; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0022961 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0022961
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionprotein LIKE COV 1-like
Genome locationchr10:5084328..5089769
RNA-Seq ExpressionPI0022961
SyntenyPI0022961
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR007462 - Protein of unknown function DUF502


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
EOY30765.1 Uncharacterized protein TCM_037862 isoform 2 [Theobroma cacao]3.5e-3183.91Show/hide
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KAG6739648.1 hypothetical protein POTOM_057261 [Populus tomentosa]7.1e-3288.89Show/hide
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KAG6772107.1 hypothetical protein POTOM_023503 [Populus tomentosa]1.2e-3187.65Show/hide
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        WLFCSVILFPIAITFYITWWF+HFVDGFFSPIY  LGIDIFGLGF TS+TFIFLVGVFMSSWLGA VL+LGEWFIKR+P +
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MBA0604005.1 hypothetical protein [Gossypium davidsonii]4.6e-3181.11Show/hide
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        + + +HF   LFCSVILFPIAITFYITWWFIHFVDGFFSPIY QLGIDIFGLGF TS+TFIFLVG+FMSSWLGA VL LGEWFIKR+P +
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RXH74533.1 hypothetical protein DVH24_029254 [Malus domestica]5.4e-3270.37Show/hide
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        S ++  W  KKLL     +++++H++   F SVILFPIAITFYITWWFIHFVDGFFSPIY QLGI+IFGLGF TS+TFIFLVGVFMSSWLGA VL LGEW
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        FIKR+P +
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061GLN2 Uncharacterized protein isoform 21.7e-3183.91Show/hide
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        S  F+   FCSVILFPIAITFYITWWFIHFVDGFFSPIY QLGIDIFGLGF TS+TFIFLVGVFMSSWLGA VL LGEWFIKR+P +
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A0A498I046 Uncharacterized protein2.6e-3270.37Show/hide
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        S ++  W  KKLL     +++++H++   F SVILFPIAITFYITWWFIHFVDGFFSPIY QLGI+IFGLGF TS+TFIFLVGVFMSSWLGA VL LGEW
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Query:  FIKRIPLL
        FIKR+P +
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A0A4D8YA19 Uncharacterized protein1.4e-3087.34Show/hide
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        FCSVIL PIAITFY+TWWFIHFVDGFFSPIY QLGIDIFGLGF TS+TFIFLVGVFMSSWLGA VL+LGEWFIKR+P +
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A0A5A7TX33 Protein LIKE COV 1-like isoform X14.2e-3093.42Show/hide
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        VILFPIAITFYITWWFIHFVDGFFSPIY QLGIDIFGLGFATSVTFIFLVGVFMSSWLGA VLALGEWFIKR+P +
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A0A7J8QR85 Uncharacterized protein2.2e-3181.11Show/hide
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        + + +HF   LFCSVILFPIAITFYITWWFIHFVDGFFSPIY QLGIDIFGLGF TS+TFIFLVG+FMSSWLGA VL LGEWFIKR+P +
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4IQJ6 Protein LIKE COV 31.3e-2853.72Show/hide
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        + S ++ + +  +  +I  W  KK +                  VIL PIA+TFY TWWFIHFVDGFFSPIY  LGI++FGLGF TS+TFIF+VGVFMSS
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        WLGA VL++GEWFIK++PL++
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F4IUE7 Protein CONTINUOUS VASCULAR RING 14.5e-2960.87Show/hide
