CuGenDBv2

Gene ID	PI0023515
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	F-box domain-containing protein
Genome location	chr07:5482716..5485337
RNA-Seq Expression	PI0023515
Synteny	PI0023515
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

TYK16544.1 uncharacterized protein E5676_scaffold21G003600 [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_008451930.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103493082 isoform X2 [Cucumis melo]

4.9e-71

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XP_011653222.1 uncharacterized protein LOC101208661 isoform X1 [Cucumis sativus]

5.4e-70

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0KUY4 Uncharacterized protein

2.6e-70

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A0A1S3BSL8 uncharacterized protein LOC103493082 isoform X2

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A0A1S3BSP7 uncharacterized protein LOC103493082 isoform X1

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A0A5D3D003 Uncharacterized protein

4.9e-69

93.55

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A0A6J1FN06 uncharacterized protein LOC111447296

9.3e-60

79.53

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        GEGRIQGGIATVPGFGWWPIKAYRPCP FVASGGRYKRRGQSMDEVTSGG RTEASA+AG+KDS  I   P
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G42070.1 unknown protein

9.0e-31

50.3

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        M  ++ S+  P    F + SH SR     P+ SS S  FL+ SS       +      SSSP  +      D +D +F GC+ACGKEE E GCNG+GRIQ
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        GGIATVPGFGWWPIKAYRPCP FV +GGRY+R GQSMDEV  G G +++S S    DS     KP
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGAACTGCTCTTCTCTCAGTTCCTGCCCCATTCTTCCATTCCTCCCATCCTTCCCGATTCACCACTTCACTCCCATTTTCATCATCTAGGTCCATCACCTTCCTCTC
TTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCTTCAACTTCGGTTGTTGATGAAGAGATCAATTCTTCTTCCCCAGATCAACTTTCTCTTCAATCTGAATCTGACCCAGATGATTTTTCCT
TCAGAGGGTGTAAGGCTTGTGGAAAGGAAGAAATTGAGAGGGGATGCAATGGTGAGGGAAGGATACAAGGTGGAATTGCAACAGTCCCTGGTTTTGGTTGGTGGCCTATA
AAGGCATACAGGCCTTGTCCTGGATTCGTAGCATCGGGTGGCAGATACAAGCGGCGTGGACAAAGCATGGACGAGGTTACATCTGGAGGAGGGAGGACTGAAGCCTCTGC
CAGTGCTGGTAGAAAGGACTCGTCGAGCATAAGTGGTAAACCTTTTTTTTTTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGTALLSVPAPFFHSSHPSRFTTSLPFSSSRSITFLSSSSSSSSSTSVVDEEINSSSPDQLSLQSESDPDDFSFRGCKACGKEEIERGCNGEGRIQGGIATVPGFGWWPI
KAYRPCPGFVASGGRYKRRGQSMDEVTSGGGRTEASASAGRKDSSSISGKPFFF

PI0023515 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome