; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0022585 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0022585
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionHeterogeneous nuclear ribonucleoprotein
Genome locationchr11:29281985..29290187
RNA-Seq ExpressionPI0022585
SyntenyPI0022585
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571306.1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-12294.89Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWDVDTE LREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVK+ATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ----GGGGGGGYGAYNAYIS
        SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASSDSVE+LMA+THELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ    GGGGGGGYGAYNAYIS
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ----GGGGGGGYGAYNAYIS

Query:  AATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        AATRYAALGAPTLYDHPG VYGRREFRGMGKKI +
Subjt:  AATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

XP_008457826.1 PREDICTED: RNA-binding protein Musashi homolog 1 [Cucumis melo]7.5e-12598.27Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGYGAYNAYISAATR
        +VTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ GGGGGGYGAYNAYISAATR
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGYGAYNAYISAATR

Query:  YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKI +
Subjt:  YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

XP_011649346.1 RNA-binding protein Musashi homolog 1 isoform X2 [Cucumis sativus]9.8e-12597.84Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ-GGGGGGGYGAYNAYISAAT
        +VTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGS VVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ GGGGGGGYGAYNAYISAAT
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ-GGGGGGGYGAYNAYISAAT

Query:  RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKI +
Subjt:  RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

XP_022973186.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like-B isoform X1 [Cucurbita maxima]7.7e-12294.85Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWD+DTE LREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVK+ATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ--GGGGGGGYGAYNAYISAA
        SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASS+SVE+LMA+THELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ  GGGGGGGYGAYNAYISAA
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ--GGGGGGGYGAYNAYISAA

Query:  TRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        TRYAALGAPTLYDHPG VYGRREFRGMGKKI +
Subjt:  TRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

XP_038877270.1 RNA-binding protein Musashi homolog 1 [Benincasa hispida]3.7e-12497.84Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWDVDTEGLR+YMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGYGAYNAYISAATR
        SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ GGGGGGYGAYNAYISAATR
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGYGAYNAYISAATR

Query:  YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        YAALGAPTLYDHPGSVYGRRE RGMGKKI +
Subjt:  YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMN9 Uncharacterized protein4.7e-12597.84Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ-GGGGGGGYGAYNAYISAAT
        +VTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGS VVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ GGGGGGGYGAYNAYISAAT
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ-GGGGGGGYGAYNAYISAAT

Query:  RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKI +
Subjt:  RYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

A0A1S3C728 RNA-binding protein Musashi homolog 13.6e-12598.27Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGYGAYNAYISAATR
        +VTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ GGGGGGYGAYNAYISAATR
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGYGAYNAYISAATR

Query:  YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKI +
Subjt:  YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

A0A6J1D811 RNA-binding protein Musashi homolog 1 isoform X21.6e-12094.81Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWD+DTEGL++YMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGYGAYNAYISAATR
        SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASSDSVENLMA+THELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKM Q G  GGGYGAYNAYISAATR
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGYGAYNAYISAATR

Query:  YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        YAALGAPTLYDHPGSVYGRRE RGMGKKI +
Subjt:  YAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

A0A6J1EWL0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0-like1.1e-12193.67Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWDVDTE LREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVK+ATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ------GGGGGGGYGAYNAY
        SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASSDSVE+LMA+THELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ      GGGGGGGYGAY+AY
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ------GGGGGGGYGAYNAY

Query:  ISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        ISAATRYAALGAPTLYDHPG VYGRREFRGMGKKI +
Subjt:  ISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

A0A6J1I7Z8 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like-B isoform X13.7e-12294.85Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        MDRKLVVLGIPWD+DTE LREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVK+ATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ--GGGGGGGYGAYNAYISAA
        SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSK HRGIGFITFASS+SVE+LMA+THELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ  GGGGGGGYGAYNAYISAA
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQ--GGGGGGGYGAYNAYISAA

Query:  TRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL
        TRYAALGAPTLYDHPG VYGRREFRGMGKKI +
Subjt:  TRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFRGMGKKILL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O43347 RNA-binding protein Musashi homolog 16.8e-2836.13Show/hide
Query:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARIS
        K+ + G+ W    EGLREY  +FGE+++C+VM++  T RSRGFG+VTF         L+ S H L ++ ++ KVA P+   RA PK VTR   IFV  +S
Subjt:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARIS

Query:  QSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGK-------MPQG------GGGG
         + T    + +FE++G++ D  +  D+ +  HRG GF+TF S D VE +     HE+    V   +A PK +   P G        MP G      G G 
Subjt:  QSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGK-------MPQG------GGGG

Query:  GGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR
         GY  + A   A+  Y  L        PG  Y   EFR
Subjt:  GGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR

O94432 Uncharacterized RNA-binding protein C660.154.4e-2735.12Show/hide
Query:  DRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQS
        D K+ + G+ W+   + LR+Y  +FGE+ DC VM++ +TGRSRGFG++TF   +     +S EH L  ++++ K A P+EE     ++  ++FV  +   
Subjt:  DRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQS

Query:  VTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTH-ELGGSTVVVDRATPK
         TE  FR+ F ++G + D  +  D+ +   RG GF+T+ +  +VE  M+  +  + G  V V RATPK
Subjt:  VTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTH-ELGGSTVVVDRATPK

Q61474 RNA-binding protein Musashi homolog 18.8e-2836.13Show/hide
Query:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARIS
        K+ + G+ W    EGLREY  +FGE+++C+VM++  T RSRGFG+VTF         L+ S H L ++ ++ KVA P+   RA PK VTR   IFV  +S
Subjt:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARIS

Query:  QSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGK-------MPQG------GGGG
         + T    + +FE++G++ D  +  D+ +  HRG GF+TF S D VE +     HE+    V   +A PK +   P G        MP G      G G 
Subjt:  QSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGK-------MPQG------GGGG

Query:  GGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR
         GY  + A   A+  Y  L        PG  Y   EFR
Subjt:  GGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR

Q8K3P4 RNA-binding protein Musashi homolog 18.8e-2836.13Show/hide
Query:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARIS
        K+ + G+ W    EGLREY  +FGE+++C+VM++  T RSRGFG+VTF         L+ S H L ++ ++ KVA P+   RA PK VTR   IFV  +S
Subjt:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALS-SEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTR---IFVARIS

Query:  QSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGK-------MPQG------GGGG
         + T    + +FE++G++ D  +  D+ +  HRG GF+TF S D VE +     HE+    V   +A PK +   P G        MP G      G G 
Subjt:  QSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLM-ADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGK-------MPQG------GGGG

Query:  GGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR
         GY  + A   A+  Y  L        PG  Y   EFR
Subjt:  GGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRREFR

Q8W034 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 19.4e-3036.02Show/hide
Query:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPK---------------
        KL V GI W+ D + LRE+ + +GE+   IVM+++ TGR RGFG+V F+        L  +H +  R ++VK A  +EE +   +               
Subjt:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPK---------------

Query:  -RVTRIFVARISQSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGG---
         +  +IFV  +  ++T+  FR +FE YG +TD+ +  DQ +   RG GF++F S D+V++++  T H+L G  V V RA PKD +       P GGG   
Subjt:  -RVTRIFVARISQSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGG---

Query:  GGGGYGAYNAY
        GGGG G Y  Y
Subjt:  GGGGYGAYNAY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07810.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.6e-3236.76Show/hide
Query:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR--------------APPKR
        KL + GI WD + E L+EY S FGE+ + +++K+R+TGR+RGFG+V FA    A+  ++ +H +  R++E K A P+++                  P R
Subjt:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR--------------APPKR

Query:  VTRIFVARISQSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGY
          +IFV  +  SVTE+ F+++FE++G  TD+ +  D  ++  RG GFIT+ S ++VE ++  T HEL G  V V RA PK+    P  + P G G   G 
Subjt:  VTRIFVARISQSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGY

Query:  GAYN
           N
Subjt:  GAYN

AT3G07810.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.6e-3236.76Show/hide
Query:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR--------------APPKR
        KL + GI WD + E L+EY S FGE+ + +++K+R+TGR+RGFG+V FA    A+  ++ +H +  R++E K A P+++                  P R
Subjt:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR--------------APPKR

Query:  VTRIFVARISQSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGY
          +IFV  +  SVTE+ F+++FE++G  TD+ +  D  ++  RG GFIT+ S ++VE ++  T HEL G  V V RA PK+    P  + P G G   G 
Subjt:  VTRIFVARISQSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGY

Query:  GAYN
           N
Subjt:  GAYN

AT4G26650.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.0e-3135.92Show/hide
Query:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR-----APP-----------
        KL + GI WD D E L+EY  K+G+L + ++M++R+TGR+RGFG++ FA    A+  +  +H +  R +E K A P+++ +     A P           
Subjt:  KLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMR-----APP-----------

Query:  ---KRVTRIFVARISQSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGG
            R  +IFV  +  S+TEA F+++F+++G I D+ +  D  ++  RG GFITF S +SV+ ++  T HEL G  V V RA PK+       + P   G
Subjt:  ---KRVTRIFVARISQSVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADT-HELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGG

Query:  GGGGYG
         G  YG
Subjt:  GGGGYG

AT4G36960.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein9.2e-9772.13Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        M+RKLVVLGIPWD+D++GL++YMSKFG+LEDCIVMK+RSTGRSRGFGYVTFA+ EDAKNAL  EHFLGNR++EVKVATPKEEMR P K+VTRIFVARI  
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDF----RPIGKMPQ-------GGGGGGGYG
        SV+E+ FRSHFE+YGEITDLYMPKD  SK HRGIGFITF+S+DSVE+LM DTH+LGG+TV VDRATPK+DD      P+ +M +       G G  GGYG
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDF----RPIGKMPQ-------GGGGGGGYG

Query:  AYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE--FRGMGKKILL
        AY+AYISAATRYAALGAPTLYD+P + YGR E   RG+G KI +
Subjt:  AYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE--FRGMGKKILL

AT4G36960.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein9.2e-9772.13Show/hide
Query:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ
        M+RKLVVLGIPWD+D++GL++YMSKFG+LEDCIVMK+RSTGRSRGFGYVTFA+ EDAKNAL  EHFLGNR++EVKVATPKEEMR P K+VTRIFVARI  
Subjt:  MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQ

Query:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDF----RPIGKMPQ-------GGGGGGGYG
        SV+E+ FRSHFE+YGEITDLYMPKD  SK HRGIGFITF+S+DSVE+LM DTH+LGG+TV VDRATPK+DD      P+ +M +       G G  GGYG
Subjt:  SVTEAAFRSHFEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDF----RPIGKMPQ-------GGGGGGGYG

