; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0023979 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0023979
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionGlutaredoxin-C5
Genome locationchr11:1011607..1015447
RNA-Seq ExpressionPI0023979
SyntenyPI0023979
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
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GO:0050660 - flavin adenine dinucleotide binding (molecular function)
GO:0050661 - NADP binding (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002109 - Glutaredoxin
IPR011899 - Glutaredoxin, eukaryotic/virial
IPR014025 - Glutaredoxin subgroup
IPR036249 - Thioredoxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576070.1 Glutaredoxin-C5, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-7788.46Show/hide
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XP_008459988.1 PREDICTED: glutaredoxin-C5, chloroplastic [Cucumis melo]3.4e-9293.26Show/hide
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XP_023549357.1 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-8090.11Show/hide
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XP_038874858.1 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like [Benincasa hispida]5.8e-8491.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA52 Glutaredoxin domain-containing protein4.4e-9393.3Show/hide
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A0A1S3CB05 glutaredoxin-C5, chloroplastic1.7e-9293.26Show/hide
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A0A5D3DLT6 Glutaredoxin-C51.7e-9293.26Show/hide
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A0A6J1GS13 glutaredoxin-C5, chloroplastic-like2.0e-7787.98Show/hide
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A0A6J1JVU3 monothiol glutaredoxin-S10-like7.7e-7483.98Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81187 Glutaredoxin2.8e-2053.76Show/hide
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P55142 Glutaredoxin-C64.7e-2053.12Show/hide
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        K T+   PVVVYSK++C +   VK LF++LG     IELD     G +LQ  L   TGQ TVPNVFI GKHIGGC DT+ L  +G+L P+L+EA A
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Q0J3L4 Monothiol glutaredoxin-S104.3e-4575.61Show/hide
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        F   R  S+ +  SSSS  SSFGSR+E+SVK T+  NPVV+YSK+WCSYS EVK LFKR+GVQP VIELD+LG QGPQLQKVLERLTGQ TVPNVFIGGK
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        HIGGCTDTVKL+RKGEL  MLSE
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Q8GWS0 Glutaredoxin-C5, chloroplastic3.4e-5060.69Show/hide
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        +SL P    S S +  + ++    Y  C  +S S+            R M+  S ++SSSSSSFGSR+EES++ T+T+N VV+YSKTWCSY +EVK LFK
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Q8LBS4 Monothiol glutaredoxin-S12, chloroplastic1.4e-4355.87Show/hide
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        VK LFK L V+PLV+ELD+LG +G QLQ VLE++TGQ+TVPNVFIGGKHIGGC+DT++L+ KGELE +L+EAN KN +T
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein9.7e-4555.87Show/hide
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        +N T    NS  ++SF   + + +   LPF        I I+    L      R  S++++SSSSSSS  GS LEE+VKTT+ +NPVVVYSKTWCSYSS+
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AT2G20270.2 Thioredoxin superfamily protein2.5e-4048.54Show/hide
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        +N T    NS  ++SF   + + +   LPF        I I+    L      R  S++++SSSSSSS  GS LEE+VKTT+ +NPVVVYSKTWCSYSS+
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        VK LFK L V+PLV+ELD+L                           G +G QLQ VLE++TGQ+TVPNVFIGGKHIGGC+DT++L+ KGELE +L+EAN
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Query:  AKNSET
         KN +T
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AT4G28730.1 Glutaredoxin family protein2.4e-5160.69Show/hide
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        +SL P    S S +  + ++    Y  C  +S S+            R M+  S ++SSSSSSFGSR+EES++ T+T+N VV+YSKTWCSY +EVK LFK
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Query:  RLGVQPLVIELDELGPQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVFIGGKHIGGCTDTVKLYRKGELEPMLSEANAKNSET
        RLGVQPLV+ELD+LGPQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVF+ GKHIGGCTDTVKL RKG+LE ML+EAN KN ++
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AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein4.1e-1946.15Show/hide
Query:  ESVKTTITQNPVVVYSKTWCSYSSEVKVLFKRLGVQPLVIELDELGPQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVFIGGKHIGGCTDTVKLYRKGELEPMLSEANAK
        +  K  +    VVV+SKT+C Y   VK L ++LG +   +ELD     G Q+Q  L   TGQ TVPNVFIGG HIGGC  T  L++ G+L P+L+EA A 
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Query:  NSET
          +T
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AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein4.1e-1947.92Show/hide
Query:  KTTITQNPVVVYSKTWCSYSSEVKVLFKRLGVQPLVIELDELGPQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVFIGGKHIGGCTDTVKLYRKGELEPMLSEANA
        K  ++  PVVV+SKT+C Y   VK L  +LG    V+ELDE+   G ++Q  L   TGQ TVPNVFI G HIGGC   ++  ++G+L P+L+EA A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAACTGGAGCTTGAACTTCAAATCAATGGCGGTTCCGTCCAATTTCACCTCTCTTCCTCCAAATTCTCCTCGCTCTCTTTCCTTCTTCTTCAAAGCTTCCGTTTT
TTCCCTTCCCTTTTATAATCCCTGCACTTCCAAATCCATTTCGATCTCAAAACACAATGCCCTCAATGGCTTCACAAGGACCAGACCCATGTCGATTCAATCCGTCTCTT
CTTCCTCCTCTTCTTCTTCTTTTGGTTCTAGACTCGAGGAGAGTGTCAAAACTACAATTACACAGAACCCAGTTGTTGTTTACTCCAAGACATGGTGTTCGTATTCTTCC
GAGGTTAAGGTGTTGTTCAAGAGGCTTGGAGTGCAGCCATTGGTCATTGAATTGGATGAATTAGGTCCCCAAGGGCCACAATTGCAAAAGGTACTTGAGAGGCTTACTGG
ACAACATACGGTACCAAACGTTTTCATCGGGGGCAAACATATAGGTGGTTGTACAGATACTGTGAAACTATACCGAAAAGGAGAACTGGAACCTATGCTATCTGAAGCTA
ATGCTAAAAATTCAGAGACATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAGGCTTAAATATAGTTTGCTTTAGGAGGTCAAAAGTAAAGTGAAAGTGAACTTTTTGATAGGTTACAACAAATTGAGAAGATGAAGAACTGGAGCTTGAACTTCAAAT
CAATGGCGGTTCCGTCCAATTTCACCTCTCTTCCTCCAAATTCTCCTCGCTCTCTTTCCTTCTTCTTCAAAGCTTCCGTTTTTTCCCTTCCCTTTTATAATCCCTGCACT
TCCAAATCCATTTCGATCTCAAAACACAATGCCCTCAATGGCTTCACAAGGACCAGACCCATGTCGATTCAATCCGTCTCTTCTTCCTCCTCTTCTTCTTCTTTTGGTTC
TAGACTCGAGGAGAGTGTCAAAACTACAATTACACAGAACCCAGTTGTTGTTTACTCCAAGACATGGTGTTCGTATTCTTCCGAGGTTAAGGTGTTGTTCAAGAGGCTTG
GAGTGCAGCCATTGGTCATTGAATTGGATGAATTAGGTCCCCAAGGGCCACAATTGCAAAAGGTACTTGAGAGGCTTACTGGACAACATACGGTACCAAACGTTTTCATC
GGGGGCAAACATATAGGTGGTTGTACAGATACTGTGAAACTATACCGAAAAGGAGAACTGGAACCTATGCTATCTGAAGCTAATGCTAAAAATTCAGAGACATAGGCCTC
AAGGCACATTTTGTTTTCTGAGCCATTTGGTGACTGACCTGTTGTTGATGTTCTCAATTCTACCTCAAGAGACACTTGTGTTTTTAGTTAGGAAAATGATGTATGTTAAG
CTATTTGTGGATGAATTTGTTACAAGGAACTCCAACTTGTGCCATGAAATAAGAAAACATTTTATTACCGTTTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKNWSLNFKSMAVPSNFTSLPPNSPRSLSFFFKASVFSLPFYNPCTSKSISISKHNALNGFTRTRPMSIQSVSSSSSSSSFGSRLEESVKTTITQNPVVVYSKTWCSYSS
EVKVLFKRLGVQPLVIELDELGPQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVFIGGKHIGGCTDTVKLYRKGELEPMLSEANAKNSET