; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0021847 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0021847
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionATP-dependent Clp protease proteolytic subunit
Genome locationchr07:1079626..1083422
RNA-Seq ExpressionPI0021847
SyntenyPI0021847
Gene Ontology termsGO:0006515 - protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins (biological process)
GO:0009368 - endopeptidase Clp complex (cellular component)
GO:0009526 - plastid envelope (cellular component)
GO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component)
GO:0004176 - ATP-dependent peptidase activity (molecular function)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0051117 - ATPase binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001907 - ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit
IPR018215 - ClpP, Ser active site
IPR023562 - Clp protease proteolytic subunit /Translocation-enhancing protein TepA
IPR029045 - ClpP/crotonase-like domain superfamily
IPR033135 - ClpP, histidine active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004152221.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucumis sativus]3.3e-16195.42Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKN PVKAMYSGEFSSMD NSRQGIWSIRDDVQVPSS YFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGG V+DDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTM+HIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQG QTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMS KEA DYGLIDGVIMNPLKALQPLA  AST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDKPDA
        EDKP+A
Subjt:  EDKPDA

XP_008454281.1 PREDICTED: ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucumis melo]1.1e-16999.67Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDKPDA
        EDKPDA
Subjt:  EDKPDA

XP_022155316.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Momordica charantia]7.3e-16194.12Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSS+SQK FLPL+PF SRKLGKLVGGGRNLKN+PVKA+YS EFSS+DR+SRQG+WSIRDDVQ+PSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERF SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAAA+T
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDKPDA
        E +P A
Subjt:  EDKPDA

XP_022998282.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Cucurbita maxima]3.3e-16193.46Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTF YTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQK FLPLE FHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKA+YSGEFSS+D++SRQG+WSIRDDVQ+PSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA++YGLIDGVIMNPLKA QPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDKPDA
        E+KPDA
Subjt:  EDKPDA

XP_038906134.1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic [Benincasa hispida]4.6e-16396.69Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSS+S K FLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVK++YSGE SS+DRNSRQGIWSIRDDVQ+PSSPYFPAYAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAAA T
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  ED
        ED
Subjt:  ED

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KTB0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit1.6e-16195.42Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKN PVKAMYSGEFSSMD NSRQGIWSIRDDVQVPSS YFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGG V+DDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTM+HIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQG QTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMS KEA DYGLIDGVIMNPLKALQPLA  AST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDKPDA
        EDKP+A
Subjt:  EDKPDA

A0A1S3BY88 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit5.4e-17099.67Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDKPDA
        EDKPDA
Subjt:  EDKPDA

A0A5A7TNH0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit5.4e-17099.67Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDKPDA
        EDKPDA
Subjt:  EDKPDA

A0A6J1DRD0 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit3.5e-16194.12Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSS+SQK FLPL+PF SRKLGKLVGGGRNLKN+PVKA+YS EFSS+DR+SRQG+WSIRDDVQ+PSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERF SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAAA+T
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDKPDA
        E +P A
Subjt:  EDKPDA

A0A6J1K7I3 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit1.6e-16193.46Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG
        MAHTF YTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQK FLPLE FHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKA+YSGEFSS+D++SRQG+WSIRDDVQ+PSSPYFP YAQG
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQG

Query:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
        QGPPPMVQERFQSVISQLFQ+RI+RCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDI++YVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA
Subjt:  QGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSA

Query:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST
        GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEML+HKANLNGYLSYHTGQSLEKIN+DTDRDFFMSAKEA++YGLIDGVIMNPLKA QPLAAAAST
Subjt:  GTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAST

Query:  EDKPDA
        E+KPDA
Subjt:  EDKPDA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2JIP1 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 21.1e-6364.92Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VDDD+AN+IVAQ+LYL++ DP KDI +Y+NSPGGSV AGMAI+DTM+HI+PDVST+C+GLAASMGAFLL+ GTKGKR +
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAS
        LP++RIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L  K +LN  L+YHTGQ LE+I +DTDRD FM+ ++AK+YGLID VI    K  QP  AA S
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAS

Q2JV68 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 21.2e-6263.87Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VDDD+AN+IVAQ+LYL++ DP KDI +Y+NSPGGSV AGMAI+DTM+HI+PDVST+C+GLAASMGAFLL+ G KGKR +
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAS
        LP++RIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L  K +LN  L+YHTGQ LE+I +DTDRD FM+ ++AK+YGLID VI    +  QP  AA S
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAAS

Q3MFR5 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 16.4e-6767.91Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII  G  VD ++AN+IVAQLL+LDA DP KDI +Y+NSPGGSVTAGM IFDTM+HIRPDV T+C GLAASMGAFLLSAGTKGKR S
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLA
        LP+SRIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L+HK  LN YL+ HTGQ +E+I +DT+RDFFMS  EA+DYGLID VI       +P+A
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLA

Q8YXH5 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 11.4e-6667.38Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RI+  G  VD ++AN+IVAQLL+LDA DP KDI +Y+NSPGGSVTAGM IFDTM+HIRPDV T+C GLAASMGAFLLSAG KGKR S
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLA
        LP+SRIMIHQPLGGAQG  TDI+IQA E+L+HK  LN YL+ HTGQ +E+I +DT+RDFFMS  EAKDYGLID VI       +P+A
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLA

Q9S834 ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 5, chloroplastic3.4e-13784.23Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNS-LVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQ
        MAH    TSASS R  +  VS   + SS DS K  LP EP  SRK  KLV   +N KNS  KA+YSG   + +  S QG+WSIRDD+QVPSSPYFPAYAQ
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNS-LVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQ

Query:  GQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS
        GQGPPPMVQERFQS+ISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDP KDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS
Subjt:  GQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS

Query:  AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYL+YHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02560.1 nuclear encoded CLP protease 52.4e-13884.23Show/hide
Query:  MAHTFAYTSASSFRLNS-LVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQ
        MAH    TSASS R  +  VS   + SS DS K  LP EP  SRK  KLV   +N KNS  KA+YSG   + +  S QG+WSIRDD+QVPSSPYFPAYAQ
Subjt:  MAHTFAYTSASSFRLNS-LVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQ

Query:  GQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS
        GQGPPPMVQERFQS+ISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDP KDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS
Subjt:  GQGPPPMVQERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLS

Query:  AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
        AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYL+YHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAK+YGLIDGVIMNPLKALQPLAAA
Subjt:  AGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAA

AT1G11750.1 CLP protease proteolytic subunit 63.7e-3841.21Show/hide
Query:  SPYFPAYAQGQGPPPMVQERFQ-----SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTV
        +P F      +G PP++           + S LF+ RII  G  ++  +A  +++QL+ L ++D   DI+MY+N PGGS  + +AI+D M  I+P V TV
Subjt:  SPYFPAYAQGQGPPPMVQERFQ-----SVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTV

Query:  CVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI
          G+AAS GA LL+ G KG RY++PN+R+MIHQP  G  G   D+  Q NE +  +  ++   +  TGQ LEK+ Q T+RD F+SA EA ++GLIDG++
Subjt:  CVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI

AT1G66670.1 CLP protease proteolytic subunit 35.6e-5055.03Show/hide
Query:  SQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIM
        + L + RI+  G  VDD  A+++++QLL LDA D  +DI +++NSPGGS+TAGM I+D M+  + DVSTVC+GLAASMGAFLL++G+KGKRY +PNS++M
Subjt:  SQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIM

Query:  IHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI
        IHQPLG A G  T++ I+  EM++HK  LN   S  TG+   +I  DTDRD F++  EAK+YGLID VI
Subjt:  IHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI

AT5G23140.1 nuclear-encoded CLP protease P75.4e-4547.18Show/hide
Query:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS
        ER   + S+L + RII   G ++DD ++++VAQLLYL++ +P+K I MY+NSPGG VTAG+AI+DTM++IR  +ST+C+G AASM + LL+AG KG+R S
Subjt:  ERFQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYS

Query:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAASTEDK
        LPN+ +MIHQP GG  G   DI I   +++     LN     HTGQ L+ +  + DRD FM+ +EAK +G+ID VI      L   A    ++DK
Subjt:  LPNSRIMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAASTEDK

AT5G45390.1 CLP protease P41.2e-4752.05Show/hide
Query:  VISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSR
        V+  L + RI+  G ++DD +A+ I++QLL LDA DP KDI +++NSPGGS++A MAI+D ++ +R DVST+ +G+AAS  + +L AGTKGKR+++PN+R
Subjt:  VISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSR

Query:  IMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI
        IMIHQPLGGA G   D++IQA E++H+K N+   ++  T +S E++ +D DRD +MS  EA +YGLIDGVI
Subjt:  IMIHQPLGGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCATACTTTCGCCTACACATCTGCCTCGTCTTTCCGATTAAACTCCCTCGTTTCTGTTCCGAATTCTAGCTCTTCTTCTGACTCCCAGAAGTTCTTTCTTCCTCT
GGAGCCTTTTCACTCGAGGAAACTAGGAAAATTAGTTGGAGGTGGAAGGAACCTCAAGAATTCTCCAGTAAAAGCCATGTACTCGGGGGAGTTTTCATCAATGGATAGGA
ATTCTCGCCAAGGAATTTGGTCTATAAGGGATGATGTGCAAGTTCCATCTTCACCGTACTTCCCAGCTTACGCACAAGGGCAAGGCCCTCCTCCAATGGTGCAGGAACGC
TTCCAAAGTGTTATAAGCCAGCTTTTTCAATATAGAATTATTCGTTGTGGTGGAGCCGTTGATGATGATATGGCAAATATCATTGTTGCCCAACTTCTATACCTTGATGC
TGTTGATCCCAATAAGGATATTGTGATGTATGTAAATTCCCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGTATGGCCATTTTTGATACTATGAGACATATTAGACCCGACGTTTCTA
CTGTCTGCGTGGGACTAGCAGCCAGTATGGGAGCTTTCCTGCTTAGCGCTGGAACTAAAGGAAAACGATACAGCTTGCCAAATTCACGGATAATGATCCATCAGCCTCTC
GGTGGTGCTCAGGGTGGACAGACTGACATTGATATTCAGGCAAATGAAATGTTGCATCATAAGGCAAATCTTAACGGGTATCTCTCATACCACACCGGTCAAAGTCTTGA
GAAGATTAACCAGGATACGGATCGGGATTTCTTCATGAGTGCTAAAGAAGCTAAAGACTATGGACTCATAGATGGAGTTATAATGAATCCTCTCAAAGCTCTCCAACCTT
TAGCAGCAGCAGCTTCCACCGAAGACAAGCCGGACGCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCCATACTTTCGCCTACACATCTGCCTCGTCTTTCCGATTAAACTCCCTCGTTTCTGTTCCGAATTCTAGCTCTTCTTCTGACTCCCAGAAGTTCTTTCTTCCTCT
GGAGCCTTTTCACTCGAGGAAACTAGGAAAATTAGTTGGAGGTGGAAGGAACCTCAAGAATTCTCCAGTAAAAGCCATGTACTCGGGGGAGTTTTCATCAATGGATAGGA
ATTCTCGCCAAGGAATTTGGTCTATAAGGGATGATGTGCAAGTTCCATCTTCACCGTACTTCCCAGCTTACGCACAAGGGCAAGGCCCTCCTCCAATGGTGCAGGAACGC
TTCCAAAGTGTTATAAGCCAGCTTTTTCAATATAGAATTATTCGTTGTGGTGGAGCCGTTGATGATGATATGGCAAATATCATTGTTGCCCAACTTCTATACCTTGATGC
TGTTGATCCCAATAAGGATATTGTGATGTATGTAAATTCCCCTGGTGGATCAGTTACAGCTGGTATGGCCATTTTTGATACTATGAGACATATTAGACCCGACGTTTCTA
CTGTCTGCGTGGGACTAGCAGCCAGTATGGGAGCTTTCCTGCTTAGCGCTGGAACTAAAGGAAAACGATACAGCTTGCCAAATTCACGGATAATGATCCATCAGCCTCTC
GGTGGTGCTCAGGGTGGACAGACTGACATTGATATTCAGGCAAATGAAATGTTGCATCATAAGGCAAATCTTAACGGGTATCTCTCATACCACACCGGTCAAAGTCTTGA
GAAGATTAACCAGGATACGGATCGGGATTTCTTCATGAGTGCTAAAGAAGCTAAAGACTATGGACTCATAGATGGAGTTATAATGAATCCTCTCAAAGCTCTCCAACCTT
TAGCAGCAGCAGCTTCCACCGAAGACAAGCCGGACGCGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAHTFAYTSASSFRLNSLVSVPNSSSSSDSQKFFLPLEPFHSRKLGKLVGGGRNLKNSPVKAMYSGEFSSMDRNSRQGIWSIRDDVQVPSSPYFPAYAQGQGPPPMVQER
FQSVISQLFQYRIIRCGGAVDDDMANIIVAQLLYLDAVDPNKDIVMYVNSPGGSVTAGMAIFDTMRHIRPDVSTVCVGLAASMGAFLLSAGTKGKRYSLPNSRIMIHQPL
GGAQGGQTDIDIQANEMLHHKANLNGYLSYHTGQSLEKINQDTDRDFFMSAKEAKDYGLIDGVIMNPLKALQPLAAAASTEDKPDA