; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0022898 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0022898
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptiongamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial
Genome locationchr02:24997015..25001462
RNA-Seq ExpressionPI0022898
SyntenyPI0022898
Gene Ontology termsGO:0016746 - transferase activity, transferring acyl groups (molecular function)
InterPro domainsIPR001451 - Hexapeptide repeat
IPR011004 - Trimeric LpxA-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587404.1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-13097.13Show/hide
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KAG7021390.1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-13097.54Show/hide
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XP_008464419.1 PREDICTED: gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucumis melo]2.4e-13097.13Show/hide
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XP_022933267.1 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita moschata]1.4e-13097.54Show/hide
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XP_023531879.1 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.3e-13197.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CLK0 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial1.2e-13097.13Show/hide
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A0A5D3BH64 Gamma carbonic anhydrase-like 21.2e-13097.13Show/hide
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A0A6J1EZA5 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial6.8e-13197.54Show/hide
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A0A6J1JI10 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial2.6e-13096.31Show/hide
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A0A6J1L3J3 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial2.6e-13097.13Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q94AU7 Gamma carbonic anhydrase 3, mitochondrial4.1e-3239.34Show/hide
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Q9C6B3 Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial2.0e-3139.39Show/hide
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Q9FMV1 Gamma carbonic anhydrase-like 1, mitochondrial4.1e-10978.66Show/hide
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        RF+RTLT+EETLEIPKLAVAIN LS ++FSEFLPYSTVYLEVEKFKKSLGI +
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Q9FWR5 Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial1.2e-3139.89Show/hide
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        P +  +A+VAP+  + G V +  G+S+W G VLRGD+N ++VG  +N+Q+  ++H A S+ +G    T I   VTIG  ++L  CT+E E  IG  + L+
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        +G +VE H ++ AG++V    RIP+GE+W GNPARF+R LT EE   I + A   ++L++ H +E    +   L V +F+K L
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Q9SMN1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial1.4e-11279.05Show/hide
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        RF+RTLT+EETLEIPKLAVAIN LS ++FSEFLPYST+YLEVEKFKKSLGI I
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19580.1 gamma carbonic anhydrase 18.4e-3339.89Show/hide
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        P +  +A+VAP+  + G V +  G+S+W G VLRGD+N ++VG  +N+Q+  ++H A S+ +G    T I   VTIG  ++L  CT+E E  IG  + L+
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        +G +VE H ++ AG++V    RIP+GE+W GNPARF+R LT EE   I + A   ++L++ H +E    +   L V +F+K L
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AT3G48680.1 gamma carbonic anhydrase-like 29.7e-11479.05Show/hide
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        RF+RTLT+EETLEIPKLAVAIN LS ++FSEFLPYST+YLEVEKFKKSLGI I
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AT5G63510.1 gamma carbonic anhydrase like 12.9e-11078.66Show/hide
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        ++AR SR+ + S    N +RR F+        TE+ K   T++PS DRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPK+AVDAYVAPNVVLAGQV V DG+SVW G+VLR
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Query:  GDLNKITVGFCSNVQERCVLHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPTGELWAGNPA
        GDLNKITVGFCSNVQERCV+HAAWSSPTGLPA T I+R+VT+GAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET SILEAGSVVPPGRRIP+GELW GNPA
Subjt:  GDLNKITVGFCSNVQERCVLHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPTGELWAGNPA

Query:  RFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSREHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSLGITI
        RF+RTLT+EETLEIPKLAVAIN LS ++FSEFLPYSTVYLEVEKFKKSLGI +
Subjt:  RFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSREHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSLGITI

AT5G63510.2 gamma carbonic anhydrase like 16.3e-10570.71Show/hide
Query:  ALARFSRKAIASAVATNQLRRAFS--------TEVSK---TITPSPDRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLR
        ++AR SR+ + S    N +RR F+        TE+ K   T++PS DRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPK+AVDAYVAPNVVLAGQV V DG+SVW G+VLR
Subjt:  ALARFSRKAIASAVATNQLRRAFS--------TEVSK---TITPSPDRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLR

Query:  GDLNKITVGFCSNVQERCVLHAAWSSPT---------------------------GLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET
        GDLNKITVGFCSNVQERCV+HAAWSSPT                            LPA T I+R+VT+GAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET
Subjt:  GDLNKITVGFCSNVQERCVLHAAWSSPT---------------------------GLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET

Query:  HSILEAGSVVPPGRRIPTGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSREHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSLGITI
         SILEAGSVVPPGRRIP+GELW GNPARF+RTLT+EETLEIPKLAVAIN LS ++FSEFLPYSTVYLEVEKFKKSLGI +
Subjt:  HSILEAGSVVPPGRRIPTGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSREHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSLGITI

AT5G66510.1 gamma carbonic anhydrase 32.9e-3339.34Show/hide
Query:  PKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLRGDLNKITVGFCSNVQERCVLHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILM
        P +   A+VAPN  L+G V V  G+S+W G VLRGD N I+VG  +N+Q+  ++H A ++ +G    T I   VTIG  ++L  CT+E E  IG  + ++
Subjt:  PKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLRGDLNKITVGFCSNVQERCVLHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILM

