; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024080 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024080
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionNDR1/HIN1-like protein 10
Genome locationchr04:5549617..5550192
RNA-Seq ExpressionPI0024080
SyntenyPI0024080
Gene Ontology termsGO:0098542 - defense response to other organism (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR004864 - Late embryogenesis abundant protein, LEA_2 subgroup
IPR044839 - Protein NDR1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8651105.1 hypothetical protein Csa_001204 [Cucumis sativus]4.1e-8588.65Show/hide
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XP_004136708.1 NDR1/HIN1-like protein 10 [Cucumis sativus]5.7e-7980Show/hide
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XP_004136710.2 uncharacterized protein LOC101218041 [Cucumis sativus]1.0e-8888.48Show/hide
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XP_008443592.1 PREDICTED: protein YLS9-like [Cucumis melo]1.1e-8788.24Show/hide
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XP_038904447.1 NDR1/HIN1-like protein 10 [Benincasa hispida]6.7e-8082.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEQ7 LEA_2 domain-containing protein5.0e-8988.48Show/hide
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A0A0A0LGS2 LEA_2 domain-containing protein2.8e-7980Show/hide
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A0A1S3B955 protein YLS9-like6.8e-7878.95Show/hide
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        +TTSLL+GRFEGQ+ +VI NN VSEL SEKL+GVYS+DVKFRL L+LKFG+YKI+RVRPKV C FQ+PLNSSGTSS   FQ AI C VDY
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A0A1S3B970 protein YLS9-like5.5e-8888.24Show/hide
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A0A5A7TR00 Protein YLS9-like5.5e-8888.24Show/hide
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        LWC LIS+I+V  ISFG SILILWL+FITNKIKF+VTDATLTQFNFTNNDTQLHYNLGV+FTIRNPNKQ+GIYYDTI+ATAMYKGQNFDTRLLTPFYQGS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C615 Putative syntaxin-241.2e-1835.14Show/hide
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        +N +KF V DA LT F+  +N+  L Y+L +  +IRN    IGI+YD  EAT  Y  Q      +  FY GS+ T LL+  FEGQ ++++  N   +   
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Query:  EKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGCGFQIPLNSSGTSS
        ++ +GVY IDVK  +  ++         ++P V C  +IPL    ++S
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Q9FI03 NDR1/HIN1-like protein 262.9e-0930.25Show/hide
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        + FT S  FS     I ++WL+    + +F +T+A +   N T + T L  N  V  T+  +NPNK++GIYYD +   A Y+GQ   +   L PFYQ   
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Query:  TTSLLKGRFEGQQVMVIPNNTVSELNSEKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGC
          +LL    +G + + +  +   +++ E+ +G   I +K    L+ K G +     R  V C
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Q9FNH6 NDR1/HIN1-like protein 32.9e-3341.49Show/hide
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        ++ +++I   +  G + LI+WL+F  N IKF VTDA LT+F    TNN   L YNL + FTIRNPN++IG+YYD IE    Y  Q F  +  ++ FYQG 
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        + T+++  +  GQQ++++      +LN +  S +Y ID K RL ++ KFGL K  R +PK+ C  ++PL S+ TS F     +CDVD+
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Q9SJ52 NDR1/HIN1-like protein 103.3e-3744.5Show/hide
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        L  L + VII   +  G + LI WL+     IKF VTDA+LT+F+ T+ D  L YNL +   +RNPNK+IG+YYD IEA A Y+G+ F T  LTPFYQG 
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        + T++L   F+GQ +++        LN+E++SGVY+I++KFRL ++ K G  K  R++PKV C   ++PL++S    T+S    I+CD D+
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Q9SRN1 NDR1/HIN1-like protein 23.9e-3037.97Show/hide
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        L+ +++I   +  G + LILWL+F  N +KF V DA L +F+F  N+  LHY+L + FTIRNPN+++G+YYD    +  Y  Q F +  ++ FYQG + T
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Query:  SLLKGRFEGQQVMVIPNNTVSELNSEKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGC-GFQIPL---NSSGTSSFQNAIRCDVD
        +++  + EGQ ++V+ +   ++L  ++ SG+Y I+ K RL ++ KF   K  +++PK+ C   +IPL   NS+G   FQ  ++CD D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32270.1 syntaxin, putative8.3e-2035.14Show/hide
Query:  TNKIKFDVTDATLTQFNFTNNDTQLHYNLGVYFTIRNPNKQIGIYYDTIEATAMYKGQNFDTRLLTPFYQGSRTTSLLKGRFEGQQVMVIPNNTVSELNS
        +N +KF V DA LT F+  +N+  L Y+L +  +IRN    IGI+YD  EAT  Y  Q      +  FY GS+ T LL+  FEGQ ++++  N   +   
Subjt:  TNKIKFDVTDATLTQFNFTNNDTQLHYNLGVYFTIRNPNKQIGIYYDTIEATAMYKGQNFDTRLLTPFYQGSRTTSLLKGRFEGQQVMVIPNNTVSELNS

Query:  EKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGCGFQIPLNSSGTSS
        ++ +GVY IDVK  +  ++         ++P V C  +IPL    ++S
Subjt:  EKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGCGFQIPLNSSGTSS

AT2G35460.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family1.8e-3037.3Show/hide
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        ++ +++I   +  G   LILW +   N +KF VT+A LT+F F      LHYN+ + F+IRNPN+++GI+YD +E    Y  Q F    +T FYQG + T
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Query:  SLLKGRFEGQQVMVIPNNTVSELNSEKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGCGFQIPLN-SSGTSSFQ-NAIRCDVD
        +++     GQ+++++      +   ++ SGVY IDVK R  L+ KFG      VRPK+ C  ++PL+ SS    FQ +  +C VD
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AT2G35980.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family2.3e-3844.5Show/hide
Query:  LWCLLISVIIVFTISFGFSILILWLLFITNKIKFDVTDATLTQFNFTNNDTQLHYNLGVYFTIRNPNKQIGIYYDTIEATAMYKGQNFDTRLLTPFYQGS
        L  L + VII   +  G + LI WL+     IKF VTDA+LT+F+ T+ D  L YNL +   +RNPNK+IG+YYD IEA A Y+G+ F T  LTPFYQG 
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Query:  RTTSLLKGRFEGQQVMVIPNNTVSELNSEKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGC-GFQIPLNSSG---TSSFQNAIRCDVDY
        + T++L   F+GQ +++        LN+E++SGVY+I++KFRL ++ K G  K  R++PKV C   ++PL++S    T+S    I+CD D+
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AT3G11650.1 NDR1/HIN1-like 22.8e-3137.97Show/hide
Query:  LLISVIIVFTISFGFSILILWLLFITNKIKFDVTDATLTQFNFTNNDTQLHYNLGVYFTIRNPNKQIGIYYDTIEATAMYKGQNFDTRLLTPFYQGSRTT
        L+ +++I   +  G + LILWL+F  N +KF V DA L +F+F  N+  LHY+L + FTIRNPN+++G+YYD    +  Y  Q F +  ++ FYQG + T
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Query:  SLLKGRFEGQQVMVIPNNTVSELNSEKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGC-GFQIPL---NSSGTSSFQNAIRCDVD
        +++  + EGQ ++V+ +   ++L  ++ SG+Y I+ K RL ++ KF   K  +++PK+ C   +IPL   NS+G   FQ  ++CD D
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AT5G06320.1 NDR1/HIN1-like 32.0e-3441.49Show/hide
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        ++ +++I   +  G + LI+WL+F  N IKF VTDA LT+F    TNN   L YNL + FTIRNPN++IG+YYD IE    Y  Q F  +  ++ FYQG 
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Query:  RTTSLLKGRFEGQQVMVIPNNTVSELNSEKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGCGFQIPLNSSGTSSFQ-NAIRCDVDY
        + T+++  +  GQQ++++      +LN +  S +Y ID K RL ++ KFGL K  R +PK+ C  ++PL S+ TS F     +CDVD+
Subjt:  RTTSLLKGRFEGQQVMVIPNNTVSELNSEKLSGVYSIDVKFRLYLKLKFGLYKIIRVRPKVGCGFQIPLNSSGTSSFQ-NAIRCDVDY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACGTTTTTTATGGTGTCTTTTAATATCCGTCATTATTGTGTTCACAATATCTTTTGGGTTCTCTATATTGATCTTATGGCTTCTTTTCATAACCAACAAGATCAA
ATTCGACGTAACCGATGCCACTCTCACCCAATTCAACTTCACCAACAATGACACTCAACTCCATTACAATCTTGGTGTATACTTCACCATTAGAAACCCTAATAAGCAAA
TTGGAATCTACTACGACACAATTGAAGCAACTGCAATGTATAAAGGTCAAAACTTTGACACCAGATTGCTAACCCCTTTTTACCAAGGCTCTAGGACTACAAGCTTACTT
AAAGGACGATTTGAAGGGCAGCAGGTTATGGTCATTCCCAACAACACGGTTTCTGAATTAAATTCTGAGAAACTTTCTGGGGTTTATTCAATTGATGTCAAATTTCGTCT
TTATTTGAAGTTGAAATTTGGGCTTTATAAAATCATTAGAGTTAGGCCTAAAGTGGGATGTGGATTCCAAATTCCATTGAATTCCAGTGGAACTTCTTCTTTTCAGAATG
CTATTCGTTGTGATGTTGATTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCACGTTTTTTATGGTGTCTTTTAATATCCGTCATTATTGTGTTCACAATATCTTTTGGGTTCTCTATATTGATCTTATGGCTTCTTTTCATAACCAACAAGATCAA
ATTCGACGTAACCGATGCCACTCTCACCCAATTCAACTTCACCAACAATGACACTCAACTCCATTACAATCTTGGTGTATACTTCACCATTAGAAACCCTAATAAGCAAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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