; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0022748 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0022748
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic
Genome locationchr06:3074447..3078154
RNA-Seq ExpressionPI0022748
SyntenyPI0022748
Gene Ontology termsGO:1901259 - chloroplast rRNA processing (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049207.1 putative G3BP-like protein [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-13096.86Show/hide
Query:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST
        AAAAATGASFF T LRGSRSKHW SDSLLATPSTQVLPILSRSL IESPPLRASS RWRPVLIISAAVVQG+TAVTVGVEEGVEEET VE GSPVESGST
Subjt:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
        KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW

Query:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV
        SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV
Subjt:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV

KAG6582419.1 hypothetical protein SDJN03_22421, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-11481.02Show/hide
Query:  AAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEE--TTVEDGSPVESGST
        AAATG SFF T +RGSRS  WLSDS LATPSTQVLP+LSR LA++S PLRA S R RP  IISA  VQG+ A+TVGVEEG E+E    V+ GSPVESGST
Subjt:  AAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEE--TTVEDGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
        KLYFGNLPYSVDS QLAAIVQD+GVAELIEVLYDR+TGKSRGFAFVTM+SI+DCNKVIENL+G  YMGRILRVNFSDKPKPKE L+PETEYKLFV NL+W
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW

Query:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
        SVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTKSEMETAL ALN+   EGRV+ VSLAEG QAQG
Subjt:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG

XP_004134038.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Cucumis sativus]2.3e-13794.53Show/hide
Query:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST
        AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESP LRASS +WRPV+IISAAVVQG+TAVTVGVEEGVEEET VE GSPVESGST
Subjt:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
        KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQD+G+AELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG+AYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW

Query:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
        SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIY+GETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALE +NE+ELEGRVIRVSLAEGKQA G
Subjt:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG

XP_016898952.1 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein [Cucumis melo]1.4e-13496.59Show/hide
Query:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST
        AAAAATGASFF T LRGSRSKHW SDSLLATPSTQVLPILSRSL IESPPLRASS RWRPVLIISAAVVQG+TAV VGVEEGVEEET VE GSPVESGST
Subjt:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
        KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW

Query:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
        SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
Subjt:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV

XP_022157973.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Momordica charantia]9.6e-12084.04Show/hide
Query:  MAAAAAT-GASFFAT--SLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEE----TTVEDG
        MAAAAAT G+SF A+  S +G RSKHWLSDSLLA PSTQ+LP+LSR LA+ES  LRA S +WRPVL ISAAVVQG+ AVT   EEGV EE      V  G
Subjt:  MAAAAAT-GASFFAT--SLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEE----TTVEDG

Query:  SPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK
        SPVE+GSTKLYFGNLPYSVDSSQLA IVQ+HGV ELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCN+VIENLDG+AYMGR+LRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK
Subjt:  SPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK

Query:  LFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
        LFVGNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTK EME ALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
Subjt:  LFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L496 Uncharacterized protein1.1e-13794.53Show/hide
Query:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST
        AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESP LRASS +WRPV+IISAAVVQG+TAVTVGVEEGVEEET VE GSPVESGST
Subjt:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
        KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQD+G+AELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG+AYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW

Query:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
        SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIY+GETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALE +NE+ELEGRVIRVSLAEGKQA G
Subjt:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG

A0A1S4DSH7 LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein6.7e-13596.59Show/hide
Query:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST
        AAAAATGASFF T LRGSRSKHW SDSLLATPSTQVLPILSRSL IESPPLRASS RWRPVLIISAAVVQG+TAV VGVEEGVEEET VE GSPVESGST
Subjt:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
        KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW

Query:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
        SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
Subjt:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV

A0A5D3CZH4 Putative G3BP-like protein7.6e-13196.86Show/hide
Query:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST
        AAAAATGASFF T LRGSRSKHW SDSLLATPSTQVLPILSRSL IESPPLRASS RWRPVLIISAAVVQG+TAVTVGVEEGVEEET VE GSPVESGST
Subjt:  AAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
        KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSW

Query:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV
        SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV
Subjt:  SVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV

A0A6J1DUT6 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic4.6e-12084.04Show/hide
Query:  MAAAAAT-GASFFAT--SLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEE----TTVEDG
        MAAAAAT G+SF A+  S +G RSKHWLSDSLLA PSTQ+LP+LSR LA+ES  LRA S +WRPVL ISAAVVQG+ AVT   EEGV EE      V  G
Subjt:  MAAAAAT-GASFFAT--SLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEE----TTVEDG

Query:  SPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK
        SPVE+GSTKLYFGNLPYSVDSSQLA IVQ+HGV ELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCN+VIENLDG+AYMGR+LRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK
Subjt:  SPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK

Query:  LFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
        LFVGNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTK EME ALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
Subjt:  LFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG

A0A6J1IVW4 putative G3BP-like protein2.2e-11481.78Show/hide
Query:  AAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEET-------TVEDGSPV
        AAATG SFF T +RGSRSKHWLSDS LATPSTQVLPILSR LA++S PLRA S RWRP  +ISAA VQG+ A+TVG EEGVEEET        V+ GSPV
Subjt:  AAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEET-------TVEDGSPV

Query:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
        ESGSTKLYFGNLPYSVDS QLAAIVQD+GVAELIEVLYDR+TGKSRGFAFVTM+SIEDCNKVIENL+G  YMGRILRVNFSDKPKPKE L+PETEYKLFV
Subjt:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV

Query:  GNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
         NL+WSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTKSEMETAL ALN+   EGRV+ V
Subjt:  GNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19683 31 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic8.1e-3742.65Show/hide
Query:  GDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRI
        GD   +  VE   EEE   E   P E    KL+ GNLPY VDS  LA + +  GV E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+  K +E  +     GR+
Subjt:  GDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRI

Query:  LRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSL
        L VN +    ++P+ + P   E  Y+++VGN+ W +    L Q F E+G VV ARV+Y+ ETG+SRG+GFV+ ++++EM  A+  L+   L+GR IRV++
Subjt:  LRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSL

Query:  AEGK
        AE +
Subjt:  AEGK

P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic9.5e-3839.81Show/hide
Query:  DTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL
        + A++   EE +EE+    +   VE G  +LY GNLP+S+ SSQL+ I  + G    +E++YDR T +SRGFAFVTM S+E+  + I   DG+   GR +
Subjt:  DTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL

Query:  RVNFSDKPKPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEG
        +VNF + P+  E              + ++ +KL+V NLSW++TS+ L  AF +    + A+VIY+  +G+SRG+GF+++S+   M +AL+ +NEVELEG
Subjt:  RVNFSDKPKPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEG

Query:  RVIRVSLAEGK
        R +R+++A  K
Subjt:  RVIRVSLAEGK

P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic2.8e-3743.4Show/hide
Query:  AVVQGDT----AVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVES--GSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIEN
        AV++G++    AV+ G E  V +E  VE G          KL+ GNLPY VDS +LA I    GV E+ EV+Y+R T +SRGF FVTMS++E+  K +E 
Subjt:  AVVQGDT----AVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVES--GSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIEN

Query:  LDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY----KLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVE
        L+G    GR L VN    P+      P  ++    +++VGNL W V +  L Q F E+G VV ARV+ + ETG+SRG+GFV+ S++SE+  A+ AL+   
Subjt:  LDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY----KLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVE

Query:  LEGRVIRVSLAE
        L+GR +RV++AE
Subjt:  LEGRVIRVSLAE

P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic1.6e-3741.41Show/hide
Query:  VEEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDK
        V E     +T    S  E G+ +LY GN+P ++++ +L  IV++HG  E+ EV+YD+ +G+SR F FVTM ++ED N VIE L+ T   GR ++VN ++K
Subjt:  VEEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDK

Query:  P---------KPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLA
        P         + ++  + E+ YK+++GNL+ +VT+E+L   F E G V+GA+V     T KS G+GFVS+S++ E+E A++ALN   LEG+ IRV+ A
Subjt:  P---------KPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLA

Q9FGS0 RNA-binding protein CP31B, chloroplastic8.1e-3737.07Show/hide
Query:  SRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLR--ASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVED--GSPVESGSTKLYFGNLPYSVDS
        S   H  + SL + P    L + S++L   SP +   + +  W       A   +G+     G    V+E    ED  G P      KL+ GNLPY VDS
Subjt:  SRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLR--ASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVED--GSPVESGSTKLYFGNLPYSVDS

Query:  SQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQ
          LA + +  G  E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+  K +E  +     GR L VN +     +P+ ++P   +  ++++VGNL W V S  L +
Subjt:  SQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQ

Query:  AFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAE
         F E+G VV ARV+ + ETG+SRG+GFV  S ++E+  A+ AL+   LEGR I+V++AE
Subjt:  AFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.5e-7065.66Show/hide
Query:  VTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVN
        +TV +EE  +++       P  + +TKLYFGNLPY+VDS+ LA I+QD    EL+EVLY+R+TG+SRGFAFVTMS++EDCN +I+NLDGT Y+GR L+VN
Subjt:  VTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVN

Query:  FSDKPKP-KEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ
        F+DKPKP KEPLYPETE+KLFVGNLSW+VTSE L  AF+E G+VVGARV+++G+TG+SRGYGFV YS+K+EMETALE+L+  ELEGR IRV+LA+GK+
Subjt:  FSDKPKP-KEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ

AT2G37220.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.1e-3638.46Show/hide
Query:  VTVGVEEGVEEETTVEDGSPVE---SGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL
        V +  E  VEE+   +   P E   S   KL+ GNLP++VDS+QLA + +  G  E++EV+YD+ TG+SRGF FVTMSS+ +     +  +G    GR L
Subjt:  VTVGVEEGVEEETTVEDGSPVE---SGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL

Query:  RVNFSDKPKPKEPLY---PETEY-------------------KLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL
        RVN    P  +E  +   P + +                   +++VGNLSW V    L   F E G VV ARVIY+ ++G+S+G+GFV+Y +  E++ A+
Subjt:  RVNFSDKPKPKEPLY---PETEY-------------------KLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL

Query:  EALNEVELEGRVIRVSLAEGK
        ++L+  +L+GR IRVS AE +
Subjt:  EALNEVELEGRVIRVSLAEGK

AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 333.1e-3637.75Show/hide
Query:  EEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKP
        EE VEEE      S  E    +LY GNLPY++ SS+L+ I  + G    ++++YD+ T +SRGF FVTM SIE+  + ++  + +   GR ++VNF + P
Subjt:  EEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKP

Query:  KPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLA
        +  E              Y ++ +K++ GNL W++TS+ L  AF +   V+GA+VIY   TG+SRG+GF+S+ +   +++AL  +N VE+EGR +R++LA
Subjt:  KPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLA

Query:  EGKQ
          ++
Subjt:  EGKQ

AT4G24770.1 31-kDa RNA binding protein8.3e-3742.29Show/hide
Query:  VEEGVEEETTVEDGS-------PVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL
        V EG E E  V +G+       P  S   KL+ GNL Y V+S  LA + +  G  E+ EV+Y+R T +SRGF FVTMSS+++    +E  +     GR+L
Subjt:  VEEGVEEETTVEDGS-------PVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL

Query:  RVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLA
         VN +     +P+ + P   E  ++++VGNL W V +  L Q F E+G VV ARV+Y+ ETG+SRG+GFV+ S   E+  A+ AL+   LEGR IRV++A
Subjt:  RVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLA

Query:  E
        E
Subjt:  E

AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B5.7e-3837.07Show/hide
Query:  SRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLR--ASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVED--GSPVESGSTKLYFGNLPYSVDS
        S   H  + SL + P    L + S++L   SP +   + +  W       A   +G+     G    V+E    ED  G P      KL+ GNLPY VDS
Subjt:  SRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLR--ASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVED--GSPVESGSTKLYFGNLPYSVDS

Query:  SQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQ
          LA + +  G  E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+  K +E  +     GR L VN +     +P+ ++P   +  ++++VGNL W V S  L +
Subjt:  SQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQ

Query:  AFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAE
         F E+G VV ARV+ + ETG+SRG+GFV  S ++E+  A+ AL+   LEGR I+V++AE
Subjt:  AFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCCGCCGCCGCCACCGGAGCCTCCTTCTTTGCCACTTCCTTAAGGGGTTCACGGTCCAAGCACTGGCTCTCTGATTCTCTCCTCGCAACCCCATCTACCCAAGT
TTTGCCCATACTGTCCCGCTCTCTGGCCATTGAATCGCCTCCGCTCAGAGCTTCCTCGGTGAGGTGGCGGCCGGTTCTGATCATCTCGGCCGCCGTTGTGCAAGGAGACA
CGGCTGTGACGGTTGGAGTTGAAGAAGGTGTGGAGGAGGAGACGACGGTGGAAGATGGTTCTCCAGTAGAGTCTGGGAGTACTAAGCTGTACTTTGGGAATCTTCCTTAT
AGTGTTGATAGTTCACAGCTCGCTGCTATCGTTCAGGATCATGGTGTCGCCGAGCTCATTGAGGTTCTTTATGACAGAAATACTGGGAAAAGTAGAGGATTTGCATTTGT
AACCATGAGCAGTATTGAAGATTGCAATAAAGTGATTGAAAATCTGGATGGAACTGCTTACATGGGCAGAATTTTGAGGGTTAATTTCTCAGACAAACCCAAGCCCAAGG
AACCTTTGTATCCAGAAACTGAGTATAAACTTTTTGTCGGAAACTTATCCTGGTCAGTAACATCTGAAATTTTGACACAAGCATTTCAAGAATATGGAAATGTGGTAGGA
GCAAGGGTCATTTATAACGGGGAGACCGGAAAGTCACGTGGTTATGGCTTTGTTTCTTATTCAACAAAATCAGAAATGGAAACAGCTCTTGAAGCTCTTAATGAAGTAGA
ACTTGAAGGCAGGGTAATACGTGTAAGCTTGGCTGAAGGAAAACAGGCACAGGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCACCATTGGCCACCAAGCGGCCACGTCAGCATGAACTACTAACTTGAGGCTGTGAAAAAACTGCACCATCACATTTCCACTCACCTCTGCTGTTACCCATCTCCTCCC
CATCAAATTCCACCACCATGGCCGCCGCCGCCGCCACCGGAGCCTCCTTCTTTGCCACTTCCTTAAGGGGTTCACGGTCCAAGCACTGGCTCTCTGATTCTCTCCTCGCA
ACCCCATCTACCCAAGTTTTGCCCATACTGTCCCGCTCTCTGGCCATTGAATCGCCTCCGCTCAGAGCTTCCTCGGTGAGGTGGCGGCCGGTTCTGATCATCTCGGCCGC
CGTTGTGCAAGGAGACACGGCTGTGACGGTTGGAGTTGAAGAAGGTGTGGAGGAGGAGACGACGGTGGAAGATGGTTCTCCAGTAGAGTCTGGGAGTACTAAGCTGTACT
TTGGGAATCTTCCTTATAGTGTTGATAGTTCACAGCTCGCTGCTATCGTTCAGGATCATGGTGTCGCCGAGCTCATTGAGGTTCTTTATGACAGAAATACTGGGAAAAGT
AGAGGATTTGCATTTGTAACCATGAGCAGTATTGAAGATTGCAATAAAGTGATTGAAAATCTGGATGGAACTGCTTACATGGGCAGAATTTTGAGGGTTAATTTCTCAGA
CAAACCCAAGCCCAAGGAACCTTTGTATCCAGAAACTGAGTATAAACTTTTTGTCGGAAACTTATCCTGGTCAGTAACATCTGAAATTTTGACACAAGCATTTCAAGAAT
ATGGAAATGTGGTAGGAGCAAGGGTCATTTATAACGGGGAGACCGGAAAGTCACGTGGTTATGGCTTTGTTTCTTATTCAACAAAATCAGAAATGGAAACAGCTCTTGAA
GCTCTTAATGAAGTAGAACTTGAAGGCAGGGTAATACGTGTAAGCTTGGCTGAAGGAAAACAGGCACAGGGGTAAATGTAGAAATGATTTAATTGTATGACAAGCATACA
GTGACTAATCAAGAAATGGGGAAGAGTTTCAAGCTGGCTGTTCCTGAACAAACTGCGAGTGACTGAATCTTCTCTCTTCTTTTTTGTTGTATATACCTCATTTCCCATTT
TTGTACCTTACAAGCTACATTCAGCGGGAAATTTTTTTTTTTTCTCCGACAATTGTGGTAGAGATATCATATCAGACTTGAGATGCTCCCAAAGCTGAAAATGGTTGTAC
CATGATTGAGAATGTAATGGCTAGGAAAGAATTTCTACCTTGCTATTGCTGCTCAAACGCCAAGTGACTGAAATTTCTTTCTCATTATTTTCATTTAGTCATATCTCACA
CCTATACCTTACAAGTGAGACTGACTACGCGTGAAAAACATTTGATGGTCTCTCGTTAACTGTGGTCGAGATGTTTGTATCAAGCTTGATTCAGGTTGATGATTAGACTT
TAAACCTTACAACCAGCTGTAGCAGGGACTAAGGAGTGATGTCTGAACCAGATGAAATCTACACTACTTAAAGAGAATGGACAACTGTCGCCACCAGCTCTTTAAAGATT
TGCTCCTCAGAAACACTTTTCACAAGAGTCTGCTCTATTTGCTCAGGTATGAACGGATCACTCTAGTGTTTATACAACTAACAATCTGATTGAACAACAATAAGTCAAGA
ACTACCACTCTATATTTGAAACGGATCTCAAAGTACCCACATGCTCCAAATTCAAAAACTCATCTTTGGGGACTTTCAGCAAACACCTGGTATGCACCCCACCAAACAAA
CCCAATCTTCAATGGATTTATCAGCTCAAAAGAGGGGAAAGGAAAAGTTTGGCTGCAGGGCAGTAGTAGACACTGATGGGCATAGAAATACCAACATAGGCACTAGATTG
TGCTGCTCAATGTCTCCCAAAACTTAAAAAGCGCCGTATGCCTAAAAGCGCGGTGCTAATTGTGTCAGCAGACAAGGAGATCAATGTGCCCTTCTCTTTATGGGCGAAAT
TATTGTGCATTTATGTGCTTTTGGGGTTAATGGTCGTTGCCTAAAACTTGTAAAATGGCGGCTGCTGCAAATTAAAGTATGTTTCTTTTAGTATAACCATCGGATATTTA
CACTACAACTTTAATGTAATGGAAAGAGTATAATAAAAAATATTACATTTTATAGCCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAAAATGASFFATSLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESPPLRASSVRWRPVLIISAAVVQGDTAVTVGVEEGVEEETTVEDGSPVESGSTKLYFGNLPY
SVDSSQLAAIVQDHGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSEILTQAFQEYGNVVG
ARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG