; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0022683 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0022683
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HAT22-like
Genome locationchr06:22074542..22076441
RNA-Seq ExpressionPI0022683
SyntenyPI0022683
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060358.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Cucumis melo var. makuwa]4.2e-14495.97Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBR7 Homeobox domain-containing protein6.0e-14495.6Show/hide
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A0A1S3BNL6 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like9.2e-14596.34Show/hide
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A0A5D3DEZ1 Homeobox-leucine zipper protein HAT22-like2.1e-14495.97Show/hide
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A0A6J1KP81 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like2.4e-10074.1Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XE76 Homeobox-leucine zipper protein HOX195.7e-5146.94Show/hide
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P46603 Homeobox-leucine zipper protein HAT91.7e-7158.19Show/hide
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         E E +  RV SD  ED++G  + RKKLRL+KQQSALLEESFK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETL DE
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        N RLQKE+QELK +KL +P YM MP +TLT CPSCER+G GG G  G G            S +K  FS+   PHF+NPF+NPSAAC
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P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT223.1e-7357.75Show/hide
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             +EE     VC RVSD+ DD+   + RKKLRL+KQQSALLE++FK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCC
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        ETLTDENRRLQKE+Q+LKA+KL++P YM MP ATLT+CPSCER+G GG GG         +K  FS+   P FYNPF+NPSAAC
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Q67UE2 Homeobox-leucine zipper protein HOX111.1e-4955.56Show/hide
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        P P SS S   E    T GF       SG GG   G   +   V      +SP++SA       FSG      D +      +R C R SDEDD G  + 
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Query:  RKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQM
        RKKLRLSK+QSA LEESFK++STLNPKQK  LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCETLT+ENRRLQKE+ EL+A+K   P YM +
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Query:  PGATLTICPSCERVGT
        P  TL++CPSCERV +
Subjt:  PGATLTICPSCERVGT

Q8GRL4 Homeobox-leucine zipper protein HOX195.7e-5146.94Show/hide
Query:  SKTGLVLGLGLSELADDQTATLK------KKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGF-----SGCGGDTHGKVIDHVGVHHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERD
        S  GL LGL L       T          ++P+P SS     EP  LTL       +G             G  H     S  S +V ++ +  VKRER 
Subjt:  SKTGLVLGLGLSELADDQTATLK------KKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGF-----SGCGGDTHGKVIDHVGVHHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERD

Query:  LSSEEVELERVCWRVSDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLT
          +EE + ERV    +  DDD   +TRKKLRL+K+QSALLE+ F+++STLNPKQK  LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCETLT
Subjt:  LSSEEVELERVCWRVSDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLT

Query:  DENRRLQKEVQELKAIKLA----------------KPVYMQMPGATLTICPSCERVGTGGHGGVGDGNSNSKPKFSMPPNPHFYNPFSNPSAAC
        +ENRRLQ+E+QEL+A+K A                 P YMQ+P ATLTICPSCERVG             +K         HF+NPF++ SAAC
Subjt:  DENRRLQKEVQELKAIKLA----------------KPVYMQMPGATLTICPSCERVGTGGHGGVGDGNSNSKPKFSMPPNPHFYNPFSNPSAAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22800.1 Homeobox-leucine zipper protein family1.2e-7258.19Show/hide
Query:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQTATLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGCGGDTHGKVIDHVGVHHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEE
        MGFDD   TGLVLGLG S + ++  +T+++      SS    EP  LTL  S   GD    V+   G   L RQTS HS     S    VKRERD   E 
Subjt:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQTATLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGCGGDTHGKVIDHVGVHHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEE

Query:  VELERVCWRV-SD--EDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDE
         E E +  RV SD  ED++G  + RKKLRL+KQQSALLEESFK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETL DE
Subjt:  VELERVCWRV-SD--EDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDE

Query:  NRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMPGATLTICPSCERVGTGGHGGVGDG-----------NSNSKPKFSMPPNPHFYNPFSNPSAAC
        N RLQKE+QELK +KL +P YM MP +TLT CPSCER+G GG G  G G            S +K  FS+   PHF+NPF+NPSAAC
Subjt:  NRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMPGATLTICPSCERVGTGGHGGVGDG-----------NSNSKPKFSMPPNPHFYNPFSNPSAAC

