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PI0019721 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0019721
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionserine-rich protein-related
Genome locationchr06:26978376..26980009
RNA-Seq ExpressionPI0019721
SyntenyPI0019721
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN55991.1 hypothetical protein Csa_011649 [Cucumis sativus]7.9e-1865.06Show/hide
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        KT +SK  A+ E + ++LKK  NLL+SPTALSR +     KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRS++++RGGSVGSNLSDL + S+
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KYP49765.1 hypothetical protein KK1_028449 [Cajanus cajan]3.4e-1351.55Show/hide
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        ME +VE K    K+   PE D+E LKK  ++L+SPT+ S   K+     NCLCSPTTH+GSFRCR HRS+ M RG S+GSNL+ L   +  S SDS+
Subjt:  MEGRVEGKTESSKMGALPEYDMEELKKTPNLLLSPTALSRFSKS-----NCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLARNSDDSASDSV

TYK19387.1 putative PGPS/D10 protein [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-1765.06Show/hide
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        KT +SK  A+ E + ++LKK  +LL+SPTALSR +     KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRS+AM+RG SVGSNLSDL + S+
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XP_020232817.1 uncharacterized protein LOC109813106 [Cajanus cajan]3.4e-1351.55Show/hide
Query:  MEGRVEGKTESSKMGALPEYDMEELKKTPNLLLSPTALSRFSKS-----NCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLARNSDDSASDSV
        ME +VE K    K+   PE D+E LKK  ++L+SPT+ S   K+     NCLCSPTTH+GSFRCR HRS+ M RG S+GSNL+ L   +  S SDS+
Subjt:  MEGRVEGKTESSKMGALPEYDMEELKKTPNLLLSPTALSRFSKS-----NCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLARNSDDSASDSV

XP_022143490.1 uncharacterized protein LOC111013367 [Momordica charantia]2.4e-1971.08Show/hide
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        KT ++K  ALPE D++ELKK+  NL++SPTALSR S     KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRS+A++RGGSVGSNLSDLA+ S
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3W3 Uncharacterized protein2.2e-1358.11Show/hide
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        A  + ++E+LK+ P +L+SP+  S         +K+NCLCSPTTHIGSFRCR HR S M RGGSVGSNLSDL R
Subjt:  ALPEYDMEELKKTPNLLLSPTALSRF-------SKSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLAR

A0A0A0L7C7 Uncharacterized protein3.8e-1865.06Show/hide
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        KT +SK  A+ E + ++LKK  NLL+SPTALSR +     KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRS++++RGGSVGSNLSDL + S+
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A0A151S4K4 Uncharacterized protein1.7e-1351.55Show/hide
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        ME +VE K    K+   PE D+E LKK  ++L+SPT+ S   K+     NCLCSPTTH+GSFRCR HRS+ M RG S+GSNL+ L   +  S SDS+
Subjt:  MEGRVEGKTESSKMGALPEYDMEELKKTPNLLLSPTALSRFSKS-----NCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLARNSDDSASDSV

A0A5D3D753 Putative PGPS/D10 protein1.1e-1765.06Show/hide
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        KT +SK  A+ E + ++LKK  +LL+SPTALSR +     KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRS+AM+RG SVGSNLSDL + S+
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A0A6J1CNY2 uncharacterized protein LOC1110133671.2e-1971.08Show/hide
Query:  KTESSKMGALPEYDMEELKKTP-NLLLSPTALSRFS-----KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLARNS
        KT ++K  ALPE D++ELKK+  NL++SPTALSR S     KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRS+A++RGGSVGSNLSDLA+ S
Subjt:  KTESSKMGALPEYDMEELKKTP-NLLLSPTALSRFS-----KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLARNS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein2.8e-0553.06Show/hide
Query:  SKSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSV-GSNLSDLARNSDDSAS
        +K+NCLCSPTTH GSFRCR HRS ++ R  S+  ++L D      DS S
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AT1G67910.2 unknown protein2.8e-0553.06Show/hide
Query:  SKSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSV-GSNLSDLARNSDDSAS
        +K+NCLCSPTTH GSFRCR HRS ++ R  S+  ++L D      DS S
Subjt:  SKSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSV-GSNLSDLARNSDDSAS

AT3G13227.1 serine-rich protein-related3.0e-0760.42Show/hide
Query:  KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSA---MTRGGSVGSNLSDLARNSDDS
        + NCLC+PTTH GSFRCR HR +A   M+RG SV SNLS LA    +S
Subjt:  KSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSA---MTRGGSVGSNLSDLARNSDDS

AT3G56500.1 serine-rich protein-related4.8e-0555.88Show/hide
Query:  SRFSKSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGS
        +R  K+ C+C+PT H GSFRCR HRSSA + G +
Subjt:  SRFSKSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGS

AT5G55980.1 serine-rich protein-related4.9e-1047.69Show/hide
Query:  TPNLLLSPTALSRFSKSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLARNSDDSASDSV
        +P+L    ++  + ++ NCLCSPTTH GSFRCR HR  ++TR GS+GSNL+ L  +     SDS+
Subjt:  TPNLLLSPTALSRFSKSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLARNSDDSASDSV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGGAAGAGTGGAGGGGAAAACTGAGAGTTCAAAAATGGGAGCATTGCCGGAATACGACATGGAAGAGCTAAAGAAAACGCCAAATTTATTGCTCTCACCCACAGC
TTTATCTCGCTTCTCAAAATCCAATTGTTTGTGTTCTCCTACCACTCACATTGGTTCTTTTCGATGTCGCCGTCACCGGAGCTCTGCCATGACTCGTGGTGGCTCCGTCG
GCTCCAACCTCTCTGATTTGGCTCGCAACTCCGACGACTCTGCCAGTGACTCGGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAATATGAACAAAAATTAAGAATATCTTGCTTTTCATACCCTCTCTCTCTCATTTGGTAGAGACGCAGGGTTCCAGTCTTCTCCCTAAACACAAGCTAAGATAAATG
GAGGGAAGAGTGGAGGGGAAAACTGAGAGTTCAAAAATGGGAGCATTGCCGGAATACGACATGGAAGAGCTAAAGAAAACGCCAAATTTATTGCTCTCACCCACAGCTTT
ATCTCGCTTCTCAAAATCCAATTGTTTGTGTTCTCCTACCACTCACATTGGTTCTTTTCGATGTCGCCGTCACCGGAGCTCTGCCATGACTCGTGGTGGCTCCGTCGGCT
CCAACCTCTCTGATTTGGCTCGCAACTCCGACGACTCTGCCAGTGACTCGGTTTGAGGTTTCAAATTCAATCATTTTACTAAAAACCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTCTTGTAACCTTATAGGGAAAATTAAAGCTTACAATGAATTCTATTGCTGTGTTCATTTTATAAAACCATGTAATAGCTATTAACTTTATTTTGAATTTACTTT
GTTTGATAATTATATTTAATGTTCGAGAAATCATACGAATCGTTGTAAAGAGGTAAGGATCTTTACCTTTAACTTCTTACTCGTTGATAATGTTTTGGTGAAAATATAAG
TAATTTGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGRVEGKTESSKMGALPEYDMEELKKTPNLLLSPTALSRFSKSNCLCSPTTHIGSFRCRRHRSSAMTRGGSVGSNLSDLARNSDDSASDSV