; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0023486 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0023486
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptiontranscription factor MYB118-like
Genome locationchr09:18930479..18931198
RNA-Seq ExpressionPI0023486
SyntenyPI0023486
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648558.1 hypothetical protein Csa_007738 [Cucumis sativus]8.4e-7297.14Show/hide
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KAG7016199.1 Transcription factor MYB-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.9e-6164.44Show/hide
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        H+ +DH      GSLQ+LLSE+P  TQ  +PK E    +NE  KD  FE+ GA K MHGF+G G  VWTNFPGNF+PQ SQ PNSHLGLG +       +
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XP_004142853.1 transcription factor MYB98 [Cucumis sativus]4.0e-12296.15Show/hide
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XP_022992905.1 transcription factor MYB118-like [Cucurbita maxima]1.9e-6366.53Show/hide
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XP_023551683.1 transcription factor MYB118-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.9e-6263.16Show/hide
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        S++N+NN+H+ +DH      GSLQ+LLSE+P   Q  +PK E    +NE  KD  FE+ GA K MHGF+G G  VWTNFPGNF+PQ SQ PNSHLGLG +
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KSF9 Uncharacterized protein2.9e-12696.25Show/hide
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A0A6J1FFZ3 transcription factor MYB118-like3.2e-6164.44Show/hide
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A0A6J1HHA2 transcription factor MYB118-like5.5e-5359.69Show/hide
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         HH      + + FSI  GSLQ LLS +P  TQ  DP  +P    NEFSKD +FEN GA KFMHG LG    VWTNFPGNF+PQ SQ PNS      HLG
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Query:  LGSSSSSSGNFSFI------GYDHNKKRKRIQLRKENK-PPKKLPNIIKGQWTPQEDR
        LG ++        I      GYD NKK+KRIQ RKEN+ PP KLPNI+KGQWTPQEDR
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A0A6J1JTV8 transcription factor MYB118-like1.5e-5360.08Show/hide
Query:  MEFDSNFKDDLPLFSSFFSDKTESKPQLL-DDNDNDRGEFSGMELGSSSSPSSSSKGLFHSLQL----HNNFENHNHN---QYLHQYFPINGSSDHHHHH
        MEFDSNFKDDLPL SSFFSDK +SK QL  DDND+D GEFS MEL +S    SSSKGLFH+LQL    H++  +HNHN   QYLH +FPINGS   +++ 
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Query:  SMNNNNNNHFSIDHGSLQNLLSEIPITTQYSDPKIEPNFTNNEFSKDQSFENMGANKFMHGFLGCGNNVWTNFPGNFLPQISQLPNS-----HLGLGSSS
        S +  + + FSI +GSLQ LLS +P  TQ  DP  +P    NEFSKD +FEN GA KFMHG LG    VWTNFPGNFLPQ SQ PNS     HLGLG ++
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Query:  SSSGNFSFI------GYDHNKKRKRIQLRKENK-PPKKLPNIIKGQWTPQEDR
        +       I      GYD NKK+KRIQ RKEN+ PP KLPNI+KGQWTPQEDR
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A0A6J1JX07 transcription factor MYB118-like9.1e-6466.53Show/hide
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        MEFDSNFKDDLPL SSFFSDK ESKP L DD+D    EFSGMELG S    SSSKGLF SL L ++  N+NH QYLHQYFP+   SD     S++N+NN+
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        H+ +DH      GSLQ+LLSE+P  TQ  DPK E    +NE  KDQSFE+ GA KFMHGF G G  VWTNFPGNF+PQ SQ PNSHLGLG S       +
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         IGYDH KKRKRIQLRKENKPPKKLPNIIKGQWTPQEDR
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTTTGATTCCAACTTCAAAGATGATCTTCCCCTCTTTTCGAGCTTCTTCTCCGATAAAACGGAGTCGAAGCCACAGCTACTCGACGACAACGACAACGATCGCGG
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AATATCTTCATCAATATTTCCCCATCAATGGATCATCTGATCATCATCATCATCATTCAATGAATAACAATAACAATAATCATTTCTCCATTGATCATGGGTCCTTACAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGTTTGATTCCAACTTCAAAGATGATCTTCCCCTCTTTTCGAGCTTCTTCTCCGATAAAACGGAGTCGAAGCCACAGCTACTCGACGACAACGACAACGATCGCGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NIIKGQWTPQEDRYTNNLT