; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0019837 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0019837
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationchr07:6439154..6441131
RNA-Seq ExpressionPI0019837
SyntenyPI0019837
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0062958.1 putative serine-rich protein [Cucumis melo var. makuwa]3.9e-22793.38Show/hide
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XP_004147758.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucumis sativus]3.2e-21391.96Show/hide
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XP_008451820.1 PREDICTED: uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucumis melo]4.6e-22893.99Show/hide
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XP_023551901.1 uncharacterized protein LOC111809733 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.4e-20586.48Show/hide
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XP_038878848.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]1.4e-22192.42Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXH6 Uncharacterized protein1.6e-21391.96Show/hide
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A0A1S3BT64 uncharacterized serine-rich protein C215.132.2e-22893.99Show/hide
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A0A5A7V5R8 Putative serine-rich protein1.9e-22793.38Show/hide
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A0A5D3CZJ6 Putative serine-rich protein2.2e-22893.99Show/hide
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A0A6J1ETX7 homeobox protein prospero-like5.5e-20385.84Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSSDNFLDCSSSVPCHSYGWLSPRVSFSR----DDSPPSNLLGPLSKTK----PAGESETRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADEL
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        F DGKLVPLQVSSVKPSVNGLKSTRC SSPET VQ+RRRVE+EC+TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNG  N NG AKNENHKTTTTSSSS
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Query:  YFSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKSR
        YFSEANSKALKYFLHR+SKSSL+SS DSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPN NPISLHRNPNHNNPPRMRLVK R
Subjt:  YFSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKSR

Query:  PKSESNPRSTSTADHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRL-GMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVL
        PKSE+NPRSTST DHHP+ATRVGRSP+RRTPG+  SSSSRL G+RGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPS+FNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVL
Subjt:  PKSESNPRSTSTADHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRL-GMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVL

Query:  NVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSSRNHQNGSSNSSNSNRTTTRRIMDTEGGGKIH
        NVPVCSSLRGSSKS SVFGFGP LFTGTGG     R+HQ+ SS+SS++NRTTTRRI +T+GGGK+H
Subjt:  NVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSSRNHQNGSSNSSNSNRTTTRRIMDTEGGGKIH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein3.7e-6645.73Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSSDNFLDCSSSVPCHSYGWLSPRVSFSRDDSPPSNLLGPLSKTKPAGESETRDPDPELV-PVSEFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGKLV
        MASACV + G+S + F          SYGW SPR+S +RDD+  S+ +          + +  DP PE+  PV +FEF L+DPV+ ML ADELF DGKLV
Subjt:  MASACVNNVGMSSDNFLDCSSSVPCHSYGWLSPRVSFSRDDSPPSNLLGPLSKTKPAGESETRDPDPELV-PVSEFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGKLV

Query:  PLQVSSVKPSVN------GLKSTRCGSSPETTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSSYFS
        PL+ S  K +           +T    SPE  ++S RR+E E S    LFSPKAPRC++RWRELLGLK+L  +            E  ++   SSSS  +
Subjt:  PLQVSSVKPSVN------GLKSTRCGSSPETTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSSYFS

Query:  EANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN-NPPRMRLVKSR
           + + K FLHR SKSS      ++ S PL K+SD SES+S++SSR+SL SSSSS HE +DL RLSLD + KP+ NP +  R  + N N PR+RL K R
Subjt:  EANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN-NPPRMRLVKSR

Query:  PKSESNPRSTSTADHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTP
            ++P ST + D                   SSSSS+ +  RG++V  DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP SF GGP+ K + GM RSYSANVR+TP
Subjt:  PKSESNPRSTSTADHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTP

Query:  VLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSSRNHQNGSSNSSNSNRTTTRR
        VLNVPVC     S KS   FG    LF+ +  SSSSS +  N S   SN ++    R
Subjt:  VLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSSRNHQNGSSNSSNSNRTTTRR

AT1G79060.1 unknown protein3.3e-7548.83Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSSDNFLDCSSSVPCHSYGWLSPRVSFSRDDSPPSNLLGPLSKTKPAGESETRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGKLVP
        MAS CVNNV +S D            +YG  +PR SFSRDD   S+  G ++   P  E+         V   +FEFRL++    MLPADELF DGKLV 
Subjt:  MASACVNNVGMSSDNFLDCSSSVPCHSYGWLSPRVSFSRDDSPPSNLLGPLSKTKPAGESETRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGKLVP

Query:  LQVSSVKPSVNGLKSTRCGSSPETTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSSYFSEANSKAL
         Q       + G    +C             +E     D   FSPKAPRCSSRWR+LLGLK+  Q+SS        K+ +  TTTT++      +++ +L
Subjt:  LQVSSVKPSVNGLKSTRCGSSPETTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSSYFSEANSKAL

Query:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN--------------NPPRM
        K FLHRSS+SS SSS D+SL  SLPLLKDSDSESVS+SSSR+SLSSSSSGH+HEDL RLSLD E +PN N I    N NHN              NPPRM
Subjt:  KYFLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHN--------------NPPRM

Query:  RLVKSRPKSESNPRSTSTADHHPSAT---RVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKNRGMERSYS
        RLV                +H  S T   RVGRSP+RR+ GE+S+  +    RGVSVDSPR+NSSGKIVF NLERSSSSPSSFNGG   +++RGMERSYS
Subjt:  RLVKSRPKSESNPRSTSTADHHPSAT---RVGRSPIRRTPGESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKNRGMERSYS

Query:  ANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSSRNHQNGSSNSSNSN------RTTTRRI
        +NVRVTPVLNVPVC S+RG S    VFG     F  +  SSSSS+N++ G++N++ ++      R +T RI
Subjt:  ANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSSRNHQNGSSNSSNSN------RTTTRRI

AT3G12970.1 unknown protein4.1e-5743.48Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSSDNFLDCSSSVPCHSYGWLSPRVSFSRDDSPPSNLLGPLSKTKPAGESETRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGKLVP
        MAS CV NVG S           P HS  W S ++S +R+  P            PA E+E         PV +FEF L+DPV+ ML ADELF DGKLVP
Subjt:  MASACVNNVGMSSDNFLDCSSSVPCHSYGWLSPRVSFSRDDSPPSNLLGPLSKTKPAGESETRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGKLVP

Query:  LQVSSVK-PSVNGLKSTRCGSSPETTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSSYFSEANS
        L+ S V  P    + S        T V+  RR+E E S   DPYLFSP+APRC+ RWRELLGLK+L            AK +   + ++SS    S  N 
Subjt:  LQVSSVK-PSVNGLKSTRCGSSPETTVQSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSSYFSEANS

Query:  K--ALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNT-NPISLHRNPNHNNPPRMRLVKSR
        K  + ++FL+RSSKS+           P  KDSD   S S S+SSSR+SL SSSSSGHE +DL RLSLD +NKP T NP +  R  +H            
Subjt:  K--ALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNT-NPISLHRNPNHNNPPRMRLVKSR

Query:  PKSESNPRSTSTADHHPSATRVGRSPIRRTP-GESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPV
                      HH       R P R T   ES+ SS    +  V+ DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP +F GGP+ K + GM RS+SANVR+TPV
Subjt:  PKSESNPRSTSTADHHPSATRVGRSPIRRTP-GESSSSSSRLGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-NRGMERSYSANVRVTPV

