YDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLD

Query:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVG---LRG
        D R+ ++PN+SIM++GNK D   +R V+KEEG+ FA+++GLLFLE SA+T QN++E         F++    I+  I+ GV D+SN  +GIK+G    +G
Subjt:  DIRELSHPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVG---LRG

Query:  SIESSSMEIKSGG
        +       I  GG
Subjt:  SIESSSMEIKSGG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCGCCGTCTACGATTACCTTTTCAAGTATATTCTAATTGGAAATACAGGGGTTGGAAAATCTTGCTTGATGTCACAATTTCTAGGGAAAAAGTTTCAGCCGGTTCA
TGAAGTCACTGTGGGGGCAGAATTTGGTGCTCGTACCCTTACCCTTAATGACAAAATTATTAAGCTTCATATTTGGGATACGGCTGGGCAAGAGGTATACAAATCAATTA
CAAAATCTTATTATAGAGGAGCAATTGGTGCACTTTTAGTTTACGATGTTACCAGGAGAGAGACATTCGACAATTTGAAGAGTTGGTTAGATGATATTAGGGAGCTTTCA
CATCCCAACATATCAATTATGGTCCTAGGAAATAAGGTTGATCGAGATCTTCGAAGAGAAGTAACAAAGGAAGAAGGAGAACATTTTGCTGAACAAAATGGACTCTTGTT
TTTAGAGACATCCGCTAAAACAACTCAAAATATTGATGAGTTGCTCACCGGTAGTTGTTCTACAGGCTTTCTCAAAATTGGAAATAACATAGTTCACAAGATTGAGCTCG
GTGTCATTGATTTATCCAATATGCCAACTGGAATCAAGGTCGGGCTAAGGGGAAGTATTGAAAGTTCATCCATGGAAATAAAATCAGGAGGATTTACATTGAAAAGTACA
TGTTGCAGCATCCAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCGCCGTCTACGATTACCTTTTCAAGTATATTCTAATTGGAAATACAGGGGTTGGAAAATCTTGCTTGATGTCACAATTTCTAGGGAAAAAGTTTCAGCCGGTTCA
TGAAGTCACTGTGGGGGCAGAATTTGGTGCTCGTACCCTTACCCTTAATGACAAAATTATTAAGCTTCATATTTGGGATACGGCTGGGCAAGAGGTATACAAATCAATTA
CAAAATCTTATTATAGAGGAGCAATTGGTGCACTTTTAGTTTACGATGTTACCAGGAGAGAGACATTCGACAATTTGAAGAGTTGGTTAGATGATATTAGGGAGCTTTCA
CATCCCAACATATCAATTATGGTCCTAGGAAATAAGGTTGATCGAGATCTTCGAAGAGAAGTAACAAAGGAAGAAGGAGAACATTTTGCTGAACAAAATGGACTCTTGTT
TTTAGAGACATCCGCTAAAACAACTCAAAATATTGATGAGTTGCTCACCGGTAGTTGTTCTACAGGCTTTCTCAAAATTGGAAATAACATAGTTCACAAGATTGAGCTCG
GTGTCATTGATTTATCCAATATGCCAACTGGAATCAAGGTCGGGCTAAGGGGAAGTATTGAAAGTTCATCCATGGAAATAAAATCAGGAGGATTTACATTGAAAAGTACA
TGTTGCAGCATCCAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSAVYDYLFKYILIGNTGVGKSCLMSQFLGKKFQPVHEVTVGAEFGARTLTLNDKIIKLHIWDTAGQEVYKSITKSYYRGAIGALLVYDVTRRETFDNLKSWLDDIRELS
HPNISIMVLGNKVDRDLRREVTKEEGEHFAEQNGLLFLETSAKTTQNIDELLTGSCSTGFLKIGNNIVHKIELGVIDLSNMPTGIKVGLRGSIESSSMEIKSGGFTLKST
CCSIQ