; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0019564 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0019564
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionprotodermal factor 1-like
Genome locationchr11:9323534..9325861
RNA-Seq ExpressionPI0019564
SyntenyPI0019564
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039923 - Protodermal factor 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143175.1 protodermal factor 1 [Cucumis sativus]4.7e-11893.85Show/hide
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XP_008456355.1 PREDICTED: protodermal factor 1-like [Cucumis melo]2.1e-11895.49Show/hide
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XP_022947015.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita moschata]3.5e-10585.08Show/hide
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XP_022970795.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita maxima]4.1e-10684.46Show/hide
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XP_038900371.1 protodermal factor 1-like [Benincasa hispida]9.4e-11190.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF76 Uncharacterized protein2.3e-11893.85Show/hide
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A0A1S3C4A9 protodermal factor 1-like1.0e-11895.49Show/hide
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A0A5A7UHX0 Protodermal factor 1-like1.0e-11895.49Show/hide
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A0A6J1G5M6 protodermal factor 1-like1.7e-10585.08Show/hide
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A0A6J1I3W1 protodermal factor 1-like2.0e-10684.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9S728 Protodermal factor 13.8e-4647Show/hide
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        ++ L A LLSQ L   V S    D K+YY SPP      P S +PPS + GS            P PPSH                           N G
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Query:  TP--------HYSTPTPSTPSNPPSGGGGYYNPPSSGG----SPPSTPVDPGTPSTPSTPSVP-STPSTPSTPTIPTTPF-----TCNYWLNHPGLIWGV
        +P        H STP+  TPS+PPS  GGYY+ P        +PPS  VDPGTP    +P  P   P TP TP IP  PF     TC+YW NHP LIWG+
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        LGWWGT+G AFG     +++PGF  ++NLLQALSNTR+D  GAL REGTAS+LNS+ +++FP+TT QVR  FV+ L+SNKAA  QA+TFKLANEG++KPR
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42840.1 protodermal factor 12.7e-4747Show/hide
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        ++ L A LLSQ L   V S    D K+YY SPP      P S +PPS + GS            P PPSH                           N G
Subjt:  LFTLLAGLLSQSLLIPVLSTSIADQKSYY-SPPD-----PHSGSPPSGSHGS------------PIPPSHG--------------------------NGG

Query:  TP--------HYSTPTPSTPSNPPSGGGGYYNPPSSGG----SPPSTPVDPGTPSTPSTPSVP-STPSTPSTPTIPTTPF-----TCNYWLNHPGLIWGV
        +P        H STP+  TPS+PPS  GGYY+ P        +PPS  VDPGTP    +P  P   P TP TP IP  PF     TC+YW NHP LIWG+
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        LGWWGT+G AFG     +++PGF  ++NLLQALSNTR+D  GAL REGTAS+LNS+ +++FP+TT QVR  FV+ L+SNKAA  QA+TFKLANEG++KPR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAAGCAAACAAGCTCCTGCTCTCCTTTTCACTTTGCTTGCTGGGCTGCTTTCTCAAAGCCTACTCATCCCTGTATTGTCCACCTCCATTGCTGATCAGAAAAGCTA
CTACTCTCCTCCAGACCCACATTCTGGATCTCCCCCATCAGGTTCACATGGCAGCCCTATCCCACCATCACATGGTAATGGAGGAACGCCACATTACTCCACACCAACTC
CTTCCACACCGTCAAATCCGCCGTCTGGTGGTGGTGGATACTACAACCCTCCGTCTTCTGGTGGTAGCCCACCAAGCACCCCTGTAGATCCAGGCACTCCTAGCACTCCA
AGCACTCCTAGTGTTCCTAGCACACCAAGCACACCAAGCACACCTACCATTCCCACTACTCCATTTACCTGCAATTATTGGCTGAATCATCCAGGATTGATATGGGGAGT
ATTGGGATGGTGGGGAACATTAGGAAATGCCTTCGGAGCAACCAATGTTCCAGGGTTTGGAACAAATCTGAACTTGCTCCAAGCACTTTCTAACACAAGGAATGATGGGT
ATGGGGCCCTTTTGAGAGAAGGAACTGCTTCGTACCTCAACTCTCTTGCTAGTAACAGATTCCCCTACACAACCAAGCAAGTTAGGACAAGTTTCGTCTCGGCACTCAAC
TCCAACAAAGCAGCAGCTGATCAGGCCAACACGTTCAAGTTAGCCAACGAGGGCAAAATTAAACCCAGAGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAAATATATGGACCAAAATGAATCAAAGTTGGAAAAATAAGGACCAAAATAATCATTCTGAAAATATATACAAAAATGAACCAGAACCAAAATGGACCAGAGTAGCATC
ACAATTTTGAATTATATATCATAATAGCTATACTATGGAGACTATATCTAATAAATTTATCAGGAGAAGTGAGAGGTTCAAAATTTCATAGGCATGCATGTGATTTCACC
TCCCTCCCCAATGAATTCATCCCTGGAAAATCTGAACATTATTTGAAACAATTAAAAGCAGCAAGCAATATGAATAAATGCACCAATAAAACAGCAACTAACCACATACT
CTCCACCTGTAAGAAGTAACTTCACTTTCCCTCAACCCCCCCTTCTATATATTCCCCCATTTGTTCTAAACATTCCATCCATCACCATTCCCATTCCTTCCCTTCTTTCC
CATCTCTAATCCCTTTGCTCCCCCAATCAGAAAAACAGCCAACCGAAGAAACAACCATGAGAAGCAAACAAGCTCCTGCTCTCCTTTTCACTTTGCTTGCTGGGCTGCTT
TCTCAAAGCCTACTCATCCCTGTATTGTCCACCTCCATTGCTGATCAGAAAAGCTACTACTCTCCTCCAGACCCACATTCTGGATCTCCCCCATCAGGTTCACATGGCAG
CCCTATCCCACCATCACATGGTAATGGAGGAACGCCACATTACTCCACACCAACTCCTTCCACACCGTCAAATCCGCCGTCTGGTGGTGGTGGATACTACAACCCTCCGT
CTTCTGGTGGTAGCCCACCAAGCACCCCTGTAGATCCAGGCACTCCTAGCACTCCAAGCACTCCTAGTGTTCCTAGCACACCAAGCACACCAAGCACACCTACCATTCCC
ACTACTCCATTTACCTGCAATTATTGGCTGAATCATCCAGGATTGATATGGGGAGTATTGGGATGGTGGGGAACATTAGGAAATGCCTTCGGAGCAACCAATGTTCCAGG
GTTTGGAACAAATCTGAACTTGCTCCAAGCACTTTCTAACACAAGGAATGATGGGTATGGGGCCCTTTTGAGAGAAGGAACTGCTTCGTACCTCAACTCTCTTGCTAGTA
ACAGATTCCCCTACACAACCAAGCAAGTTAGGACAAGTTTCGTCTCGGCACTCAACTCCAACAAAGCAGCAGCTGATCAGGCCAACACGTTCAAGTTAGCCAACGAGGGC
AAAATTAAACCCAGAGCTTGATTTCCCCCCTTTTTCCTACCATTTACCATCTTAATAACTAATGAGTGTGCCTTAGCAGTTAGTAGTGAGACAGTGAGACCAATTTACCA
TTGCATGTGTTGTTTTGTTTTATTTTGTTCTTGTTTCTAGTTTCTTGCAATCTCTTTTGTTCATGTATTTGAACATAGAGATGCTCGTCTTTGTTATCCAAATTCATTGT
GAAATCAAGATTTGTTTCAAGTAGTTATATTTGTTTAATCAGATTATCCAAAAGGGGGTTGAAAATTAAAAGTTCAGATGCTTGTTATCTACACTAATCTATAGTTTCTA
TCACTATGCTTTAAAAGGGTAGCAAAATCCATGAAGTGTTGTATTTATGGCGCATTAATGAGGAAATCCACTACATTCAATAAGGTTAACCTACAAAAGAACAAACAACT
TGGGATGCCCTTGGGTTGAATTTAATGACCAGAGCTTGATTTTGTGAACAGTATAAATGCTAAATCTCAAATATCAACGGTGCAAAAAGAAGACATAATAGAGTAAGTGC
AGTAAACAAACTCATATAGATGGAAGAAGCCAACAGCCATAAGGAAACGTCCGGTCCGGTGCTCTGAGAAGGTGGGTCCGCTAGTTAAGAACTCCCATTAAGCCAACCAC
CCAAGATATTTTACCTTGAAAAACAGCAGGAAAAGTAATAATAGGAACATAAACTCATGTCTTTAACAAAAAGTTCAGTTGTTCATAGCCATAAATTTAGCCTGATAATC
TTCTCACACCAATGGAGATTCTATTGTTCCTTGGATGGAAGAACAATATGACAGTATTTCAAATTAAGTACCAAACAACATTTCACATTGAAGATTAGATTGTAGACCAC
CAAGCACCAGCCAGAACAACAAAATGGGAGTTGAAATTTATCATTTATTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRSKQAPALLFTLLAGLLSQSLLIPVLSTSIADQKSYYSPPDPHSGSPPSGSHGSPIPPSHGNGGTPHYSTPTPSTPSNPPSGGGGYYNPPSSGGSPPSTPVDPGTPSTP
STPSVPSTPSTPSTPTIPTTPFTCNYWLNHPGLIWGVLGWWGTLGNAFGATNVPGFGTNLNLLQALSNTRNDGYGALLREGTASYLNSLASNRFPYTTKQVRTSFVSALN
SNKAAADQANTFKLANEGKIKPRA