CuGenDBv2

Gene ID	PI0021185
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	Late embryogenesis abundant protein 6
Genome location	chr06:29554113..29555666
RNA-Seq Expression	PI0021185
Synteny	PI0021185
Gene Ontology terms	GO:0009793 - embryo development ending in seed dormancy (biological process)
InterPro domains	IPR005513 - Late embryogenesis abundant protein, LEA_1 subgroup

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6577696.1 Late embryogenesis abundant protein 6, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

4.1e-40

83.62

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP
        MEKLSNMGSVAK+KLKICRAKLDEKV+KAS KTAEERKI EERRKAA AEAKRELHEAKARHAAQKLR R+SHVLG  LHHQ PVEGG+      A NVP
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP

Query:  AYPIASPEGYYPGHKI
        AYPIASPEGYYPGH+I
Subjt:  AYPIASPEGYYPGHKI

XP_004148757.1 late embryogenesis abundant protein 6 [Cucumis sativus]

8.9e-51

95.69

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP
        MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKI+EERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGH HHQSP+EGGAATHLGGATNVP
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP

Query:  AYPIASPEGYYPGHKI
        AYPI SPEGY+PGHKI
Subjt:  AYPIASPEGYYPGHKI

XP_008448704.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490795 [Cucumis melo]

2.0e-50

97.44

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVL-GGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNV
        MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVL GGHLHH SPVEGGAATHLGG TNV
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVL-GGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNV

Query:  PAYPIASPEGYYPGHKI
        PAYPIASPEGYYPGHKI
Subjt:  PAYPIASPEGYYPGHKI

XP_023553167.1 late embryogenesis abundant protein 6-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

7.0e-40

83.62

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP
        MEKLSNMGSVAK+KLKICRAKLDE V+KASVKTAEERKI EERRKAA AEAKRELHEAKARHAAQKLR R+SHVLG  LHHQ PVEGG+      A NVP
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP

Query:  AYPIASPEGYYPGHKI
        AYPIASPEGYYPGH+I
Subjt:  AYPIASPEGYYPGHKI

XP_038906206.1 late embryogenesis abundant protein 6-like [Benincasa hispida]

3.4e-42

85.34

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP
        MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKT EERKI EERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLR++KSHVLGGHLHH  P+EG AAT+LG A    
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP

Query:  AYPIASPEGYYPGHKI
        AYPI + EGYYPGHKI
Subjt:  AYPIASPEGYYPGHKI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BKB4 uncharacterized protein LOC103490795

9.6e-51

97.44

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVL-GGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNV
        MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVL GGHLHH SPVEGGAATHLGG TNV
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVL-GGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNV

Query:  PAYPIASPEGYYPGHKI
        PAYPIASPEGYYPGHKI
Subjt:  PAYPIASPEGYYPGHKI

A0A5D3CHS9 Seed maturation protein

9.6e-51

97.44

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVL-GGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNV
        MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVL GGHLHH SPVEGGAATHLGG TNV
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVL-GGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNV

Query:  PAYPIASPEGYYPGHKI
        PAYPIASPEGYYPGHKI
Subjt:  PAYPIASPEGYYPGHKI

A0A6J1E5Y8 late embryogenesis abundant protein 6-like isoform X2

4.5e-40

82.76

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP
        MEKLSNMGSVAK+KLKICRAKLDEKV+KAS KTAEERKI EERRKAA AEAKRELHEAKARHAAQKLR R+SHV+G  LHHQ PVEGG+      A NVP
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP

Query:  AYPIASPEGYYPGHKI
        AYPIASPEGYYPGH+I
Subjt:  AYPIASPEGYYPGHKI

A0A6J1E6N7 late embryogenesis abundant protein 6-like isoform X1

4.5e-40

82.76

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP
        MEKLSNMGSVAK+KLKICRAKLDEKV+KAS KTAEERKI EERRKAA AEAKRELHEAKARHAAQKLR R+SHV+G  LHHQ PVEGG+      A NVP
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP

Query:  AYPIASPEGYYPGHKI
        AYPIASPEGYYPGH+I
Subjt:  AYPIASPEGYYPGHKI

A0A6J1HN56 late embryogenesis abundant protein 6-like isoform X1

6.4e-39

81.9

Show/hide

Query:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP
        MEKLSNMGSVAK+KLKICRAKL+EKV+KAS KTAEERKIVEERRKAA AE KRELHEAKARHAAQKLR R+SHVLG  LHHQ PVE G+      A NVP
Subjt:  MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVP

Query:  AYPIASPEGYYPGHKI
        AYPIASPEGYYPGH+I
Subjt:  AYPIASPEGYYPGHKI

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q39138 Late embryogenesis abundant protein 6

3.8e-12

40.94

Show/hide

Query:  EKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHV----LGGHLHHQSPVEG-------GAA
        +K+S+M S AKEK+ IC+AK DEK E+A  +T EE++I  +RRKA  AEA  ++H AKA HA  KL  ++SH      G H+  Q+PV         G  
Subjt:  EKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHV----LGGHLHHQSPVEG-------GAA

Query:  THLGGATNVPA---YPIASPEGYYPGH
         +  G T+VP    +P   P G++  H
Subjt:  THLGGATNVPA---YPIASPEGYYPGH

Q96273 Late embryogenesis abundant protein 18

1.2e-05

41.86

Show/hide

Query:  EKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEG
        EK+S+M S AKEKL I  AK     EK   +T +E+K+ +ER K+  A+AK +LH++KA HAA        H L GH  + +   G
Subjt:  EKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEG

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G32560.1 Late embryogenesis abundant protein, group 1 protein

2.7e-13

40.94

Show/hide

Query:  EKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHV----LGGHLHHQSPVEG-------GAA
        +K+S+M S AKEK+ IC+AK DEK E+A  +T EE++I  +RRKA  AEA  ++H AKA HA  KL  ++SH      G H+  Q+PV         G  
Subjt:  EKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHV----LGGHLHHQSPVEG-------GAA

Query:  THLGGATNVPA---YPIASPEGYYPGH
         +  G T+VP    +P   P G++  H
Subjt:  THLGGATNVPA---YPIASPEGYYPGH

AT2G35300.1 Late embryogenesis abundant protein, group 1 protein

8.4e-07

41.86

Show/hide

Query:  EKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEG
        EK+S+M S AKEKL I  AK     EK   +T +E+K+ +ER K+  A+AK +LH++KA HAA        H L GH  + +   G
Subjt:  EKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGAAGCTGAGTAATATGGGTAGTGTTGCTAAAGAAAAGCTCAAAATTTGTAGAGCCAAACTCGACGAGAAGGTGGAGAAAGCGTCGGTGAAGACGGCGGAGGAGAG
GAAGATTGTGGAGGAGAGGAGGAAGGCAGCAACGGCGGAGGCGAAGCGGGAGCTACACGAGGCAAAAGCCAGACATGCTGCTCAAAAGCTAAGGAATAGGAAATCACATG
TACTTGGTGGCCATCTACACCATCAATCACCGGTGGAAGGCGGTGCCGCCACACATCTTGGTGGAGCAACAAATGTTCCGGCTTATCCTATAGCTAGCCCGGAAGGGTAC
TATCCCGGACATAAAATTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEKLSNMGSVAKEKLKICRAKLDEKVEKASVKTAEERKIVEERRKAATAEAKRELHEAKARHAAQKLRNRKSHVLGGHLHHQSPVEGGAATHLGGATNVPAYPIASPEGY
YPGHKI

PI0021185 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome