; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0021882 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0021882
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationchr01:26501006..26504864
RNA-Seq ExpressionPI0021882
SyntenyPI0021882
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058670.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucumis melo var. makuwa]4.0e-17098.43Show/hide
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XP_004135900.2 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucumis sativus]4.1e-16796.25Show/hide
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XP_008461232.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucumis melo]8.3e-16897.49Show/hide
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XP_022953211.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita moschata]1.4e-15187.62Show/hide
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XP_038899359.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Benincasa hispida]1.7e-15792.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBK3 RING-type E3 ubiquitin transferase2.0e-16796.25Show/hide
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A0A1S3CE92 RING-type E3 ubiquitin transferase4.0e-16897.49Show/hide
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A0A5D3CET0 RING-type E3 ubiquitin transferase1.9e-17098.43Show/hide
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A0A6J1GMD4 RING-type E3 ubiquitin transferase6.9e-15287.62Show/hide
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        MSSA+    AAAERHTYWCHECDMSVTLVSP     SSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSP DSDPSSFV+VDPLP T
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        NS+GDENGFV MDGPI EDAGT+
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A0A6J1JS41 RING-type E3 ubiquitin transferase1.3e-15087.27Show/hide
Query:  MSSATITATAAAERHTYWCHECDMSVTLVSP----SSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSSPTDSDPSSFVVVDPLPITS
        MSSA+    AAAERHTYWCHECDMSVTLVSP    SSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSP DSDPSSFV+VDPLP TS
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Query:  DDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSESDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
        DDNYLL+SPQFLRLFQQLADSS+SDF PSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKV+SA+L+EDP+LICAICKD+FLL+VEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
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Query:  PLCRFKLPSDDPSDRVRCR--TSALLRARDLMHQEDSYGLRTTLELMARRHSSISSEGIHVDSFQSPTQFGVAVMGSGEQTDSVETVSSVATDDGIVIVN
        PLCR+KLPSD+PSD VRCR  T ALLRARDLM QEDSYGLRTTLE MARRHSSI SEG+ VD  QSPTQ GVAVMG+GEQTDSVETVSSVATDDGIVIVN
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Query:  SNGDENGFVGMDGPITEDAGTV
        S+GDENGFV MDGPI EDAGT+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A1.8e-1639.82Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSESDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    LF+QL+  +     P  P       ++++ A+PTIK+    L       C +CKD+F L  EAKQ+PC+H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  SDDPSDRVRCRTS
        S       + RT+
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O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A2.2e-1430.94Show/hide
Query:  PSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP-----NSSSSPTDS------DPSSFVV---------VDPLPITSDDNYLLNSPQFLRL
        P  SSSSS+ S+S+   +  T  +      +  + S+ S +P      S+++P+        D S+F +         + PLP  S   +LL S  F RL
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Query:  FQQLA--DSSESDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDP
          Q++  + + +  + S    P +  K+++ A+P I++    L  D    CA+CK+ F+L+  A+++PC+H+YHPDCILPWL+  +SCP+CR +LP++D 
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Query:  SDRVRCRTSALLRARDLMHQEDS
        +D      +A+    +   +EDS
Subjt:  SDRVRCRTSALLRARDLMHQEDS

P0CH30 E3 ubiquitin-protein ligase RING15.9e-1531.6Show/hide
Query:  LVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSSPTDSDPSSFV----------------VVDPLPITSDDNYLLNS-------
        L+ PSSSS+++SSS+S+                 P + S      +    P   DP +F+                V+   P  SD  + L +       
Subjt:  LVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSSPTDSDPSSFV----------------VVDPLPITSDDNYLLNS-------

Query:  -PQFLRLFQQLADSSESDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKL
         P   +L QQLA++  + +    P       K+++ A+P + +T + L+ +    CA+C D F    EAKQ+PC HLYH DC+LPWL  H+SCP+CR +L
Subjt:  -PQFLRLFQQLADSSESDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKL

Query:  PSDDPSDRVRCR
        P+DDP    R R
Subjt:  PSDDPSDRVRCR

Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like1.8e-1629.89Show/hide
Query:  SATITATAAAE-RHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSS--PTDSDPSSFVV-----------
        ++T +A AA E    ++C++C+ +VT+        S SSS+   CP C   FLE  ++  P  + S++ +PNSS S  P  +DP S ++           
Subjt:  SATITATAAAE-RHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSS--PTDSDPSSFVV-----------

Query:  ------------VDPLPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSESD-------------FVPSV-----------PFNPFTP--IKA
                    + P   ++  N          +L N  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP   K+
Subjt:  ------------VDPLPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSESD-------------FVPSV-----------PFNPFTP--IKA

Query:  SVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDRVRCRTS
        ++ A+PT+KVT  +L  + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP    R + S
Subjt:  SVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDRVRCRTS

Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF11.6e-1739.17Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSESDFVPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    L +QL+  +     P  P       K+S+ A+PTIK+T   L       C +CKD+F L+ EAKQ+PC H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
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Query:  SDDPSDRVRCRTSALLRARD
        S   S   +   +     R+
Subjt:  SDDPSDRVRCRTSALLRARD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44330.1 RING/U-box superfamily protein9.0e-1944.23Show/hide
Query:  SDFVPSVPF----NPFTPIKAS-----VMAIPTIKVTSALL----DEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSD
        S F  S PF    NPF   + S     + ++PTIK++S++L     +D  L CAIC++ F++   A++LPC+HLYH DCI+PWL++H+SCPLCR +LP  
Subjt:  SDFVPSVPF----NPFTPIKAS-----VMAIPTIKVTSALL----DEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSD

Query:  DPSD
           D
Subjt:  DPSD

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AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein1.2e-1839.17Show/hide
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AT3G56580.3 RING/U-box superfamily protein1.2e-1839.17Show/hide
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          + SDDN+LL+SP   RL + LA  +      S   +  + +K+S + +IPTI+++S+LL      D D VL+CA+CK+ F++   A++LPCSH+YH D
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        CI+PWLS+H+SCPLCRF+LP+         +   R+R    A + A     ++D  G+R  L  +ARRH  +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TTCTTCTTCCTCTTCCTCTCTTCTTTGCCCCCACTGCCTCACTGACTTCCTCGAACACATGGATTTTACCATACCCACTTCCTCTTCTTCCATTTCCGACCACCCCAATT
CCTCTTCTTCCCCCACAGATTCCGATCCATCATCCTTCGTCGTTGTCGACCCACTTCCGATCACTTCCGATGACAATTACCTCCTTAACAGCCCTCAATTTCTCCGTCTT
TTCCAGCAGCTTGCAGATTCATCCGAGTCTGATTTCGTCCCATCTGTCCCTTTCAACCCATTTACTCCGATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCCACTATTAAAGTCAC
CTCCGCCTTGCTCGATGAAGACCCAGTTCTAATTTGTGCTATTTGTAAGGATCAGTTCCTTCTTGAGGTTGAAGCCAAACAGCTCCCCTGTTCTCATCTTTATCATCCAG
ATTGCATTCTTCCTTGGCTTTCTAATCATGATTCTTGCCCGCTTTGCCGTTTTAAGCTTCCTTCTGATGACCCTTCGGATCGTGTGAGATGTAGGACTAGTGCCTTGTTG
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GTTTCAATCACCCACTCAGTTTGGGGTTGCTGTGATGGGGAGTGGGGAACAGACTGACAGTGTTGAAACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGATGATGGGATTGTAATTGTCA
ATAGCAATGGTGATGAAAATGGGTTTGTGGGAATGGATGGACCTATAACTGAGGATGCTGGCACTGTAGTTTAG
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ACCTACTGGTGCCACGAGTGCGATATGAGCGTCACTTTGGTTTCCCCTTCTTCTTCATCATCATCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTCTTCTTTGCCCCCACTGCCTCACTGA
CTTCCTCGAACACATGGATTTTACCATACCCACTTCCTCTTCTTCCATTTCCGACCACCCCAATTCCTCTTCTTCCCCCACAGATTCCGATCCATCATCCTTCGTCGTTG
TCGACCCACTTCCGATCACTTCCGATGACAATTACCTCCTTAACAGCCCTCAATTTCTCCGTCTTTTCCAGCAGCTTGCAGATTCATCCGAGTCTGATTTCGTCCCATCT
GTCCCTTTCAACCCATTTACTCCGATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCCACTATTAAAGTCACCTCCGCCTTGCTCGATGAAGACCCAGTTCTAATTTGTGCTATTTG
TAAGGATCAGTTCCTTCTTGAGGTTGAAGCCAAACAGCTCCCCTGTTCTCATCTTTATCATCCAGATTGCATTCTTCCTTGGCTTTCTAATCATGATTCTTGCCCGCTTT
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ACTACTTTGGAACTCATGGCTAGAAGGCATAGTTCTATTTCTAGTGAGGGAATTCATGTGGATTCGTTTCAATCACCCACTCAGTTTGGGGTTGCTGTGATGGGGAGTGG
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TAACTGAGGATGCTGGCACTGTAGTTTAGGATATTGGAGTTTCTCCTTCGAGTTTTGTTTCTGCAAATTTGAGGTAATATAGTAGAATATATGGTTGTTAGATGAATCTT
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CTCAACATAAGAAGAGATGAACCTTATTTACATTGTTAATCTTGTCACCTACCAATGTTTCCCTTCTCTCTTTTAGTCATGGTTTGAGTCAATGAGGCTCTCTCTATATA
TATAAAGCTCTGCAGTTTCAATCTATTGAGAAATAGATTCAAGAATTTTTAATCCATATTTCATTGTGCCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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