; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0020892 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0020892
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionHistone H1-like
Genome locationchr05:2210484..2211953
RNA-Seq ExpressionPI0020892
SyntenyPI0020892
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR005818 - Linker histone H1/H5, domain H15
IPR005819 - Linker histone H1/H5
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063593.1 histone H1-like [Cucumis melo var. makuwa]5.5e-10493.26Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAADPVVSSDAPAAA AAVAQPAENDSK+KK AASKASKAKKPSGAKK RSSPTHPPFLQMISEAI+SLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK AAAAPVA KKPVSSKLKA ASIKK AVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTV KSK +AKPKT  AAK
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

KAG6599320.1 Histone H1.2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.2e-9687.97Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAADPV SSDAP A  AAVAQP ENDSK+KK AASKASKAKKPSGAK+TRSSPTHPPF +MISEAI+SLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKT
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAKPKAKTA KPKPKAVA  KPK  AKSK +AKPK  A AK 
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKT

Query:  KAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        KAAEKVKKVAPKPKPAAK AKVAKTLSRTSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_004139246.1 histone H1 [Cucumis sativus]3.7e-10091.82Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPA   AAVAQPAENDSKAKK AASKASKAKKPSGAKK RSSPTHPPFLQMISEAI+SLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK---AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAA
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAK   AAAAPV AKKPVSSKLK AASIKKAAVAK KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSK +AKPKT  A
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK---AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAA

Query:  AKTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AKTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPA KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AKTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_008456174.1 PREDICTED: histone H1-like [Cucumis melo]4.6e-10392.88Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAADPVVSSDAPAAA AAVAQPAENDSK+KK AASKASKAKKPSGAKK RSSPTHPPFLQMISEAI+SLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK AAAAPVA KKPVSSKLKA ASIKK AVAKPKAKTAAK KPKAVAKPKPKTV KSK +AKPKT  AAK
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_022946127.1 histone H1-like [Cucurbita moschata]9.3e-9687.59Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAADPV SSDAP A  AAVAQP ENDSK+KK AASKASKAKKPSGAK+TRSSPTHPPF +MISEAI+SLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKT
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAKPKAKTA KPKPKAVA  KPK+ AKSK +AKPK  A AK 
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKT

Query:  KAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        KAAEKVKKVAPKPKPAAK AKVAKTLSRTSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLA4 H15 domain-containing protein6.5e-8784.01Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAAD V+ SDAPA   AAVAQPAENDSKAKK AASKASKAKKPSGAKK RSSPTHPPFLQMISEAI+SLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK---AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAA
        LLVHLKKLVAA+KLVKVKNSYKLPSARSIQAK   AAAAPV AKKPVSSKLK AASIKKAAVAK KAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSK +AKPKT  A
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK---AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAA

Query:  AKTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AKTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAA                      KVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AKTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A1S3C278 histone H1-like2.2e-10392.88Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAADPVVSSDAPAAA AAVAQPAENDSK+KK AASKASKAKKPSGAKK RSSPTHPPFLQMISEAI+SLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK AAAAPVA KKPVSSKLKA ASIKK AVAKPKAKTAAK KPKAVAKPKPKTV KSK +AKPKT  AAK
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A5D3D4H1 Histone H1-like2.6e-10493.26Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAADPVVSSDAPAAA AAVAQPAENDSK+KK AASKASKAKKPSGAKK RSSPTHPPFLQMISEAI+SLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK AAAAPVA KKPVSSKLKA ASIKK AVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTV KSK +AKPKT  AAK
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK-AAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK

Query:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        TKAAEKVKKVAPKPK  AKA KVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  TKAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1G2W2 histone H1-like4.5e-9687.59Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAADPV SSDAP A  AAVAQP ENDSK+KK AASKASKAKKPSGAK+TRSSPTHPPF +MISEAI+SLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKT
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAKPKAKTA KPKPKAVA  KPK+ AKSK +AKPK  A AK 
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKT

Query:  KAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        KAAEKVKKVAPKPKPAAK AKVAKTLSRTSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1KEC3 histone H1-like9.4e-9486.09Show/hide
Query:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        MSSAADPV SSDAP A  A VA P ENDSK+KK AASKASKAKKPSGAK+TRSSPTHPPF +MISEAI+SLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKT
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKP SSKLKAA S+KKAAVAKPKAKTA KPKPK VA  KPK  AKSK + KPK  A AK 
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKT

Query:  KAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        KAAEKVKKVAPKPKPAAK AKVAKTLSR SPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  KAAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08283 Histone H12.4e-3048.63Show/hide
Query:  VAQPAENDSKAKKTAASKASKAK--KPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVK
        + +P   + +  K    K  KAK  KP  A K R+  +HP + +MI +AI+SLKE+ GSSQYAI KF EEK KQLP+NF+KLLL +LKK VA+ KL+KVK
Subjt:  VAQPAENDSKAKKTAASKASKAK--KPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVK

Query:  NSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKS------KAIAKPKTAAAAKTKAAEKVKKVAPK
         S+KL +             AAKKP  +K KA  + K  +V   KAK AAKPK KAV KPK  + AK+      KA AKPKT  AAKTK      K   K
Subjt:  NSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKS------KAIAKPKTAAAAKTKAAEKVKKVAPK

Query:  PKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK
        PK   K AKVAKT  +T+PGK+ A   K  AKKV  K  K K+VKSP +KV  ++
Subjt:  PKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK

P23444 Histone H16.4e-3153.44Show/hide
Query:  SDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHK-QLPSNFRKLLLVHLKKLV
        ++ PA    A A  A  D+ A   A + A+KAKK +  KK R+SPTH P+ +M+SEAI SLKERTGSS YAI KF E+KHK +LP NFRKLL V LKKLV
Subjt:  SDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHK-QLPSNFRKLLLVHLKKLV

Query:  AADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKTKAAEKV--K
        A  KL KVKNSYKL SA     K  AAP   KKP     K  A   KAA AKPKAKT AK KP      KPK  AK KA+ KPKT A  K K A K   K
Subjt:  AADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKTKAAEKV--K

Query:  KVAPKPKPAAK---AAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
            KPKP AK    AK AKT ++ +PGK+ APA KA    +KK  T   P RK  +RK KK
Subjt:  KVAPKPKPAAK---AAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P26569 Histone H1.22.3e-3350.36Show/hide
Query:  SSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAK-KPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        S AAD  V S           +PA    K+KKT  +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AI++LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKL
Subjt:  SSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAK-KPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPK---TAAA
        LLV+LK+LVA++KLVKVK S+K+PSARS      AAPV  K  V +K K   +   AAVA  KAK AA    K   KP  K VAK+K  AKPK   TAA 
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPK---TAAA

Query:  AKTK---AAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
         K+K   A  K K VA KPK   + AK ++T +RTSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  AKTK---AAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P37218 Histone H19.2e-3850.35Show/hide
Query:  DPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVHL
        +PV+ ++      A      E +  AK   A K +KAKKP+  +K  ++PTHPP+ +MI +AI++LKERTGSSQ+AITKF EEK K LPSNF+KLLL  L
Subjt:  DPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVHL

Query:  KKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKP----------------KPKTVAKSKAI
        KK VA++KLVKVKNSYKLPS       AAAA  A KKP ++K K AA  K  A  KPKAK AAK KP A AKP                KP   AK  A 
Subjt:  KKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKP----------------KPKTVAKSKAI

Query:  AKPKTAAAAKTKAAEKVKKVAPKPKPAAK--------AAKVAKTLSRTSPGKRAAP-AAKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK
        AKPK AAAAK KAA K K    K K A K         AKVAKT +RT+P ++AAP A  AKK   KK   K VKSPA+K   ++ +K
Subjt:  AKPKTAAAAKTKAAEKVKKVAPKPKPAAK--------AAKVAKTLSRTSPGKRAAP-AAKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK

Q9M5W4 Histone H18.9e-3353.97Show/hide
Query:  SDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKP-SGAKKTRSSPT--HPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK
        +D P +A            +  K AA K  K KK    AKK +S  T  HP F +MIS+AI +LKERTGSSQYAI KF E+KHKQLPSNFRKLLL HLKK
Subjt:  SDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKP-SGAKKTRSSPT--HPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK

Query:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPK-AKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKTKAAEKV
        LVA+ KLVKVKNS+KLPSAR     AA AP  AKKP   K K A        AKPK AK  AKPK K  AK   KT A +K +AK   AA  K K A K 
Subjt:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPK-AKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKTKAAEKV

Query:  KKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARK
        K VA KP      AKVAKT +  SPGK+       K V  KK KTVKSPA K
Subjt:  KKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.0e-2848.33Show/hide
Query:  SSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKP-SGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKL
        ++DAP    A   +PA   +K +KT   K  K KK  + A K R+  +HP + +MI +AI++LKERTGSSQYAI KF EEK K+LP  FRKLLL++LK+L
Subjt:  SSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKP-SGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKL

Query:  VAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK-TKAAEKVK
        VA+ KLVKVK S+KLPSA    AKA++   AA+K   +K K A      AV K K K AA  K K     KPKT A  K  AK K     + T AA K K
Subjt:  VAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK-TKAAEKVK

Query:  KVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK
         V  KPK  A+ AK AKT   TSP K+A  A K        KK   K   KPKTVKSPA++  +R VKK
Subjt:  KVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKRAAPAAK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G18050.1 histone H1-34.1e-0938.18Show/hide
Query:  AKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPS----
        A+     K   AKKP   K T    THPP+ QMI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL      
Subjt:  AKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPS----

Query:  -ARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAI
          R    K         K ++ + +++++  K  V+  K +   K K     K    +V K KA+
Subjt:  -ARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAI

AT2G18050.2 histone H1-31.6e-0537.59Show/hide
Query:  MISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPS-----ARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKK
        MI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL        R    K         K ++ + +++++  K
Subjt:  MISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPS-----ARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKK

Query:  AAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAI
          V+  K +   K K     K    +V K KA+
Subjt:  AAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAI

AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.7e-3450.36Show/hide
Query:  SSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAK-KPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        S AAD  V S           +PA    K+KKT  +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AI++LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKL
Subjt:  SSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAK-KPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPK---TAAA
        LLV+LK+LVA++KLVKVK S+K+PSARS      AAPV  K  V +K K   +   AAVA  KAK AA    K   KP  K VAK+K  AKPK   TAA 
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPK---TAAA

