; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0020492 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0020492
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionheterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
Genome locationchr12:13329118..13333689
RNA-Seq ExpressionPI0020492
SyntenyPI0020492
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR034131 - DAZ-associated protein 1, RNA recognition motif 2
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035665.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 [Cucumis melo var. makuwa]3.1e-24597.98Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDRTTGRARGFGFVVFADP+AAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        TV RGGLSPISPGYGMG+NLDTGLNPNYGTGP  SSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNV NSAGTNSSHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGTNSLNNIGGLWG SASLGHGEN GSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

XP_008463611.1 PREDICTED: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 [Cucumis melo]3.1e-24597.98Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDRTTGRARGFGFVVFADP+AAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        TV RGGLSPISPGYGMG+NLDTGLNPNYGTGP  SSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNV NSAGTNSSHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGTNSLNNIGGLWG SASLGHGEN GSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

XP_022142553.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 [Momordica charantia]2.6e-23995.06Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDRTTGRARGFGFVVFADP+ AARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTI DV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL GYPY FGRVGSYLNGYNQGYNP SVGGYGLRSDGRFSP+
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        +V RGGLSPISPGYG+GLNLDTGL+PNYG GPN +SNLSYGRVMSPSYG NLNRYGSPNPM+YGGG GGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAG NSSHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGTNSLN+IGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGN+FYGHSSWQSLP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRN+AGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

XP_031745329.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like [Cucumis sativus]3.6e-24196.63Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDR TGRARGFGFVVFADP+AAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP+NFGRVGSYLNGYNQGYNPT+VGGYGLRSDGRFSPV
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        TV RGGLSPISPGYGMGLNL+TGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSY GNLNRYGSPNPMVY  GGGGNGSILSSSVQNLWGNV  SAGTNSSHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGT+SLNNIGGLWGASASLGHGENAGS FNT NLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

XP_038894700.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 [Benincasa hispida]1.8e-24597.53Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDRTTGRARGFGFVVFADP+ AARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL GYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        TV RGGLSPISPGYG+GLNLDTGLNPNYGTGPNV SNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGG GGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTN SHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGTNSLN+IGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFG+GDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LTE8 Uncharacterized protein1.7e-24196.63Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDR TGRARGFGFVVFADP+AAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP+NFGRVGSYLNGYNQGYNPT+VGGYGLRSDGRFSPV
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        TV RGGLSPISPGYGMGLNL+TGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSY GNLNRYGSPNPMVY  GGGGNGSILSSSVQNLWGNV  SAGTNSSHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGT+SLNNIGGLWGASASLGHGENAGS FNT NLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

A0A1S3CK54 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 11.5e-24597.98Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDRTTGRARGFGFVVFADP+AAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        TV RGGLSPISPGYGMG+NLDTGLNPNYGTGP  SSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNV NSAGTNSSHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGTNSLNNIGGLWG SASLGHGEN GSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

A0A5D3E516 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 11.5e-24597.98Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDRTTGRARGFGFVVFADP+AAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        TV RGGLSPISPGYGMG+NLDTGLNPNYGTGP  SSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNV NSAGTNSSHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGTNSLNNIGGLWG SASLGHGEN GSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

A0A6J1CL94 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 11.2e-23995.06Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDRTTGRARGFGFVVFADP+ AARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTI DV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL GYPY FGRVGSYLNGYNQGYNP SVGGYGLRSDGRFSP+
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        +V RGGLSPISPGYG+GLNLDTGL+PNYG GPN +SNLSYGRVMSPSYG NLNRYGSPNPM+YGGG GGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAG NSSHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGTNSLN+IGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGN+FYGHSSWQSLP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRN+AGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

A0A6J1EKS0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like isoform X13.8e-23392.58Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        MIMRDRTTGRARGFGFVVFADP+ AARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQN+LSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFK YFDQFGTI DV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNR+QL  YPY FGRVGSYLNGYNQGYNPTSVG YGLRSD RFSPV
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP
        TV RGGLSPISPGYG+GLNLDTGLNPNYGTG NV SNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGG GGNGSILSSSVQNLWGNVGNS GTNSSHLR FP
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFP

