; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0023153 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0023153
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionglycine-rich protein-like
Genome locationchr01:3765786..3766432
RNA-Seq ExpressionPI0023153
SyntenyPI0023153
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0059138.1 cold and drought-regulated protein CORA-like [Cucumis melo var. makuwa]8.3e-4091.6Show/hide
Query:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYG
        MSS+AFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK D EATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGG  G  G GRGGY GRGGYGGRGGYGGGRGGYG GCRYG
Subjt:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

KAE8645725.1 hypothetical protein Csa_020407 [Cucumis sativus]2.5e-4478.06Show/hide
Query:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAK-----------------YGGGYDRGYGGGRG
        MQIFLIP+ QNQSLT HT MSS+AFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK D E TVETNGVEDAK                 YGGGYDRGYGGG  
Subjt:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAK-----------------YGGGYDRGYGGGRG

Query:  GGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
         GYG GRGGY GRG YGGRGGYGGGRGGYG GCRYGRCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

KGN43456.1 hypothetical protein Csa_020456 [Cucumis sativus]1.8e-4788.49Show/hide
Query:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGY
        MQIFLIP+SQNQSLT HT MSS+AFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK D EATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG   GYG GRGGY GRG Y
Subjt:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGY

Query:  GGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GGRGGYGGGRGGYG GCRYGRCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

XP_008455506.1 PREDICTED: cold and drought-regulated protein CORA-like [Cucumis melo]4.1e-3990.76Show/hide
Query:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYG
        MSS+AFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAET SK D EATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGG  G  G GRGGY GRGGYGGRGGYGGGRGGYG GCRYG
Subjt:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

XP_022969295.1 glycine-rich protein-like [Cucurbita maxima]1.6e-3880.28Show/hide
Query:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETS-SKDTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGG----GRGGGYGRGRGGYGGR
        MQI LIP S   SL  +TKMSS+AF+FLGLL AF+LL+SSEVAARDLAETS +K+ EATVETNGVEDAKY GGYD GYGG    G  GGYG GRGGYGGR
Subjt:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETS-SKDTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGG----GRGGGYGRGRGGYGGR

Query:  GGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GGYGGRGGY GGRGGYG GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6L7 Uncharacterized protein9.0e-4888.49Show/hide
Query:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGY
        MQIFLIP+SQNQSLT HT MSS+AFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK D EATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG   GYG GRGGY GRG Y
Subjt:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGY

Query:  GGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GGRGGYGGGRGGYG GCRYGRCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A1S3C180 cold and drought-regulated protein CORA-like2.0e-3990.76Show/hide
Query:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYG
        MSS+AFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAET SK D EATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGG  G  G GRGGY GRGGYGGRGGYGGGRGGYG GCRYG
Subjt:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like4.0e-4091.6Show/hide
Query:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYG
        MSS+AFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK D EATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGG  G  G GRGGY GRGGYGGRGGYGGGRGGYG GCRYG
Subjt:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1HZJ5 glycine-rich protein-like7.6e-3980.28Show/hide
Query:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETS-SKDTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGG----GRGGGYGRGRGGYGGR
        MQI LIP S   SL  +TKMSS+AF+FLGLL AF+LL+SSEVAARDLAETS +K+ EATVETNGVEDAKY GGYD GYGG    G  GGYG GRGGYGGR
Subjt:  MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETS-SKDTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGG----GRGGGYGRGRGGYGGR

Query:  GGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GGYGGRGGY GGRGGYG GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0P8W6 Cell wall glycine-rich protein1.7e-3889.17Show/hide
Query:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRY
        MSS+AFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK D EATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG   GYG GRGGY GRG YGGRGGYGGGRGGYG GCRY
Subjt:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-DTEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGGYGGGCRY

Query:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GRCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P11898 Glycine-rich protein HC15.9e-0445.74Show/hide
Query:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKDTEATVETNGVEDA----KYGGGYDRGYGG-GRGGGYGRGRGGY-------GGRGGYGGRGGYGGG
        M S+ F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++K TE      G  +       GGGY  G GG   GGGY  G GGY        G GGY   GG+  G
Subjt:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKDTEATVETNGVEDA----KYGGGYDRGYGG-GRGGGYGRGRGGY-------GGRGGYGGRGGYGGG

Query:  RGGY--------GGGCRYGRCGYRCCSYA
         GGY        GGG  Y  C  RCCS A
Subjt:  RGGY--------GGGCRYGRCGYRCCSYA

P37703 Glycine-rich protein DC9.15.9e-0445.74Show/hide
Query:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKDTEATVETNGVEDA----KYGGGYDRGYGG-GRGGGYGRGRGGY-------GGRGGYGGRGGYGGG
        M S+ F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++K TE      G  +       GGGY  G GG   GGGY  G GGY        G GGY   GG+  G
Subjt:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKDTEATVETNGVEDA----KYGGGYDRGYGG-GRGGGYGRGRGGY-------GGRGGYGGRGGYGGG

Query:  RGGY--------GGGCRYGRCGYRCCSYA
         GGY        GGG  Y  C  RCCS A
Subjt:  RGGY--------GGGCRYGRCGYRCCSYA

Q09134 Abscisic acid and environmental stress-inducible protein2.1e-0659.14Show/hide
Query:  VLLLSSEVAARDLAETSSKDTEATVE-TNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYG-GRGGYGGGRGGY---GGGCRYGRCGY
        VLL+SSEV+ARDL ET+S   +  VE TN V DAKYGGGY+ G GG  GGGY  G GGY   GGY  G GGY  G GGY   GGG   G  GY
Subjt:  VLLLSSEVAARDLAETSSKDTEATVE-TNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYG-GRGGYGGGRGGY---GGGCRYGRCGY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05540.1 Glycine-rich protein family6.2e-0948.84Show/hide
Query:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-------DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGR-GGYGGRGGYGGGRGGY
        M+S+A +FL L++  VLL++SEV ARDLAE S++       + + T +  G     YGG    GYGG  GGGYG   GGY  R GGYG RGG  G RG  
Subjt:  MSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK-------DTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGR-GGYGGRGGYGGGRGGY

Query:  GGGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE
        GG CRYG C  GY     RCC+YAG+ V+
Subjt:  GGGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAATCTTTCTCATCCCCATCTCCCAAAATCAATCTCTTACTAAACACACAAAAATGAGTTCCAGAGCCTTTGTTTTCCTCGGCCTTCTTCTCGCCTTCGTTCTCCT
CCTCTCGTCCGAGGTGGCCGCAAGAGACCTTGCGGAGACCTCCTCCAAGGACACCGAGGCCACGGTGGAAACCAATGGCGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGAGGGTACG
ACAGAGGCTATGGCGGTGGTCGTGGTGGTGGTTACGGTCGTGGTCGTGGTGGCTATGGTGGTCGTGGTGGTTACGGTGGTCGTGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGTGGC
TACGGAGGAGGTTGCAGATATGGTCGATGCGGGTACAGGTGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTAGTAGAGGGTGCAAAACCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAATCTTTCTCATCCCCATCTCCCAAAATCAATCTCTTACTAAACACACAAAAATGAGTTCCAGAGCCTTTGTTTTCCTCGGCCTTCTTCTCGCCTTCGTTCTCCT
CCTCTCGTCCGAGGTGGCCGCAAGAGACCTTGCGGAGACCTCCTCCAAGGACACCGAGGCCACGGTGGAAACCAATGGCGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGAGGGTACG
ACAGAGGCTATGGCGGTGGTCGTGGTGGTGGTTACGGTCGTGGTCGTGGTGGCTATGGTGGTCGTGGTGGTTACGGTGGTCGTGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGTGGC
TACGGAGGAGGTTGCAGATATGGTCGATGCGGGTACAGGTGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTAGTAGAGGGTGCAAAACCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQIFLIPISQNQSLTKHTKMSSRAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKDTEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGRGGGYGRGRGGYGGRGGYGGRGGYGGGRGG
YGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP