; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0023029 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0023029
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionDCC family protein At1g52590, chloroplastic
Genome locationchr07:1225744..1227667
RNA-Seq ExpressionPI0023029
SyntenyPI0023029
Gene Ontology termsGO:0015035 - protein disulfide oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007263 - DCC1-like thiol-disulfide oxidoreductase family


Homology Show/hide homology
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KAA0044436.1 DCC family protein [Cucumis melo var. makuwa]9.3e-8791.49Show/hide
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XP_008454244.1 PREDICTED: DCC family protein At1g52590, chloroplastic [Cucumis melo]6.2e-9195.68Show/hide
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XP_022153577.1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic [Momordica charantia]1.2e-8187.22Show/hide
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XP_038900615.1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic [Benincasa hispida]2.2e-8393.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVF0 Uncharacterized protein2.3e-9195.11Show/hide
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A0A1S3BZD9 DCC family protein At1g52590, chloroplastic3.0e-9195.68Show/hide
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A0A5A7TQQ0 DCC family protein4.5e-8791.49Show/hide
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A0A5D3E0H0 DCC family protein3.0e-9195.68Show/hide
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A0A6J1DJB0 DCC family protein At1g52590, chloroplastic5.7e-8287.22Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P40761 Uncharacterized protein YuxK7.8e-2043.1Show/hide
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         IA NRY  FG+   C
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Q9SSR1 DCC family protein At1g52590, chloroplastic1.7e-5968.99Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24095.1 Putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC1.9e-1633.33Show/hide
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        ++ ++S TT +   D V A  D  E  T+            ++++DGVC+LC+GGV+++   D+ R+I+   LQS+A +  L  SG   +D+    L  +
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           +    S A LR++ +L LP+  L  F   VP  +R+ VYD +A NRY  FG++E C
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AT1G52590.1 Putative thiol-disulphide oxidoreductase DCC1.2e-6068.99Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAACTGCCACTGCCACCGTCTCCAATGGCGCTTCCACTTTCCGGCAGATTTCCCGCGCGTTTTCTTCCGCCGTCTACGGCGAAAGCTGGACTACTGCATCCAATTGC
TTCCGCCTCTTTATCTCCGACAACCAAAGACGAAACGATAGATTGGGTCGAAGCAACTTCCGACTTCTTTGAGAAAGATACGAGACCGATTATGCTATTTGACGGTGTTT
GCAATTTGTGCAATGGAGGTGTGAGATTTGTTCGTGCTAATGATAGAAACAGAAGAATACGATTGGAGGCTCTCCAAAGTGAAGCTGGCAAGAAGCTGTTAAGAAGGTCA
GGAAGAGCACCGGATGATATTTCAAGTGTTGTACTTGTTGAACAGGACAGATCTTATATCAAGTCTGAAGCTGTTCTAAGAATAATGGAACATTTAGAGTTACCCTTTCC
TCAGCTTGCATTTTTTCTCCAGTTCGTGCCTCTGTTTGTTCGAAATATTGTCTACGACAATATTGCAGATAATCGATATACATTATTTGGACGCTCGGAGTCATGTGAAA
TATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTTATAGTTTTTCAAAATATAAAAATTTTTCCTTCAAATTGGTGGAGGAGAAGCCACCATGCAACTGCCACTGCCACCGTCTCCAATGGCGCTTCCACTTTCCGGCAG
ATTTCCCGCGCGTTTTCTTCCGCCGTCTACGGCGAAAGCTGGACTACTGCATCCAATTGCTTCCGCCTCTTTATCTCCGACAACCAAAGACGAAACGATAGATTGGGTCG
AAGCAACTTCCGACTTCTTTGAGAAAGATACGAGACCGATTATGCTATTTGACGGTGTTTGCAATTTGTGCAATGGAGGTGTGAGATTTGTTCGTGCTAATGATAGAAAC
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TCTACGACAATATTGCAGATAATCGATATACATTATTTGGACGCTCGGAGTCATGTGAAATATAGAATTACTTGTACACTTAGGATTTGTATGTAATACTTGGGAATTAG
TAATTTTAGAAGTTAAGATCTTTGTTTGATAATTAATACTATCAGGAATTGGAGCTGATATCATGATTGCTTGCCAGGTCAACCTTTGATATTGTTATCTGTGTTCTTTA
AGGATTCTCAATGTTTGCTTAGTCAGTTCCTTTCATTGACCCAACTTTTATAACATATCGTTTCAGCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GRAPDDISSVVLVEQDRSYIKSEAVLRIMEHLELPFPQLAFFLQFVPLFVRNIVYDNIADNRYTLFGRSESCEI