| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7022543.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 4.4e-120 | 86.35 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDY+DRD++R RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-------------RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSP RS SP+RSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT RSVSPRG+PA+SRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-------------RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
|
|
| XP_004136874.2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis sativus] | 9.8e-136 | 95.76 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDY+D+D++RRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRYDDERRSRSL
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP RSPSPRRSLSPRRSPSPR+ESPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRPA+SRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSDDK
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 1.6e-138 | 97.53 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDY+DRD++RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRYDDERRSRS+
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPA+SRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSDDK
|
|
| XP_022141921.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Momordica charantia] | 2.0e-120 | 89.36 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDER--RSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRRYRDD +DRD++RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDER--RSR
Query: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
S SRS+SRG+SRSVDS SPGR RS SPRRSLSP+RSPSPR ESP RNG+ GGR+PT RSVSPRG+PA+SRSPSPQNSD
Subjt: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 1.2e-130 | 93.64 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDER--RSR
IHKGKISEAFPKSRY+SRSRSPRRRYRDDY+DRD++RRSRSRSRSRS DRSDRDRRGRE+ERER++RRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDER--RSR
Query: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
S SRSRSRGRSRSVDSGSPGR+SPSP RSPSPRRSLSPRRSPSPR SPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRP +SRSPSPQNSD
Subjt: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 4.7e-136 | 95.76 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDY+D+D++RRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRYDDERRSRSL
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP RSPSPRRSLSPRRSPSPR+ESPERNGNG GRSPTSRSVSPRGRPA+SRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSDDK
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 7.8e-139 | 97.53 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDY+DRD++RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRYDDERRSRS+
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSDDK
SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPA+SRSPSPQNSDDK
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSDDK
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 9.6e-121 | 89.36 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDER--RSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRRYRDD +DRD++RRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDER--RSR
Query: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
S SRS+SRG+SRSVDS SPGR RS SPRRSLSP+RSPSPR ESP RNG+ GGR+PT RSVSPRG+PA+SRSPSPQNSD
Subjt: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 2.1e-120 | 86.35 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDY+DRD++R RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-------------RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSP RS SP+RSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT RSVSPRG+PA+SRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-------------RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 3.4e-118 | 83.95 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRD+Y+DRD++R RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDY+KGRGRGRY DERR+RS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSL
Query: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-------------------RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
S SRSRGRSRSV+S SPGRRSPSP RS SP+RSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT RSVSPRG+ A+SRSPSPQNSD
Subjt: SRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSP-------------------RSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSPQNSD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.2e-27 | 44.98 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + S Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S + R + +S S+S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNG
RSRSR RSRS RS SP S R S S RS SP +SPE G
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 5.9e-27 | 44.58 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S + R + +S S+S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNG
RSRSR RSRS RS SP S R S S RS SP +SPE G
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNG
|
|
| Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.5e-27 | 44.58 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S + R + +S S+S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNG
RSRSR RSRS RS SP S R S S RS SP +SPE G
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 5.9e-27 | 44.58 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG ++DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLS
+G + Y RSRSPRRR RRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S + R + +S S+S
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLS
Query: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNG
RSRSR RSRS RS SP S R S S RS SP +SPE G
Subjt: RSRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 4.1e-68 | 60.13 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDY+++D+++RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP----------SPRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP + RSPSPRRSLSPR SPS ++ SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP----------SPRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPANSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPANSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 8.5e-13 | 38.29 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
Query: SRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSR
+ R R R + RD +RR+ R SRS RS RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R RSL+ R + RS
Subjt: SRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSR
Query: SVDSGSPGRRSP-SPRSPSPR--RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSP
S RSP RSPSP+ RS+SPRRS S SP R+ RSP S PA SRS SP
Subjt: SVDSGSPGRRSP-SPRSPSPR--RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSP
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 4.5e-14 | 36.3 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSR
+ E SR+R R R+P R Y S RS RRGR R R D+ R RSISPR D + R D R R
Subjt: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDH------RRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSR
Query: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP-SPRSPSPR--RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSP
SL+ R + RS S RSP RSPSP+ RS+SPRRS S SP R+ RSP S PA SRS SP
Subjt: SLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP-SPRSPSPR--RSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPSP
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.1e-12 | 36.26 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSR
+ + +S R++ R RSP R R R RRSRSRSR + + R +SRS+SP+ RY+ E RS SR
Subjt: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRRPSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSR
Query: SRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPS
S SR V SGSPGR S SPRRS+SPR++ S E R+ + R S + PRG RSPS
Subjt: SRSRGRSRSVDSGSPGRRSPSPRSPSPRRSLSPRRSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRSVSPRGRPANSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.9e-69 | 60.13 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDY+++D+++RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP----------SPRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP + RSPSPRRSLSPR SPS ++ SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP----------SPRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPANSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPANSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.9e-69 | 60.13 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG +VDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTMVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDY+++D+++RSRSRS DRR R E++RDHRRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYKDRDHKRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDHRRRSRSISPRR
Query: PSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP----------SPRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
SPD K R RGRYD+E RS S S S S R RS S SP + SP + RSPSPRRSLSPR SPS ++ SPER N RSP+ S
Subjt: PSPDYTKGRGRGRYDDERRSRSLSRSRSRGRSRSVDSGSPGRRSP----------SPRSPSPRRSLSPR------RSPSPRDESPERNGNGGGRSPTSRS
Query: VSP-RGRPANSRSPSP
+P R A SRS SP
Subjt: VSP-RGRPANSRSPSP
|
|
