; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0023198 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0023198
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionF-box/LRR-repeat protein 15 isoform X1
Genome locationchr07:23582806..23584525
RNA-Seq ExpressionPI0023198
SyntenyPI0023198
Gene Ontology termsGO:0010252 - auxin homeostasis (biological process)
GO:1905393 - plant organ formation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR035940 - CAP superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L0V6 Uncharacterized protein6.4e-12095.98Show/hide
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A0A1S3BUP6 uncharacterized protein LOC1034937012.1e-11896.02Show/hide
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A0A5D3D935 F-box/LRR-repeat protein 15 isoform X14.3e-10897.51Show/hide
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A0A6J1F7E3 uncharacterized protein LOC1114427834.2e-11191.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02180.1 ferredoxin-related1.3e-3539.32Show/hide
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        +LF+S+ S    S +  N A ++V++LN+NRTA KL  L ++PGL C+ALQY++  +G C  V      + P   F + FAPNCGV + +   ITG +LG
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        C SKY     AFSD+L  ++ +L +L  +++TEVG  +     G+ +FWC+LFS+G  ++SF  E  G     R GCYSG+   CS  ++       LL+
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Query:  AFTSLV
        +F  L+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGTTGCCAGTCTAAATATGTACATGCTCCGGAAGCATTTTCTGATGTTTTAATGGAGAATAACAAGAGCTTGGAGATTCTTTACTACAAGAATAACACTGAAGTTGGAGC
TGCTGTTACTGGCACAGATGGGGGTTCTCCTTACTTTTGGTGTGTGTTGTTCAGCAACGGCAGCACCTCCAACAGCTTTGCTTTTGAGGGCGGAGTGGCCAAGTTAACGC
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GCCTTTGGTTTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTTCATTGCTGCAGCCGATCTGTTTGGTTTGGGCCTTGAAGAAGCCTTCTTCCAGTTTGTAAGGTTATTGGCTGTCTCTCACTCAGCCGATTCAATGACCGCTGCCCTTT
GAACAGCTGCAATGGCGACCAAGATTCTGTGGTATCTCTTGTTTTGTGTCCTGTTCGTCTCTGTTTTTTCTGCAGGAGATTCAAATGTGACCGATAACCCTGCTGATAAA
CTAGTAGCTGTGCTGAACAAGAACAGGACGGCTCATAAGTTATCTCCTCTAAAAGACAATCCTGGCTTGGCATGCCTTGCTCTTCAGTATATTAAGGCGTACCAAGGGAA
ATGTGAAGCGGTTGGAGGTCCCGACGGAATGAAGCCTCCTAATTCTGCGTTTGTTGAAACTTTTGCTCCTAACTGCGGAGTTGTTGTCTCGTCTCTTGCTCCGATCACGG
GGCGGTTGCTTGGTTGCCAGTCTAAATATGTACATGCTCCGGAAGCATTTTCTGATGTTTTAATGGAGAATAACAAGAGCTTGGAGATTCTTTACTACAAGAATAACACT
GAAGTTGGAGCTGCTGTTACTGGCACAGATGGGGGTTCTCCTTACTTTTGGTGTGTGTTGTTCAGCAACGGCAGCACCTCCAACAGCTTTGCTTTTGAGGGCGGAGTGGC
CAAGTTAACGCGCCCCGGGTGCTACAGTGGTGCCAATGACCAATGCAGCGGAGCCAATAGCCTGTTTTCAACCTCCCGTATGTTGCTATCAGCCTTCACATCTTTGGTTG
CCATAACATATGCCTTTGGTTTATGATCATAGGTCTTGTCCAAACACGAAAAACGTCATATTACTTGCTTTACAACCATCTTTTTTCTTTATCATTGGTTGGGCAGTGTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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