; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0024409 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0024409
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionhaloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp
Genome locationchr11:598462..601113
RNA-Seq ExpressionPI0024409
SyntenyPI0024409
Gene Ontology termsGO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006439 - HAD hydrolase, subfamily IA
IPR023198 - Phosphoglycolate phosphatase-like, domain 2
IPR023214 - HAD superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily
IPR041492 - Haloacid dehalogenase-like hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023000617.1 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp [Cucurbita maxima]2.3e-13785.16Show/hide
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XP_023514863.1 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-13684.81Show/hide
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XP_038906797.1 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp [Benincasa hispida]1.2e-14189.36Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CB79 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp isoform X11.7e-14994.35Show/hide
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A0A1S3CBS4 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp isoform X27.3e-12193.97Show/hide
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A0A5D3DLZ2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp isoform X11.7e-14994.35Show/hide
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A0A6J1HHQ5 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp4.0e-13584.1Show/hide
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A0A6J1KE49 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp1.1e-13785.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O33513 Protein CbbY2.6e-1428.06Show/hide
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        + ++    +  G++ A  T   R N + +++        D FEV+  G+E  + KP PD YL+ALQ L L P     FEDS +G+ +   AG+RVV
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P95649 Protein CbbY1.3e-1326.9Show/hide
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        IE +LFD+DGTL +++ LH  AF +    +G +      E   +   +G   E +   L         LP  D+ +A+      E +   +A  ++    
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Query:  GLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSML---KLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVV
        G+  +    +  GI+ A  T    PN E +          + F+V+  G+     KP PD Y  AL+ L + P+ +   EDS++G++A  GAG+R +
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Q3J8A0 Phosphoglycolate phosphatase3.4e-1427.51Show/hide
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        E +L D+DGTL DS P   +    M++++    G+P+  E  +    G   E L    L+ N +        Q  E  F  L A+          G+ + 
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Query:  CKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVV
          W++ +G +   VTN        +L+ L + D+FE+VI G+     KP P P L A     ++P+ + +  DS+S +KA   A  ++V
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Q9X0Y1 Phosphorylated carbohydrates phosphatase TM_12548.3e-2130.05Show/hide
Query:  IEGVLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQVGFNNGVPISEEFFIENISGRHNEDLCGILLPNWDLPKA-----RKFLQDKEAYFCRLAAEQLEGIEGLEK
        +E V+FD+DG L D++PL+F A+R++ +    + G P +E+     I G    +   IL+   ++  +     ++  ++K+  F  L  E      G+ +
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Query:  VCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGM-RVVGVGRR-NPQ
          ++++ + IK A  T+ P+  A   L  L L  +F+V++ G++ +  KP P+ YL  L+ L + P+   VFEDS SG++A   AG+ R+ GV    N  
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Query:  ELLKEAGATFVIQ
        + L EAGA  +++
Subjt:  ELLKEAGATFVIQ

Q9ZVJ5 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein Sgpp3.8e-7455.07Show/hide
Query:  SPSSLWEKGPIEGVLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQVGFNNGVPISEEFFIENISGRHNEDLCGILLPNWDLPKARKFLQDKEAYFCRLAAEQLEGI
        S  SL +  P+E +LFD+DGTLCDSDP+H  AF+++LQ++GFNNGVPI E+FF+ENI+G+HN ++  +L P+ D+ +  KF  +KEA + ++ AE+++ +
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Query:  EGLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVVGVGRR
        +GL K+ KWIE+RG+KRAAVTNAP+ NAEL++S L LTDFF+ VI+G+ECE  KP P PYLKAL+ L +S +H+ VFEDS+SGIKAGV AGM V+G+   
Subjt:  EGLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVVGVGRR

Query:  NPQELLKEAGATFVIQDFNDPILWTQL
        NP  LL +A   F+I+++ DP LW  L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56500.1 haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein6.3e-1628.09Show/hide
Query:  SPAAVVSPSSLWEKGPIEGVLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQVGFNNGVPISEEFFIENISGRHNEDLCGILLP------NWDLPKARKFLQDKEAY
        SPAA ++    W  G +  VLFD+DG LC+S+ L     R+    V    GV ++ + F+  +     + L G+         + D  K R F    E Y
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Query:  FCRLA-AEQLEGIEGLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPR--PNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIK
          + A  E   G  G  ++    + +G+K A  ++A R   +A L  + L LT  F+ ++  +  E  KP PD +L A + L +      V ED+++G++
Subjt:  FCRLA-AEQLEGIEGLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPR--PNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIK

Query:  AGVGAGMRVVGVGRRNPQELLKEAGATFVIQDFND
        A   A MR + V     + +LK+AG + +  D  +
Subjt:  AGVGAGMRVVGVGRRNPQELLKEAGATFVIQDFND

AT2G38740.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein2.7e-7555.07Show/hide
Query:  SPSSLWEKGPIEGVLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQVGFNNGVPISEEFFIENISGRHNEDLCGILLPNWDLPKARKFLQDKEAYFCRLAAEQLEGI
        S  SL +  P+E +LFD+DGTLCDSDP+H  AF+++LQ++GFNNGVPI E+FF+ENI+G+HN ++  +L P+ D+ +  KF  +KEA + ++ AE+++ +
Subjt:  SPSSLWEKGPIEGVLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQVGFNNGVPISEEFFIENISGRHNEDLCGILLPNWDLPKARKFLQDKEAYFCRLAAEQLEGI

Query:  EGLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVVGVGRR
        +GL K+ KWIE+RG+KRAAVTNAP+ NAEL++S L LTDFF+ VI+G+ECE  KP P PYLKAL+ L +S +H+ VFEDS+SGIKAGV AGM V+G+   
Subjt:  EGLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVVGVGRR

Query:  NPQELLKEAGATFVIQDFNDPILWTQL
        NP  LL +A   F+I+++ DP LW  L
Subjt:  NPQELLKEAGATFVIQDFNDPILWTQL

AT2G41250.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein6.5e-0536.76Show/hide
Query:  KVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQ
        KV K I+E G+K A V+N        +L  L+  D+F+ V +  E E  KP P  +LKA + L+++P+
Subjt:  KVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQ

AT4G21470.1 riboflavin kinase/FMN hydrolase1.1e-1226.88Show/hide
Query:  VLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQVGFNNGVPISEEFFIENISGRHNEDLCGILLPNWDLP-KARKFLQDKEAYFCRLAAEQLEGIEGLEKVCKWIEE
        VL D+DGTL ++D +     R+ L + G       S +     I G+   +    ++ +++LP K  +F  +    F     ++++ + G  ++ + ++ 
Subjt:  VLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQVGFNNGVPISEEFFIENISGRHNEDLCGILLPNWDLP-KARKFLQDKEAYFCRLAAEQLEGIEGLEKVCKWIEE

Query:  RGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLK-LTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVVGV
         G+  A  +N+ R N E  +S  +   + F V++  +E  + KP PD +L+A + L+  P    V EDSV G+ AG  AG +V+ V
Subjt:  RGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLK-LTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVVGV

AT4G39970.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein2.8e-0825.32Show/hide
Query:  RSPPSPAAVVSPSSLWEKGPIEGVLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQV------GFNNGVPISEEFF--IENISGRHNEDLCGILLPN-W--------
        RS  S + V SP S      +E ++FD DG + +S+ LH  A+               +  +  S EF+   +N+ G     +      N W        
Subjt:  RSPPSPAAVVSPSSLWEKGPIEGVLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQV------GFNNGVPISEEFF--IENISGRHNEDLCGILLPN-W--------

Query:  ------DLPKARKFLQD--KEAYFCRLAAEQLEGIEGLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFF---EVVIIGNECERAKPFPDPYLK
              D  K    LQD   E Y   + +  +E   G+ ++    +  G K A  + A + +  L L  L   + F   +  + G++ +  KP P  Y+ 
Subjt:  ------DLPKARKFLQD--KEAYFCRLAAEQLEGIEGLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFF---EVVIIGNECERAKPFPDPYLK

Query:  ALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVV
        A + L +S +   V EDSV G++A   AGM  V
Subjt:  ALQALQLSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAATCTCTTCACCATCTCACTGTTATCCCTTTACCTTTTACTCCTCATCCCCACACCCTCCATTTTTTCAACACCCATTTCCCCTCCTCCATTTTCACTCATTCATA
TCTCCCCCGCACCCGCCGTTCTCCGCCCTCTCCCGCGGCCGTAGTCTCCCCCAGCAGCTTGTGGGAGAAGGGGCCTATTGAAGGTGTTCTGTTTGATATTGATGGAACAC
TATGTGATTCTGATCCTCTTCACTTCTATGCCTTCCGCCAAATGCTTCAACAGGTTGGATTCAACAATGGAGTCCCAATTAGTGAGGAATTTTTCATAGAAAACATAAGT
GGAAGGCACAATGAGGATCTTTGTGGCATTCTCCTTCCAAATTGGGACCTACCCAAAGCTAGAAAATTCCTTCAAGATAAGGAAGCTTATTTTTGCAGATTGGCAGCAGA
GCAGTTGGAAGGCATAGAAGGGCTGGAGAAGGTCTGCAAATGGATAGAGGAGCGTGGGATTAAACGCGCTGCCGTGACAAATGCCCCAAGACCGAACGCGGAGCTAATTT
TGTCGATGCTTAAACTTACGGATTTCTTTGAAGTAGTGATCATAGGGAACGAATGTGAACGTGCAAAGCCATTCCCTGATCCTTACTTGAAGGCTCTTCAAGCTCTTCAA
CTCTCTCCTCAACATTCTTTTGTCTTTGAGGATTCAGTATCAGGAATAAAAGCAGGAGTAGGAGCTGGAATGAGAGTGGTAGGTGTGGGAAGAAGAAATCCACAAGAATT
ATTAAAAGAAGCTGGAGCCACTTTTGTAATTCAAGATTTCAATGATCCAATTCTTTGGACCCAACTACTCTTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATATTTACACACTATATGCGCTGTAATAACTAACCCATGACTTAAGACTAGTAGGTGCCCAAAGAGTCTAAAATTTTATAATTTGAACCAAAAAAGGGGGAGGGGGAGG
GGGTATGAAGTGAGATTTGTGGTTCACACATTAATTCAAAACAAAAACAATGCAATCTCTTCACCATCTCACTGTTATCCCTTTACCTTTTACTCCTCATCCCCACACCC
TCCATTTTTTCAACACCCATTTCCCCTCCTCCATTTTCACTCATTCATATCTCCCCCGCACCCGCCGTTCTCCGCCCTCTCCCGCGGCCGTAGTCTCCCCCAGCAGCTTG
TGGGAGAAGGGGCCTATTGAAGGTGTTCTGTTTGATATTGATGGAACACTATGTGATTCTGATCCTCTTCACTTCTATGCCTTCCGCCAAATGCTTCAACAGGTTGGATT
CAACAATGGAGTCCCAATTAGTGAGGAATTTTTCATAGAAAACATAAGTGGAAGGCACAATGAGGATCTTTGTGGCATTCTCCTTCCAAATTGGGACCTACCCAAAGCTA
GAAAATTCCTTCAAGATAAGGAAGCTTATTTTTGCAGATTGGCAGCAGAGCAGTTGGAAGGCATAGAAGGGCTGGAGAAGGTCTGCAAATGGATAGAGGAGCGTGGGATT
AAACGCGCTGCCGTGACAAATGCCCCAAGACCGAACGCGGAGCTAATTTTGTCGATGCTTAAACTTACGGATTTCTTTGAAGTAGTGATCATAGGGAACGAATGTGAACG
TGCAAAGCCATTCCCTGATCCTTACTTGAAGGCTCTTCAAGCTCTTCAACTCTCTCCTCAACATTCTTTTGTCTTTGAGGATTCAGTATCAGGAATAAAAGCAGGAGTAG
GAGCTGGAATGAGAGTGGTAGGTGTGGGAAGAAGAAATCCACAAGAATTATTAAAAGAAGCTGGAGCCACTTTTGTAATTCAAGATTTCAATGATCCAATTCTTTGGACC
CAACTACTCTTTTAATTTTTATATTAATTCCTCTCATTTTCTTCTTTTAATATACTATTTTTATTTCACTTCTTTCTCTTCTTATACTCCATTTATATCATTATTTAAAC
ATAATATAATATGATCATTAATTCATGATCAACACATTCAAATTTAACCTACATGGATATAATGTATTTATTTAGAGTTGTGATTTTAATATCCATCTCTTTTGTTTGTT
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQSLHHLTVIPLPFTPHPHTLHFFNTHFPSSIFTHSYLPRTRRSPPSPAAVVSPSSLWEKGPIEGVLFDIDGTLCDSDPLHFYAFRQMLQQVGFNNGVPISEEFFIENIS
GRHNEDLCGILLPNWDLPKARKFLQDKEAYFCRLAAEQLEGIEGLEKVCKWIEERGIKRAAVTNAPRPNAELILSMLKLTDFFEVVIIGNECERAKPFPDPYLKALQALQ
LSPQHSFVFEDSVSGIKAGVGAGMRVVGVGRRNPQELLKEAGATFVIQDFNDPILWTQLLF