; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0020568 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0020568
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionsec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic
Genome locationchr06:7354956..7360153
RNA-Seq ExpressionPI0020568
SyntenyPI0020568
Gene Ontology termsGO:0009409 - response to cold (biological process)
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GO:1903426 - regulation of reactive oxygen species biosynthetic process (biological process)
GO:2000070 - regulation of response to water deprivation (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
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InterPro domainsIPR003369 - Sec-independent protein translocase protein TatA/B/E


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK22976.1 sec-independent protein translocase protein TATB [Cucumis melo var. makuwa]6.0e-11787.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3AYD4 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X23.6e-11587.46Show/hide
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A0A1S3AYF5 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X11.0e-11788.15Show/hide
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A0A5A7SWY3 Sec-independent protein translocase protein TATB1.0e-11788.15Show/hide
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A0A5D3DH86 Sec-independent protein translocase protein TATB2.9e-11787.8Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48950 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic1.7e-2947.52Show/hide
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Q2R237 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic4.0e-3149.53Show/hide
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Q8DJ44 Sec-independent protein translocase protein TatA3.3e-0954.1Show/hide
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        ++FG+G PE +VI VVALL+FGPK L E+ R+LGKT RAF+   RE QD  +     LE E
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Q94G16 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic8.6e-4250.39Show/hide
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Q9XH75 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic2.1e-4049.63Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G28750.1 Bacterial sec-independent translocation protein mttA/Hcf1067.8e-0636.67Show/hide
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AT5G52440.1 Bacterial sec-independent translocation protein mttA/Hcf1061.5e-4149.63Show/hide
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        SSSSP+ T S L   P   S   +S       K +LS     LG   FSP+ GLKHLG  IS +   PE+++R  K   + ASLFGVGAPEALVIGVVAL
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        LVFGPKGLAEVAR LGKTLR FQPTIRELQDVSR+FK+TLEREIGLD+I  S  + YN +++    PP  P         PSVP  E    A   +DS S
Subjt:  LVFGPKGLAEVARTLGKTLRAFQPTIRELQDVSREFKTTLEREIGLDEIESSVNSSYNSSKSTYSDPPSVPKAEESVSDSPSVPKAEELSVAEPTDDSSS

Query:  ASKAYSSEEYLKVTEEQLKAQDQLQTNFAAQIQSGSQVQREGTVEEPATAAPELQNLETGKVEESTASAP
          KAY+SE+YLK TEEQLKA         A+ Q+  Q Q +   +      P  ++   G   E+TA++P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTCCAAAATTTCAGTTTCCACATTCCCATTTTCCTCATCTTCCCCATCATCTACTTGCTCAAGACTTTCACCTTCCACTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCATCTT
ATACCCCAGAACCCCCAAATTTCATCTCTCCTTGTGTAATTTCCCACTGGGTCTCCGCCTTTTCTCTCCATGGACTGGTTTAAAGCACTTGGGTATTTCTACCAGAGGAA
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CTGTTTCAGACTCACCTTCTGTTCCTAAAGCAGAAGAGCTTTCGGTGGCTGAACCAACAGATGATTCTTCATCAGCAAGCAAAGCTTATAGCTCTGAAGAGTACCTAAAG
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TGGTCCCAAGGGTCTTGCTGAGGTTGCTCGGACTCTGGGGAAGACCTTACGTGCATTTCAACCCACTATAAGAGAACTTCAGGACGTTTCTAGAGAATTCAAAACCACGC
TTGAGCGAGAAATTGGTCTCGATGAAATTGAGAGTTCAGTTAACAGCTCATACAATTCGAGCAAATCTACCTACTCAGACCCACCTTCTGTTCCTAAAGCAGAAGAGTCT
GTTTCAGACTCACCTTCTGTTCCTAAAGCAGAAGAGCTTTCGGTGGCTGAACCAACAGATGATTCTTCATCAGCAAGCAAAGCTTATAGCTCTGAAGAGTACCTAAAGGT
TACAGAAGAGCAGCTGAAAGCACAAGATCAGCTCCAAACCAATTTTGCAGCACAAATCCAGAGTGGATCCCAAGTACAGCGTGAAGGAACTGTCGAAGAACCTGCCACGG
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ATCGGTGTCTTGGAACGTAATTAGTTTCTAGACATTGGATAAGATGATTTTGTTGGATTACTGCTAATTAGAATTCCTTCCTCATTTCATATTAATATCTTCCACGGATT
TTAATTACCTTATATAAAGGCCGTTAAATAATATATGTTTTGGTCCTAATTTTTATTAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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