Query:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP
        GSGGVHTGTNSLN IGGLWGASASL HGE++GSPFN  NLDF +GD S TSGTTVGYARS+GTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGN+FYGHSSWQ LP
Subjt:  GSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLP

Query:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        TELEDSSS+GFGLGNAASDVISRNN GYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  TELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8W034 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 11.0e-4435.02Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR----NNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGT
        ++MRD+ TGR RGFGFV+F+DP    RV+ EKH ID R V+ K+A+ R++Q +  R    N +   G     +TKKIFVGGL  T+T+ +F++YF+ +G 
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR----NNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGT

Query:  IVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGR
        + DV +MYD  T RPRGFGF++++SE++V+ VL+KTFH+L+GK VEVKRA+PK+++P      + G     G  G Y     QGY     GG     DGR
Subjt:  IVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGR

Query:  FSPVTVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGG---GGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNS
              S   L   S G G+     +G    YG G N +   +YG      Y G+   YG+     YG     G G GS    + +N W    +S   N 
Subjt:  FSPVTVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGG---GGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNS

Query:  SHLRNFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGN-----
         +     GSG  H+G        G+ GA+          SP   +N  +G G     SG+  GY         + + Y          G+N+ G+     
Subjt:  SHLRNFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGN-----

Query:  TFYGHSSWQSLPTE
          YG  SW+S P++
Subjt:  TFYGHSSWQSLPTE

Q96DH6 RNA-binding protein Musashi homolog 25.5e-3537.81Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLE-KHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVD
        M+MRD TT R+RGFGFV FADP +  +V+ +  H +D +T++ K A PR  Q  +             TRTKKIFVGGL++     D K+YF+QFG + D
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLE-KHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVD

Query:  VVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKE-SSPVPNRNQLAGYPY-------NFGRVG--SYLNGYNQGYNPTSVGGY
         ++M+D  T R RGFGF+T+E+E+ VEKV    FHE+N KMVE K+A PKE   P   R +  G PY         G +G  +++  Y +GY P     Y
Subjt:  VVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKE-SSPVPNRNQLAGYPY-------NFGRVG--SYLNGYNQGYNPTSVGGY

Query:  GLRSDG----RFSP-----VTVSRG-GLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMV
        G +  G     + P     V  +RG G +P  PG   G N    +   YG     S   +Y    SP  G     +G   P++
Subjt:  GLRSDG----RFSP-----VTVSRG-GLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMV

Q96EP5 DAZ-associated protein 14.3e-3238.74Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEK-HVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTK--KIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTI
        +IM+D+TT ++RGFGFV F DP     V+  + H +DGR ++ K   PR  Q   +R   G    P    +K  KIFVGG+     E++ ++YF +FG +
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEK-HVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTK--KIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTI

Query:  VDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP----YNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRS
         +VV++YD   QRPRGFGFIT+E E+SV++ +   FH++ GK VEVKRA P++S     ++Q  G P    +    V +  NG+     PT   GYG   
Subjt:  VDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP----YNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRS

Query:  DGRFSPVTVSRGGLSPISPGYG
         G + P   + GG  P   G G
Subjt:  DGRFSPVTVSRGGLSPISPGYG

Q9C652 RNA-binding protein 12.3e-3342.31Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDD-----------QNILSRNNTGI--LGSPGPT-RTKKIFVGGLASTVTESD
        ++ +++ TG+ RGFGFV FA+     + + + H I G+ V+ +KA+ + +           +  + + N G+  + S G T RTKKIFVGGL+S  TE +
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDD-----------QNILSRNNTGI--LGSPGPT-RTKKIFVGGLASTVTESD

Query:  FKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP-YNFGRVGSYL---NGYNQGYN
        FK YF++FG   DVVVM+D  T RPRGFGF+TY+SE+SVE V+   FHEL+ K VEVKRA+PKE     N N +   P Y+  +   Y+   NGY     
Subjt:  FKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP-YNFGRVGSYL---NGYNQGYN

Query:  -PTSVGGY
         P  V GY
Subjt:  -PTSVGGY

Q9JII5 DAZ-associated protein 11.5e-3238.74Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEK-HVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSP--GPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTI
        +IM+D+TT ++RGFGFV F DP     V+  + H +DGR ++ K   PR  Q   +R   G    P    +++ KIFVGG+     E++ ++YF +FG +
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEK-HVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSP--GPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTI

Query:  VDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP----YNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRS
         +VV++YD   QRPRGFGFIT+E E+SV++ +   FH++ GK VEVKRA P++S     +NQ  G P    +      S  NG+     PT   GYG   
Subjt:  VDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP----YNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRS

Query:  DGRFSPVTVSRGGLSPISPGYG
         G + P   + GG  P   G G
Subjt:  DGRFSPVTVSRGGLSPISPGYG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07810.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.5e-11255.36Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR-NNTGILGSP-GPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIV
        +I++DRTTGRARGFGFVVFADP  A  V+ EKH IDGR VEAKKAVPRDDQN+++R N++ I GSP GP RT+KIFVGGL S+VTESDFK YF+QFGT  
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR-NNTGILGSP-GPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIV

Query:  DVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL-AGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRF
        DVVVMYDHNTQRPRGFGFITY+SEE+VEKVL KTFHELNGKMVEVKRAVPKE SP P+R+ L AGY Y   RV + LNGY QG+NP +VGGYGLR DGRF
Subjt:  DVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL-AGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRF

Query:  SPVTVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVG----NSAGTNS
        SPV   R G +  S GYGM +N D GL   +  G N + N+ YGR MSP Y GN NR+G P     GG GGGN S  SS  +NLWGN G    N+  TNS
Subjt:  SPVTVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVG----NSAGTNS

Query:  SHLRNFPG-SGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTN----VSSASLYSAPNI--YD-----EVH
        +      G S G +T +    N G  WGA    G G NA S  N      GNG++ F  GT    AR+ G N     SS S  SA N   YD     E +
Subjt:  SHLRNFPG-SGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTN----VSSASLYSAPNI--YD-----EVH

Query:  GNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNA--ASDVISRNNA-GYTVGYGVSNRQSNRGIA
        GN       Y   +W+S   E E  +   +G+G    +SDV +R+++ GY   Y V+ RQ NRGIA
Subjt:  GNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNA--ASDVISRNNA-GYTVGYGVSNRQSNRGIA

AT3G07810.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.7e-11155.17Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR-NNTGILGSP-GPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIV
        +I++DRTTGRARGFGFVVFADP  A  V+ EKH IDGR VEAKKAVPRDDQN+++R N++ I GSP GP RT+KIFVGGL S+VTESDFK YF+QFGT  
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR-NNTGILGSP-GPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIV

Query:  DVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL-AGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRF
        DVVVMYDHNTQRPRGFGFITY+SEE+VEKVL KTFHELNGKMVEVKRAVPKE SP P+R+ L AGY Y   RV + LNGY QG+NP +VGGYGLR DGRF
Subjt:  DVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL-AGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRF

Query:  SPVTVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVG----NSAGTNS
        SPV   R G +  S GYGM +N D GL   +  G N + N+ YGR MSP Y GN NR+G P     GG GGGN S  SS  +NLWGN G    N+  TNS
Subjt:  SPVTVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVG----NSAGTNS

Query:  SHLRNFPG-SGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTN----VSSASLYSAPNI--YD-----EVH
        +      G S G +T +    N G  WGA    G G NA S  N      GNG++ F  GT    AR+ G N     SS S  SA N   YD     E +
Subjt:  SHLRNFPG-SGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTN----VSSASLYSAPNI--YD-----EVH

Query:  GNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNA--ASDVISRNNA-GYTVGYGVSNRQSNRG
        GN       Y   +W+S   E E  +   +G+G    +SDV +R+++ GY   Y V+ RQ NRG
Subjt:  GNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNA--ASDVISRNNA-GYTVGYGVSNRQSNRG

AT5G47620.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.6e-9348.22Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        +IM+DR TGRARGFGFVVFADP  A RVVL KH+IDG+ VEAKKAVPRDD  + +++N+ + GSPGP+ +KKIFVGGLAS+VTE++FKKYF QFG I DV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDH TQRPRGFGFI+Y+SEE+V+KVL KTFHELNGKMVEVK AVPK+ +    RNQ+    +   R+ S LN Y QG++P+ + GYG++ + R+SP 
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQN-LWGNVGNSAGTNSSHLR-N
          +RGG SP   GYG+ LN +     NYG+G    S+  +GR  SP Y  +L R+GS   M  GG   GNGS+L+++ +N LWGN G    +NS   R +
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQN-LWGNVGNSAGTNSSHLR-N

Query:  FPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASA---SLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSS
        F G+ G+    +SL +IG  WG  A   S  HGE  G                      VG     G +V   S  S  +I         E ++ Y  S 
Subjt:  FPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASA---SLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSS

Query:  WQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        W SLP + E+      GLG    D +SR  AGY       NRQ N GIAA
Subjt:  WQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

AT5G47620.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.6e-9348.22Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV
        +IM+DR TGRARGFGFVVFADP  A RVVL KH+IDG+ VEAKKAVPRDD  + +++N+ + GSPGP+ +KKIFVGGLAS+VTE++FKKYF QFG I DV
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDV

Query:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV
        VVMYDH TQRPRGFGFI+Y+SEE+V+KVL KTFHELNGKMVEVK AVPK+ +    RNQ+    +   R+ S LN Y QG++P+ + GYG++ + R+SP 
Subjt:  VVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPV

Query:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQN-LWGNVGNSAGTNSSHLR-N
          +RGG SP   GYG+ LN +     NYG+G    S+  +GR  SP Y  +L R+GS   M  GG   GNGS+L+++ +N LWGN G    +NS   R +
Subjt:  TVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQN-LWGNVGNSAGTNSSHLR-N

Query:  FPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASA---SLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSS
        F G+ G+    +SL +IG  WG  A   S  HGE  G                      VG     G +V   S  S  +I         E ++ Y  S 
Subjt:  FPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASA---SLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSS

Query:  WQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        W SLP + E+      GLG    D +SR  AGY       NRQ N GIAA
Subjt:  WQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

AT5G47620.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein8.0e-9045.97Show/hide
Query:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGR----------------------TVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGL
        +IM+DR TGRARGFGFVVFADP  A RVVL KH+IDG+                       VEAKKAVPRDD  + +++N+ + GSPGP+ +KKIFVGGL
Subjt:  MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGR----------------------TVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGL

Query:  ASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYN
        AS+VTE++FKKYF QFG I DVVVMYDH TQRPRGFGFI+Y+SEE+V+KVL KTFHELNGKMVEVK AVPK+ +    RNQ+    +   R+ S LN Y 
Subjt:  ASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYN

Query:  QGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSV
        QG++P+ + GYG++ + R+SP   +RGG SP   GYG+ LN +     NYG+G    S+  +GR  SP Y  +L R+GS   M  GG   GNGS+L+++ 
Subjt:  QGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVSRGGLSPISPGYGMGLNLDTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSV

Query:  QN-LWGNVGNSAGTNSSHLR-NFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASA---SLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSA
        +N LWGN G    +NS   R +F G+ G+    +SL +IG  WG  A   S  HGE  G                      VG     G +V   S  S 
Subjt:  QN-LWGNVGNSAGTNSSHLR-NFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASA---SLGHGENAGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSA

Query:  PNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
         +I         E ++ Y  S W SLP + E+      GLG    D +SR  AGY       NRQ N GIAA
Subjt:  PNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCATGAGGGATCGGACCACTGGCCGTGCCCGTGGCTTTGGATTCGTTGTCTTTGCTGACCCTATTGCTGCAGCGAGAGTTGTATTGGAAAAACATGTAATTGATGG
AAGAACTGTTGAAGCAAAGAAGGCGGTTCCTCGAGATGATCAAAACATTTTGAGCAGGAACAATACTGGTATTCTTGGATCACCTGGTCCTACTCGCACAAAGAAGATAT
TTGTTGGAGGATTGGCATCAACTGTTACAGAGAGTGATTTCAAAAAGTATTTTGATCAGTTTGGAACAATCGTAGATGTCGTTGTGATGTATGATCATAATACTCAGAGA
CCAAGAGGTTTTGGATTTATCACTTACGAGTCAGAGGAATCGGTGGAGAAAGTGTTGTACAAAACTTTTCATGAACTCAATGGTAAAATGGTTGAGGTTAAGAGGGCTGT
TCCCAAGGAATCATCACCAGTGCCAAATCGAAATCAATTAGCTGGATATCCTTACAATTTTGGTAGAGTTGGTAGCTATTTAAATGGCTATAATCAAGGATATAATCCAA
CCTCAGTTGGGGGATATGGATTGAGATCTGATGGTAGATTTAGTCCTGTTACAGTCAGTCGGGGTGGACTTTCTCCAATTAGTCCTGGTTATGGAATGGGGCTAAATCTT
GATACAGGGTTGAATCCGAACTATGGGACAGGTCCCAATGTTAGCTCTAACCTCAGCTATGGACGAGTAATGAGCCCCTCGTATGGTGGAAATTTAAATAGGTACGGTAG
CCCAAACCCCATGGTATATGGTGGTGGCGGTGGAGGTAATGGTTCTATTTTAAGCTCGTCGGTTCAGAATCTGTGGGGAAACGTCGGTAACTCTGCTGGTACAAACTCCT
CACACTTGAGGAATTTTCCTGGCTCTGGTGGTGTGCATACAGGAACTAATTCATTAAACAATATCGGAGGGCTTTGGGGTGCTTCTGCAAGTTTAGGTCATGGGGAAAAT
GCTGGTTCTCCATTCAATACTGCTAATCTTGACTTCGGAAACGGAGATGCCAGCTTTACATCAGGAACAACTGTAGGTTATGCTAGAAGCATTGGAACTAATGTTTCCTC
AGCATCTTTGTACTCTGCACCAAATATTTATGATGAGGTTCATGGGAATAATGATGAAGGAAACACATTTTATGGGCATTCTAGTTGGCAGTCGTTGCCGACAGAGCTTG
AGGATTCTTCCTCAATTGGTTTTGGCCTTGGCAATGCAGCTTCAGATGTTATTAGTAGAAACAATGCTGGTTATACTGTTGGATACGGTGTTTCTAATAGACAATCTAAT
AGAGGAATTGCTGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGTATATATAATTTGTTATATATTTAGATGCAAATATTGCGCCCATTCCAGATGCAAATTCCTTTTCTTACACAAATATCTTTCTCCTTCTCTCTGTTTCATATATAGCC
TTCAATCGTTTATTTGGTATTGCATATTTATCTAGAACAAAAACCAAAACAGTAACTGGAACAAGGAAAGAGATAGGAAAAAAGGAGGGCCTCTCGCCCTCTCTTCTTAT
TATGCCTTCTCTTAGATCTTAGATTCTAGAGTTCCCAACTGGGTCGTTTTCATTTCGCTTGGATTGATCGGCTTTGTGGCTTCTTCTTCTCAAGGCGATTGGATTAGACT
TTAAGATATGCGATTGCTGTGTGCTGTATGCATTCTTATTGTTGAATGATACTGATGGGATTGGTTGCAATGGATTTGTAGAGTGGGCATGGATCCTGGCAAGCTTTTCA
TTGGTGGTATTTCGGGACACAGATGAAGATCGTCTTCGAGAGTATTTTCGGAACTTTGGAGAAGTGGTAGAGGTGATGATCATGAGGGATCGGACCACTGGCCGTGCCCG
TGGCTTTGGATTCGTTGTCTTTGCTGACCCTATTGCTGCAGCGAGAGTTGTATTGGAAAAACATGTAATTGATGGAAGAACTGTTGAAGCAAAGAAGGCGGTTCCTCGAG
