; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0022370 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0022370
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionKH domain-containing protein
Genome locationchr08:14121320..14128022
RNA-Seq ExpressionPI0022370
SyntenyPI0022370
Gene Ontology termsGO:0048024 - regulation of mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004087 - K Homology domain
IPR004088 - K Homology domain, type 1
IPR032377 - STAR protein, homodimerisation region
IPR036612 - K Homology domain, type 1 superfamily
IPR045071 - KH domain-containing BBP-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142668.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X2 [Cucumis sativus]9.4e-15598.94Show/hide
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XP_011653733.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X1 [Cucumis sativus]1.0e-15699.29Show/hide
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XP_022925242.1 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X1 [Cucurbita moschata]6.1e-15497.87Show/hide
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XP_038882687.1 KH domain-containing protein At2g38610 isoform X1 [Benincasa hispida]5.5e-15599.29Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXW7 KH domain-containing protein4.5e-15598.94Show/hide
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A0A1S3CIV3 KH domain-containing protein At2g386102.0e-15599.29Show/hide
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A0A5D3C4T5 KH domain-containing protein1.1e-15399.28Show/hide
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A0A6J1EB88 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X12.9e-15497.87Show/hide
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A0A6J1HTR7 KH domain-containing protein At3g08620-like isoform X11.1e-15397.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WLR1 KH domain-containing protein At4g264807.4e-7855.71Show/hide
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         +  P E+ +S +P    +W ++P S S L VKR +R++IPVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KE+ +RG+PGYEHLN
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        EPLHIL+EA+LP  IVD RL QA+EI+++LL PV+E+HD+ K+QQLRELA+LN S REE     GS+SP+NS GMKRAKT
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Q75GR5 KH domain-containing protein SPIN19.2e-11372.79Show/hide
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        MSG+YS  FSPAR  SP IR+ P DVDSQYL+ELLAEHQK GPFMQVLPIC +LL+QEI+RVS ++ N GF D DR R RSPSPM+S N  SN S  G S
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         WNGL QE RL    G +MDWQ AP SPSS  VK+ILRL++PVD+YPNFNFVGR+LGPRGNSLKRVE +TGCRV+IRGKGSIKDP KE+KLRG+PGYEHL
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        ++PLHILIEA+ PA+I+D RLR AQE+IEELLKPVDES D+ KRQQLRELAMLNS+ RE+SP P GSVSPF++ GMKRAKTG+
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Q8GYR4 KH domain-containing protein At3g086201.5e-12680.28Show/hide
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        MSG+Y+  NFSP+R ASP IRT + DVDSQY+S+LLAEHQK GPFMQVLPIC RLLNQEI R++GMM NQGF D DRLRHRSPSPMAS NLMSNVS  GL
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         GWNGLP E R+    GM M+WQ APASPSS  VKRILRL++PVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRVYIRGKGSIKDP+KEEKL+G+PGYEH
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Query:  LNEPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        LNE LHILIEADLP +IVDI+LRQAQEIIEEL+KPVDES DYIKRQQLRELA+LNS+ RE SPGP GSVSPFNS+ MKR KTGR
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Q9FKT4 KH domain-containing protein At5g561404.8e-7755.24Show/hide
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        YS++ S  P+   SP+    +R+   V     +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RLLNQEILRV+ ++ N        L H  PSP+AS  +  N + 
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          ++GW +  P E+ +  +PG   +W ++P S S L  KR +R++IPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KEE +RG+P
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        GYEHLNEPLHIL+EA+LP  IVD RL QA+EI+++LL P++E+HD  K+QQLRELA+LN + REE     GSVSP+NS GMKRAKT
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Q9ZVI3 KH domain-containing protein At2g386107.8e-12883.97Show/hide
Query:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTG
        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLMSNVS+TG
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        L GWNGL QE RLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYE
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Query:  HLNEPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG
        HLNE LHILIEADLPA+IV+IRLRQAQEIIEELLKPVDES D+IKRQQLRELA+LNS + REESPGP  GGSVSPFNSSG KR KTG
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38610.1 RNA-binding KH domain-containing protein5.5e-12983.97Show/hide
Query:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTG
        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLMSNVS+TG
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Query:  LSGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYE
        L GWNGL QE RLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYE
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Query:  HLNEPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG
        HLNE LHILIEADLPA+IV+IRLRQAQEIIEELLKPVDES D+IKRQQLRELA+LNS + REESPGP  GGSVSPFNSSG KR KTG
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AT2G38610.2 RNA-binding KH domain-containing protein5.5e-12983.97Show/hide
Query:  MSGMY--STNFSPARTASPHIRTTPDVD-SQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTG
        MSG+Y  S+ FSPAR ASP IR+TP++D SQYL+ELLAEHQK  PFMQVLPIC RLLNQE+ RVSGMMSNQGF D DRLRHRSPSPMASSNLMSNVS+TG
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Query:  LSGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYE
        L GWNGL QE RLS  PGMTMDWQ AP SPSS TVKRILRLEIPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRV+IRGKGSIKDP+KE+KLRGRPGYE
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Query:  HLNEPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG
        HLNE LHILIEADLPA+IV+IRLRQAQEIIEELLKPVDES D+IKRQQLRELA+LNS + REESPGP  GGSVSPFNSSG KR KTG
Subjt:  HLNEPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNS-SFREESPGP--GGSVSPFNSSGMKRAKTG

AT3G08620.1 RNA-binding KH domain-containing protein1.0e-12780.28Show/hide
Query:  MSGMYS-TNFSPARTASPHIRT-TPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTGL
        MSG+Y+  NFSP+R ASP IRT + DVDSQY+S+LLAEHQK GPFMQVLPIC RLLNQEI R++GMM NQGF D DRLRHRSPSPMAS NLMSNVS  GL
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Query:  SGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH
         GWNGLP E R+    GM M+WQ APASPSS  VKRILRL++PVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE TTGCRVYIRGKGSIKDP+KEEKL+G+PGYEH
Subjt:  SGWNGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEH

Query:  LNEPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR
        LNE LHILIEADLP +IVDI+LRQAQEIIEEL+KPVDES DYIKRQQLRELA+LNS+ RE SPGP GSVSPFNS+ MKR KTGR
Subjt:  LNEPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR

AT4G26480.1 RNA-binding KH domain-containing protein5.3e-7955.71Show/hide
Query:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTGLSGW
        S   S NFS    + P      +   +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RL+NQEILRV+ ++ N     L + R   PSP+AS  +  N S   ++GW
Subjt:  SGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTGLSGW

Query:  -NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN
         +  P E+ +S +P    +W ++P S S L VKR +R++IPVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KE+ +RG+PGYEHLN
Subjt:  -NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLN

Query:  EPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT
        EPLHIL+EA+LP  IVD RL QA+EI+++LL PV+E+HD+ K+QQLRELA+LN S REE     GS+SP+NS GMKRAKT
Subjt:  EPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT

AT5G56140.1 RNA-binding KH domain-containing protein3.4e-7855.24Show/hide
Query:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSS
        YS++ S  P+   SP+    +R+   V     +YLSELLAE  K  PF+ VLP   RLLNQEILRV+ ++ N        L H  PSP+AS  +  N + 
Subjt:  YSTNFS--PARTASPH----IRTTPDV---DSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSS

Query:  TGLSGW-NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP
          ++GW +  P E+ +  +PG   +W ++P S S L  KR +R++IPVD YPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVE +T CRV IRG+GSIKDP KEE +RG+P
Subjt:  TGLSGW-NGLPQEQRLSRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRP

Query:  GYEHLNEPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT
        GYEHLNEPLHIL+EA+LP  IVD RL QA+EI+++LL P++E+HD  K+QQLRELA+LN + REE     GSVSP+NS GMKRAKT
Subjt:  GYEHLNEPLHILIEADLPANIVDIRLRQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCGGTATGTACAGTACCAACTTCTCCCCTGCAAGAACTGCTTCTCCTCACATCAGAACTACTCCCGATGTCGACAGTCAGTACTTGTCGGAGCTACTAGCGGAGCA
TCAGAAGTTCGGCCCCTTCATGCAAGTTCTTCCGATCTGCGGCCGACTTTTGAATCAAGAAATATTGCGGGTTTCTGGAATGATGTCCAACCAGGGTTTCTGCGACCTTG
ATAGGCTTCGGCATAGAAGCCCTAGTCCAATGGCTTCTTCAAACCTTATGTCTAATGTTAGTAGTACAGGTTTGAGTGGCTGGAATGGTCTTCCTCAGGAGCAGAGATTA
AGTAGAGCCCCTGGGATGACAATGGACTGGCAAAGTGCACCTGCAAGTCCTAGTTCACTCACCGTAAAGAGGATTCTACGTTTGGAAATACCTGTTGATACTTATCCCAA
TTTCAATTTTGTAGGGCGGCTTTTGGGACCTCGCGGGAATTCCTTGAAACGAGTGGAAGTTACTACAGGTTGTCGTGTATACATTCGAGGGAAAGGGTCGATAAAGGATC
CAGACAAGGAAGAAAAATTACGGGGACGACCTGGCTATGAGCACTTAAACGAACCACTGCACATCTTGATTGAGGCAGACTTGCCAGCCAATATTGTTGATATACGGCTC
AGACAGGCACAAGAAATTATTGAAGAACTGCTCAAACCTGTGGATGAGAGTCATGATTACATTAAAAGGCAGCAGTTACGCGAACTCGCGATGCTAAATTCAAGTTTCAG
AGAAGAGAGTCCAGGACCTGGTGGCAGCGTCTCTCCTTTCAACTCAAGTGGTATGAAACGTGCCAAAACAGGTCGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAACGACGACCATTTACAATCATAGATTTTCCTCAATTCAGCTTCCACCCTTTTACTCCTTAGCTCCGCCTCCTCCTCCTCCCTCGTCGGAGTTGTCCTTATCCACCGT
CCTCTCCGGCGACATCCTCGCCTTAATCTCCAAAACCCCACTCCACTTTCCAATCCCCCAATTCTCAGAACATCCATTTCAGCTCATAGTTCAATAGCTCACAGCTATGT
CCGGTATGTACAGTACCAACTTCTCCCCTGCAAGAACTGCTTCTCCTCACATCAGAACTACTCCCGATGTCGACAGTCAGTACTTGTCGGAGCTACTAGCGGAGCATCAG
AAGTTCGGCCCCTTCATGCAAGTTCTTCCGATCTGCGGCCGACTTTTGAATCAAGAAATATTGCGGGTTTCTGGAATGATGTCCAACCAGGGTTTCTGCGACCTTGATAG
GCTTCGGCATAGAAGCCCTAGTCCAATGGCTTCTTCAAACCTTATGTCTAATGTTAGTAGTACAGGTTTGAGTGGCTGGAATGGTCTTCCTCAGGAGCAGAGATTAAGTA
GAGCCCCTGGGATGACAATGGACTGGCAAAGTGCACCTGCAAGTCCTAGTTCACTCACCGTAAAGAGGATTCTACGTTTGGAAATACCTGTTGATACTTATCCCAATTTC
AATTTTGTAGGGCGGCTTTTGGGACCTCGCGGGAATTCCTTGAAACGAGTGGAAGTTACTACAGGTTGTCGTGTATACATTCGAGGGAAAGGGTCGATAAAGGATCCAGA
CAAGGAAGAAAAATTACGGGGACGACCTGGCTATGAGCACTTAAACGAACCACTGCACATCTTGATTGAGGCAGACTTGCCAGCCAATATTGTTGATATACGGCTCAGAC
AGGCACAAGAAATTATTGAAGAACTGCTCAAACCTGTGGATGAGAGTCATGATTACATTAAAAGGCAGCAGTTACGCGAACTCGCGATGCTAAATTCAAGTTTCAGAGAA
GAGAGTCCAGGACCTGGTGGCAGCGTCTCTCCTTTCAACTCAAGTGGTATGAAACGTGCCAAAACAGGTCGGTAAGTGCTCAATATCATTCCGTACCCTAAACAATTTCT
ACCCCAGTCCAAATTTCGGTCACTTATATACTGTGAAGTGAATCATGACCGACCGTGTGACATAGCTACGAGAAAGGGGAGGCTAACTTCAGTTCCAGGCGAGCCTTCTG
TTGGCTTTTTCTTTGTGTTCCCTTTAATATTCTTGACAGAAAGACTGGAAAAATGTTGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAACAGAGGGTGAAAAGGAAAAAAAAATTGT
TAGTATTAGTAGGGATGGTTTTTCATGTTGGGTGTAGGTTTGAATAGGTCAGTTTTTCCAACAAAGTTAATATATTCATTGGATTTATTCTTGTGTTAGTGACTGCTGAG
GAGTGTGTAGTTTTATTACATTATTGATGCAAAAACCATAGGAAGTGATGATGATGTAATACTATTTGATATTTGTTAGGTGTTGTATGCAATGTCAATGTCAATTATAT
TTTTGGACTGATATATGAAAGAACAGTGCAAAAACTCATACAAAAGTGCTTGCTCAGTTTGTGTTTGCTTTTCAAGTTTCAGAATATGATTCTCCTTTCTGTCTTTTCAT
TTCCTGAAAAGTTGAAAACTTATGCCTTTGACTATTATTACATGTCTTGCATAGTTGTTTTCTAATTTTTCGACGAATAGGAGGGTAAGCGGGTCAGTTTGGACGGATGA
ACTTGCAAAGGTAACATGAATCAATATCGACCAACTTGTATCTTCATTAATCTTATACCTCTTTCTTGGCCATCTCCATCATGTCCTTCATGATGTTGAAGGACCTGGCG
ATACCGTCAGTTTTCTGTTAATTACTAACGTCAACCATTCATGGCTCCTCCCTCCACAGTCTCTCGTTTCTTTATTTTTTCGCTATTTTTTCCCTCCTCTATCTTCTCCT
ACGTAACAAGAATCCCAAAAAGTGAAAATGGTCAAAAGGAGGCCCCTTGGTTTTCATCATTTTCAGATTGGGGTCGTGCAACAACAACAGAAAAGAAAAAGAAAGGGGAA
GATCCAATGTTAAAGAAGAGAGAGAGAGAGATGGTAAAGAGGGCCGACATTGATGACAAATGGTGGTGGCAGTCATGGATGAGCAAGTTTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGMYSTNFSPARTASPHIRTTPDVDSQYLSELLAEHQKFGPFMQVLPICGRLLNQEILRVSGMMSNQGFCDLDRLRHRSPSPMASSNLMSNVSSTGLSGWNGLPQEQRL
SRAPGMTMDWQSAPASPSSLTVKRILRLEIPVDTYPNFNFVGRLLGPRGNSLKRVEVTTGCRVYIRGKGSIKDPDKEEKLRGRPGYEHLNEPLHILIEADLPANIVDIRL
RQAQEIIEELLKPVDESHDYIKRQQLRELAMLNSSFREESPGPGGSVSPFNSSGMKRAKTGR