Query:  EGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPTGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSREHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL
        +G+ VE H+++ +G++V    RIP+GE+W GNPA+F+R +T EE +     AV  ++L++ H +E    +   L+  +FKK L
Subjt:  EGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPTGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSREHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCTCTAGCTCGTTTCTCCCGGAAGGCTATTGCCTCAGCGGTTGCGACCAATCAACTCCGCCGTGCTTTCTCGACGGAAGTGTCGAAGACGATCACGCCCTCACC
GGATCGAGTCAAGTGGGACTATAGAGGTCAAAGACAGATAATCCCGCTCGGTCAGTGGCTCCCCAAAATCGCCGTCGACGCCTATGTTGCGCCTAATGTGGTCCTTGCCG
GACAGGTTAAAGTCTGCGATGGGGCCTCTGTTTGGGCGGGTTCCGTTCTCCGCGGCGATCTCAACAAGATTACAGTCGGGTTTTGCTCTAATGTGCAGGAACGGTGCGTC
CTTCATGCTGCTTGGTCCTCCCCAACAGGACTGCCGGCAGAGACATCTATAGAGAGATTCGTCACCATTGGTGCTTATAGTCTGTTGCGGTCCTGCACAATTGAGCCAGA
ATGCATTATCGGGCAGCATTCCATCCTCATGGAAGGTTCCCTGGTTGAGACTCACTCTATTCTTGAAGCTGGGTCCGTGGTTCCCCCAGGAAGGAGAATTCCCACTGGTG
AACTTTGGGCAGGAAACCCAGCCAGGTTTGTCAGAACGTTGACCCATGAAGAGACATTGGAAATTCCTAAACTTGCTGTTGCAATTAATGACCTAAGCAGGGAACATTTC
TCAGAGTTTCTTCCTTACTCAACAGTATACTTGGAGGTTGAGAAATTCAAGAAGTCCTTGGGTATAACCATATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACGAGCTGAATCACAGACCACGCTCGCTTTCTGCTCTAGCAATGGCAGCTCTAGCTCGTTTCTCCCGGAAGGCTATTGCCTCAGCGGTTGCGACCAATCAACTCCGCCG
TGCTTTCTCGACGGAAGTGTCGAAGACGATCACGCCCTCACCGGATCGAGTCAAGTGGGACTATAGAGGTCAAAGACAGATAATCCCGCTCGGTCAGTGGCTCCCCAAAA
TCGCCGTCGACGCCTATGTTGCGCCTAATGTGGTCCTTGCCGGACAGGTTAAAGTCTGCGATGGGGCCTCTGTTTGGGCGGGTTCCGTTCTCCGCGGCGATCTCAACAAG
ATTACAGTCGGGTTTTGCTCTAATGTGCAGGAACGGTGCGTCCTTCATGCTGCTTGGTCCTCCCCAACAGGACTGCCGGCAGAGACATCTATAGAGAGATTCGTCACCAT
TGGTGCTTATAGTCTGTTGCGGTCCTGCACAATTGAGCCAGAATGCATTATCGGGCAGCATTCCATCCTCATGGAAGGTTCCCTGGTTGAGACTCACTCTATTCTTGAAG
CTGGGTCCGTGGTTCCCCCAGGAAGGAGAATTCCCACTGGTGAACTTTGGGCAGGAAACCCAGCCAGGTTTGTCAGAACGTTGACCCATGAAGAGACATTGGAAATTCCT
AAACTTGCTGTTGCAATTAATGACCTAAGCAGGGAACATTTCTCAGAGTTTCTTCCTTACTCAACAGTATACTTGGAGGTTGAGAAATTCAAGAAGTCCTTGGGTATAAC
CATATGATGCAACCTGTCTTCTTGTCTTTGCATTTTGTTTGTTGAGGAAAATAAAATATCTCCAAAAGATAAACCAGTTTTCAGATTCCTTCATTTGACGTTCGTTTTGC
TGGCATCGAGTTAGGATCAAATGAATTTTCTTAGATTGTAAGGTTGATGTTTATGTTATCACCTGGATTCCTCGTTGGTGGGTAGTTAAAATCCACCAATAACTTGTAAT
CTCCCGTTCTATGTTTTATGCATAACATTTGTATGTTTGTACCCAATGATGCATCTGGGTTTTACATTTGCCATTTCCCAGGTACTATTCAAATTTGGTTAAGAACTGGC
TCTGTAAATGTTTCAAGGAATGTCTGACTGCACGACAATGCCTTCCCTTCCATTGTCTGCTTATACTAGTTTAGTTCGCGCTTGTACTGTATTCTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAALARFSRKAIASAVATNQLRRAFSTEVSKTITPSPDRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVKVCDGASVWAGSVLRGDLNKITVGFCSNVQERCV
LHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPTGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSREHF
SEFLPYSTVYLEVEKFKKSLGITI