| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004140747.2 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucumis sativus] | 4.0e-75 | 97.28 | Show/hide |
Query: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
+S VVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Subjt: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Query: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
SYFTLLNALAEDGR+DEAEELWNKLFSQHLES+PRIFFHKMISLYYD
Subjt: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| XP_022968275.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucurbita maxima] | 2.6e-74 | 92.9 | Show/hide |
Query: KLFLADSKASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLS
K L S S VVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLE QREWKRIIQLTKWMLS
Subjt: KLFLADSKASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLS
Query: KGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
KGQGRTMGSYFTLLNALAEDGR+DEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYY+
Subjt: KGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| XP_023541679.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.5e-74 | 92.9 | Show/hide |
Query: KLFLADSKASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLS
K L S +S VVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLE QREWKRIIQLTKWMLS
Subjt: KLFLADSKASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLS
Query: KGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
KGQGRTMGSYFTLLNALAEDGR+DEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYY+
Subjt: KGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| XP_038888232.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 isoform X1 [Benincasa hispida] | 5.2e-75 | 96.6 | Show/hide |
Query: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
+S VVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGT+SKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKAL+TLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Subjt: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Query: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
SYFTLLNALAEDGR+DEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
Subjt: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| XP_038888233.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 isoform X2 [Benincasa hispida] | 5.2e-75 | 96.6 | Show/hide |
Query: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
+S VVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGT+SKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKAL+TLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Subjt: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Query: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
SYFTLLNALAEDGR+DEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
Subjt: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L6Q9 Uncharacterized protein | 1.9e-75 | 97.28 | Show/hide |
Query: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
+S VVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Subjt: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Query: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
SYFTLLNALAEDGR+DEAEELWNKLFSQHLES+PRIFFHKMISLYYD
Subjt: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| A0A1S3AY30 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 isoform X2 | 2.1e-74 | 95.92 | Show/hide |
Query: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
+S VVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Subjt: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Query: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
SYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYD
Subjt: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| A0A5A7SS06 Pentatricopeptide repeat-containing protein | 2.1e-74 | 95.92 | Show/hide |
Query: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
+S VVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Subjt: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Query: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
SYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYD
Subjt: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| A0A5D3DHA7 Pentatricopeptide repeat-containing protein | 2.1e-74 | 95.92 | Show/hide |
Query: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
+S VVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Subjt: ASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMG
Query: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
SYFTLLNAL EDGR+DEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYYD
Subjt: SYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| A0A6J1HWS4 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 | 1.3e-74 | 92.9 | Show/hide |
Query: KLFLADSKASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLS
K L S S VVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLE QREWKRIIQLTKWMLS
Subjt: KLFLADSKASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLS
Query: KGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
KGQGRTMGSYFTLLNALAEDGR+DEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYY+
Subjt: KGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYD
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G18975.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 9.0e-33 | 50.72 | Show/hide |
Query: VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
+WK G+ KA LV + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I KAL+ L + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y LL A D R DE
Subjt: VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
Query: AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLY--YDLNQRQI
AE LWN + H S+PR F +MI+LY +DL+ + I
Subjt: AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLY--YDLNQRQI
|
|
| AT4G18975.2 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 9.0e-33 | 50.72 | Show/hide |
Query: VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
+WK G+ KA LV + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I KAL+ L + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y LL A D R DE
Subjt: VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
Query: AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLY--YDLNQRQI
AE LWN + H S+PR F +MI+LY +DL+ + I
Subjt: AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLY--YDLNQRQI
|
|
| AT4G18975.3 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 9.0e-33 | 50.72 | Show/hide |
Query: VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
+WK G+ KA LV + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I KAL+ L + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y LL A D R DE
Subjt: VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
Query: AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLY--YDLNQRQI
AE LWN + H S+PR F +MI+LY +DL+ + I
Subjt: AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLY--YDLNQRQI
|
|
| AT4G18975.4 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 9.0e-33 | 50.72 | Show/hide |
Query: VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
+WK G+ KA LV + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I KAL+ L + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y LL A D R DE
Subjt: VWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDE
Query: AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLY--YDLNQRQI
AE LWN + H S+PR F +MI+LY +DL+ + I
Subjt: AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLY--YDLNQRQI
|
|
| AT4G21190.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 2.5e-67 | 69.44 | Show/hide |
Query: LEIRFDIKPVLFFSYKEVISKLFLADSKASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALK
L +R+ + P L +E +KLF + VVCAA+GPRPR PRVWKT+KRIGTISKAAK++ C+KGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPL+ VKKAL
Subjt: LEIRFDIKPVLFFSYKEVISKLFLADSKASRVVCAAKGPRPRYPRVWKTKKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALK
Query: TLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDLNQRQ
LE+++EWK+IIQ+TKWMLSKGQGRTMG+YF+LLNALAED R+DEAEELWNKLF +HLE PR FF+KMIS+YY + Q
Subjt: TLENQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAEDGRVDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYDLNQRQ
|
|