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        + S    LS  I  W  KK +                  VIL PIAITFYITWWFIHFVDGFFSPIY QLGI++FG GF TS+ FIFLVGVFMSSWLGA 
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        VL LGEWFIKR+P +
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Q8VY49 Protein LIKE COV 11.4e-2759.13Show/hide
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        + S    LS  I  W  KK +                  VIL PIA+TFY TWWFIHFVDGFFSPIY  LGI+IFG GF TS+ FIFLVGVFMSSWLGA 
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        VL LGEWFIKR+P +
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Q9C8C1 Protein LIKE COV 24.3e-2451.3Show/hide
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        NSS ++    ++  W+ KK +                  V+LFP+A+TF ITWWFI FVDGFFSPIY  LG+DIFGLGF TSV F F VG+F SSWLG+ 
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        V  LGE FI+R+P +
Subjt:  VLALGEWFIKRIPLL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43130.1 like COV 23.1e-2551.3Show/hide
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        NSS ++    ++  W+ KK +                  V+LFP+A+TF ITWWFI FVDGFFSPIY  LG+DIFGLGF TSV F F VG+F SSWLG+ 
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        V  LGE FI+R+P +
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AT2G18460.1 like COV 39.2e-3053.72Show/hide
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        + S ++ + +  +  +I  W  KK +                  VIL PIA+TFY TWWFIHFVDGFFSPIY  LGI++FGLGF TS+TFIF+VGVFMSS
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Query:  WLGAFVLALGEWFIKRIPLLA
        WLGA VL++GEWFIK++PL++
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AT2G20120.1 Protein of unknown function (DUF502)3.2e-3060.87Show/hide
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        + S    LS  I  W  KK +                  VIL PIAITFYITWWFIHFVDGFFSPIY QLGI++FG GF TS+ FIFLVGVFMSSWLGA 
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        VL LGEWFIKR+P +
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AT2G20130.1 like COV 11.0e-2859.13Show/hide
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        + S    LS  I  W  KK +                  VIL PIA+TFY TWWFIHFVDGFFSPIY  LGI+IFG GF TS+ FIFLVGVFMSSWLGA 
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        VL LGEWFIKR+P +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATATCATTGTTAAACTCTTCGTTTCAACGTTGTTTATCATCAATCATCAATCAATGGTTGCAAAAAAAATTACTAATTGATGATAGTGTTTTAATATCTTCACACTT
TATCATCTGGCTGTTTTGCAGTGTCATTCTATTTCCAATTGCAATAACTTTCTATATAACATGGTGGTTTATTCACTTTGTGGATGGATTTTTTTCTCCGATCTATGTTC
AACTTGGAATTGATATCTTTGGTCTTGGATTTGCAACATCTGTAACATTCATCTTCCTTGTTGGGGTGTTCATGTCATCATGGTTGGGTGCTTTTGTTCTGGCCCTTGGA
GAGTGGTTCATCAAGCGCATACCATTGCTGGCTGCTAATAATCAATATACGATCTTGGGGACACCATTGCATTTGTATTTCTGTCTTGTAATTTGCTATGCTTTGTTTCT
TGTCACTTATGAAGCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATATCATTGTTAAACTCTTCGTTTCAACGTTGTTTATCATCAATCATCAATCAATGGTTGCAAAAAAAATTACTAATTGATGATAGTGTTTTAATATCTTCACACTT
TATCATCTGGCTGTTTTGCAGTGTCATTCTATTTCCAATTGCAATAACTTTCTATATAACATGGTGGTTTATTCACTTTGTGGATGGATTTTTTTCTCCGATCTATGTTC
AACTTGGAATTGATATCTTTGGTCTTGGATTTGCAACATCTGTAACATTCATCTTCCTTGTTGGGGTGTTCATGTCATCATGGTTGGGTGCTTTTGTTCTGGCCCTTGGA
GAGTGGTTCATCAAGCGCATACCATTGCTGGCTGCTAATAATCAATATACGATCTTGGGGACACCATTGCATTTGTATTTCTGTCTTGTAATTTGCTATGCTTTGTTTCT
TGTCACTTATGAAGCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MISLLNSSFQRCLSSIINQWLQKKLLIDDSVLISSHFIIWLFCSVILFPIAITFYITWWFIHFVDGFFSPIYVQLGIDIFGLGFATSVTFIFLVGVFMSSWLGAFVLALG
EWFIKRIPLLAANNQYTILGTPLHLYFCLVICYALFLVTYEA