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PI0022611 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0022611
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationchr12:3925243..3926359
RNA-Seq ExpressionPI0022611
SyntenyPI0022611
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004153812.1 uncharacterized protein LOC101208118 [Cucumis sativus]2.9e-8594.35Show/hide
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XP_008441031.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485264 [Cucumis melo]1.2e-8696.61Show/hide
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XP_022139905.1 uncharacterized protein LOC111010704 [Momordica charantia]3.0e-6677.22Show/hide
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XP_022924226.1 uncharacterized protein LOC111431737 [Cucurbita moschata]1.1e-6575.27Show/hide
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        MANW+ ALRK+YGFS+DLEEEDVW SVEGK+D+S+F+ RKS DY                   RLPTAPKMIPKSI+TRTHETQM  NRSSAPVDIPDW+
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XP_038894875.1 uncharacterized protein LOC120083273 [Benincasa hispida]1.1e-7991.06Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX30 Uncharacterized protein1.4e-8594.35Show/hide
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A0A1S3B355 uncharacterized protein LOC1034852645.7e-8796.61Show/hide
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A0A5D3BLZ0 Zinc-regulated protein 85.7e-8796.61Show/hide
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A0A6J1CDL0 uncharacterized protein LOC1110107041.5e-6677.22Show/hide
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E5GC55 Uncharacterized protein5.7e-8796.61Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5848.8e-1641.22Show/hide
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        SSSS   +S+ SSSS   +PTAPK   + +              SAPV +P  S                V D E+ E+ +M+PPHE +A+ LA+S + S
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         SV EG GRTLKGRDL +VRNA+  +TGF++
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AT3G45210.1 Protein of unknown function, DUF5844.8e-1440.15Show/hide
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        +++ +  S   S+ S S     +L T+  K  P +++T T         SS P+++ +WSKI GK    S      + + +DG  +  +PPHE+    LA
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Query:  RSRISSFSVCEGVGRTLKGRDLSKVRNAILTKTGFLE
        ++R++SFSV EG+GRTLKGRD+S+VRNAIL KTGFL+
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AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5841.8e-2948.19Show/hide
Query:  DDLEEEDVWNSV-EGKDDTSNFINRKSNDYYYSSSSSSSSSSSSSSSTWRLPTAPKMIPKSISTRTHETQMANNRSSAPVDIPDWSKIYG--KMGSSSAG
        ++ +EEDVW+ + EG+  +      KS+          SSSSSSSSS W +             R  +      +SSAP+++PDWSK+YG  K    S+ 
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Query:  EKTDVRDQEDGEDDD-MVPPHEWIAQKLARSRISSFSVCEGVGRTLKGRDLSKVRNAILTKTGFLE
          +   D +D +DD  MVPPHEW+A+KLAR++ISSFS+CEGVGRTLKGRDLSKVRNA+L+KTGFLE
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AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5844.2e-2642.68Show/hide
Query:  DDLEEEDVWNSVEGKDDTSNFINRKSNDYYYSSSSSSSSSSSSSSSTWRLPTAPKMIPKSISTRTHETQMANNRSSAPVDIPDWSKIYG--KMGSSSAGE
        ++ +EE+VW+ +   +     +    ++  +S+SSSSS+               + IPK      +E      +SSAP++IPDWSK+YG  K  +SS   
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Query:  KTDVRDQEDGEDDDMVPPHEWIAQKLARSRISSFSVCEGVGRTLKGRDLSKVRNAILTKTGFLE
           + D ++G    MVPPHE +A++LAR++ISSFS+CEG+GRTLKGRDLSK RNA+LT+TGFLE
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AT5G60680.1 Protein of unknown function, DUF5843.7e-1440.13Show/hide
Query:  GKDDTSNFINRKSNDYYYSSSSSSSSSSSSSSSTWRLPTAPKMIPKSISTRTHETQMANNRSSAPVDIPDWSKIYGKMGSSSAGEKTDVRDQEDGEDD--
        G D  S F    S   +  S   +   S S     ++ ++ +   KS S R      A   SS PV++PDWSKI    G      +  + D +D +DD  
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Query:  ---DMVPPHEWIAQKLARSRISSFSVCEGVGRTLKGRDLSKVRNAILTKTGF
           D +PPHE+    LA++R++SFSV EGVGRTLKGRDLS+VRNAI  K GF
Subjt:  ---DMVPPHEWIAQKLARSRISSFSVCEGVGRTLKGRDLSKVRNAILTKTGF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAATTGGAGCAGTGCTTTGAGAAAAAACTATGGATTCAGTGATGATTTGGAAGAAGAAGATGTATGGAATTCTGTTGAAGGTAAAGATGATACTTCAAATTTCAT
CAATAGAAAGTCTAATGACTATTATTACTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCATCTTCTTCTTCCACTTGGCGTCTTCCAACTGCTCCAAAAATGATCCCGA
AATCCATTTCAACAAGAACACATGAAACCCAGATGGCGAATAATCGATCCTCTGCTCCGGTGGATATTCCCGATTGGTCCAAAATTTACGGCAAAATGGGTTCGTCGTCC
GCCGGTGAAAAAACTGACGTTAGAGATCAAGAAGACGGTGAAGATGACGATATGGTGCCTCCTCATGAATGGATTGCACAGAAATTAGCGAGAAGCAGAATTTCGTCTTT
CTCTGTTTGTGAAGGGGTTGGAAGAACTCTGAAAGGAAGAGATTTAAGTAAAGTTCGAAACGCCATTTTAACAAAGACGGGTTTTTTAGAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGATTTCTCTCTGTTTTTGTGGTCTTCTCTTTTGCCACATTACATTCAAACCTCTGTTCTTCCCTTCACCTTCTCTTTTTCCTTCTTCTTTCTTTACACCTTCTCTCCC
ATTTTCTTCATGTTTTTTTGGATTATGAACAAAACCCATTTCAGGAATTCTTGAAAAAAGCTCTGCTTTTTTCTTTTTTCCTTTTTTTTTTCTCAACAGAACTCTGCCAC
AAAAGCCTGGATATCAATGGCGAATTGGAGCAGTGCTTTGAGAAAAAACTATGGATTCAGTGATGATTTGGAAGAAGAAGATGTATGGAATTCTGTTGAAGGTAAAGATG
ATACTTCAAATTTCATCAATAGAAAGTCTAATGACTATTATTACTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCATCTTCTTCTTCCACTTGGCGTCTTCCAACTGCT
CCAAAAATGATCCCGAAATCCATTTCAACAAGAACACATGAAACCCAGATGGCGAATAATCGATCCTCTGCTCCGGTGGATATTCCCGATTGGTCCAAAATTTACGGCAA
AATGGGTTCGTCGTCCGCCGGTGAAAAAACTGACGTTAGAGATCAAGAAGACGGTGAAGATGACGATATGGTGCCTCCTCATGAATGGATTGCACAGAAATTAGCGAGAA
GCAGAATTTCGTCTTTCTCTGTTTGTGAAGGGGTTGGAAGAACTCTGAAAGGAAGAGATTTAAGTAAAGTTCGAAACGCCATTTTAACAAAGACGGGTTTTTTAGAGTGA
TTCTTTCCTTCTGCTTGAGAGATTATCATCATCTTCATCATTTTGTTCTGTGTTTTCTTGTTTGCTTTACTGCCATTGTTATGCTCTGCTGGAGCTTAGTTAGAACAGAG
TTTCTAGCAAGAACTGGAGAAAAAAAATGAAGAATTTGGAGCTTTTTTTGGGTATTTAAAATGGAGTGGAACTGTTTCATGTTCTATGATTTTGAGTTAAGAATGGTTTG
TTGAAGTTCTTAGTTTATAGTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MANWSSALRKNYGFSDDLEEEDVWNSVEGKDDTSNFINRKSNDYYYSSSSSSSSSSSSSSSTWRLPTAPKMIPKSISTRTHETQMANNRSSAPVDIPDWSKIYGKMGSSS
AGEKTDVRDQEDGEDDDMVPPHEWIAQKLARSRISSFSVCEGVGRTLKGRDLSKVRNAILTKTGFLE