; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0021400 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0021400
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionDUF1985 domain-containing protein
Genome locationchr08:11280370..11280555
RNA-Seq ExpressionPI0021400
SyntenyPI0021400
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025875.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold34G001540 [Cucumis melo var. makuwa]7.3e-0457.41Show/hide
Query:  RMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA
        RM+R+  K Y E   V + IWI+A RGK+    K+KENS SS  PSFDLHLSQA
Subjt:  RMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA

KAA0033325.1 protein Ycf2-like [Cucumis melo var. makuwa]6.6e-0558.33Show/hide
Query:  MAKDREERMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPS
        M +D+E+RM+R+ DK Y E K V + IWI+  RGK+G SNKEKENS S
Subjt:  MAKDREERMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPS

KAA0035754.1 protein Ycf2-like [Cucumis melo var. makuwa]7.3e-0457.41Show/hide
Query:  RMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA
        RM+R+  K Y E   V + IWI+A RGK+    K+KENS SS  PSFDLHLSQA
Subjt:  RMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA

KAA0042311.1 hypothetical protein E6C27_scaffold824G001090 [Cucumis melo var. makuwa]4.3e-0458.49Show/hide
Query:  MRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA
        M+R+  K Y E   V +RIWI+A RGK+    K+KENS SS  PSFDLHLSQA
Subjt:  MRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SN41 DUF1985 domain-containing protein3.5e-0457.41Show/hide
Query:  RMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA
        RM+R+  K Y E   V + IWI+A RGK+    K+KENS SS  PSFDLHLSQA
Subjt:  RMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA

A0A5A7SVZ4 Protein Ycf2-like3.2e-0558.33Show/hide
Query:  MAKDREERMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPS
        M +D+E+RM+R+ DK Y E K V + IWI+  RGK+G SNKEKENS S
Subjt:  MAKDREERMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPS

A0A5A7SWP9 Protein Ycf2-like3.5e-0457.41Show/hide
Query:  RMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA
        RM+R+  K Y E   V + IWI+A RGK+    K+KENS SS  PSFDLHLSQA
Subjt:  RMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA

A0A5A7TL52 DUF1985 domain-containing protein2.1e-0458.49Show/hide
Query:  MRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA
        M+R+  K Y E   V +RIWI+A RGK+    K+KENS SS  PSFDLHLSQA
Subjt:  MRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA

A0A5D3BRJ0 Protein Ycf2-like6.0e-0454.24Show/hide
Query:  KDREERMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA
        K  E RM+R+  K Y E   V + IWI+A RGK+    K+KENS SS  PSFD HLSQA
Subjt:  KDREERMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAAAAGATAGGGAAGAACGAATGAGAAGAGCATATGATAAACCCTATATAGAGGAGAAGCTAGTGATATCGAGAATATGGATAAATGCAGCAAGAGGGAAAATGGG
ACGATCAAACAAAGAGAAAGAAAATTCACCTTCATCAAACATGCCATCATTTGACTTGCATCTGAGTCAGGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAAAAGATAGGGAAGAACGAATGAGAAGAGCATATGATAAACCCTATATAGAGGAGAAGCTAGTGATATCGAGAATATGGATAAATGCAGCAAGAGGGAAAATGGG
ACGATCAAACAAAGAGAAAGAAAATTCACCTTCATCAAACATGCCATCATTTGACTTGCATCTGAGTCAGGCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKDREERMRRAYDKPYIEEKLVISRIWINAARGKMGRSNKEKENSPSSNMPSFDLHLSQA