; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0021224 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0021224
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-2A
Genome locationchr04:3227445..3229818
RNA-Seq ExpressionPI0021224
SyntenyPI0021224
Gene Ontology termsGO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6594717.1 Ras-related protein RABB1c, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.5e-7598.6Show/hide
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KAG7026687.1 Ras-related protein RABB1c [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.5e-7598.6Show/hide
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XP_004134816.1 ras-related protein RABB1c [Cucumis sativus]8.4e-76100Show/hide
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XP_008440951.1 PREDICTED: ras-related protein RABB1c-like [Cucumis melo]1.9e-7599.3Show/hide
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XP_022926861.1 ras-related protein RABB1c-like [Cucurbita moschata]5.5e-7598.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMV2 Uncharacterized protein4.1e-76100Show/hide
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A0A1S3B2A4 ras-related protein RABB1c-like9.1e-7699.3Show/hide
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A0A5A7SKE6 Ras-related protein RABB1c-like9.1e-7699.3Show/hide
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A0A6J1EG19 ras-related protein RABB1c-like2.6e-7598.6Show/hide
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A0A6J1KNY2 ras-related protein RABB1c-like2.6e-7598.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P36863 GTP-binding protein yptV44.5e-7291.61Show/hide
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P49103 Ras-related protein Rab-2-A2.2e-7493.71Show/hide
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P49104 Ras-related protein Rab-2-B2.2e-7493.71Show/hide
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P92963 Ras-related protein RABB1c1.1e-7595.8Show/hide
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Q39570 GTP-binding protein YPTC44.5e-7291.61Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C2.6e-4356.74Show/hide
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        Y YLFK ++IGD+GVGKS +L +FT N F      TIGVEF  R   +E K IK QIWDTAGQE +R+IT +YYRGA GALLVYDIT+R+TF++++ WL 
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        + R HA++N+ IM+ GNKSDL H R+V+ E+G+  A++ GL
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AT4G17160.1 RAB GTPase homolog B1A1.5e-6783.92Show/hide
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        MSYAY FKYI+IGDTGVGKSCLLL+FTD RFQ VHDLTIGVEFGA+ ITI+NKPIKLQIWDTAGQESFRS+TRSYYRG AG LLVYDITRRETFNHL SW
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        LE+ARQHA+ NMT MLIGNK DL  +R VSTEEGE FA+EHGL
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AT4G17170.1 RAB GTPase homolog B1C8.1e-7795.8Show/hide
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        LEDARQHANANMTIMLIGNK DLAHRRAVSTEEGE FAKEHGL
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AT4G35860.1 GTP-binding 22.1e-7288.81Show/hide
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        MSY YLFKYI+IGDTGVGKSCLLLQFTD RFQPVHDLTIGVEFGARM+T++ +PIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHL SW
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        LEDARQHAN NM+IMLIGNK DLAH+RAVS EEG+ FAKEHGL
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AT4G35860.2 GTP-binding 23.7e-4586.6Show/hide
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        M+T++ +PIKLQIWDTAGQESFRSITRSYYRGAAGALLVYDITRRETFNHL SWLEDARQHAN NM+IMLIGNK DLAH+RAVS EEG+ FAKEHGL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGTATGCTTACCTATTCAAGTATATCGTCATCGGCGATACCGGAGTTGGAAAATCGTGTCTTCTCCTTCAGTTCACGGATAATCGATTTCAGCCTGTTCATGACTT
AACTATCGGGGTCGAATTCGGAGCCAGAATGATCACCATTGAGAATAAGCCAATTAAGCTCCAGATTTGGGATACTGCCGGCCAAGAGTCATTCAGGTCCATTACAAGGT
CCTACTATAGAGGTGCTGCTGGTGCCTTGCTTGTCTATGATATTACCAGAAGGGAGACTTTCAATCACTTGATTAGCTGGTTAGAAGATGCAAGGCAGCATGCAAATGCA
AACATGACAATTATGCTAATTGGTAATAAGAGTGATCTTGCTCATAGAAGGGCTGTGAGCACAGAAGAGGGTGAACTGTTTGCAAAGGAGCATGGTTTATATTCATGGAG
GCATCTGCCAAAACTGCCCAGAATGTTGAAGAGGCATTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCATTGTGAATTGCTCTACGTTTCTCTGTTTTTGCATAAATTCAGACGATAATCTTTGGATTTAATCACACCATTTTTGCGATTAATCACTGTATTCTATTTCTGAAG
CAGATCCGGCCGGAAAAAATGTCGTATGCTTACCTATTCAAGTATATCGTCATCGGCGATACCGGAGTTGGAAAATCGTGTCTTCTCCTTCAGTTCACGGATAATCGATT
TCAGCCTGTTCATGACTTAACTATCGGGGTCGAATTCGGAGCCAGAATGATCACCATTGAGAATAAGCCAATTAAGCTCCAGATTTGGGATACTGCCGGCCAAGAGTCAT
TCAGGTCCATTACAAGGTCCTACTATAGAGGTGCTGCTGGTGCCTTGCTTGTCTATGATATTACCAGAAGGGAGACTTTCAATCACTTGATTAGCTGGTTAGAAGATGCA
AGGCAGCATGCAAATGCAAACATGACAATTATGCTAATTGGTAATAAGAGTGATCTTGCTCATAGAAGGGCTGTGAGCACAGAAGAGGGTGAACTGTTTGCAAAGGAGCA
TGGTTTATATTCATGGAGGCATCTGCCAAAACTGCCCAGAATGTTGAAGAGGCATTCGTAAAGACAGCTGCGACCATATTCAAGAAGATTCAGGATGGAGTATTTGATGT
TTCAAATGAGTCTTATGGAATCAAAGTTGGATATGGCGGCATACCGGGACCGTCGGGCAGCAGGGAGGGATCATCTTCCCAAGCTGGCGGCTGTTGCAATTGAACCATGA
AATTATAGAAACTAGCTGACTTCAACAATCTGTTTGTGCCTGTCTTAATTCATTTCATTCTTTTAATCTTTTTCATTTTTCCTCATGTACTGCTGTGAAATGTGAATATC
CCCTCCCTCCCCCAACCAAAAAAAGAGTAGAAGAAACTTTTGTGTTAAAAGGAAAGGCAGGTTCTTTTAATGCTACTACATTTTCACTCTGCAGTCAATTCAATTGTAAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NMTIMLIGNKSDLAHRRAVSTEEGELFAKEHGLYSWRHLPKLPRMLKRHS