; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0021433 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0021433
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionBEST Arabidopsis thaliana protein match is: s in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink).
Genome locationchr05:5487867..5488439
RNA-Seq ExpressionPI0021433
SyntenyPI0021433
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055564.1 putative OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B [Cucumis melo var. makuwa]9.0e-9393.72Show/hide
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KAG7029810.1 hypothetical protein SDJN02_08153, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.9e-6472.25Show/hide
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TYK01355.1 putative OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-9394.24Show/hide
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XP_022997465.1 uncharacterized protein LOC111492375 [Cucurbita maxima]6.1e-6572.49Show/hide
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XP_031737371.1 uncharacterized protein LOC116402243 [Cucumis sativus]1.6e-8992.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHA2 Uncharacterized protein3.6e-5593.28Show/hide
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A0A5A7UK88 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B4.4e-9393.72Show/hide
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A0A5D3BQA0 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B1.1e-9394.24Show/hide
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A0A6J1ENL5 uncharacterized protein LOC1114361412.5e-6471.96Show/hide
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A0A6J1K9Q8 uncharacterized protein LOC1114923752.9e-6572.49Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G25845.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B (TAIR:AT4G25850.2)3.6e-1547.78Show/hide
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        MK       SSI  +S   YY     +GVPF+WE QPGTP +  P++++PPLSPPPA+LSLG+PKP   I++PK+   P +++LR WK +
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AT4G25850.2 OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B4.9e-1237.25Show/hide
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        MK       SSI  +S   YY     +GVPF+WE QPGTP +  P++++PPLSPPPA+LSLG+PKP   I++PK+   P +++LR WK +   R   R  
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             +     L   + FS     D E  AS+  R  +S   T    S  ++F
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AT5G01790.1 unknown protein1.2e-0550.98Show/hide
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        S  C S  IYY   A   VPF+WE+ PGTPK P  +   LPPL+PPP+  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATAGATCACTATAATGATAAGTTGGAAACCTTTTCATTTCTTAGTTCTGATTGTGAGTTCATGGCGTCTTCTAGTCCTCGAGACTCAATGTCTTCGTCTTCGACGTCGTC
ATCTTCTTCATCACCATCATCTTTCCTCGATTCGTTAAACATGCGAAATACGAGGAAGGTTTCATTTGAAAGGCCTTCAAGTTGGAATAATGCTTGGCAAATTAATAGAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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