Query:  LNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSSRNHQNGSSNSSNSNRTTTRRIMDT
        LNVPV SSLR   KS  +F FG L  + +  SSSSS  ++    +++  NRT   R+  T
Subjt:  LNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSSRNHQNGSSNSSNSNRTTTRRIMDT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCATGCGTTAACAATGTCGGAATGTCGTCGGATAATTTCCTCGACTGCTCTTCTTCTGTTCCATGTCATTCCTATGGTTGGCTTAGCCCTCGCGTCTCCTT
CAGCCGTGATGACTCCCCTCCTTCTAACCTCCTCGGACCTTTATCTAAGACTAAACCTGCTGGGGAGTCTGAGACTCGAGATCCGGATCCTGAACTGGTTCCAGTTAGTG
AGTTCGAGTTCCGTCTTCAAGATCCCGTCTCCTTGATGCTCCCTGCAGATGAGCTATTTTTTGATGGGAAACTCGTGCCGCTTCAGGTCTCTTCTGTTAAACCCTCAGTC
AACGGTTTGAAGTCCACAAGGTGCGGTTCGTCGCCAGAGACTACGGTTCAGTCCCGTCGGAGAGTGGAGGAAGAATGCAGTACGGATCCGTATCTTTTTTCTCCTAAAGC
ACCGCGGTGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTAGGCCTCAAAAAGCTGTACCAGAGTAGCAGCAATGGCAATGGCAATGGCGGCGCTAAAAACGAAAACCACAAAACGA
CGACGACGTCTTCGTCGTCTTACTTCTCGGAAGCTAATTCGAAGGCTCTGAAGTACTTCCTTCACCGGAGTTCGAAATCGTCGTTGTCATCCTCGTTGGATTCGTCGCTG
AGCCTTCCATTACTTAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTCACTATCTTCTTCTCGTGTATCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGGTCACGAACACGAAGATCTTCACAGACT
GTCACTCGATTGCGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTTCCCTCCATAGGAACCCTAATCACAACAATCCACCGCGGATGAGACTGGTGAAATCGAGGCCTAAATCGG
AAAGCAATCCAAGATCAACTTCAACAGCAGATCATCATCCATCGGCGACAAGAGTAGGGAGAAGCCCGATACGGCGTACGCCTGGAGAATCATCGTCATCCTCCAGTAGA
TTAGGGATGCGAGGAGTATCCGTAGATAGTCCACGAATGAACTCGTCAGGTAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCAAGCAGTCCAAGCAGCTTCAATGGCGG
ACCAAAATTCAAAAACAGAGGAATGGAACGGTCATACTCTGCTAACGTGAGAGTAACTCCAGTCCTAAACGTTCCAGTTTGTTCTTCCTTAAGAGGATCCTCAAAATCCG
TCTCTGTATTCGGATTCGGACCATTATTATTCACCGGCACCGGCGGAAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACCACCAGAATGGCAGCAGCAACAGTAGTAATAGTAACCGGACG
ACGACGCGACGGATCATGGATACCGAGGGCGGAGGGAAAATCCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAAAGGCCAACTCATCATCTCTTCAAACCCTAACTCTCTCTCTCCTCCAGATCTCGCCGGATATTCAGCCGATGTGATTTCCGCCATAGACGTTGACCAACTCCGGCGT
CACTTTCTTCCTCATTTCCCCCCATCACCGGACTTTCATTTCACCTTCGCATGATCGCCGCCGCTATCCATGGCTTCCGCATGCGTTAACAATGTCGGAATGTCGTCGGA
TAATTTCCTCGACTGCTCTTCTTCTGTTCCATGTCATTCCTATGGTTGGCTTAGCCCTCGCGTCTCCTTCAGCCGTGATGACTCCCCTCCTTCTAACCTCCTCGGACCTT
