| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036574.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-156 | 70.09 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+ YITW HQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
+LNQE+GQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYE V+AALLHRN LPSLDA VQEILFEEK+
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
Query: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+H D ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK S +GSSSVV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
DLHDLLKQVISS STALA T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS PVQSLPPIHSADGN M+ISHIGTV+TPTI LS+TYHV NLTFNLASVGQLCDL
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
Query: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
GL IIF S+GCQVQD QTG VIGTGRK+
Subjt: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
| KAA0043149.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 4.8e-157 | 70.33 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+ YITW HQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
+LNQE+GQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESV+AALLHRN LPSLDA VQEILFEEK+
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
Query: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+H D ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK S +GSSSVV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
DLHDLLKQVISS STALA T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS PVQSLPPIHSADGN M+ISHIGTV+TPTI LS+TYHV NLTFNLASVGQLCDL
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
Query: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
GL IIF S+GCQVQD QTG VIGTGRK+
Subjt: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
| KAA0053979.1 Integrase, catalytic core [Cucumis melo var. makuwa] | 3.1e-140 | 63.37 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP------------TKND--DVDTTIQ--------------------------
MEKSDIARPIST LDGS YITW HQMRSFLIGRKLW IVTGDITKPVKP ND D DTT +
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP------------TKND--DVDTTIQ--------------------------
Query: -----------ETTPE------------------------NNLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNL
+T E +LNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQL+QAKIS DHI LIKVLMGLRPEYESV AALLHRN
Subjt: -----------ETTPE------------------------NNLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNL
Query: LPSLDAVVQEILFEEKKLGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSV
LPSLD +Q+ILFEEK+L I SS+ D AL T+ +PT+E++FCK CKL GH ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK SP +G+SSV
Subjt: LPSLDAVVQEILFEEKKLGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSV
Query: VVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYH
V AAT D T +FQL DLHDLLKQVISSNSTALA T GTSWLLD AC NHMTS+ LSS PVQSLPPIHS GN+M+ISHIGTV+TPTI LS+TYH
Subjt: VVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYH
Query: VQNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
V NLTFNLA VGQLCD+GL I+F +GCQVQDPQT VIGTGRK+
Subjt: VQNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
| KAA0058316.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.8e-156 | 70.09 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+ YITW HQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
+LNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYE V+AALLHRN LPSLDA VQEILFEEK+
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
Query: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+H D ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+C+YCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK +GSSSVV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
DLHDLLKQVISS STALA T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS TPVQSLPPIHSADGN M+ISHIGTV+TPTI LS+TYHV NLTFNLASVGQLCDL
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
Query: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
GL IIF S+GCQVQD QTG VIGTGRK+
Subjt: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
| KAA0065380.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 2.7e-160 | 76.01 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTI------QETTPENNLNQEVGQ
MEK+D+ARPISTILDG+ YITW HQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + Q + +LNQE+GQ
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTI------QETTPENNLNQEVGQ
Query: SVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKKLGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKL
SVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESV+AALLHRN LPSLDA VQEILFEEK+LGI SS+H D ALATTH R NE FCK CKL
Subjt: SVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKKLGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKL
Query: QGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSAC
GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK S +GSSSVV AATS T PS S QL DLHDLLKQVISS STALA T GTSWLLDSAC
Subjt: QGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSAC
Query: CNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
CNHMTSDISLLSS PVQSLPPIHSADGN M+ISHIGTV+TPTI LS+TYHV NLTFNLASVGQLCDLGL IIF S+GCQVQD QTG VIGTGRK+
Subjt: CNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SZ66 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 8.8e-157 | 70.09 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+ YITW HQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
+LNQE+GQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYE V+AALLHRN LPSLDA VQEILFEEK+
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
Query: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+H D ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK S +GSSSVV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
DLHDLLKQVISS STALA T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS PVQSLPPIHSADGN M+ISHIGTV+TPTI LS+TYHV NLTFNLASVGQLCDL
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
Query: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
GL IIF S+GCQVQD QTG VIGTGRK+
Subjt: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
| A0A5A7UKE6 Integrase, catalytic core | 1.5e-140 | 63.37 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP------------TKND--DVDTTIQ--------------------------
MEKSDIARPIST LDGS YITW HQMRSFLIGRKLW IVTGDITKPVKP ND D DTT +
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP------------TKND--DVDTTIQ--------------------------
Query: -----------ETTPE------------------------NNLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNL
+T E +LNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQL+QAKIS DHI LIKVLMGLRPEYESV AALLHRN
Subjt: -----------ETTPE------------------------NNLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNL
Query: LPSLDAVVQEILFEEKKLGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSV
LPSLD +Q+ILFEEK+L I SS+ D AL T+ +PT+E++FCK CKL GH ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK SP +G+SSV
Subjt: LPSLDAVVQEILFEEKKLGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSV
Query: VVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYH
V AAT D T +FQL DLHDLLKQVISSNSTALA T GTSWLLD AC NHMTS+ LSS PVQSLPPIHS GN+M+ISHIGTV+TPTI LS+TYH
Subjt: VVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYH
Query: VQNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
V NLTFNLA VGQLCD+GL I+F +GCQVQDPQT VIGTGRK+
Subjt: VQNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
| A0A5A7UVX4 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 8.8e-157 | 70.09 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+ YITW HQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
+LNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYE V+AALLHRN LPSLDA VQEILFEEK+
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
Query: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+H D ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+C+YCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK +GSSSVV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
DLHDLLKQVISS STALA T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS TPVQSLPPIHSADGN M+ISHIGTV+TPTI LS+TYHV NLTFNLASVGQLCDL
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
Query: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
GL IIF S+GCQVQD QTG VIGTGRK+
Subjt: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
| A0A5A7VDW0 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 1.3e-160 | 76.01 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTI------QETTPENNLNQEVGQ
MEK+D+ARPISTILDG+ YITW HQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + Q + +LNQE+GQ
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTI------QETTPENNLNQEVGQ
Query: SVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKKLGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKL
SVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESV+AALLHRN LPSLDA VQEILFEEK+LGI SS+H D ALATTH R NE FCK CKL
Subjt: SVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKKLGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKL
Query: QGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSAC
GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK S +GSSSVV AATS T PS S QL DLHDLLKQVISS STALA T GTSWLLDSAC
Subjt: QGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSAC
Query: CNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
CNHMTSDISLLSS PVQSLPPIHSADGN M+ISHIGTV+TPTI LS+TYHV NLTFNLASVGQLCDLGL IIF S+GCQVQD QTG VIGTGRK+
Subjt: CNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
| A0A5D3DG18 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.3e-157 | 70.33 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+ YITW HQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSKYITWTHQMRSFLIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
+LNQE+GQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESV+AALLHRN LPSLDA VQEILFEEK+
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTQLDQAKISPDHIRLIKVLMGLRPEYESVQAALLHRNLLPSLDAVVQEILFEEKK
Query: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+H D ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPPRPPGHSHKPK S +GSSSVV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHYDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVVVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
DLHDLLKQVISS STALA T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS PVQSLPPIHSADGN M+ISHIGTV+TPTI LS+TYHV NLTFNLASVGQLCDL
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSADGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVQNLTFNLASVGQLCDL
Query: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
GL IIF S+GCQVQD QTG VIGTGRK+
Subjt: GLNIIFFSNGCQVQDPQTGHVIGTGRKI
|
|
