; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0020140 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0020140
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionLINE-1 retrotransposable element ORF2 protein
Genome locationchr05:16867602..16868887
RNA-Seq ExpressionPI0020140
SyntenyPI0020140
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN45637.1 hypothetical protein Csa_005027 [Cucumis sativus]2.7e-3065.42Show/hide
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XP_008464344.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103502250 [Cucumis melo]3.8e-1639.37Show/hide
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        + +F+ PS  I     ++T S    E+
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XP_031736681.1 uncharacterized protein LOC116402062 [Cucumis sativus]2.2e-3259.52Show/hide
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        L  FEPS   T   ++     VP E+
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XP_031743987.1 uncharacterized protein LOC116404759 [Cucumis sativus]2.9e-1638.58Show/hide
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        MF +K+ N DP LDATS F +   D+  +KF+PS F +I+ ++ P F A + +    FT +SVD +H S++SL+ F +A+L+G S++SM+IHL +  N I
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        + +F+ PS  I     ++  S    E+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K902 Uncharacterized protein1.4e-1638.58Show/hide
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        + +F+ PS  I     ++  S    E+
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A0A0A0KB76 Uncharacterized protein1.3e-3065.42Show/hide
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A0A0A0LIE0 Uncharacterized protein7.9e-6894.96Show/hide
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A0A1S3CL88 uncharacterized protein LOC1035022501.8e-1639.37Show/hide
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A0A5D3DZ07 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein1.8e-1639.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCTCAATTAAGGTTGACAACCTTGATCCTTTTTTAGATGCAACTTCTCTATTCACCGAATTTATTAACGACGAAATCTGCCTCAAGTTCTCACCATCGACGTTTTC
AATGATTGCTCGATATCAATGCCCAACCTTCTTTGCAATGATGTTCATGCCACATCCATTATTCACCGAGTACTCCGTTGATCGAAATCATATTTCAAGGATTTCTCTCC
AATGCTTCCGCAACGCTTTGTTGGAAGGTCAAAGCTATTCCTCAATGAGTATCCATCTTCGAGAACCCCAAAATACCATACTCTTTAAATTTGAGCCTTCGATTTTGATT
ACTTCAAAGGGTTCACAAATCACATTCTCTGCCGTTCCATGTGAGGAGATAGTTATTAGAGAAGAGGTATGTTTTGTGACATTTGTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTCTCAATTAAGGTTGACAACCTTGATCCTTTTTTAGATGCAACTTCTCTATTCACCGAATTTATTAACGACGAAATCTGCCTCAAGTTCTCACCATCGACGTTTTC
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ACTTCAAAGGGTTCACAAATCACATTCTCTGCCGTTCCATGTGAGGAGATAGTTATTAGAGAAGAGGTATGTTTTGTGACATTTGTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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