; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0019510 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0019510
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description60S acidic ribosomal protein P1
Genome locationchr09:58650..59260
RNA-Seq ExpressionPI0019510
SyntenyPI0019510
Gene Ontology termsGO:0002181 - cytoplasmic translation (biological process)
GO:0006414 - translational elongation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0030295 - protein kinase activator activity (molecular function)
GO:0043021 - ribonucleoprotein complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR038716 - Ribosomal protein P1/P2, N-terminal domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
EOY23697.1 60S acidic ribosomal protein family, putative [Theobroma cacao]1.6e-2256.64Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM
        M+TSELAC+YAALILHDD     AEKI TLV  A++ VESYWPSLF KL   RNI+D+I+N+GS       A+ + S+ + AG AA + PA+ EKKEE  
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM

Query:  EDSEDDMVFGLFD
        E+++DD+ FGLFD
Subjt:  EDSEDDMVFGLFD

XP_010099432.1 60S acidic ribosomal protein P1 [Morus notabilis]3.3e-2364.35Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGS--AAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEE
        MSTSELACTYAALILHDD     A+KI+T+V  A+++VESYWPSLFAKLA  RN++DLILN GS   AA  A  SHS    S AG AA AA A+ EKKEE
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGS--AAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEE

Query:  VMEDSEDDMVFGLFD
          E+S+DDM F LFD
Subjt:  VMEDSEDDMVFGLFD

XP_011075889.1 60S acidic ribosomal protein P1 [Sesamum indicum]1.6e-2260Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGS--AAASTAAASHSLSIASSAGN-----AAVAAPALV
        MS  ELACTYAALILHDD     AEKI+TLV  A +TVESYWPSLFAKL   RNI+DLI+N+GS    A+ A A+ + ++A+ AG      AA AAPA  
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGS--AAASTAAASHSLSIASSAGN-----AAVAAPALV

Query:  EKKEEVMEDSEDDMVFGLFD
        EKKEE  E+S+DDM F LFD
Subjt:  EKKEEVMEDSEDDMVFGLFD

XP_022138163.1 60S acidic ribosomal protein P1-like isoform X1 [Momordica charantia]1.7e-2467.89Show/hide
Query:  ELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVMEDSE
        ELACTYAALILHDD     AEKI+TLV  A +TVESYWPSLFAKL+  RNI+DLILN+GSAAAS A  S + S ++ A  A   APA VEKKEE +E+SE
Subjt:  ELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVMEDSE

Query:  DDMVFGLFD
        DD+VFGLFD
Subjt:  DDMVFGLFD

XP_022138164.1 60S acidic ribosomal protein P1-like isoform X2 [Momordica charantia]1.4e-2669.03Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM
        MSTSELACTYAALILHDD     AEKI+TLV  A +TVESYWPSLFAKL+  RNI+DLILN+GSAAAS A  S + S ++ A  A   APA VEKKEE +
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM

Query:  EDSEDDMVFGLFD
        E+SEDD+VFGLFD
Subjt:  EDSEDDMVFGLFD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061G3F9 60S acidic ribosomal protein family, putative7.9e-2356.64Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM
        M+TSELAC+YAALILHDD     AEKI TLV  A++ VESYWPSLF KL   RNI+D+I+N+GS       A+ + S+ + AG AA + PA+ EKKEE  
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM

Query:  EDSEDDMVFGLFD
        E+++DD+ FGLFD
Subjt:  EDSEDDMVFGLFD

A0A6I9SZL2 60S acidic ribosomal protein P17.9e-2360Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGS--AAASTAAASHSLSIASSAGN-----AAVAAPALV
        MS  ELACTYAALILHDD     AEKI+TLV  A +TVESYWPSLFAKL   RNI+DLI+N+GS    A+ A A+ + ++A+ AG      AA AAPA  
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGS--AAASTAAASHSLSIASSAGN-----AAVAAPALV

Query:  EKKEEVMEDSEDDMVFGLFD
        EKKEE  E+S+DDM F LFD
Subjt:  EKKEEVMEDSEDDMVFGLFD

A0A6J1C9A3 60S acidic ribosomal protein P1-like isoform X26.9e-2769.03Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM
        MSTSELACTYAALILHDD     AEKI+TLV  A +TVESYWPSLFAKL+  RNI+DLILN+GSAAAS A  S + S ++ A  A   APA VEKKEE +
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM

Query:  EDSEDDMVFGLFD
        E+SEDD+VFGLFD
Subjt:  EDSEDDMVFGLFD

A0A6J1CC92 60S acidic ribosomal protein P1-like isoform X18.4e-2567.89Show/hide
Query:  ELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVMEDSE
        ELACTYAALILHDD     AEKI+TLV  A +TVESYWPSLFAKL+  RNI+DLILN+GSAAAS A  S + S ++ A  A   APA VEKKEE +E+SE
Subjt:  ELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVMEDSE

Query:  DDMVFGLFD
        DD+VFGLFD
Subjt:  DDMVFGLFD

W9RA28 60S acidic ribosomal protein P1-11.6e-2364.35Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGS--AAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEE
        MSTSELACTYAALILHDD     A+KI+T+V  A+++VESYWPSLFAKLA  RN++DLILN GS   AA  A  SHS    S AG AA AA A+ EKKEE
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGS--AAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEE

Query:  VMEDSEDDMVFGLFD
          E+S+DDM F LFD
Subjt:  VMEDSEDDMVFGLFD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23095 60S acidic ribosomal protein P1-25.1e-1950.88Show/hide
Query:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEV
        MST  ELAC+YA +IL D+     ++KI+TLV  A + +ESYWP LFAK+A  RN+ DLI+N+G A      A  S +  ++AG AA AAPA  EKK+E 
Subjt:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEV

Query:  MEDSEDDMVFGLFD
         E+S+ D+ FGLFD
Subjt:  MEDSEDDMVFGLFD

P18660 60S acidic ribosomal protein P11.8e-1646.43Show/hide
Query:  STSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVME
        S SELAC Y+ALILHDD      +KI+ L+  A + VE +WP LFAK   + +I  LI N+G+   + AAA+ +   A + G AA A     E+K+E  E
Subjt:  STSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVME

Query:  DSEDDMVFGLFD
        +S+DDM FGLFD
Subjt:  DSEDDMVFGLFD

P52855 60S acidic ribosomal protein P14.9e-2255.75Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM
        M++ ELAC YAALIL DD     AEKI+T+V  A I VESYWP+LFAKL   RN+ DLIL++GS   +   A    + A + G AA AAPA+ EKKEE  
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVM

Query:  EDSEDDMVFGLFD
        E+S+DDM F LFD
Subjt:  EDSEDDMVFGLFD

Q8LCW9 60S acidic ribosomal protein P1-19.6e-1849.57Show/hide
Query:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVE-KKEE
        MST  ELAC+YA +IL D+     A+KI+TLV  A +++ESYWP LFAK+A  RN+ DLI+N+G+     A  +   + A +AG  A AAPA  E KK+E
Subjt:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVE-KKEE

Query:  VMEDSEDDMVFGLFD
          E+S+ D+ FGLFD
Subjt:  VMEDSEDDMVFGLFD

Q8LEQ0 60S acidic ribosomal protein P1-35.6e-1850.43Show/hide
Query:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVE-KKEE
        MST  ELAC+YA +IL D+     A+KI+TLV  A +T+ESYWP LFAK+A  RN+ DLI+N+G  A     A  + +  ++ G AA AAPA  E KK+E
Subjt:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVE-KKEE

Query:  VMEDSEDDMVFGLFD
          E+S+ D+ FGLFD
Subjt:  VMEDSEDDMVFGLFD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G00810.1 60S acidic ribosomal protein family3.6e-2050.88Show/hide
Query:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEV
        MST  ELAC+YA +IL D+     ++KI+TLV  A + +ESYWP LFAK+A  RN+ DLI+N+G A      A  S +  ++AG AA AAPA  EKK+E 
Subjt:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEV

Query:  MEDSEDDMVFGLFD
         E+S+ D+ FGLFD
Subjt:  MEDSEDDMVFGLFD

AT4G00810.2 60S acidic ribosomal protein family3.6e-2050.88Show/hide
Query:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEV
        MST  ELAC+YA +IL D+     ++KI+TLV  A + +ESYWP LFAK+A  RN+ DLI+N+G A      A  S +  ++AG AA AAPA  EKK+E 
Subjt:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEV

Query:  MEDSEDDMVFGLFD
         E+S+ D+ FGLFD
Subjt:  MEDSEDDMVFGLFD

AT5G24510.1 60S acidic ribosomal protein family1.5e-2153.45Show/hide
Query:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEE--
        MSTSELACTYAALILHDD     AE IS LV  A + VESYWPSLFAKL   +NI+DLI+N+G+     A     ++ A+   + +V+ P   EKK E  
Subjt:  MSTSELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEE--

Query:  -VMEDSEDDMVFGLFD
         + E+SEDDM+ GLFD
Subjt:  -VMEDSEDDMVFGLFD

AT5G47700.1 60S acidic ribosomal protein family4.0e-1950.43Show/hide
Query:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVE-KKEE
        MST  ELAC+YA +IL D+     A+KI+TLV  A +T+ESYWP LFAK+A  RN+ DLI+N+G  A     A  + +  ++ G AA AAPA  E KK+E
Subjt:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVE-KKEE

Query:  VMEDSEDDMVFGLFD
          E+S+ D+ FGLFD
Subjt:  VMEDSEDDMVFGLFD

AT5G47700.2 60S acidic ribosomal protein family4.0e-1950.43Show/hide
Query:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVE-KKEE
        MST  ELAC+YA +IL D+     A+KI+TLV  A +T+ESYWP LFAK+A  RN+ DLI+N+G  A     A  + +  ++ G AA AAPA  E KK+E
Subjt:  MST-SELACTYAALILHDD-----AEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVE-KKEE

Query:  VMEDSEDDMVFGLFD
          E+S+ D+ FGLFD
Subjt:  VMEDSEDDMVFGLFD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAACCAGTGAACTCGCTTGCACCTACGCCGCCTTGATTCTTCATGACGACGCCGAGAAGATTTCCACATTGGTGAACGTTGCCCGCATTACCGTCGAATCATACTG
GCCCTCTCTTTTCGCTAAGTTGGCCGTCGATAGGAACATCAATGATCTCATTCTCAACCTCGGATCTGCTGCTGCTTCCACCGCTGCGGCTTCTCATTCACTCTCCATCG
CATCTTCTGCCGGTAATGCCGCTGTTGCCGCTCCTGCTCTCGTCGAAAAGAAGGAAGAGGTCATGGAAGACAGCGAGGATGACATGGTCTTCGGCTTGTTTGATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAACCAGTGAACTCGCTTGCACCTACGCCGCCTTGATTCTTCATGACGACGCCGAGAAGATTTCCACATTGGTGAACGTTGCCCGCATTACCGTCGAATCATACTG
GCCCTCTCTTTTCGCTAAGTTGGCCGTCGATAGGAACATCAATGATCTCATTCTCAACCTCGGATCTGCTGCTGCTTCCACCGCTGCGGCTTCTCATTCACTCTCCATCG
CATCTTCTGCCGGTAATGCCGCTGTTGCCGCTCCTGCTCTCGTCGAAAAGAAGGAAGAGGTCATGGAAGACAGCGAGGATGACATGGTCTTCGGCTTGTTTGATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSTSELACTYAALILHDDAEKISTLVNVARITVESYWPSLFAKLAVDRNINDLILNLGSAAASTAAASHSLSIASSAGNAAVAAPALVEKKEEVMEDSEDDMVFGLFD