CuGenDBv2

Gene ID	PI0023698
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	B-like cyclin
Genome location	chr10:10125353..10135697
RNA-Seq Expression	PI0023698
Synteny	PI0023698
Gene Ontology terms	GO:0007049 - cell cycle (biological process) GO:0051301 - cell division (biological process) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR006671 - Cyclin, N-terminal IPR036915 - Cyclin-like superfamily IPR039361 - Cyclin

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008456870.1 PREDICTED: cyclin-J18 isoform X1 [Cucumis melo]

2.5e-117

92.44

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XP_011655068.1 cyclin-J18 isoform X5 [Cucumis sativus]

4.6e-116

90.91

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XP_031740951.1 cyclin-J18 isoform X1 [Cucumis sativus]

4.8e-113

85.6

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XP_031740952.1 cyclin-J18 isoform X2 [Cucumis sativus]

3.7e-113

85.88

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XP_031740954.1 cyclin-J18 isoform X3 [Cucumis sativus]

4.1e-112

86.51

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KSP7 B-like cyclin

1.4e-105

93.52

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        TVPVQEWEFPIVPW Y
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A0A1S3C472 B-like cyclin

2.8e-106

95.26

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        QEWEFPIVPWV
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A0A1S3C4A5 B-like cyclin

1.2e-117

92.44

Show/hide

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        GD MIKEQHFMTRDFLDAEVIFMRILNFEIGTANITFIFLEELLN FKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYE+EETSVFY SPCSLAAAILVASYLITVPV
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A0A6J1H0W7 B-like cyclin

7.7e-109

83.2

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        M G   TMESE LPILRI VVKFLIQSAHDLEV PIVKYSALS FADRFYPS+SG TSSN SR WLLQPITESNLQLFALVSLWISSKLHTSHPLSIKLL
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        ++FGDKMIKEQHFMTRD LDAEVIFM+IL FEIGTANITF+FLEELL QFKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYEKEETSV Y SPCSLAAAILVASYLIT
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        VPVQEWEFP++PWV FV PF EEDIV++ R ILLH  E +  +A K  ++
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A0A6J1K886 B-like cyclin

8.0e-106

86.32

Show/hide

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        M G   TMESE LPILRI VVKFLIQSAHDLEV PIVKYSALS FADRFYPS+SG TS N SR WLLQPITESNLQLFALVSLWISSKLHTSHPLS+KLL
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Query:  RAFGDKMIKEQHFMTRDFLDAEVIFMRILNFEIGTANITFIFLEELLNQFKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYEKEETSVFYRSPCSLAAAILVASYLIT
        ++FGDKMIKEQHFMTRD LDAEVIFM+IL FEIGTANITF+FLEELL QFKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYEKEETSV Y SP SLAAAILVASYLIT
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Query:  VPVQEWEFPIVPWVYFVTPFKEEDIVQQARNILL
        VPVQEWEFP++PWV FV PF EEDIV+Q R+ILL
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q0DTM7 Cyclin-J18-like

5.2e-62

49.12

Show/hide

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        P  R  +++FL+ ++  L++ P+VKY+ALSFFADR  PS+    GF  +   R    WLL+P+ +SNL+LFALV++WI+SK+H   PLS+K L+A GD++
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Query:  IKEQHFMTRDFLDAEVIFMRILNFEIGTANITFIFLEELLNQFKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYEKEETSVFYRSPCSLAAAILVASYLITVPVQEWE
        I +QHF  RDF +AE++FM ++ + IG+ NI F +LEELL QF+E++K+G+L+N + CM+++D+LYE E++S  + SPC LAA+ LV +Y I+VP Q WE
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Query:  FPIVPWVYFVTPFKEEDIVQQARNILLH
        FPI+PWV F T + EE+I++    IL+H
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Q9C5X2 Cyclin-J18

6.8e-70

60.45

Show/hide

Query:  LRISVVKFLIQSAHDLEVPPIVKYSALSFFADRFYPSISGFTSSNDSRYWLLQPITESNLQLFALVSLWISSKLHTSHPLSIKLLRAFGDKMIKEQHFMT
        LR  +V+FLIQS   LE+PPIVKYSALS F DRF P++  F     + +WLLQP+ ESNLQLF L+S+WIS K+H +  LS+  L++FGDK+I EQ FM 
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Query:  RDFLDAEVIFMRILNFEIGTANITFIFLEELLNQFKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYEKEETSVFYRSPCSLAAAILVASYLITVPVQEWEFPIVPWVY
        RDFLDAE++F+++L FEIGT NI +  LE+LL QFKEVAKVGE +N+EACMD+MDLLYEKE+TS+ Y+S  SLAA+ILV+SY+ITVP Q++EFPI+PWV 
Subjt:  RDFLDAEVIFMRILNFEIGTANITFIFLEELLNQFKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYEKEETSVFYRSPCSLAAAILVASYLITVPVQEWEFPIVPWVY

Query:  FVTPFKEEDIVQQARNILLH
         VT  +E ++V+    IL H
Subjt:  FVTPFKEEDIVQQARNILLH

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G01905.1 cyclin J18

4.9e-71

60.45

Show/hide

Query:  LRISVVKFLIQSAHDLEVPPIVKYSALSFFADRFYPSISGFTSSNDSRYWLLQPITESNLQLFALVSLWISSKLHTSHPLSIKLLRAFGDKMIKEQHFMT
        LR  +V+FLIQS   LE+PPIVKYSALS F DRF P++  F     + +WLLQP+ ESNLQLF L+S+WIS K+H +  LS+  L++FGDK+I EQ FM 
Subjt:  LRISVVKFLIQSAHDLEVPPIVKYSALSFFADRFYPSISGFTSSNDSRYWLLQPITESNLQLFALVSLWISSKLHTSHPLSIKLLRAFGDKMIKEQHFMT

Query:  RDFLDAEVIFMRILNFEIGTANITFIFLEELLNQFKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYEKEETSVFYRSPCSLAAAILVASYLITVPVQEWEFPIVPWVY
        RDFLDAE++F+++L FEIGT NI +  LE+LL QFKEVAKVGE +N+EACMD+MDLLYEKE+TS+ Y+S  SLAA+ILV+SY+ITVP Q++EFPI+PWV 
Subjt:  RDFLDAEVIFMRILNFEIGTANITFIFLEELLNQFKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYEKEETSVFYRSPCSLAAAILVASYLITVPVQEWEFPIVPWVY

Query:  FVTPFKEEDIVQQARNILLH
         VT  +E ++V+    IL H
Subjt:  FVTPFKEEDIVQQARNILLH

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTGGGAAGGTGCGCAACTATGGAGAGTGAGACATTACCGATTCTCAGAATTAGCGTCGTGAAATTTCTAATTCAATCTGCTCATGATCTCGAAGTGCCTCCGATCGT
CAAATATTCTGCGTTGTCGTTTTTCGCTGATAGATTCTACCCATCGATTTCTGGGTTCACTAGCAGCAATGACTCAAGATATTGGCTTCTGCAACCAATCACAGAAAGCA
ATTTGCAGTTATTTGCACTTGTTTCCCTATGGATATCTAGCAAATTGCACACTTCTCATCCTCTTTCTATAAAACTTCTGAGGGCTTTTGGGGATAAGATGATCAAGGAA
CAACATTTTATGACACGGGATTTTTTGGATGCAGAGGTCATATTCATGCGGATATTAAATTTCGAGATTGGTACTGCAAATATCACTTTTATATTTCTTGAGGAACTTCT
TAATCAATTCAAGGAAGTAGCAAAAGTTGGAGAGCTTGTGAACTGGGAAGCATGCATGGATGTAATGGATCTTCTTTATGAAAAAGAGGAGACATCTGTGTTTTACAGGT
CTCCTTGTTCTTTAGCTGCTGCCATCTTGGTTGCTTCATATCTCATCACTGTTCCAGTTCAAGAATGGGAATTTCCAATTGTTCCCTGGGTCTATTTTGTAACACCATTC
AAAGAAGAAGATATTGTACAACAAGCCAGAAACATTCTACTTCACGGAGAGGAACTGAATTGCATTGTGGCTTTCAAAGCCATACAAAGTAGAGAAATGGTATCAGCCTA
CCAAGATGAATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVGRCATMESETLPILRISVVKFLIQSAHDLEVPPIVKYSALSFFADRFYPSISGFTSSNDSRYWLLQPITESNLQLFALVSLWISSKLHTSHPLSIKLLRAFGDKMIKE
QHFMTRDFLDAEVIFMRILNFEIGTANITFIFLEELLNQFKEVAKVGELVNWEACMDVMDLLYEKEETSVFYRSPCSLAAAILVASYLITVPVQEWEFPIVPWVYFVTPF
KEEDIVQQARNILLHGEELNCIVAFKAIQSREMVSAYQDE

PI0023698 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome