; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0021939 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0021939
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationchr05:1902629..1904835
RNA-Seq ExpressionPI0021939
SyntenyPI0021939
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063558.1 putative serine-rich protein C215.13-like protein [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-9699Show/hide
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KAG6586344.1 hypothetical protein SDJN03_19077, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-8087.06Show/hide
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XP_016902457.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496492 [Cucumis melo]9.2e-9698.51Show/hide
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XP_031737100.1 uncharacterized protein LOC101209679 [Cucumis sativus]5.4e-9698.51Show/hide
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XP_038890503.1 uncharacterized protein LOC120080038 [Benincasa hispida]2.4e-8893.53Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL69 Uncharacterized protein2.6e-9698.51Show/hide
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A0A1S4E2K6 uncharacterized protein LOC1034964924.5e-9698.51Show/hide
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A0A5A7V7K3 Putative serine-rich protein C215.13-like protein1.2e-9699Show/hide
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A0A6J1FCB9 uncharacterized protein LOC1114441077.6e-8086.57Show/hide
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A0A6J1HLP3 uncharacterized protein LOC1114656734.5e-8087.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein2.7e-0550Show/hide
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        GS  + ++ S +K  C+CSPTTHPGSFRC +H+ +  Q
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related7.6e-4052.47Show/hide
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        M  TS R  S+  VLRS SPSGRF G       +SSSSAFASSTS+  S  +++FF             RS SP+RV L+ +  +S  S R+SLD R+ S
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        P N+S+SVS ++    N  + R+      CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ + LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSH
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          +RR  ++P+ SRLSIM+KADE
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related7.2e-1434.91Show/hide
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        MAAT  RSS SVLR LS S R +      HR  S S                  C      R+K +   S+  PSV             V+VSS+     
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                 +KR C+CSPTTHPGSFRCS H+ +  +     + S                 LN R+ A+ NSL +IG VE +  +R+LAA L +PSS   
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         RR +FRP+ SR
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related1.2e-4051.15Show/hide
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        +VSS++    +++      S+R CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ + LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSHQ +RR 
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         + P+RSRL+ MSKA++
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related1.2e-4051.15Show/hide
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        T+R + ++ LRS SPSGRF G         + SSS FASSTS+  S  +T+FF           RS SP+RV L  S  ++  S R+S+D R+ SPNRS+
