; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0021138 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0021138
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationchr09:19775919..19776654
RNA-Seq ExpressionPI0021138
SyntenyPI0021138
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]2.2e-4798.96Show/hide
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XP_022134197.1 mini zinc finger protein 2-like [Momordica charantia]4.8e-4291.67Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]2.8e-4291.67Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]3.9e-4492.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor5.5e-4496.74Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 21.1e-4798.96Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 21.1e-4798.96Show/hide
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A0A6J1BYZ4 mini zinc finger protein 2-like2.3e-4291.67Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like1.4e-4291.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 16.7e-2370Show/hide
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        VRY ECQ+NHAA +GG+A+DGCREFMASG EGT A L CAACGCHR+FHRR+V      CDCSS  S+GT
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 37.9e-2460.64Show/hide
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        M+KRQVV+++ +     T +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYA+DGCREFMASG +     LTCAACGCHRNFHRR+V TEVVC+ S   +N
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 16.7e-2370Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 19.4e-2556.7Show/hide
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        M+KRQ+V+++    S          + +SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYA+DGCREFMA+G EGT   L CAACGCHRNFHR++V TEVVC+ S
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 22.4e-3677.78Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger5.6e-2560.64Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 16.7e-2656.7Show/hide
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AT2G18350.1 homeobox protein 247.4e-1765.38Show/hide
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        RY ECQKNHAA  GG+ +DGC EFM+SG+EGT   L CAAC CHR+FHR+++
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AT3G28917.1 mini zinc finger 21.7e-3777.78Show/hide
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AT4G24660.1 homeobox protein 224.3e-1765.38Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+A+DGC EFM SG++GT   L CAACGCHRNFHR++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCCTCAAGGGACACTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCA
CGCTGCCGGGGTCGGAGGGTATGCCCTTGACGGGTGTCGAGAATTCATGGCGAGTGGTGACGAAGGGACGACCGCTGGACTGACTTGTGCCGCTTGTGGTTGCCACCGGA
ATTTTCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTGTGTGATTGTTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTTTTTTTAGAACAAGACCTAGCTAATTACCCTTAAAAAAAACCTTTTTTTACAATTTTTTCTTTGGTTCAAATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAA
GAACCCTCAAGGGACACTGTGGCTTCTTCTTTCACAGTTAGAAGTGTAAGATATGGGGAGTGTCAAAAGAACCACGCTGCCGGGGTCGGAGGGTATGCCCTTGACGGGTG
TCGAGAATTCATGGCGAGTGGTGACGAAGGGACGACCGCTGGACTGACTTGTGCCGCTTGTGGTTGCCACCGGAATTTTCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTGT
GTGATTGTTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAAAAGACTACACACATAATAATACTATAACTTCAGTGTGTATGGGGTGAGGAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGGT
GCTGAATAAACAAAATTTCTCAACATGGGATTGAGAGTTGAGATTCAGCTCTGTTGTTGTGTTGCTTGAATTATTATTATTATTTTTAAAAAAATTTCTTGTGTTGGATT
GGAATGAACTTGACTTGAACTAAGAAATTGTGTTTTGTGTAATTTGAATTTTTTCCCTTTAATTTCCGGTTCATTTGAGGATAAAAAAAGGTATGTAAGTCCTTTTTTTT
CATTATATGTATTTGATTTGAGTGTATCAATTATCTTTTGGAGATTGGAAGTAATAGACCAAAAATCTTTATTGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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