ATGATCAAAACATTTTGAGCAGGAACAATACTGGTATTCTTGGATCACCTGGTCCTACTCGCACAAAGAAGATATTTGTTGGAGGATTGGCATCAACTGTTACAGAGAGT
GATTTCAAAAAGTATTTTGATCAGTTTGGAACAATCGTAGATGTCGTTGTGATGTATGATCATAATACTCAGAGACCAAGAGGTTTTGGATTTATCACTTACGAGTCAGA
GGAATCGGTGGAGAAAGTGTTGTACAAAACTTTTCATGAACTCAATGGTAAAATGGTTGAGGTTAAGAGGGCTGTTCCCAAGGAATCATCACCAGTGCCAAATCGAAATC
AATTAGCTGGATATCCTTACAATTTTGGTAGAGTTGGTAGCTATTTAAATGGCTATAATCAAGGATATAATCCAACCTCAGTTGGGGGATATGGATTGAGATCTGATGGT
AGATTTAGTCCTGTTACAGTCAGTCGGGGTGGACTTTCTCCAATTAGTCCTGGTTATGGAATGGGGCTAAATCTTGATACAGGGTTGAATCCGAACTATGGGACAGGTCC
CAATGTTAGCTCTAACCTCAGCTATGGACGAGTAATGAGCCCCTCGTATGGTGGAAATTTAAATAGGTACGGTAGCCCAAACCCCATGGTATATGGTGGTGGCGGTGGAG
GTAATGGTTCTATTTTAAGCTCGTCGGTTCAGAATCTGTGGGGAAACGTCGGTAACTCTGCTGGTACAAACTCCTCACACTTGAGGAATTTTCCTGGCTCTGGTGGTGTG
CATACAGGAACTAATTCATTAAACAATATCGGAGGGCTTTGGGGTGCTTCTGCAAGTTTAGGTCATGGGGAAAATGCTGGTTCTCCATTCAATACTGCTAATCTTGACTT
CGGAAACGGAGATGCCAGCTTTACATCAGGAACAACTGTAGGTTATGCTAGAAGCATTGGAACTAATGTTTCCTCAGCATCTTTGTACTCTGCACCAAATATTTATGATG
AGGTTCATGGGAATAATGATGAAGGAAACACATTTTATGGGCATTCTAGTTGGCAGTCGTTGCCGACAGAGCTTGAGGATTCTTCCTCAATTGGTTTTGGCCTTGGCAAT
GCAGCTTCAGATGTTATTAGTAGAAACAATGCTGGTTATACTGTTGGATACGGTGTTTCTAATAGACAATCTAATAGAGGAATTGCTGCTTAGGAAGAAGATGATACAAC
AGATGTCAAAAATTATAGTAGGTGATGCGTATTTCGGTAAAGCAGGTGTACTGCAATTTTTCGTATAATTTCGTCCTTGTGATACACTCCCATTTGATACTGTCAGAGCT
AATTTGTTTTCTGTTTCACAAACTGTCCCATAAAGAAGCAGGTTCCAGAGGGTTTTCTCTTGGTCAGGATTGAGCTTGAAAATATAGGTCTTTCTTCTTTCTTCTTCTTC
TACTTCTTTCTTTCTTTCCTTCCTTCTTTCTTGTAATTTGATTGATATGTATAATTGGATTGTGGGTAAGGTATATATGCAGAACTGTTGCATAATACGCTACTCCGAGA
AACGATGTCACACGAACGAATCAACATCTTTCTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTCTCCTTTTCTTTTCGGGTTCGTTTTTCTGAAAAAAGATGCTAGTATTCATCAGGTT
TTCTTGTTGTTTGACCTTTTATTATTAGTCATTCTGGGTTTTTACTTCTCATCTGATTGTATGAAACTAAGGTTGATTTAGTGGTGTGATATTATCCAGCTTCCCAATTC
TTATTTGTTGTAAATTTAGCTCCTTTTTGAGCTAAACTAAAGTTTTTTAAGCTAAAAAACACTCTTACTTGCAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIMRDRTTGRARGFGFVVFADPIAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQR
PRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVSRGGLSPISPGYGMGLNL
DTGLNPNYGTGPNVSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVGNSAGTNSSHLRNFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGASASLGHGEN
AGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSN
RGIAA