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        +VSS++    +++      S+R CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ + LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSHQ +RR 
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCAACTTCCCGAAGATCAAGCGCATCAGTTCTCCGATCCCTCTCACCGTCCGGAAGATTCTATGGTCACCGGACTTCATCTTCCTCCGCCTTCGCTTCCTCCAC
CTCCACTTTCTCCTCTAGATCCGCCACTTCCTTCTTCTGCAGATCAACTTCCCCCTCGCGTGTGAAGCTCCACGGTTCGCCTTCAGTTTCTGTCCCCTCCGTGCGGTTTT
CTCTTGACCGTGCGACCTCTCCCAACAGATCCGTCTCTGTTTCTTCTTCTCGCAGCGGTGGAAGCAATCGTGTTGTGCAGAGACAGAGCAGTTCGAAGAGGACGTGTATG
TGTTCTCCTACAACTCACCCTGGCTCGTTCCGGTGTAGTCTCCATAAAGGTATAATTTCGCAACCTCCTGCTCTGTACTCGCCGAGTAGGTTGAATGCTCGTAGATCGGC
GATGACGAATTCTCTTGTTAGAATTGGAGGCGTTGAAGGTGATCTCGTGAAACGAGCTTTAGCGGCTTTGATTCGACCTTCTTCTCATCAGCAACGTCGTCGAGTTGATT
TTAGGCCAAAACGTAGCCGGCTCTCGATTATGTCCAAAGCCGATGAAACATTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAAAAGACGCCGCTTTCAATATTTGCTCTTACTTTGCGTTGAATCCCTATAAATACATAGTGGGAGTGAAGACGGGTTTGCCAAACTCAACAGCCAAACGCGGCCTATA
AGGCTTTTATACTAGAAAGCTCTAGATTCATCCCCCCCTTTCTTCCCTCTCTTCTCCGACCAAAATGGCGGCAACTTCCCGAAGATCAAGCGCATCAGTTCTCCGATCCC
TCTCACCGTCCGGAAGATTCTATGGTCACCGGACTTCATCTTCCTCCGCCTTCGCTTCCTCCACCTCCACTTTCTCCTCTAGATCCGCCACTTCCTTCTTCTGCAGATCA
ACTTCCCCCTCGCGTGTGAAGCTCCACGGTTCGCCTTCAGTTTCTGTCCCCTCCGTGCGGTTTTCTCTTGACCGTGCGACCTCTCCCAACAGATCCGTCTCTGTTTCTTC
TTCTCGCAGCGGTGGAAGCAATCGTGTTGTGCAGAGACAGAGCAGTTCGAAGAGGACGTGTATGTGTTCTCCTACAACTCACCCTGGCTCGTTCCGGTGTAGTCTCCATA
AAGGTATAATTTCGCAACCTCCTGCTCTGTACTCGCCGAGTAGGTTGAATGCTCGTAGATCGGCGATGACGAATTCTCTTGTTAGAATTGGAGGCGTTGAAGGTGATCTC
GTGAAACGAGCTTTAGCGGCTTTGATTCGACCTTCTTCTCATCAGCAACGTCGTCGAGTTGATTTTAGGCCAAAACGTAGCCGGCTCTCGATTATGTCCAAAGCCGATGA
AACATTATAATCCTTTCGGTATGTTGAAAATTGAAATTGCCTGATCTATGAATTTCCGGAGATAAGACGTAGTTCTTCTAATCCTTCGGCGGCGGTTCGTGACGGTGCTA
GACGGTGCTATCTTTTTCTCTCCGGAGACCGTTACAGACATTGATCACTACAGAACTGTGAAATCTCCTTTTGTACAAATTAATATTTTATACAGATTAGTAGATGTGAA
ATTGTTTGTGTTCGTCGCGATCGGCGTTCAGATCAGACCTAAAATTGAGAGTAATTGGAGAAATCGATCACAAATTTAATGAAATTCACATGAATTTAAGAGGTGTATAA
CCTCATCAATCGAACCAGATTTTAGAATTAGGGTTTGGAAAATCCTCCATTAGCAGTTTTGCATTCCGTTTTCTCCGCCGTCTGATTTTTTGGTTTCCGTTTCGATAAGC
ATAAACAGCGTTAAGACGCCGTCTGGTTTGTTGCATTGTGTCTTCATTTATTTATTTATTTTCTATTTTCCCTTCTCGTGTTTGAGATATGTTTATTTATTTATTTATTT
TTAATTTTTGTTTTGTCTTTTTGCAGGGACATGATTGGATTGATGATTCTCAGCAGCAATGGATGTGGATTCTTATTATTTTTTAGAAACAAAATACTTCAAAATGGGGA
CCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAAATCTGCACTTTACCTATATGTTCTTTTGACATCTTGTTTCGGTTCTTGAATTTATTTATTTTTTTAGACAAAAATTT
CACATATTTTGTTGATAATAAACTGGTCCCTAACTTTTAAATGTTTTCTTTTCGTGATTTTATTTGTGTTTATAAATCGAGGGGAAAATTACCCAAAGTTTTGATGAATA
CGGTCCTACTCACAATGGACCTTTTTAGTCTTCCAATAAACCTGAGTTTTCAATACTATATTTTGAGTTTAAATATCCTCAAGTAGTTCTATATTAAATTAGAAGAGTAA
TTTTTTAAAACAAAAAGTATAATTTTTAAAACACAAACTAATTTATTTTCATTTCAAATATTATATAATTATTTTTAAAAAAGAATGATCATATAAACTATCTCCAAATA
TGGATTTTGCTAAATAGTTAGAAAAACTTAGAAAACAAATGTTAAATTTTTATATTCATGGAGTCTTAAATTTTAAAATCGTTTAAAAATTTACCCGAAAACTTAAAAAA
CAAATGTTTATATTTATATAAACTTAAGAGTCTAAATTTTAAAACTTAAGGACCTAACATTAATGAAAATATTGTTTTCTAATTTCTATTATTTGAAAAAATATTTAAAA
ATAATTAAATTTGAGTGGTGATCAAATGCCTTTACTCTCTCAACCTGAATTCAAGTCTTCTTTTGAAAGGAAAAAGACCTAACTCCTCGTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVKLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGSNRVVQRQSSSKRTCM
CSPTTHPGSFRCSLHKGIISQPPALYSPSRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALAALIRPSSHQQRRRVDFRPKRSRLSIMSKADETL