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 31.8e-4453.49Show/hide
Query:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSS----------EEVELERVCWRV--SDEDDDGCNN----TRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNL
        S  +S V S  SGK K ER+L +          E+ E+ER    +    +D+DG  N    +RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK++STLNPKQK  LA+QLNL
Subjt:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSS----------EEVELERVCWRV--SDEDDDGCNN----TRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNL

Query:  LPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQM-PGATLTICPSCERVG-TGGHGGVGDGNSNSKPKFSMP
          RQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCE LTDENRRLQKEV EL+A+KL+  +YM M P  TLT+CPSCERV  T     V     NS      P
Subjt:  LPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQM-PGATLTICPSCERVG-TGGHGGVGDGNSNSKPKFSMP

Query:  PNPHFYNPFSNPSAA
         +P    P     AA
Subjt:  PNPHFYNPFSNPSAA

AT4G16780.1 homeobox protein 24.1e-4461.49Show/hide
Query:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRVSDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRART
        S  +S V SS   + +RE D   +         R   +D+DG +N+RKKLRLSK QSA+LEE+FK +STLNPKQKQ LA+QL L  RQVEVWFQNRRART
Subjt:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRVSDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRART

Query:  KVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQM-PGATLTICPSCERV
        K+KQTEVDCE L++CCE LT+ENRRLQKEV EL+A+KL+   YM M P  TLT+CPSCE V
Subjt:  KVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQM-PGATLTICPSCERV

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family2.2e-7457.75Show/hide
Query:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQTATLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGCGGDTHGKVIDHVGV-HHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLS--
        MG DD   TGLVLGLGLS   ++    +KK  +      +  +P  LTL  SG       K+    G    + RQTS H S + S  SG+VKRER++S  
Subjt:  MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQTATLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGCGGDTHGKVIDHVGV-HHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLS--

Query:  -----SEEVELERVCWRVSDE-DDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCC
             +EE     VC RVSD+ DD+   + RKKLRL+KQQSALLE++FK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCC
Subjt:  -----SEEVELERVCWRVSDE-DDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCC

Query:  ETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMPGATLTICPSCERVGTGGHGG--VGDGNSNSKPKFSMPPNPHFYNPFSNPSAAC
        ETLTDENRRLQKE+Q+LKA+KL++P YM MP ATLT+CPSCER+G GG GG         +K  FS+   P FYNPF+NPSAAC
Subjt:  ETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMPGATLTICPSCERVGTGGHGG--VGDGNSNSKPKFSMPPNPHFYNPFSNPSAAC

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana1.1e-4972.26Show/hide
Query:  ELERVCWRVSDEDDDGCN-NTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRR
        E+ER   R S+ED+D  N +TRKKLRLSK QSA LE+SFK++STLNPKQK  LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCE+LT+ENRR
Subjt:  ELERVCWRVSDEDDDGCN-NTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRR

Query:  LQKEVQELKAIKLAKPVYMQMPGATLTICPSCERVGT
        LQKEV+EL+ +K + P YMQ+P  TLT+CPSCERV T
Subjt:  LQKEVQELKAIKLAKPVYMQMPGATLTICPSCERVGT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTTTGATGATTTTTCTAAAACAGGGTTGGTGTTGGGATTAGGGCTCTCGGAATTAGCTGACGATCAAACGGCGACATTGAAGAAGAAGCCTGCACCTTGCTCATC
CAGTTCACTTGATTTTGAGCCTTGTGTTTTGACTTTGGGATTTTCCGGTTGTGGTGGCGACACTCATGGGAAAGTTATTGATCATGTGGGTGTTCATCATTTGTATCGCC
AAACATCCCCTCATAGCAGCGCTGTTTGTTCTTCCTTCTCCGGCAAGGTTAAAAGAGAGAGAGATCTGAGCAGTGAAGAAGTTGAATTGGAGAGAGTTTGTTGGAGAGTT
AGTGATGAAGATGACGATGGTTGTAATAATACTAGAAAGAAACTTAGACTCTCTAAACAACAATCCGCTCTCCTGGAAGAAAGTTTCAAACAAAATAGCACGCTCAATCC
TAAGCAAAAACAAGGGTTAGCAAGACAGCTAAATCTACTGCCACGACAAGTTGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAGCTCGAACAAAAGTGAAACAAACAGAAGTAGATT
GTGAGTTGTTGAAGAAGTGTTGTGAGACGTTGACGGATGAAAATAGAAGATTACAAAAGGAGGTTCAAGAATTGAAGGCAATAAAGCTGGCAAAACCTGTATACATGCAG
ATGCCGGGGGCGACATTAACCATATGTCCCTCATGCGAAAGGGTGGGTACTGGCGGCCATGGTGGTGTCGGGGACGGTAATTCTAATTCCAAACCCAAATTTTCAATGCC
TCCTAACCCTCACTTTTACAACCCCTTCTCCAATCCTTCAGCCGCTTGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAAAGTACAAGGTGGCTTCGTATCTATATACCACAATTATTAATAATGAAATAAGAGAAAGAAATTAAGAAAAGGGGTATGATTGGGTGGGAAAGAAACTAAAAAAAAA
AAAATAATGAATGGATTCTAATATTGGGACATAAATGAAAGAAGAGGAAAAGTTTGGGGCAAATAATTGAACCCGTTTTAAAGTGAAACTGAATAACAAGACGAGGAAAC
ATTTATGAAGCAACACTCAAAAGTGGTAGTAATAGTTAAATGTAGCAAACAAGAAAGAGAGAGAGAAAGAAAGAATGATACTTTCTTGATGTGTTCCCCACAACCATGTG
AACTATGGGATTCGAGCACGAAAAGGAAATTAAGTAATTGTGGGTTTTTTTTTTTCTGTTCATTATTAATAAGGAGAAGATAATAGGTAAGCGGGGTTTCAAAGGTCAAC
CTATGTATAGAGATAGAAGGGAGTTTTAATTTGATAATTTATTATTTATTTTCCAAATGCTAACTAGATTCTTTTGTGTTCTCAATTTCTTTTCTCTTCCATTAATAATC
GTACCCATATCTCTCTCTCTTTTTTTTCTCTCTTCTTAAAGACCCTTCATATTAGTTTGTTATTGTTCACAAGTTTCGCTTTTTCCAGTTTTTCCATCCACAATTATTAT
TTCCCTCTCACCCGAGATGGGTTTTGATGATTTTTCTAAAACAGGGTTGGTGTTGGGATTAGGGCTCTCGGAATTAGCTGACGATCAAACGGCGACATTGAAGAAGAAGC
CTGCACCTTGCTCATCCAGTTCACTTGATTTTGAGCCTTGTGTTTTGACTTTGGGATTTTCCGGTTGTGGTGGCGACACTCATGGGAAAGTTATTGATCATGTGGGTGTT
CATCATTTGTATCGCCAAACATCCCCTCATAGCAGCGCTGTTTGTTCTTCCTTCTCCGGCAAGGTTAAAAGAGAGAGAGATCTGAGCAGTGAAGAAGTTGAATTGGAGAG
AGTTTGTTGGAGAGTTAGTGATGAAGATGACGATGGTTGTAATAATACTAGAAAGAAACTTAGACTCTCTAAACAACAATCCGCTCTCCTGGAAGAAAGTTTCAAACAAA
ATAGCACGCTCAATCCTAAGCAAAAACAAGGGTTAGCAAGACAGCTAAATCTACTGCCACGACAAGTTGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAGCTCGAACAAAAGTGAAA
CAAACAGAAGTAGATTGTGAGTTGTTGAAGAAGTGTTGTGAGACGTTGACGGATGAAAATAGAAGATTACAAAAGGAGGTTCAAGAATTGAAGGCAATAAAGCTGGCAAA
ACCTGTATACATGCAGATGCCGGGGGCGACATTAACCATATGTCCCTCATGCGAAAGGGTGGGTACTGGCGGCCATGGTGGTGTCGGGGACGGTAATTCTAATTCCAAAC
CCAAATTTTCAATGCCTCCTAACCCTCACTTTTACAACCCCTTCTCCAATCCTTCAGCCGCTTGTTAGACAATTTATTATTCCAACTTACACAATAATATTATTACCTTT
CTTTTATCTTTTCTTCTTCAAAAATGGTTGTAGAGCTAAATTAGAGGTTAGAAAATTTAATGTAAGTAGTAGCTACCTAGCTAGCTTGTAAAAAAATTACTCTGTTATCA
TCCAACATCAAATTATATCAGTCTTATTTTTCTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFDDFSKTGLVLGLGLSELADDQTATLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGCGGDTHGKVIDHVGVHHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRV
SDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQ
MPGATLTICPSCERVGTGGHGGVGDGNSNSKPKFSMPPNPHFYNPFSNPSAAC