TATCTAAGACTAAACCTGCTGGGGAGTCTGAGACTCGAGATCCGGATCCTGAACTGGTTCCAGTTAGTGAGTTCGAGTTCCGTCTTCAAGATCCCGTCTCCTTGATGCTC
CCTGCAGATGAGCTATTTTTTGATGGGAAACTCGTGCCGCTTCAGGTCTCTTCTGTTAAACCCTCAGTCAACGGTTTGAAGTCCACAAGGTGCGGTTCGTCGCCAGAGAC
TACGGTTCAGTCCCGTCGGAGAGTGGAGGAAGAATGCAGTACGGATCCGTATCTTTTTTCTCCTAAAGCACCGCGGTGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTAGGCCTCA
AAAAGCTGTACCAGAGTAGCAGCAATGGCAATGGCAATGGCGGCGCTAAAAACGAAAACCACAAAACGACGACGACGTCTTCGTCGTCTTACTTCTCGGAAGCTAATTCG
AAGGCTCTGAAGTACTTCCTTCACCGGAGTTCGAAATCGTCGTTGTCATCCTCGTTGGATTCGTCGCTGAGCCTTCCATTACTTAAGGATTCCGATAGTGAGTCTGTTTC
ACTATCTTCTTCTCGTGTATCTCTTTCCTCTTCTTCCTCAGGTCACGAACACGAAGATCTTCACAGACTGTCACTCGATTGCGAAAATAAGCCAAACACGAATCCGATTT
CCCTCCATAGGAACCCTAATCACAACAATCCACCGCGGATGAGACTGGTGAAATCGAGGCCTAAATCGGAAAGCAATCCAAGATCAACTTCAACAGCAGATCATCATCCA
TCGGCGACAAGAGTAGGGAGAAGCCCGATACGGCGTACGCCTGGAGAATCATCGTCATCCTCCAGTAGATTAGGGATGCGAGGAGTATCCGTAGATAGTCCACGAATGAA
CTCGTCAGGTAAAATCGTGTTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCAAGCAGTCCAAGCAGCTTCAATGGCGGACCAAAATTCAAAAACAGAGGAATGGAACGGTCATACTCTG
CTAACGTGAGAGTAACTCCAGTCCTAAACGTTCCAGTTTGTTCTTCCTTAAGAGGATCCTCAAAATCCGTCTCTGTATTCGGATTCGGACCATTATTATTCACCGGCACC
GGCGGAAGCAGCAGCAGCAGCAGAAACCACCAGAATGGCAGCAGCAACAGTAGTAATAGTAACCGGACGACGACGCGACGGATCATGGATACCGAGGGCGGAGGGAAAAT
CCATTGATGAGAGATTAGAAGAAAAGGGTTTTCTAATTTTGGGTAACACTAACCAAACCCCGTTTTTTTCCATTTTGCTCTCAATGTTTTAGCATTATACTGAAATTTCC
CCCTTTGTGATAGACGGATTTGGTTTCAATTTGCTAATTCTTAACACAAAAACAGGCATCATAATCATCATAATCATCATCATCATCATCATCATCGTGTATTATGTAAA
TACGGCAGGGGAATTTTTGTTTTTTGTTTTTAAAATTTTAGTTAATCTGGTTGATCTAATTAATCTCTTCACCATTTTGAATTCTGTGTTTGATGATCATGAATGGGATC
CAAATTTAGTATTTGTAGTGAAAAACAATCCCACACCCCCACCTGAGAGGAAGAAAAGAGAGATGGTGATTGAGAATTTTGTTTTTTCGCTGTTCCATCCAAAAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASACVNNVGMSSDNFLDCSSSVPCHSYGWLSPRVSFSRDDSPPSNLLGPLSKTKPAGESETRDPDPELVPVSEFEFRLQDPVSLMLPADELFFDGKLVPLQVSSVKPSV
NGLKSTRCGSSPETTVQSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKLYQSSSNGNGNGGAKNENHKTTTTSSSSYFSEANSKALKYFLHRSSKSSLSSSLDSSL
SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCENKPNTNPISLHRNPNHNNPPRMRLVKSRPKSESNPRSTSTADHHPSATRVGRSPIRRTPGESSSSSSR
LGMRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKNRGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSVSVFGFGPLLFTGTGGSSSSSRNHQNGSSNSSNSNRT
TTRRIMDTEGGGKIH