Query:  AYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE--FRGMGKKILL
        AY+AYISAATRYAALGAPTLYD+P + YGR E   RG+G KI +
Subjt:  AYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRRE--FRGMGKKILL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCGGAAGCTGGTGGTTCTTGGTATTCCATGGGACGTCGATACAGAAGGGCTGAGAGAATACATGAGCAAATTTGGGGAGTTGGAGGATTGTATTGTTATGAAGGA
GAGGTCAACTGGTCGGTCTCGTGGTTTTGGATATGTGACATTTGCAACCGATGAAGATGCTAAGAATGCACTATCAAGTGAGCACTTTCTTGGCAACAGAATGATGGAAG
TTAAAGTTGCCACACCTAAAGAGGAGATGAGAGCACCTCCTAAGAGAGTCACAAGGATTTTTGTAGCAAGGATCTCACAATCTGTGACTGAGGCTGCCTTCCGCAGTCAT
TTTGAGAAATATGGAGAGATAACAGATCTTTACATGCCAAAGGACCAGGGATCAAAAACCCATCGTGGAATAGGTTTCATCACTTTTGCAAGTTCAGATTCTGTGGAAAA
TTTGATGGCTGATACTCATGAATTAGGAGGTTCTACTGTGGTTGTTGATAGAGCGACCCCCAAGGATGATGATTTCAGGCCCATAGGGAAAATGCCGCAGGGGGGTGGTG
GTGGGGGCGGATATGGTGCATACAATGCTTATATTTCTGCCGCAACAAGATATGCAGCACTTGGTGCTCCTACCTTATATGACCATCCAGGCTCAGTTTATGGGAGAAGG
GAATTTCGAGGGATGGGAAAAAAGATTTTGTTGGTAGGCTCCCACAAGAAGCATCTTCTGATGATCTTCGCCAGTACTTTGGTAGATTTGGCCGTATATTGGATGTCTAT
GTTCCGAAGGATCCTAAAAGATCTGGCCATCGAGGTTTTGGTTTTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTTGAGAAGTGCACAATTTTCCATCGATTATAGGCAGATACGTGGCAGAAATCGAATGCAGCACCACCATTGTTCCTGTAGTAAGTGATCGCATTGAACAACTTCTCA
TTGCGCTGCCAAAGTCAAAACTCGAGGACCTTAAACCTGGGCGAAACCCGACGGCTTTAAAGCCCTTTCTGGCGCGCGATAGAAAAAGAGAGCGAGAGATAGAGACGAGG
AGGGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGATAGAGATAGAGATAGAGAGAGAAGAGATCTGCGTTTAGGGTTTTCTTGAAATCTCAGAAATTTTGATAAAAAGGGAGCGAGTGCG
AGAGATTTGGGGAGAGTGAGCGTGGGTCTTTGAGCGAGCGAGCGAGCGAGGAAGAAGAGGAGGAGAGAGTGATATACTTTTTCACTTTTAGGGTTCAATTTCTCTGCCTT
ACCTGCGCCAATTCATCATGGATCGGAAGCTGGTGGTTCTTGGTATTCCATGGGACGTCGATACAGAAGGGCTGAGAGAATACATGAGCAAATTTGGGGAGTTGGAGGAT
TGTATTGTTATGAAGGAGAGGTCAACTGGTCGGTCTCGTGGTTTTGGATATGTGACATTTGCAACCGATGAAGATGCTAAGAATGCACTATCAAGTGAGCACTTTCTTGG
CAACAGAATGATGGAAGTTAAAGTTGCCACACCTAAAGAGGAGATGAGAGCACCTCCTAAGAGAGTCACAAGGATTTTTGTAGCAAGGATCTCACAATCTGTGACTGAGG
CTGCCTTCCGCAGTCATTTTGAGAAATATGGAGAGATAACAGATCTTTACATGCCAAAGGACCAGGGATCAAAAACCCATCGTGGAATAGGTTTCATCACTTTTGCAAGT
TCAGATTCTGTGGAAAATTTGATGGCTGATACTCATGAATTAGGAGGTTCTACTGTGGTTGTTGATAGAGCGACCCCCAAGGATGATGATTTCAGGCCCATAGGGAAAAT
GCCGCAGGGGGGTGGTGGTGGGGGCGGATATGGTGCATACAATGCTTATATTTCTGCCGCAACAAGATATGCAGCACTTGGTGCTCCTACCTTATATGACCATCCAGGCT
CAGTTTATGGGAGAAGGGAATTTCGAGGGATGGGAAAAAAGATTTTGTTGGTAGGCTCCCACAAGAAGCATCTTCTGATGATCTTCGCCAGTACTTTGGTAGATTTGGCC
GTATATTGGATGTCTATGTTCCGAAGGATCCTAAAAGATCTGGCCATCGAGGTTTTGGTTTTGTAACTTTTGCTGAAGATGGTGTAGCAGATCGTGTATCTCGAAGATCT
CATGAGATTTGTGGACAACAGGTTGCTATTGATTCAGCCACTCCTCTTGATGATGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCTGGAGCATCAGGAGCCAGTGGAACTTTTATGATGAA
TAGTGCCGCTGAATCGTTCAGCGGCTATGTGGGGCCTATGAGGACTTATGGAAGGATGTATGGAAGCCTGGACTTCGATGATTGGGGCTATGGAATTGGTGGTGGAAGGC
CATCTAGAGCAGACTGGAGGTATCGGCCATACTAAAGAGAGCAGATCACCTTCATTCTTATAAATAAATCAACAGAAATGAATTCCCCTATTTATGAGCAACATATTCGG
AGTTTTGGCCTTTGTAGAGTCATTATCTTTGGATGTATGTTTATTGCATTCTTTCCTTTGTTTTATTTTCTTTCCTAACTGAAATGCGTCGGGTTCTAGGTCGGGGTTTG
GAGGGTAGGTTGGTTGTTTGTACCCTTGGTTAGAAGTTATTAGTTAGTTGTATTCTTCTCTAACTCTGCTTTAAGAAAACCCATTTTACGAATTTTTTTTAGAATGGTTT
CGTTTTCCACGGACAATTAATTATATTAACGAGGCATCCAATGCCACAGAATAGTGACTACTAATCACTTCTGCTTGTTCTGCCCTTTATAATAAGAACACACTATTTAA
ATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDRKLVVLGIPWDVDTEGLREYMSKFGELEDCIVMKERSTGRSRGFGYVTFATDEDAKNALSSEHFLGNRMMEVKVATPKEEMRAPPKRVTRIFVARISQSVTEAAFRSH
FEKYGEITDLYMPKDQGSKTHRGIGFITFASSDSVENLMADTHELGGSTVVVDRATPKDDDFRPIGKMPQGGGGGGGYGAYNAYISAATRYAALGAPTLYDHPGSVYGRR
EFRGMGKKILLVGSHKKHLLMIFASTLVDLAVYWMSMFRRILKDLAIEVLVL