; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024402 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024402
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionAlpha/beta hydrolase related protein
Genome locationchr03:24802125..24803846
RNA-Seq ExpressionPI0024402
SyntenyPI0024402
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016013.1 Anthranilate synthase alpha subunit 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.5e-2671.11Show/hide
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        MACS  S+VFV+VKA F+FGEMRI+  GAMEMALFGCSL L V HI VAYR SCR+RRKLRV++IDIEAV ACHKG    KN  LEGK +
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XP_004138423.1 uncharacterized protein LOC101204114 [Cucumis sativus]3.6e-3185.39Show/hide
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XP_022938963.1 uncharacterized protein LOC111445015 [Cucurbita moschata]3.5e-2671.11Show/hide
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XP_022993220.1 uncharacterized protein LOC111489306 [Cucurbita maxima]3.5e-2671.11Show/hide
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XP_038886178.1 uncharacterized protein LOC120076428 [Benincasa hispida]4.7e-3178.89Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBM0 Anthranilate synthase1.7e-3185.39Show/hide
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A0A5B7AEN9 MENTAL domain-containing protein (Fragment)3.2e-1759.77Show/hide
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        CS+ S+VFV++KAS+VF E+R+      GAME+ LF CSL L + HIVVAYR SCRERRKL VY+IDIEAV AC  G    + I LE
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A0A6J1FKD1 uncharacterized protein LOC1114450151.7e-2671.11Show/hide
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A0A6J1JXZ7 uncharacterized protein LOC1114893061.7e-2671.11Show/hide
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A0A7J6GT57 Uncharacterized protein2.4e-1757.61Show/hide
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        CSL+S+VFV++KAS+VFG   +  EG       E+ALF CSL L V HI+VAYR SCRERRKL VY+IDIEAV AC KG    + I  E +T
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G52750.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein4.3e-0647.17Show/hide
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        +K    M + L   ++F G+AH+VVAYR SC  RRKL  ++ID EAV +C  G
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AT1G80280.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein2.5e-0634.12Show/hide
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        CS++SVV ++VKA       ++  + +   +              LF  S+   + H+VVAYR SCR RRKL  + +D EAV +C
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AT2G40095.1 Alpha/beta hydrolase related protein5.4e-1757.69Show/hide
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        M CS+ S+++V++KA+FVFGE  I   G     A E+ALF CS  L + HIVVAYR SCRER+KL V++IDIEAV AC
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AT3G55880.1 Alpha/beta hydrolase related protein6.6e-1559.15Show/hide
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        M CS+ S+++V+ KA+ VFGE  I G     EMALF CS  L + HIVVAYR SCRERRKL V++IDIE+V
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AT3G55880.2 Alpha/beta hydrolase related protein3.5e-1659.46Show/hide
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        M CS+ S+++V+ KA+ VFGE  I G     EMALF CS  L + HIVVAYR SCRERRKL V++IDIE+V AC
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATGTTCTTTGATGTCGGTGGTTTTTGTTGCGGTGAAAGCTTCGTTTGTGTTTGGTGAGATGAGGATTAAGGGAGAAGGGGCCATGGAAATGGCTCTGTTTGGTTG
TTCTCTGTTTTTGGGTGTTGCTCATATTGTCGTGGCGTATAGAGGTAGTTGCAGAGAAAGAAGGAAGCTTAGAGTTTATGAAATCGACATTGAAGCAGTTTGGGCATGCC
ATAAAGGGCTCCTACACTGCAAAAACATTGCTTTGGAAGGAAAAACTATAGTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTCTGCAAAATTCAATCTTCTGCTAAAAAACCCATACGACAATCTCAAAATCAGAGATGGGCTTTCAAAAGGAAGACAGATCAACAAAGATTTGAGAGCTTTGAAGAC
CTTCTTCTTCTTAATCACCATTTTCATATCTCTCTTTTCTTCTCTGCTCCAATTCTTCTCGCCATCGCCGATGCCCTTCTTCCTTCAGCTCTACTCTCCACCCTCCTTCA
TCCCGATTCTCTTTCCTTCAAATCTCTCTCTTCCCATCTCCAAAACTACCATTTTTCTTCCTCTCTTGTTGACATTCCCCTCATCTCCATTTCCAGATCCGCCATTCTAA
TCTGTTTTTACAGTTTGTGCAATGGTCCTAAGCTATCTCGAGGGCCATATTTAGCGGCGGTGATGGCATGTTCTTTGATGTCGGTGGTTTTTGTTGCGGTGAAAGCTTCG
TTTGTGTTTGGTGAGATGAGGATTAAGGGAGAAGGGGCCATGGAAATGGCTCTGTTTGGTTGTTCTCTGTTTTTGGGTGTTGCTCATATTGTCGTGGCGTATAGAGGTAG
TTGCAGAGAAAGAAGGAAGCTTAGAGTTTATGAAATCGACATTGAAGCAGTTTGGGCATGCCATAAAGGGCTCCTACACTGCAAAAACATTGCTTTGGAAGGAAAAACTA
TAGTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MACSLMSVVFVAVKASFVFGEMRIKGEGAMEMALFGCSLFLGVAHIVVAYRGSCRERRKLRVYEIDIEAVWACHKGLLHCKNIALEGKTIV