; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0019643 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0019643
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationchr01:24770868..24771206
RNA-Seq ExpressionPI0019643
SyntenyPI0019643
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008451660.1 PREDICTED: rapid alkalinization factor-like [Cucumis melo]5.9e-5293.75Show/hide
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XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]2.7e-5292.86Show/hide
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XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]1.4e-4580.51Show/hide
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XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]3.0e-4377.97Show/hide
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XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]3.3e-5088.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein1.3e-5292.86Show/hide
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A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like2.9e-5293.75Show/hide
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A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like2.9e-5293.75Show/hide
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A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 336.9e-4680.51Show/hide
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A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like1.4e-4377.97Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 336.9e-2756.48Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor4.4e-2655.05Show/hide
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        L + +L+    +S  A   S    WV+   +   C GS+ EC+ E+ EFE+DSE NRRILA   YISY AL+ N++PCSRRGASYYNC+PGA+ANPY RG
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        C+AI+RCRS
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 237.9e-2350Show/hide
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        +  I L++A+    + VSS +   +         C G++AEC +        D+         EFEMDSEINRRILA   YISY ALR NTIPCSRRGAS
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        YYNC+ GA+ANPY RGC+AI+RCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 224.2e-2453.57Show/hide
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        I+ ++AIL   +S+   T  +   LD  RA        C GS+AEC+ E+ E E DS+I+RRILA   YISY A+R N++PCSRRGASYYNCQ GA+ANP
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Q9SRY3 Protein RALF-like 18.4e-2553.04Show/hide
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        +FL + IL V   +  P            +W   G   + CHGS+AEC+  + E EMDSEINRRILA   YISY +L+ N++PCSRRGASYYNCQ GA+A
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        NPY RGC+ I+RCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 16.0e-2653.04Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 194.3e-1642.99Show/hide
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        C+ I+ C
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AT3G05490.1 ralf-like 223.0e-2553.57Show/hide
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        I+ ++AIL   +S+   T  +   LD  RA        C GS+AEC+ E+ E E DS+I+RRILA   YISY A+R N++PCSRRGASYYNCQ GA+ANP
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 235.6e-2450Show/hide
Query:  LLPIFLLVAI----LTVSSTAKTPSWVLDGARARCHGSMAECMME-------DI---------EFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANTIPCSRRGAS
        +  I L++A+    + VSS +   +         C G++AEC +        D+         EFEMDSEINRRILA   YISY ALR NTIPCSRRGAS
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Query:  YYNCQPGAEANPYDRGCNAISRCR
        YYNC+ GA+ANPY RGC+AI+RCR
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AT4G15800.1 ralf-like 334.9e-2856.48Show/hide
Query:  PIFLLVAILTV----SSTAKTPSWVLDGARARCHGSMAECMME--DIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANTIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRG
        P+ +++AILTV    ++     S       ++C+G++AEC +   + EFEMDSEINRRILA   YISY ALR NT+PCSRRGASYYNC+ GA+ANPY RG
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Query:  CNAISRCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCCAAGGTTTCTTTTCTTCTTCCAATTTTCTTACTAGTTGCTATCCTGACGGTCTCCTCCACCGCCAAGACCCCGAGCTGGGTCCTAGATGGAGCACGTGCTCG
TTGTCACGGATCCATGGCAGAGTGCATGATGGAAGATATTGAATTTGAGATGGACTCCGAGATCAACAGACGCATATTGGCAGATTTAAACTACATAAGCTATGACGCAC
TGAGGGCCAACACGATTCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGTCAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCCCTACGACCGTGGCTGTAATGCTATTTCTCGTTGT
CGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGCCAAGGTTTCTTTTCTTCTTCCAATTTTCTTACTAGTTGCTATCCTGACGGTCTCCTCCACCGCCAAGACCCCGAGCTGGGTCCTAGATGGAGCACGTGCTCG
TTGTCACGGATCCATGGCAGAGTGCATGATGGAAGATATTGAATTTGAGATGGACTCCGAGATCAACAGACGCATATTGGCAGATTTAAACTACATAAGCTATGACGCAC
TGAGGGCCAACACGATTCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGTCAGCCAGGTGCCGAGGCAAACCCCTACGACCGTGGCTGTAATGCTATTTCTCGTTGT
CGAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKVSFLLPIFLLVAILTVSSTAKTPSWVLDGARARCHGSMAECMMEDIEFEMDSEINRRILADLNYISYDALRANTIPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCNAISRC
RS