; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0023977 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0023977
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionPlant transposase
Genome locationchr10:5091159..5091642
RNA-Seq ExpressionPI0023977
SyntenyPI0023977
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0051969.1 hypothetical protein E6C27_scaffold60G004490 [Cucumis melo var. makuwa]5.2e-1560.71Show/hide
Query:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP
        MDLTQ GSDDE+NE EAL L                    EREIKETSP PD LHH+N+D EEA TPLPSSHVN  IHPQ+KRP
Subjt:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP

KAA0055646.1 hypothetical protein E6C27_scaffold181G00110 [Cucumis melo var. makuwa]6.8e-1558.33Show/hide
Query:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP
        MD+TQ G DDE+NE E L L                    EREI+ETS  PDPLHH+N+DCEE ATP PSSHVN IIHPQSKRP
Subjt:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP

KGN44082.1 hypothetical protein Csa_016717 [Cucumis sativus]2.3e-1567.12Show/hide
Query:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHV
        MDLTQ  SDDE NEEEA+        +IVND DN A PSIEREI+ETSP+ DPLHHNN++ EEA TPLPSS V
Subjt:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHV

TYK04585.1 hypothetical protein E5676_scaffold409G002220 [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-3466.15Show/hide
Query:  DSGKEEIGPTVGEKSKRPRTATHALERRRSDRTLVKTSWRFTKSFSMDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPL
        D  KE+ G TVG+K KRPR+ TH LERRRSDRTLVKTSWRF KSFSMDLTQ GSDDE+NE EAL L                    EREIKETSP PD L
Subjt:  DSGKEEIGPTVGEKSKRPRTATHALERRRSDRTLVKTSWRFTKSFSMDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPL

Query:  HHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP
        HH+N+D EEA TPLPSSHVN  IHPQ+KRP
Subjt:  HHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP

TYK17066.1 Plant transposase [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-1254.76Show/hide
Query:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP
        MDLTQ  SDDEKN+ EAL L                    EREI+E SP PDPLH +N+DCEEA TP  SSHVN  IHPQ++RP
Subjt:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K715 Uncharacterized protein1.1e-1567.12Show/hide
Query:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHV
        MDLTQ  SDDE NEEEA+        +IVND DN A PSIEREI+ETSP+ DPLHHNN++ EEA TPLPSS V
Subjt:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHV

A0A5A7SN98 Plant transposase1.2e-1254.76Show/hide
Query:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP
        MDLTQ  SDDEKN+ EAL L                    EREI+E SP PDPLH +N+DCEEA TP  SSHVN  IHPQ++RP
Subjt:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP

A0A5A7UEP1 Uncharacterized protein2.5e-1560.71Show/hide
Query:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP
        MDLTQ GSDDE+NE EAL L                    EREIKETSP PD LHH+N+D EEA TPLPSSHVN  IHPQ+KRP
Subjt:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP

A0A5A7UMZ2 Uncharacterized protein3.3e-1558.33Show/hide
Query:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP
        MD+TQ G DDE+NE E L L                    EREI+ETS  PDPLHH+N+DCEE ATP PSSHVN IIHPQSKRP
Subjt:  MDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP

A0A5D3BZI8 Uncharacterized protein6.4e-3566.15Show/hide
Query:  DSGKEEIGPTVGEKSKRPRTATHALERRRSDRTLVKTSWRFTKSFSMDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPL
        D  KE+ G TVG+K KRPR+ TH LERRRSDRTLVKTSWRF KSFSMDLTQ GSDDE+NE EAL L                    EREIKETSP PD L
Subjt:  DSGKEEIGPTVGEKSKRPRTATHALERRRSDRTLVKTSWRFTKSFSMDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPL

Query:  HHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP
        HH+N+D EEA TPLPSSHVN  IHPQ+KRP
Subjt:  HHNNLDCEEAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCATGATTCTGGTAAGGAAGAAATTGGACCAACCGTTGGTGAGAAATCAAAAAGACCTCGTACTGCTACACATGCATTAGAACGACGGCGATCTGATCGAACCTTGGT
CAAAACGTCGTGGAGATTTACAAAGTCCTTCAGTATGGACTTAACTCAACTCGGTAGCGATGATGAGAAGAACGAGGAAGAAGCTCTTCCTTTGACAAATAGACCCAACT
CAAAGATTGTAAATGATACAGATAATGCCGCCAAGCCTAGTATCGAGAGAGAGATTAAGGAAACATCACCTTTTCCTGACCCACTCCACCACAATAACTTGGATTGTGAG
GAAGCTGCTACTCCACTTCCCTCTTCTCATGTTAATGAGATTATTCATCCTCAGTCTAAAAGACCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCATGATTCTGGTAAGGAAGAAATTGGACCAACCGTTGGTGAGAAATCAAAAAGACCTCGTACTGCTACACATGCATTAGAACGACGGCGATCTGATCGAACCTTGGT
CAAAACGTCGTGGAGATTTACAAAGTCCTTCAGTATGGACTTAACTCAACTCGGTAGCGATGATGAGAAGAACGAGGAAGAAGCTCTTCCTTTGACAAATAGACCCAACT
CAAAGATTGTAAATGATACAGATAATGCCGCCAAGCCTAGTATCGAGAGAGAGATTAAGGAAACATCACCTTTTCCTGACCCACTCCACCACAATAACTTGGATTGTGAG
GAAGCTGCTACTCCACTTCCCTCTTCTCATGTTAATGAGATTATTCATCCTCAGTCTAAAAGACCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MHDSGKEEIGPTVGEKSKRPRTATHALERRRSDRTLVKTSWRFTKSFSMDLTQLGSDDEKNEEEALPLTNRPNSKIVNDTDNAAKPSIEREIKETSPFPDPLHHNNLDCE
EAATPLPSSHVNEIIHPQSKRP