; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0021472 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0021472
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionfasciclin-like arabinogalactan protein 7
Genome locationchr01:3824716..3826442
RNA-Seq ExpressionPI0021472
SyntenyPI0021472
Gene Ontology termsGO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR000782 - FAS1 domain
IPR036378 - FAS1 domain superfamily
IPR045003 - Fasciclin-like arabinogalactan protein, group A


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0059150.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]3.5e-13297.25Show/hide
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XP_038888065.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Benincasa hispida]2.8e-12694.51Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K597 FAS1 domain-containing protein3.1e-13498.82Show/hide
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A0A1S3C2C3 fasciclin-like arabinogalactan protein 72.6e-13398.04Show/hide
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A0A5D3BU74 Fasciclin-like arabinogalactan protein 71.7e-13297.25Show/hide
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A0A6J1C1K1 fasciclin-like arabinogalactan protein 74.2e-12391.37Show/hide
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A0A6J1I0D1 fasciclin-like arabinogalactan protein 77.1e-12392.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LEE9 Fasciclin-like arabinogalactan protein 125.2e-3041.89Show/hide
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         +L++LT +Q   LI FH +P Y S + F+ +S  NP+ T AG    G + LN T    T++I SG TNT VS +V+S   +AVYQVDK+LLP+ +F   
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         P  PAPAPAP ++ +     D
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Q8LEJ6 Fasciclin-like arabinogalactan protein 114.7e-2334.84Show/hide
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        NP+ T AG    G++ LN T     ++I +G  +  V++SV+S   +AVYQVD++LLP A+FG+ + P PAP     ++  + +  D   G +  SS+ +
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Query:  PSSSHRIINWGILIHIVLGIS
         +       +GI I  V  I+
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Q9SIL7 Fasciclin-like arabinogalactan protein 67.3e-2436.76Show/hide
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        PAP      +NLT +L     F T +  L +T+       Q N++++G+TIF P D+AF   K  +L++LT  Q   L+L+H +P YYSL++   L   N
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        P+ T A    GG + LNFT    S  +++ +G   T++++++    P+AVY VD +LLPE +FGT   PT APAP    + + AD+P+   + K+A SS 
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Query:  PKPS
         + S
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Q9SJ81 Fasciclin-like arabinogalactan protein 73.9e-7867.81Show/hide
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        M  ++  A++ L   SA+A+TASPP+  L PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST  I+TFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK P LS
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        NLT DQLK L+LFH LPHYYSL+EF+NLS   P+ TFAGGQYSL FTDVSGT+ I S WT TKVSSSV S+DPVAVYQV+++LLPEAIFGTD+PP PAPA
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        PAP ++  +D+PS V D + A S    P SSH+
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Q9ZWA8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 95.6e-2434.43Show/hide
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        T+   LL+ +   A   TA P +    PAP PA   +NLT +L   G F TF+  L  T+       Q N++ EG+T+F P D+AF   K  +L+ L+ D
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            LIL+H  P YYS+ +   LS+ NP+ T A G+    Y LNFT  +  I++ +G+  T++S+S+    P+AVY VD +LLP  +FG       APAP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03870.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 93.9e-2534.43Show/hide
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AT2G04780.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 72.8e-7967.81Show/hide
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        M  ++  A++ L   SA+A+TASPP+  L PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST  I+TFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK P LS
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        NLT DQLK L+LFH LPHYYSL+EF+NLS   P+ TFAGGQYSL FTDVSGT+ I S WT TKVSSSV S+DPVAVYQV+++LLPEAIFGTD+PP PAPA
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        PAP ++  +D+PS V D + A S    P SSH+
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AT2G04780.2 FASCICLIN-like arabinoogalactan 72.8e-7967.81Show/hide
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        M  ++  A++ L   SA+A+TASPP+  L PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST  I+TFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK P LS
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        PAP ++  +D+PS V D + A S    P SSH+
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AT2G20520.1 FASCICLIN-like arabinogalactan 65.2e-2536.76Show/hide
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        PAP      +NLT +L     F T +  L +T+       Q N++++G+TIF P D+AF   K  +L++LT  Q   L+L+H +P YYSL++   L   N
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        P+ T A    GG + LNFT    S  +++ +G   T++++++    P+AVY VD +LLPE +FGT   PT APAP    + + AD+P+   + K+A SS 
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Query:  PKPS
         + S
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AT5G60490.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 123.7e-3141.89Show/hide
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        M  S+I  + + LLLL        T +P  LS P+PA APAP    N+T +L  AG F  F+  L+ST   +    Q NN++ G+TIF P DS+F   K 
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         +L++LT +Q   LI FH +P Y S + F+ +S  NP+ T AG    G + LN T    T++I SG TNT VS +V+S   +AVYQVDK+LLP+ +F   
Subjt:  PSLSNLTADQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAG----GQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKLLLPEAIFGTD

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         P  PAPAPAP ++ +     D
Subjt:  IPPTPAPAPAPDIAPAADAPSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGCGCCAGCCCCAGATTTTGTAAACCTCACAGATCTGCTCACTGTAGCTGGTCCATTTCACACCTTCCTCAGTTACCTCCAGTCTACCAAAGCCATTGACACCTTCCAAA
ACCAAGCCAATAACACAGAGGAAGGAGTGACTATCTTTGTCCCAAAAGACAGCGCTTTCTTGGCACAAAAGAAACCGTCTCTCTCGAATCTCACCGCAGATCAACTCAAG
TCTCTTATCCTATTTCATGGCTTGCCACATTACTATTCCCTTGCTGAATTCAGGAACCTCAGCCTTCAGAATCCGATCCCAACCTTTGCCGGTGGGCAATACAGTTTGAA
CTTCACAGACGTTTCTGGGACTATCCATATTGGCTCCGGCTGGACTAACACAAAAGTTAGTAGCAGTGTGCATTCAAGCGATCCTGTTGCTGTTTACCAAGTAGACAAAC
TTCTGCTGCCTGAGGCAATTTTCGGAACTGATATCCCACCTACCCCGGCCCCAGCACCCGCGCCTGATATCGCTCCTGCTGCTGACGCTCCTTCAGATGTTATTGATGGG
AAGGCTGCTCCATCTTCAGAACCAAAGCCATCATCTTCCCATAGGATTATCAATTGGGGAATTTTGATTCACATTGTTTTGGGAATCTCAGGTGGATTTTTGTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTTCAATCTTTATTTGTATTTCTCATCTCCTCCTTCCCCATTATTTCTCTGTCAGACCCCCCTTCTCTCTTCCCTGGCCTGGAAGTTGTGGAAAATGGGATTTTCCAT
GATTTTCACTGTTTGTAGTGCATTGTTGCTTCTAAGCTCTTCATCTGCCAATGCCCAAACAGCCAGCCCCCCTTCACTTAGCCCGACCCCGGCACCGGCGCCAGCCCCAG
ATTTTGTAAACCTCACAGATCTGCTCACTGTAGCTGGTCCATTTCACACCTTCCTCAGTTACCTCCAGTCTACCAAAGCCATTGACACCTTCCAAAACCAAGCCAATAAC
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TCATGGCTTGCCACATTACTATTCCCTTGCTGAATTCAGGAACCTCAGCCTTCAGAATCCGATCCCAACCTTTGCCGGTGGGCAATACAGTTTGAACTTCACAGACGTTT
CTGGGACTATCCATATTGGCTCCGGCTGGACTAACACAAAAGTTAGTAGCAGTGTGCATTCAAGCGATCCTGTTGCTGTTTACCAAGTAGACAAACTTCTGCTGCCTGAG
GCAATTTTCGGAACTGATATCCCACCTACCCCGGCCCCAGCACCCGCGCCTGATATCGCTCCTGCTGCTGACGCTCCTTCAGATGTTATTGATGGGAAGGCTGCTCCATC
TTCAGAACCAAAGCCATCATCTTCCCATAGGATTATCAATTGGGGAATTTTGATTCACATTGTTTTGGGAATCTCAGGTGGATTTTTGTTTTGATTGTGATCAGAAATCC
TACCATCCATTTATTACATTTATGAAATTTATATTGCCATTTTGTTTTGTTATTGATGTGAAGCTCCATTTTTTTGTGAACATATATGTTGTTGGATTTGTGCATGAGAA
TTCCTATTGTGTGGTCTATAAATTATGATGGGGAAGGAATTTTGTTTTACAGTTCATTGTTTCAATACACCACTATTCATCCTTTAATAAATATACCAATTTTTGTATTT
TA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFSMIFTVCSALLLLSSSSANAQTASPPSLSPTPAPAPAPDFVNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKAIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFLAQKKPSLSNLTADQLK
SLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAGGQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKLLLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAPAADAPSDVIDG
KAAPSSEPKPSSSHRIINWGILIHIVLGISGGFLF