Query:  AKTK---AAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
         K+K   A  K K VA KPK   + AK ++T +RTSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  AKTK---AAEKVKKVAPKPKPAAKAAKVAKTLSRTSPGKR-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein3.9e-2346.73Show/hide
Query:  SSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAK-KPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL
        S AAD  V S           +PA    K+KKT  +KA+K   K +   K +++ +HP + +MI +AI++LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKL
Subjt:  SSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAK-KPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK
        LLV+LK+LVA++KLVKVK S+K+PSARS      AAPV  K  V +K KA+ +  + +   P  K AA  K  AV K  P    K K+ AK  +   AK
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCCGCCGCCGATCCCGTTGTCTCCTCCGACGCTCCCGCTGCAGCAACTGCGGCGGTGGCCCAGCCAGCTGAGAACGATTCAAAGGCCAAGAAAACTGCTGCCTC
TAAAGCATCGAAGGCGAAGAAACCATCTGGTGCGAAGAAGACAAGATCTTCTCCGACTCACCCTCCGTTCCTTCAGATGATTAGCGAAGCGATCCTTTCGCTGAAGGAGA
GAACCGGGTCAAGTCAGTACGCCATTACAAAGTTCAACGAAGAGAAACACAAACAATTGCCTTCCAATTTCAGGAAGCTTTTGCTCGTTCATCTCAAGAAACTAGTCGCC
GCTGATAAACTCGTCAAGGTCAAGAACTCCTACAAGCTTCCATCGGCTCGTTCTATTCAAGCAAAAGCCGCAGCAGCACCAGTTGCCGCCAAGAAGCCTGTAAGCTCAAA
GCTCAAAGCAGCAGCAAGCATCAAGAAAGCGGCCGTTGCTAAACCGAAAGCCAAAACTGCTGCGAAACCTAAGCCGAAAGCTGTAGCGAAGCCGAAGCCGAAGACAGTCG
CTAAATCCAAGGCCATCGCGAAACCTAAAACCGCCGCCGCTGCCAAGACGAAGGCAGCTGAGAAGGTTAAGAAGGTTGCTCCAAAGCCTAAACCGGCAGCCAAGGCGGCC
AAAGTAGCGAAAACACTGTCGCGAACGTCGCCAGGAAAGAGAGCTGCACCGGCGGCAAAGGCGAAGAAGGTAGCGGCGAAGAAGCCAAAGACGGTTAAGTCGCCGGCGAG
GAAAGTCCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTCTCTCTAAAACCATTTCCTCTCCCTCTTCTCATCGATTCCGTTTCCAATAATGTCTTCCGCCGCCGATCCCGTTGTCTCCTCCGACGCTCCCGCTGCAGCAACTGCG
GCGGTGGCCCAGCCAGCTGAGAACGATTCAAAGGCCAAGAAAACTGCTGCCTCTAAAGCATCGAAGGCGAAGAAACCATCTGGTGCGAAGAAGACAAGATCTTCTCCGAC
TCACCCTCCGTTCCTTCAGATGATTAGCGAAGCGATCCTTTCGCTGAAGGAGAGAACCGGGTCAAGTCAGTACGCCATTACAAAGTTCAACGAAGAGAAACACAAACAAT
TGCCTTCCAATTTCAGGAAGCTTTTGCTCGTTCATCTCAAGAAACTAGTCGCCGCTGATAAACTCGTCAAGGTCAAGAACTCCTACAAGCTTCCATCGGCTCGTTCTATT
CAAGCAAAAGCCGCAGCAGCACCAGTTGCCGCCAAGAAGCCTGTAAGCTCAAAGCTCAAAGCAGCAGCAAGCATCAAGAAAGCGGCCGTTGCTAAACCGAAAGCCAAAAC
TGCTGCGAAACCTAAGCCGAAAGCTGTAGCGAAGCCGAAGCCGAAGACAGTCGCTAAATCCAAGGCCATCGCGAAACCTAAAACCGCCGCCGCTGCCAAGACGAAGGCAG
CTGAGAAGGTTAAGAAGGTTGCTCCAAAGCCTAAACCGGCAGCCAAGGCGGCCAAAGTAGCGAAAACACTGTCGCGAACGTCGCCAGGAAAGAGAGCTGCACCGGCGGCA
AAGGCGAAGAAGGTAGCGGCGAAGAAGCCAAAGACGGTTAAGTCGCCGGCGAGGAAAGTCCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAATGAATTATGTGTTTAGGGTTTTGATTAAT
TTCTAGGGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTCCCCTGGTACTTATTAGTAGTACGTAGCGATGTAAATTAGGGATATGAGATGCAACCGTTCGTTGTTATACAATATTTTTA
TCAAATTTTAGTTTGGTAAATTCAATGGCTTATTATCAAGTTAATCTTTTTCTTTGAATGAATCGAGCGATCTTCTTTTGGTTTTTGTTCGAGTGTTAAAGCTTCGAGTT
TTGCTTCAATGGCGGATTTCCCGTAATTAAAGCGTCGTTTTAGTCGTTTCATGTGCTTAAACGGAAAATTCAGAATCTGTACGGTTCTCGTGCATTGCACGCGATTACAA
TCCACGTTGTGCCAACGTGGCTGCTTTACACGCGATTACATTCCACGTCGTGCCGACGTGGCTACTTTTGGGGAATTTGTTGTTAAAGTTTATTATGTATTAATTTAGGG
ATTTTGGTGGTTAAAGAGATTGAGTTTTTATTTTATTTAATATTAATTTAATAATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSAADPVVSSDAPAAATAAVAQPAENDSKAKKTAASKASKAKKPSGAKKTRSSPTHPPFLQMISEAILSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVA
ADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAAPVAAKKPVSSKLKAAASIKKAAVAKPKAKTAAKPKPKAVAKPKPKTVAKSKAIAKPKTAAAAKTKAAEKVKKVAPKPKPAAKAA
KVAKTLSRTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK