; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024254 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024254
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRCD one 2, putative isoform 1
Genome locationchr04:13476780..13482574
RNA-Seq ExpressionPI0024254
SyntenyPI0024254
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012442 - Protein of unknown function DUF1645, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN58068.1 hypothetical protein Csa_023408 [Cucumis sativus]4.7e-8382.93Show/hide
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XP_008447506.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489939 [Cucumis melo]7.3e-8481.22Show/hide
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XP_011651496.1 uncharacterized protein LOC105434905 [Cucumis sativus]3.4e-8184.77Show/hide
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        SEG IEGTYCEWSPATAELGKKSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVFL+NN   S+ SSSSSPNSSSKNN+PHKQL QPQTSSSPH  HYV
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XP_023545738.1 uncharacterized protein LOC111805087 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.8e-5762.61Show/hide
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              +L+PQT++S H  HYV
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XP_038885805.1 uncharacterized protein LOC120076099 [Benincasa hispida]1.2e-6570.18Show/hide
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        D +Q E MERDL  +SL F DKL+L++GEE   EDEDED+E SFVC NPD SSPI+ADDAFYNGQIRPVYPLFN+DLLFVD    E+  PPLRKVFVEK 
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         T LAPVS    E EGVIEGTYCEWSPATAELGKKSNSTGFSKLWRFRDFMT+HRSSSDGK+AFVFLSN  S++SSSSS +     N PHKQLQ      
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             PQT SS H  HYV
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8F3 Uncharacterized protein2.3e-8382.93Show/hide
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        ++L QP  ME DLQIESLAFHDKLNL N E+ + ++E+EDDED SFVC NPDASSPI+ADDAFYNGQIRPVYPLFN+DLLFVDE+LPPPLRKVF+EKP T
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        DLAP+ SESEG IEGTYCEWSPATAELGKKSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVFL+NN   S+ SSSSSPNSSSKNN+PHKQL QPQTSSSPH
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A0A1S3BI77 uncharacterized protein LOC1034899393.5e-8481.22Show/hide
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        DLA V SESEG  EGTYCEWSPATAELGKKSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVFLSNN           PST  SSSSPNSSSKN++PHKQL 
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        PQTSSSPH  HYV
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A0A5A7UB82 Uncharacterized protein3.5e-8481.22Show/hide
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        PQTSSSPH  HYV
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A0A6J1HCS7 uncharacterized protein LOC1114624431.6e-5562.1Show/hide
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        E MERDL  ESLAF DKL +++GE  E+ED+D+D E SFVC NP+ SSPITADDAFYNGQIRPVYPLFN+DLL VD    ESL PPLRKVF+EK  T LA
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        P S      E EGV+EGTYCEWSP+ A LG+KSNSTGFSKLWRFR+FM +HRSSSDGK+A+VFLS  PS++SS  SP     +N PHK            
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A0A6J1K530 uncharacterized protein LOC1114917594.1e-5662.56Show/hide
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        E MERDL  ESLAF DKL +++GE  E+ED+D+D E SFVC NPD SSPITADDAFYNGQIRPVYPLFN+DLL VD    ESL PPLRKVF+EK  T LA
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Query:  PVSS-----ESEGVIEGTYCEWSPATAELGKKSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVFLSNNPSTASSSSSPNSSSKNNNPHK------------
        P S      E EGV+EGTYCEWSP+ A LG+KSNSTGFSKLWRFR+FM +HRSSSDGK+A+VFLS  PS++ S  SP     +N PHK            
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           +L+PQT++S H  HYV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23710.1 Protein of unknown function (DUF1645)3.0e-2744.61Show/hide
Query:  MDLTQPEHMERDLQIESLAFHDKLNLQNGEEDEDEDEDEDDEDSFVCVNPDASSPITADDAFYNGQIRPVYPLFNQDLLF-------------VDESLPP
        MD T+    E D +I+ L       L+   E  ++DE+E++E SF CVN +  SPITAD+AF +GQIRPV+PLFN+DLLF             V +   P
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Query:  PLRKVFVE-KPGTDLAPVSSESEGVIEGTYCEW-----SPATAELGKKSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVFLSNN---PSTASSSSSPNSSS
         LRK+FVE + G      +  SE    G YC W     + A+ E  +KSNSTGFSKLWRFRD   V RS+SDG++AFVFL+N+     T SSSSS ++++
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Query:  KNNN
        + N+
Subjt:  KNNN

AT1G70420.1 Protein of unknown function (DUF1645)1.4e-2953.55Show/hide
Query:  QNGEEDEDEDEDEDDEDSFVCVNPDASSPITADDAFYNGQIRPVYPLFNQDLLFVD---ESLPPPLRKVFVEKPGTDLAPVSSESEGVIEGTYCEWSPAT
        QNG + +DE  +ED   SF  VN D +SPITAD+AF +GQIRPVYPLFN+++ F D   ++L  PL+K+FVE   T+      E E    G YC W+  T
Subjt:  QNGEEDEDEDEDEDDEDSFVCVNPDASSPITADDAFYNGQIRPVYPLFNQDLLFVD---ESLPPPLRKVFVEKPGTDLAPVSSESEGVIEGTYCEWSPAT

Query:  AELG-----KKSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVFLSNNPSTASSSSS
         E       +KSNSTGFSKLWRFRD   V RS+SDGK+AFVFLSN  S+ SS+SS
Subjt:  AELG-----KKSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVFLSNNPSTASSSSS

AT5G62770.1 Protein of unknown function (DUF1645)1.8e-0831.02Show/hide
Query:  IESLAFHDKLNLQNGEEDEDEDEDEDDEDSFVCVNPDASSPI-TADDAFYNGQIRPVYPL-----FNQDLLFVDESLPPPLRKVFVEK-PGTDLAPVSSE
        +E    HD+      +     D+D D + +F C +   S P+ TAD+ F NGQIRP+ P                +LPP  R+  + K    D  P S+ 
Subjt:  IESLAFHDKLNLQNGEEDEDEDEDEDDEDSFVCVNPDASSPI-TADDAFYNGQIRPVYPL-----FNQDLLFVDESLPPPLRKVFVEK-PGTDLAPVSSE

Query:  SE-------GVIEGTYCEWSPATAELGK---------------KSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVF---LSNNPSTAS
        S        GV   TYC W P  +  G                KS+S GFSK W+ R+ + V RSSS+G +  VF   +  N  T S
Subjt:  SE-------GVIEGTYCEWSPATAELGK---------------KSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVF---LSNNPSTAS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTCACCCAACCGGAGCACATGGAAAGGGACCTTCAAATCGAATCCTTGGCCTTCCACGACAAACTAAACCTCCAGAATGGTGAAGAAGATGAAGATGAAGATGA
AGATGAAGATGATGAAGATTCCTTTGTGTGCGTCAATCCTGATGCTTCCTCCCCAATCACCGCCGACGATGCCTTCTATAACGGCCAGATCCGTCCCGTCTACCCACTCT
TCAATCAAGACCTCCTCTTTGTAGACGAATCGCTTCCGCCGCCCTTGAGGAAGGTTTTCGTGGAAAAGCCTGGTACTGATCTGGCACCCGTATCATCGGAGTCGGAGGGA
GTTATTGAGGGCACCTACTGCGAGTGGTCTCCGGCAACGGCAGAGCTCGGGAAGAAGAGCAACTCCACTGGCTTCTCCAAGCTTTGGAGATTCCGGGACTTTATGACGGT
GCACCGAAGCAGCAGTGATGGCAAAAACGCCTTCGTTTTCTTGAGCAATAATCCCTCCACCGCCTCTAGTTCCAGTTCCCCCAATTCTTCCTCCAAAAACAACAATCCCC
ACAAGCAGCTTCAACCTCAAACATCATCCTCTCCCCATCACGCACACTACGTTGTTATTTGTTTCCTCGAAAGCTTGAGTGTGACGGCTACCGTTTCTGAAATCACATCG
GCTTCCCTTTTCCCCCCTTCGTCTTTGCCTCCATCCACCACTCGTAAAGGACACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACCTCACCCAACCGGAGCACATGGAAAGGGACCTTCAAATCGAATCCTTGGCCTTCCACGACAAACTAAACCTCCAGAATGGTGAAGAAGATGAAGATGAAGATGA
AGATGAAGATGATGAAGATTCCTTTGTGTGCGTCAATCCTGATGCTTCCTCCCCAATCACCGCCGACGATGCCTTCTATAACGGCCAGATCCGTCCCGTCTACCCACTCT
TCAATCAAGACCTCCTCTTTGTAGACGAATCGCTTCCGCCGCCCTTGAGGAAGGTTTTCGTGGAAAAGCCTGGTACTGATCTGGCACCCGTATCATCGGAGTCGGAGGGA
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GCTTCCCTTTTCCCCCCTTCGTCTTTGCCTCCATCCACCACTCGTAAAGGACACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLTQPEHMERDLQIESLAFHDKLNLQNGEEDEDEDEDEDDEDSFVCVNPDASSPITADDAFYNGQIRPVYPLFNQDLLFVDESLPPPLRKVFVEKPGTDLAPVSSESEG
VIEGTYCEWSPATAELGKKSNSTGFSKLWRFRDFMTVHRSSSDGKNAFVFLSNNPSTASSSSSPNSSSKNNNPHKQLQPQTSSSPHHAHYVVICFLESLSVTATVSEITS
ASLFPPSSLPPSTTRKGH