; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0019984 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0019984
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionTransaldolase
Genome locationchr09:2959734..2963919
RNA-Seq ExpressionPI0019984
SyntenyPI0019984
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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InterPro domainsIPR001585 - Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
IPR004730 - Transaldolase type 1
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039687.1 transaldolase [Cucumis melo var. makuwa]9.8e-22298.02Show/hide
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A0A6J1H061 Transaldolase2.7e-20189.63Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6VLW0 Transaldolase7.4e-4734.45Show/hide
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        DAR++YD  G I K   ++ LYNE  V  +R+L K+ +TWQGI A+ +LE EGI  +LT ++S AQA A A+AG  +I  FVGR+ DW + +S   E   
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Query:  ALKRGEDPGLALVTKAYNYIHKYGHRSKLTAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDDKYSFIRKLSPQSAANYIFTEDEVKKWDQLSLA
        A    EDPG+  VT+ YNY  +YG+++ +  A+ RN  ++  L G D +     +L+ L+E+      K  +  ++  + A     TE E   W+     
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Query:  SGMGPAALQLLANGLEGYADQTKRVEEL
            P A++ LA G+  +A   +++E +
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B0UV30 Transaldolase1.6e-4936.83Show/hide
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        +T++LDA+ + + +V DT   D  +++ P  AT + SL+L    LP   +   +D A+A ++    D  +       +K  VN+G ++ K+VPGR+STEV
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        DAR++YDT   + K   L+ LYNE  +  +R+L KI +TWQGI A+ +LE EGI  +LT ++S AQA A A+AG  +I  FVGR+ DW + +S   E   
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Query:  ALKRGEDPGLALVTKAYNYIHKYGHRSKLTAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDDKYSFIR--KLSPQSAANYIFTEDEVKKWDQLS
        A    EDPG+  VTK YNY  +YG+ + +  A+ RN  ++  L G D +     +L+ L+E+ T    K +F    K  PQ       TE +   W   S
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              P A++ LA+G+  +A DQ K  + L EK
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P45055 Transaldolase9.7e-4735.05Show/hide
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        +T++LD++ + + +V DT   D  +++ P  AT + SL+L    LP   +   +D A+A ++    D  +       +K  VN+G ++ K+VPGR+STEV
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        DAR++YDT   + K   L+ LYN   +  +R+L KI +TWQGI A+ +LE EGI  +LT ++S AQA A A+AG  +I  FVGR+ DW + +S   E   
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        A    EDPG+  VTK YNY  +YG+ + +  A+ RN  ++  L G D +     +L+ L+E+ T      + +RKL  +    A     TE E   W   
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        S A      A++ LA G+  +A   +++E +
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Q0I1U0 Transaldolase2.7e-4935.54Show/hide
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        +T++LDA+ + + +V DT   D  +++ P  AT + SL+L    LP   +   +D A+A ++    D  +       +K  VN+G ++ K+VPGR+STEV
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        DAR++YDT   + K   L+ LYNE  +  +R+L KI +TWQGI A+ +LE EGI  +LT ++S AQA A A+AG  +I  FVGR+ DW + +S   E   
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        A    EDPG+  VTK YNY  +YG+ + +  A+ RN  ++  L G D +     +L+ L+E+ T      + +RKL  +     +  + +     Q    
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Query:  SGMGPAALQLLANGLEGYA-DQTKRVEELFEK
            P A++ LA+G+  +A DQ K  + L EK
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Q65PZ8 Transaldolase5.7e-4733.54Show/hide
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        +T++LDA+ + + +V DT   +  +++ P  AT + SL+L    LP   + + +D A+  ++    D  +       +K  VN+G ++ K+VPGR+STEV
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        DAR++YDT   + K   L+KLYNE  +  +R+L K+ +TWQGI A+ +LE EGI  +LT ++S AQA A A+AG  +I  FVGR+ DW + ++   E   
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Query:  ALKRGEDPGLALVTKAYNYIHKYGHRSKLTAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDDKYSFIRKLSPQSAANYIFTEDEVKKWDQLSLA
             EDPG+  VT  YNY  +YG+++ +  A+ RN  ++  L G D +     +L+ L+ES      K  +  ++ P+ A     TE +   W+     
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Query:  SGMGPAALQLLANGLEGYADQTKRVEEL
            P A+  LA G+  +A   +++E +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12230.1 Aldolase superfamily protein2.0e-16473.79Show/hide
Query:  MSFSLQSPPSATIPPLLSPSPSSSSFLQKKLGFSAGLFTPSILISHS-PTSLPLI-----SASSGFSSSLDTGLTSELDAVSSFSQIVPDTVVFDDFERF
        M  SLQSPP AT    LS S     +     GFS    TP   ++ S   S+P I     S+SS  SSSL+ G  +EL+AVS+FS+IVPDTVVFDDFERF
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Query:  PPTAATVSSSLLLGICGLPDTIFRNAVDMALADSECFGLDNPELKYSCIFNKALVNVGGDLAKLVPGRVSTEVDARVAYDTHGIIRKVHDLLKLYNEINV
        PPTAATVSS+LLLGICGLPDTIFRNAVDMALADS C GL+  E + SC FNKA+VNVGGDL KLVPGRVSTEVDAR+AYDT+GIIRKVHDLL+LYNEI+V
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Query:  PPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEGIQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPEIEAALKRGEDPGLALVTKAYNYIHKYGHRS
        P +RLLFKIPATWQGIEA+RLLESEGIQTH+TFVYSFAQAAAA+QAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGD EIE+A+K GEDPGLALV ++YNYIHKYG++S
Subjt:  PPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEGIQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPEIEAALKRGEDPGLALVTKAYNYIHKYGHRS

Query:  KLTAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDD-KYSFIRKLSPQSAANYIFTEDEVKKWDQLSLASGMGPAALQLLANGLEGYADQTKRVE
        KL AAAVRNKQDLFSLLGVDY+IAPLKVLQSLK+S   PDD KYSF+RKL+P++A +Y FT  E+ KWDQLSLAS MGPA+++LL+ G+EGYA+Q KRVE
Subjt:  KLTAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDD-KYSFIRKLSPQSAANYIFTEDEVKKWDQLSLASGMGPAALQLLANGLEGYADQTKRVE

Query:  ELFEKIWPPPNV
        ELF KIWPPPNV
Subjt:  ELFEKIWPPPNV

AT1G12230.2 Aldolase superfamily protein3.0e-16069.82Show/hide
Query:  MSFSLQSPPSATIPPLLSPSPSSSSFLQKKLGFSAGLFTPSILISHS-PTSLPLI-----SASSGFSSSLDTGLTSELDAVSSFSQIVPDTVVFDDFE--
        M  SLQSPP AT    LS S     +     GFS    TP   ++ S   S+P I     S+SS  SSSL+ G  +EL+AVS+FS+IVPDTVVFDDFE  
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Query:  --------------------RFPPTAATVSSSLLLGICGLPDTIFRNAVDMALADSECFGLDNPELKYSCIFNKALVNVGGDLAKLVPGRVSTEVDARVA
                            +FPPTAATVSS+LLLGICGLPDTIFRNAVDMALADS C GL+  E + SC FNKA+VNVGGDL KLVPGRVSTEVDAR+A
Subjt:  --------------------RFPPTAATVSSSLLLGICGLPDTIFRNAVDMALADSECFGLDNPELKYSCIFNKALVNVGGDLAKLVPGRVSTEVDARVA

Query:  YDTHGIIRKVHDLLKLYNEINVPPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEGIQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPEIEAALKRG
        YDT+GIIRKVHDLL+LYNEI+VP +RLLFKIPATWQGIEA+RLLESEGIQTH+TFVYSFAQAAAA+QAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGD EIE+A+K G
Subjt:  YDTHGIIRKVHDLLKLYNEINVPPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEGIQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPEIEAALKRG

Query:  EDPGLALVTKAYNYIHKYGHRSKLTAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDD-KYSFIRKLSPQSAANYIFTEDEVKKWDQLSLASGMG
        EDPGLALV ++YNYIHKYG++SKL AAAVRNKQDLFSLLGVDY+IAPLKVLQSLK+S   PDD KYSF+RKL+P++A +Y FT  E+ KWDQLSLAS MG
Subjt:  EDPGLALVTKAYNYIHKYGHRSKLTAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDD-KYSFIRKLSPQSAANYIFTEDEVKKWDQLSLASGMG

Query:  PAALQLLANGLEGYADQTKRVEELFEKIWPPPNV
        PA+++LL+ G+EGYA+Q KRVEELF KIWPPPNV
Subjt:  PAALQLLANGLEGYADQTKRVEELFEKIWPPPNV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCATTCTCTTTGCAATCTCCGCCGTCTGCAACCATTCCCCCGTTGCTGTCGCCGTCGCCGTCCTCCTCTTCCTTTCTTCAGAAAAAATTGGGGTTCTCAGCTGGATT
ATTCACACCCTCCATTCTAATTTCCCATTCTCCTACATCTCTTCCTTTAATTTCTGCTTCCTCCGGCTTCTCCTCTTCCCTCGACACTGGTTTGACATCTGAGTTAGACG
CTGTTTCTAGCTTCAGTCAGATCGTTCCTGACACCGTCGTTTTTGACGATTTCGAGAGGTTTCCTCCTACTGCTGCTACTGTTAGCTCTTCTCTCCTTCTGGGCATATGT
GGCCTTCCTGATACCATATTTAGAAATGCGGTTGATATGGCATTGGCTGATTCTGAATGTTTTGGGCTAGACAACCCCGAATTGAAATATTCCTGTATTTTTAACAAGGC
TCTAGTAAATGTTGGTGGTGATTTGGCAAAACTAGTTCCTGGACGTGTTTCAACTGAGGTGGATGCGCGTGTTGCGTATGATACACATGGCATTATCAGAAAGGTGCATG
ACCTGCTGAAATTGTACAATGAAATCAATGTTCCTCCTGAGCGGTTGTTGTTCAAAATTCCGGCAACTTGGCAGGGTATTGAGGCCTCAAGATTGTTGGAATCAGAGGGA
ATACAGACACATTTGACTTTTGTATATAGCTTTGCCCAAGCAGCAGCTGCAGCTCAAGCTGGTGCCTCTGTCATTCAGATTTTTGTTGGTCGTCTACGTGATTGGGCTCG
GAATCACTCTGGTGACCCTGAAATAGAAGCTGCACTTAAAAGAGGAGAGGATCCTGGGCTGGCTTTGGTGACAAAGGCTTACAACTACATTCACAAATATGGACACAGAT
CAAAGTTGACGGCAGCAGCAGTTAGGAATAAGCAAGATTTATTCAGTCTTCTGGGCGTCGATTACATCATTGCTCCATTGAAGGTATTGCAGTCCCTTAAAGAATCAGTT
ACCACTCCGGATGATAAGTACTCTTTTATTAGGAAACTCTCTCCGCAATCCGCAGCTAATTACATTTTCACTGAGGACGAGGTAAAAAAATGGGACCAATTAAGCCTTGC
ATCAGGAATGGGGCCTGCAGCTTTGCAGCTGCTTGCTAATGGATTGGAAGGTTATGCAGACCAAACAAAGCGAGTTGAGGAGCTTTTCGAGAAGATTTGGCCACCCCCAA
ATGTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCATTCTCTTTGCAATCTCCGCCGTCTGCAACCATTCCCCCGTTGCTGTCGCCGTCGCCGTCCTCCTCTTCCTTTCTTCAGAAAAAATTGGGGTTCTCAGCTGGATT
ATTCACACCCTCCATTCTAATTTCCCATTCTCCTACATCTCTTCCTTTAATTTCTGCTTCCTCCGGCTTCTCCTCTTCCCTCGACACTGGTTTGACATCTGAGTTAGACG
CTGTTTCTAGCTTCAGTCAGATCGTTCCTGACACCGTCGTTTTTGACGATTTCGAGAGGTTTCCTCCTACTGCTGCTACTGTTAGCTCTTCTCTCCTTCTGGGCATATGT
GGCCTTCCTGATACCATATTTAGAAATGCGGTTGATATGGCATTGGCTGATTCTGAATGTTTTGGGCTAGACAACCCCGAATTGAAATATTCCTGTATTTTTAACAAGGC
TCTAGTAAATGTTGGTGGTGATTTGGCAAAACTAGTTCCTGGACGTGTTTCAACTGAGGTGGATGCGCGTGTTGCGTATGATACACATGGCATTATCAGAAAGGTGCATG
ACCTGCTGAAATTGTACAATGAAATCAATGTTCCTCCTGAGCGGTTGTTGTTCAAAATTCCGGCAACTTGGCAGGGTATTGAGGCCTCAAGATTGTTGGAATCAGAGGGA
ATACAGACACATTTGACTTTTGTATATAGCTTTGCCCAAGCAGCAGCTGCAGCTCAAGCTGGTGCCTCTGTCATTCAGATTTTTGTTGGTCGTCTACGTGATTGGGCTCG
GAATCACTCTGGTGACCCTGAAATAGAAGCTGCACTTAAAAGAGGAGAGGATCCTGGGCTGGCTTTGGTGACAAAGGCTTACAACTACATTCACAAATATGGACACAGAT
CAAAGTTGACGGCAGCAGCAGTTAGGAATAAGCAAGATTTATTCAGTCTTCTGGGCGTCGATTACATCATTGCTCCATTGAAGGTATTGCAGTCCCTTAAAGAATCAGTT
ACCACTCCGGATGATAAGTACTCTTTTATTAGGAAACTCTCTCCGCAATCCGCAGCTAATTACATTTTCACTGAGGACGAGGTAAAAAAATGGGACCAATTAAGCCTTGC
ATCAGGAATGGGGCCTGCAGCTTTGCAGCTGCTTGCTAATGGATTGGAAGGTTATGCAGACCAAACAAAGCGAGTTGAGGAGCTTTTCGAGAAGATTTGGCCACCCCCAA
ATGTATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFSLQSPPSATIPPLLSPSPSSSSFLQKKLGFSAGLFTPSILISHSPTSLPLISASSGFSSSLDTGLTSELDAVSSFSQIVPDTVVFDDFERFPPTAATVSSSLLLGIC
GLPDTIFRNAVDMALADSECFGLDNPELKYSCIFNKALVNVGGDLAKLVPGRVSTEVDARVAYDTHGIIRKVHDLLKLYNEINVPPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEG
IQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPEIEAALKRGEDPGLALVTKAYNYIHKYGHRSKLTAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESV
TTPDDKYSFIRKLSPQSAANYIFTEDEVKKWDQLSLASGMGPAALQLLANGLEGYADQTKRVEELFEKIWPPPNV